• Biomolecules & Therapeutics
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• 제18권2호
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• pp.184-190
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• 2010

Clinical cases of pure red cell aplasia (PRCA) have been reported during the recombinant human erythropoietin (EPO) therapy for the anemia patients. PRCA is a rare hematological disorder leading to a severe anemia due to an almost complete stop of red blood cell production. Antibody (Ab)-associated PRCA is caused by the EPO-neutralizing Abs that eliminate the biological activity of EPO. In order to detect anti-EPO Abs in human sera, we performed conventional ELISA, directly coated bridging ELISA, and streptavidin coated bridging ELISA, and compared their sensitivity and specificity. Some false positive results were obtained in the conventional ELISA. One positive sample was detected successfully by streptavidin coated bridging ELISA, which was not appeared in the directly coated bridging ELISA. In conclusion, streptavidin coated bridging ELISA was substantially sensitive and specific format and one out of sixty-eight serum samples was proved to be anti-EPO positive.

• KSBB Journal
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• 제15권3호
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• pp.243-246
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• 2000

B형간염 바이러스 연구에 관한 최근의 주제는 혈중 B형간염 표면항원농도(HBsAg)를 예후 판정의 지표로 활용하는 것이다, 본 연구에서는 B형간염에 대한 자가진단을 목적으로 하여 컴퓨 터 상 분석 기법을 사용하는 HBsAg에 대한 정량적 면역크로마 토그래피 측정법을 개발하였다. 본 방법을 사용하였을 때 측정 된 integrated optical density(IOD)은 2~200 ng/mL의 범위 내에 서 표준 HBsAg 농도의 log값에 비례하여 증가하였데, ELISA 측정법은 0.1~100 ng/mL의 범위 내에서 표준 HBsAg 농도의 log값에 비례하여 증가하였다. 3개의 혈청 겸제를 가지고 두 가 지의 측정법으로 각각 시험하여 표준곡선에 대입하였을 때 동일 한 농도를 나타내 었는데 그 값이 각각 9,000, 7,000, 4,000 ng/mL 이었다. 또한 컴퓨터 상 분석 기법을 사용하는 HBsAg에 대한 정량적 면역크로마토그래피 측정법으로 동일 겸체를 5회 반복 시험하였을 때 측정된 IOD값이 재현성이 있었으며, 변이계수가 1.38 ~ 6.30% 이내였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제12권3호
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• pp.470-475
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• 2002

In the course of screening for a novel cell cycle inhibitor, a potent Cdk 1 inhibitor, HY558, was found from the culture broth of Penicillium minioluteum F558 isolated from a soil sample. The molecular ion of HY558 was identified at m/z 329 (MH+) with a molecular formula of $C_20H_44ON_2$. HY558 exhibited selective antiproliferative effects on various human cancer cell lines. Its $IC_50$ values were estimated to be 0.29 mM on HepG2, 0.30 mM on HeLa, 0.30 mM on HL6O, 0.33 mM on HT-29, and 0.25 mM on AGS cells. Interestingly, Hy558 demonstrated no antiproliferative effect with normal lymphocytes used as the control, and a low level of inhibition on the proliferation of A549 cancer cells. A flow cytometric analysis of HepG2 cells revealed an appreciable arrest of cells at the G1 and G2/M phases of the cell cycle following treatment with Hy558. furthermore, DNA fragmentation due to apoptosis was observed in HeLa cells treated with 0.46 mM of HY558.

• 통합자연과학논문집
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• 제3권3호
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• pp.143-147
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• 2010

Since it is of great importance to know how a ligand binds to a receptor, there have been a lot of efforts to improve the quality of prediction of docking poses. Earlier efforts were focused on improving search algorithm and scoring function in a docking program resulting in a partial improvement with a lot of variations. Although these are basically very important and essential, more tangible improvements came from the reduction of search space. In a normal docking study, the approximate active site is assumed to be known. After defining active site, scoring functions and search algorithms are used to locate the expected binding pose within this search space. A good search algorithm will sample wisely toward the correct binding pose. By careful study of receptor structure, it was possible to prioritize sub-space in the active site using "receptor-based pharmacophores" or "hot spots". In a sense, these techniques reduce the search space from the beginning. Further improvements were made when the bound ligand structure is available, i.e., the searching could be directed by molecular similarity using ligand information. This could be very helpful to increase the accuracy of binding pose. In addition, if the biological activity data is available, docking program could be improved to the level of being useful in affinity prediction for a series of congeneric ligands. Since the number of co-crystal structures is increasing in protein databank, "Ligand-Guided Docking" to reduce the search space would be more important to improve the accuracy of docking pose prediction and the efficiency of virtual screening. Further improvements in this area would be useful to produce more reliable docking programs.

• 한국응용약물학회:학술대회논문집
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• 한국응용약물학회 1998년도 Proceedings of UNESCO-internetwork Cooperative Regional Seminar and Workshop on Bioassay Guided Isolation of Bioactive Substances from Natural Products and Microbial Products
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• pp.89-94
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• 1998

Marine sponges are recognized as a plentiful source of diverse biologically active secondary metabolites. Recently, we have initiated a research to discover antitumor constituents from the marine sponges collected from Korean Waters. Marine sponges collected from the South Sea of Korea were screened for several biological activities including such as brine shrimp lethality and cytotoxicity. Significant brine shrimp lethality was detected in the crude extract of a two-sponge association of Poecillastra sp. and Jaspis sp. A cross-section of this sample showed two layers of morphologically distinct sponges. The thin and dirty yellow outer layer was identified as Poecillastra sp. (Pachastrellidae), the surface of which was very rough. The light-grey inner layer was identified as Jaspis sp. (Jaspidae), the surface of which was smooth. This two-sponge association appears to be consistent as these sponges were always found in associated form regardless of collection site or collection period. Investigation of the bioactive constituents monitored by brine shrimp lethality assay led to the isolation of pectenotoxin II (PTX2) and psammaplin A as causative compounds for the brine shrimp lethality. $^1$H- and $\^$13/C-nmr signals of PTX2 was fully assigned utilizing TOCSY, HETCOR, Long-range HETCOR, and Homonuclear J-resolved 2D experiments. PTX2 displayed very potent and selective cytotoxicities in the 60 cell line panel antitumor assay at the NCI. PTX2 has progressed to acute toxicity determination and in vivo antitumor assay at the NCI (Table 1). However, significant in vitro antitumor activity of PTX2 can not be affirmed in the in vivo assay.

• Food Science and Biotechnology
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• 제16권1호
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• pp.99-103
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• 2007

The purpose of this study was to develop a simple detection method, possibly at the species-level, that allows for large-scale screening of bifidobacteria. Human fecal samples were plated on MRS-raffinose agar containing cysteine and neomycin sulfate, serving as selective pressure for bifidobacteria, and 0.003%(w/v) bromocresol green. All of the test strains grew well on this medium at $37{\pm}1^{\circ}C$, forming white colonies surrounded by yellow halos, which presented a sharp contrast against the green background. In this disc assay, the required incubation time to develop a yellowish zone varied with the species of Bifidobacterium that was tested, allowing for differential counts and easy identification at the species-level: 10-14 hr for B. bifidum, 20-22 hr for B. catenulatum and B. infantis. and 24-25 hr for B. longum and B. breve. No apparent color was observed for B. angulatum and B. adolescentis 28 hr after inoculation. To evaluate the results of pH indicator-based identification, individual isolates were subjected to a colony-PCR experiment with genus-specific primers. The amplified products from the isolates were in good accordance with those from the reference strains at a level of 95% agreement. These results suggest that the present method could be conveniently applied to cell counts, as well as to the preliminary identification of bifidobacteria from a variety of sample types including human feces, dairy products, and commercial probiotic supplements.

• 한국식품과학회지
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• 제34권6호
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• pp.1002-1006
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• 2002

본 연구는 콩류의 방사선 조사 여부를 검지하기 위해서 생물학적 방법인 발아법으로 확인하였다. 콩류는 대두, 강남콩, 그리고 팥으로 0.1, 0.3, 0.5, 0.7, 1.0 kGy의 조사선량으로 방사선 조사하고 5일 동안 뿌리의 길이를 측정하여 방사선 조사에 의한 발아 특성을 살펴보았다. 모든 시료는 5일 동안 지속적인 길이 성장을 하였지만, 방사선 조사에 의해서 길이 성장이 억제되어 발아 3일째 부터는 뿌리길이에 유의적인 차이를 보이지 않았다. 대두와 팥은 발아 2일째, 강낭콩은 발아 3일째 비조사 시료와 조사 시료간에 1 cm 단위의 길이 차이를 보였다. 발아 5일째는 조사선량간에 유의적인 차이를 나타내는 경향이었지만 0.5 kGy 이상 조사 시료간에는 유의적인 길이 차이를 보이지 않았다. 또한 모든 시료에서 4일부터 길이 성장정도가 현저히 낮아지고 발아 5일 동안 비조사 시료의 성장정도가 가장 큰 것으로 나타났다. 콩류의 방사선 조사 여부는 발아 5일 동안 뿌리 길이의 유의적인 길이 성장과 비조사 시료와 조사 시료들의 성장정도를 측정함으로써 방사선 조사 여부의 선별검지가 가능한 것으로 판단되었다.

• Radiation Oncology Journal
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• 제11권1호
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• pp.35-42
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• 1993

원자력 시설 이용 증대에 따른 불의의 방사선 사고에 대비하여 방사선 작업종사자의 피폭시 진단을 위한 검사방법이 필요하다. 이 방법은 검사를 위한 검체의 채취가 용이하고, 짧은 시간내에 간편하게 많은 Sample을 처리하여야 한다는 조건을 만족시켜야 한다. 인체의 다양한 조직 및 세포 중에서 위의 조건을 만족시킬 수 있는 말초 혈액의 림파구는 비교적 방사선에 대한 감수성이 높다고 알려져 있으며, 채집 또한 용이하여 생물학적 선량 측정의 도구로써 이용가치가 높아 방사선 작업 종자사나 피폭 가능성이 있는 사람의 screening test에 사용될수 있다. 정상인에 있어서의 림파구내 미세핵 존재 여부와 방사선 피폭량에 따른 미세핵 발생빈도를 시험관내 실험을 통하여 표준화시켜 향후 방사선 피폭시 피폭선량을 역으로 산출해 낼 수 있는 방사선 장해의 평가 기술 개발의 기초자료를 마련하기 위하여 본 실험을 시행하였다. 정상인으로 부터 혈액을 채취하여 림파구만을 Ficoll-Hypaque gradient 방법으로 추출하여 배양한 다음, 본 치료방사선과의 중성자 치료기 (MC-50, scanditronix)와 Co-60 teletherapy unit(Theratron-780, AECL)를 이용하여 방사선 조사를 시행하였다. Cytokinesis-block method를 이용하여 첫번째 분열을 한 림파구에서 미세핵(Micronucleus)을 현미경을 통하여 계수한 다음, 이의 선량-반응 관계식을 linear-quadratic model을 사용하여 구하고, 이를 근거로 하여 gamma-ray에 대한 중성자의 Relative biological effectiveness (RBE)를 산출하였다. 방사선에 피폭되지 않은 림파구의 미세핵 발생빈도는 binucieated cell한 개당 $0.013{\pm}0.0002$로써 사람에 따라 통계학적으로 큰 차이를 보이지 않았다. 그림 2와 3에서 보는 바와 같이 개개인으로부터 얻은 data는 감마선과 중성자선 모두에서 선량-반응 곡선의 linear-quadratic equation에 잘 일치하였다. 감마선과 중성자선 모두에서 선량에 따른 미세핵의 발생빈도는 선량이 높을수록 비례하여 증가하였는데, 감마선의 경우에는 $r^2=1.000,\;x^2=0.7074$, p=0.95였으며, 중성자선인 경우에는 $r^2=0.996,\;x^2=7.6834$, p=0.11 였다. 이를 linear-quadratic model로 분석하면, 가장 적합한 선은 감마선인 경우에는 y= ($0.31{\pm}0.049)\;D+(0.0022{\pm}0.0002)\;D^2+(13.19{\pm}1.854$) 였으며, 중성자선인 경우에는 y=($0.99{\pm}0.528)\;D+(0.0093{\pm}0.0047)\;D^2+(13.31{\pm}7.309$) 였었다. 감마선에 대한 중성자선의 상대적 생물학적 효과비 (RBE)는 y=aD+$bD^2$+c를 다음과 같은 식으로 변형시켜 계산하였다. $$\frac{[-a{pm}\sqrt{a^2-4b\;(c-y}}]}{2{\times}6}$$ 미세핵 발생빈도가 세포당 0.05와 0.8사이에서의 중성자선의 상대적 생물학적 효과비는 $2.37{\pm}0.17$ 이었다. 이상의 결과를 종합하여 볼 때 선량에 따른 미세핵 발생빈도는 기존의 방사선 감수성 test의 결과와 대동소이하여, 앞으로 방사선 감수성을 측정하는 방법으로 이용할 수 있으며, 또한 실험방법이 비교적 간단하며 짧은 시간에 결과를 도출할 수 있어 생물학적 선량측정 도구로써 널리 이용될 수 있을 것으로 생각되어 진다.

• 한국식품과학회지
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• 제39권2호
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• pp.200-208
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• 2007

제주 자생식물 54종을 대상을 70% 메탄올로 추출하여, 총페놀 함량, DPPH radical 소거능, xanthine oxidase(XOD), tyrosinase 저해활성을 측정한 후, 생리활성이 높은 5가지 식물을 선정하여 고압 유기용매(100% 메탄올, 13.6 MPa, $40^{\circ}C$)로 추출하여 DPPH, tyrosinase, elastase 저해활성을 측정하였다. 70% 메탄올 추출물의 총페놀 함량은 새우나무, 이질풀, 아그배나무, 자금우, 짚신나물이 250 mg GAE/g 이상으로 높은 함량을 나타내었다. DPPH radical 소거활성은 백량금이 94.1%로 가장 높았다. DPPH radical 소거활성과 총페놀 함량 사이에는 높은 상관관계($R^2=0.87$)를 나타내었다. Tyrosinase 저해활성은 이삭여뀌, 붉나무, 사방오리나무, 소귀나무가 85% 이상을 나타내었으며, XOD 저해활성은 이삭여뀌와 소귀나무가 90% 이상을 나타내었다. 고압 유기용매 추출물은 70% 메탄올 추출물과 마찬가지로 DPPH 소거능과 tyrosinase 저해활성이 높았다. Tyrosinase 와 elastase의 저해활성에 대한 $IC_{50}$은 자금우가 각각 802와 88 ppm이었고, 소귀나무가 각각 959와 66 ppm이었다.

• 한국식품과학회지
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• 제39권3호
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• pp.299-303
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• 2007

본 연구에서는 L. monocytogenes를 신속하게 분석할 수 있는 면역크로마토그래피법을 개발하고자 하였다. 먼저 L. monocytogenes에 대한 단크론성 항체(FKLM-3B12-37)를 개발하여 직경 40nm로 제작된 colloidal gold와 합성한 후 conjugate pad에 처리하였고 nitrocellulose membrane 상의 test line과 control line에 단크론성 항체와 anti-mouse IgG를 각각 처리하여 면역크로마토그래피법을 개발하였다. 개발된 면역크로마토그래피법의 검출한계는 $10^{5}$ cell/mL 수준까지 검출이 가능했으며 다른 식중독 세균과는 교차 반응이 없는 것으로 나타났다. 임으로 오염시킨 식품시료의 경우 증균과정 없이 $10^{4}$ cell/25g까지 바로 분석하는데 어려움이 있으며 24시간의 증균과정을 거친 후에는 $10^{4}$ cell/25g까지 검출할 수 있었다. 본 연구에서 개발된 면역크로마토그래피법은 24시간의 증균 만으로 식품에 오염되어있는 L. monocytogenes를 검출할 수 있는 것으로 사료되었고, 기존의 식중독균 진단방법에 비해 신속하고 간편하게 그 결과를 확인할 수 있었다.