• 제목/요약/키워드: Sequence Maintenance

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BM 미생물제제를 이용한 크루즈선 오·폐수 처리 (Shipboard sewage treatment by SBR process with BM)

  • 이언승;김인수
    • 한국항해항만학회지
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    • 제35권10호
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    • pp.817-822
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    • 2011
  • 본 연구는 크루즈선에서 발생하는 오 폐수의 생물학적 처리시 야기될 수 있는 악취 문제를 해결하기 위하여 SBR공정에 유효미생물을 주입하여 Lab scale 실험을 수행하였다. 악취물질의 저감 정도와 크루즈선이라는 특수 환경과의 접목성을 검토한 결과 유효미생물의 주입은 선박환경에 매우 적합한 공정으로 평가되었다. 기존의 활성슬러지에 유효미생물의 주입함으로써 슬러지 내 미생물의 다양성과 높은 개체수를 확보할 수 있었으며, 미생물 간의 우점종도 악취처리에 유리한 미생물종으로 전환되는 것을 확인할 수 있었다. 또한 이로 인하여 악취물질의 악취 강도도 20배 이상 낮출 수 있는 것으로 확인되었다.

Bovine Lactoferricin Induces Intestinal Epithelial Cell Activation through Phosphorylation of FAK and Paxillin and Prevents Rotavirus Infection

  • Jeong, Ye Young;Lee, Ga Young;Yoo, Yung Choon
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제31권8호
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    • pp.1175-1182
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    • 2021
  • We investigated the effect of bovine lactoferricin (Lfcin-B), a peptide derived from bovine lactoferrin, on activation of intestinal epithelial cells in IEC-6 intestinal cell, and protection against in vivo rotavirus (RV) infection. Treatment with Lfcin-B significantly enhanced the growth of IEC-6 cells and increased their capacity for attachment and spreading in culture plates. Also, Lfcin-B synergistically augmented the binding of IEC-6 cells to laminin, a component of the extracellular matrix (ECM). In the analysis of the intracellular mechanism related to Lfcin-B-induced activation of IEC-6 cells, this peptide upregulated tyrosine-dependent phosphorylation of focal adhesion kinase (FAK) and paxillin, which are intracellular proteins associated with cell adhesion, spreading, and signal transduction during cell activation. An experiment using synthetic peptides with various sequences of amino acids revealed that a sequence of 9 amino acids (FKCRRWQWR) corresponding to 17-25 of the N-terminus of Lfcin-B is responsible for the epithelial cell activation. In an in vivo experiment, treatment with Lfcin-B one day before RV infection effectively prevented RV-induced diarrhea and significantly reduced RV titers in the bowels of infected mice. These results suggest that Lfcin-B plays meaningful roles in the maintenance and repair of intestinal mucosal tissues, as well as in protecting against intestinal infection by RV. Collectively, Lfcin-B is a promising candidate with potential applications in drugs or functional foods beneficial for intestinal health and mucosal immunity.

A novel mutation in GJC2 associated with hypomyelinating leukodystrophy type 2 disorder

  • Komachali, Sajad Rafiee;Sheikholeslami, Mozhgan;Salehi, Mansoor
    • Genomics & Informatics
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    • 제20권2호
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    • pp.24.1-24.8
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    • 2022
  • Hypomyelinating leukodystrophy type 2 (HLD2), is an inherited genetic disease of the central nervous system caused by recessive mutations in the gap junction protein gamma 2 (GJC2/GJA12). HLD2 is characterized by nystagmus, developmental delay, motor impairments, ataxia, severe speech problem, and hypomyelination in the brain. The GJC2 sequence encodes connexin 47 protein (Cx47). Connexins are a group of membrane proteins that oligomerize to construct gap junctions protein. In the present study, a novel missense mutation gene c.760G>A (p.Val254Met) was identified in a patient with HLD2 by performing whole exome sequencing. Following the discovery of the new mutation in the proband, we used Sanger sequencing to analyze his affected sibling and parents. Sanger sequencing verified homozygosity of the mutation in the proband and his affected sibling. The autosomal recessive inheritance pattern was confirmed since Sanger sequencing revealed both healthy parents were heterozygous for the mutation. PolyPhen2, SIFT, PROVEAN, and CADD were used to evaluate the function prediction scores of detected mutations. Cx47 is essential for oligodendrocyte function, including adequate myelination and myelin maintenance in humans. Novel mutation p.Val254Met is located in the second extracellular domain of Cx47, both extracellular loops are highly conserved and probably induce intramolecular disulfide interactions. This novel mutation in the Cx47 gene causes oligodendrocyte dysfunction and HLD2 disorder.

Current methodologies in construction of plant-pollinator network with emphasize on the application of DNA metabarcoding approach

  • Namin, Saeed Mohamadzade;Son, Minwoong;Jung, Chuleui
    • Journal of Ecology and Environment
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    • 제46권2호
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    • pp.126-135
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    • 2022
  • Background: Pollinators are important ecological elements due to their role in the maintenance of ecosystem health, wild plant reproduction, crop production and food security. The pollinator-plant interaction supports the preservation of plant and animal populations and it also improves the yield in pollination dependent crops. Having knowledge about the plant-pollinator interaction is necessary for development of pesticide risk assessment of pollinators and conservation of endangering species. Results: Traditional methods to discover the relatedness of insects and plants are based on tracing the visiting pollinators by field observations as well as palynology. These methods are time-consuming and needs expert taxonomists to identify different groups of pollinators such as insects or identify flowering plants through palynology. With pace of technology, using molecular methods become popular in identification and classification of organisms. DNA metabarcoding, which is the combination of DNA barcoding and high throughput sequencing, can be applied as an alternative method in identification of mixed origin environmental samples such as pollen loads attached to the body of insects and has been used in DNA-based discovery of plant-pollinator relationship. Conclusions: DNA metabarcoding is practical for plant-pollinator studies, however, lack of reference sequence in online databases, taxonomic resolution, universality of primers are the most crucial limitations. Using multiple molecular markers is preferable due to the limitations of developed universal primers, which improves taxa richness and taxonomic resolution of the studied community.

A New Distributed Log Anomaly Detection Method based on Message Middleware and ATT-GRU

  • Wei Fang;Xuelei Jia;Wen Zhang;Victor S. Sheng
    • KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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    • 제17권2호
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    • pp.486-503
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    • 2023
  • Logs play an important role in mastering the health of the system, experienced operation and maintenance engineer can judge which part of the system has a problem by checking the logs. In recent years, many system architectures have changed from single application to distributed application, which leads to a very huge number of logs in the system and manually check the logs to find system errors impractically. To solve the above problems, we propose a method based on Message Middleware and ATT-GRU (Attention Gate Recurrent Unit) to detect the logs anomaly of distributed systems. The works of this paper mainly include two aspects: (1) We design a high-performance distributed logs collection architecture to complete the logs collection of the distributed system. (2)We improve the existing GRU by introducing the attention mechanism to weight the key parts of the logs sequence, which can improve the training efficiency and recognition accuracy of the model to a certain extent. The results of experiments show that our method has better superiority and reliability.

A Pumilio Activity Sensor Reveals Bag-of-Marbles Inhibition of Pum Activity in the Drosophila Ovary

  • Wijeong Jang;Changsoo Kim
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제27권1호
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    • pp.39-46
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    • 2023
  • Pumilio (Pum) is an RNA-binding protein and translational repressor important to diverse biological processes. In the Drosophila ovary, Pum is expressed in female germline stem cells (GSCs), wherein it acts as an intrinsic stem cell maintenance factor via repressing target mRNAs that are as yet mostly unknown. Pum recognizes the Pum binding sequence (PBS) in the mRNA 3'UTR through its C-terminus Puf domain. Translational repression is mediated through its N-terminal domain, but the molecular mechanism remains largely unknown. We previously showed that Bag-of-marbles, a critical differentiation-promoting factor of female GSCs, physically interacts with the N-terminus of Pum. We further showed that this interaction is critical to Bam inhibition of Pum repressive action in cultured cells, but the physiological relevance was not addressed. Here we design an in vivo GFP translational reporter bearing the PBS in its 3'UTR and show that GFP expression is reduced in cells wherein Pum is known to be active. Furthermore, we demonstrate in pum mutant ovary that this GFP repression requires Pum, and also that the sensor faithfully monitors Pum activity. Finally, we show that forced expression of Bam inhibits Pum-mediated repression, validating that Bam inhibits Pum activity in vivo.

플랫 플레이트 구조의 장단기 처짐 제어에 대한 동바리 재설치 작업의 효과 분석 (Analysis of Effects of Reshoring Works on Short and Long Term Deflections of Flat Plates)

  • 김재요;박수범
    • 한국구조물진단유지관리공학회 논문집
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    • 제21권1호
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    • pp.40-48
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    • 2017
  • RC 무량판 구조는 강도 뿐만 아니라 사용성 조건에 지배받을 수 있으며, 시공 과정 및 이에 따른 동바리로 연결된 슬래브들 간의 중력하중의 분포가 무량판의 장단기 거동에 영향을 주는 중요한 요소로 작용할 수 있다. 조기재령 슬래브에 과하중이 작용하여 균열이 발생하는 경우 시공 과정에서 무량판 구조의 처짐이 크게 증가할 수 있으므로, 동바리 재설치를 통해 다층지지 슬래브에서 하중의 수직 분포를 조절하는 것은 처짐을 감소시키는 데 도움이 될 수 있다. 이 연구에서는 무령판 구조의 장단기 처짐에 대한 동바리 재설치 작업의 영향을 분석한다. 다양한 동바리 재설치 조건과 슬래브 설계 및 시공 조건에 따른 슬래브 시공하중이 간편법에 의하여 정의되고, 시공 과정과 콘크리트의 균열 및 장기 효과를 고려한 슬래브 처짐 실용해석법을 통해 장단기 처짐이 산정된다. 변수연구를 통하여 동바리 재설치 작업의 슬래브 처짐 저감효과를 검증하며, 슬래브 처짐을 위한 동바리 시공과 슬래브 설계 및 시공에 대한 최적 조건을 분석한다.

중층 규모 철근콘크리트 주거형 건물의 시공 중 구조성능 분석 (Analyses of Structural Performances for Reinforced Concrete Middle-Rise Residential Building under Construction)

  • 고준영;김재요
    • 한국구조물진단유지관리공학회 논문집
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    • 제23권5호
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    • pp.96-103
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    • 2019
  • 중층 철근콘크리트 주거형 건물은 국내에서 많은 비중을 차하며, 이러한 건물의 시공단계에서 발생 될 수 있는 문제에 대한 구조성능 분석이 필요하다. 이를 위하여, 25층 규모의 중층 철근콘크리트 주거형 건물을 예제모델로 선정해 구조성능 분석을 진행하였다. 예제모델을 5층, 10층, 15층, 20층, 25층의 시공단계 모델과 설계가 완료된 완공단계 모델로 구분해 구조해석을 수행하였다. 완공단계와 시공단계 모델들에 대하여, 고유치해석, 횡력저항성능, 완공단계에서의 설계강도비와 시공단계에서의 설계강도비를 비교를 통한 단면성능 검토를 수행하였다. 검토 결과, 시공단계와 완공단계 모두 횡변위와 층간변위비에서 건축구조기준 제한을 초과하지 않았는 것을 확인하였고, 단면성능 검토에서는 벽체의 일부 데이터를 제외한 모든 부재에서 구조적 안전성을 확인하였다. 따라서, 중층 철근콘크리트 주거형 건물의 완공단계에서 구조적 안정성이 확보되면 시공단계에서도 구조적 안정성 학보가 이루어진다는 결론을 도출할 수 있었다.

주거용 RC 벽식 건물의 시공 중 재현주기에 따른 지진하중의 영향 (Effects of Seismic Loads with Different Return Period on Residential Building with RC Shear Wall Structure under Construction)

  • 최성현;김재요
    • 한국구조물진단유지관리공학회 논문집
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    • 제26권2호
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    • pp.43-50
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    • 2022
  • 설계단계에서 구조적 안전성을 확인하더라도, 시공단계에서는 구조시스템이 완전히 형성되지 않아 구조적 안전성이 보장되지 않는다. 또한 시공 기간은 완공된 이후의 건물의 사용기간보다 짧기 때문에 설계단계에서와 같은 지진하중을 시공단계에 적용하는 것은 과다하다. ASCE 37-14는 시공 중 지진하중 저감계수의 개념을 제시하고 있지만, 명확한 적용 방법을 제공하지 않고 있다. 따라서, 이 연구에서는 재현주기에 따라 저감한 지진하중을 주거용 중층 RC건물의 예제 모델에 적용하였다. 예제모델의 시공단계를 5층 단위로 구분하였으며, 시공단계 모델들에 재현주기 변화에 따른 지진하중을 적용하여 시공 중 지진하중을 분석하고 구조 부재의 단면성능 검토를 수행하였다. 설계단계와 시공단계에서의 전단벽 설계강도비를 비교하여, 주거용 중층 RC 건물의 시공 중 안전성을 확보할 수 있는 지진하중 크기의 범위를 재현주기의 관점에서 분석하였다.

운용모드해석에 기반한 사장교의 장단기 동특성 평가 (Evaluation of Short and Long-Term Modal Parameters of a Cable-Stayed Bridge Based on Operational Modal Analysis)

  • 박종칠
    • 한국구조물진단유지관리공학회 논문집
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    • 제26권4호
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    • pp.20-29
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    • 2022
  • 상시진동을 이용하여 구조계의 동특성을 추출하는 운용모드해석 기법은 케이블교량 구조건전성모니터링의 한 분야로써 다양한 연구와 실험적 검증이 수행되어왔다. 본 연구에서는 두 번에 걸친 상시진동실험과 함께 3년간의 장기 계측을 통해 수집된 가속도 데이터를 이용하여 공용 중인 사장교의 장단기 동특성을 평가하였다. 교량 준공 이후 6년과 19년이 경과한 시기에 실시한 고해상도 상시진동실험으로부터 0.1 ~ 2.5 Hz 대역에서 27개 수직모드(휨, 비틈)와 1개 수평모드를 추출하였다. 운용모드해석에 기반한 동특성 추출은 PP기법, ERADC기법, FDD기법, TDD기법을 적용하였으며, 적용한 기법들 간에 유의미한 차이가 없는 것을 확인하였다. 장기 계측 고유진동수와 환경 요인(온도, 바람)에 대한 상관성 분석으로부터 온도 변화가 고유진동수 변동에 지배적인 영향인자임을 확인하였다. 대상교량의 고유진동수 감소 경향은 구조성능과 일체성이 변한 것이 아니라 두 번의 상시진동실험 간 온도 차이에 의한 환경영향이 컸음을 밝혔다. 또한 TDD기법 적용 시, 지연이 0에서 자기상관이 1이 되도록 시퀀스를 정규화하는 알고리즘을 추가하여 모드형상 추출의 정확도를 개선하였다.