• 환경생물
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• 제32권4호
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• pp.382-388
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• 2014

최근 뱀장어 양식장에서 사육 중이던 동남아산 뱀장어에 몸통 근육의 요철현상을 나타내면서 폐사를 일으키는 질병이 발생하였다. 병어의 몸통 근육 내 환부는 흰색 또는 황색으로 변해있었다. 병리조직학적인 변화는 근조직내에 수많은 포자와 크고 작은 시스트들이 변형된 근육근섬유 내에 관찰되었다. 병어의 근육 환부를 취하여 PCR을 실시하여 H. anguillarum이 가지는 특정 유전자인 Small subunit ribosomal RNA (SSU-rRNA)를 증폭하였다. 좀 더 정확한 동정을 위해 PCR product를 Cloning 후 Sequencing하여 서열들을 분석한 결과 H. anguillarum의 Small subunit ribosomal RNA (Gene bank accession number: AB623036) 서열과 일치하게 나타남을 확인할 수 있었다. primer 18F과 1537R의 PCR product는 약 1366 bp 길이가 일치하였으며, V1과 1392R를 이용한 PCR product는 1200 bp가 일치하게 나타났다. 또한 H1과 H2의 PCR product의 경우는 800 bp 정도 일치하였으며 이의 서열은 나머지 2개의 product가 공통적으로 가지고 있는 서열이었다. 이를 토대로 본 연구에서는 동남아산 뱀장어에 감염된 포자충은 H. anguillarum임을 동정할 수 있었다.

• 식물병연구
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• 제11권1호
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• pp.56-65
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• 2005

이 연구는 Alternaria속 균류 중에서 분생포자의 형태가 유사하여 분류, 동정이 매우 어려운 소형의 포자를 형성하는 11종의 Alternaria의 종간 유연관계와 분류체계를 확립하기 위하여 공시균들의 ribosomal DNA의 ITS 및 미토콘드리아 small submit 영역의 염기서열 분석, 그리고 URP primer에 의한 핵산지문분석을 실시하였다. 소형의 포자를 형성하는 11종 Alternaria속의 rDNA internal transcribed spacer(ITS) 영역과 미토콘드리아 small submit rDNA 의 염기서열을 분석하였던 바 A. infectoria를 제외한 10종의 Alternaria에서 100%의 상동성을 나타내었다. 이는 공시한 10종의 Alternaria가 유전적으로 매우 근연의 관계에 있음을 나타내며, 이 marker는 공시균들의 종구분에 이용할 수 없음을 나타내는 것이다. URP primer 10종을 공시하여 소형의 포자를 형성하는 Alternaria 균류의 핵산지문분석을 실시한 결과, 개개의 primer 로는 종간의 구분이 불가능하였으나 여러개의 primer를 종합하여 UPGMA분석을 실시할 경우 비록 종간 유사도는 높았디만 각각의 종은 독립된 cluster를 형성하여 종간 구별이 가능하였다. 자리공에서 분리한 Alternaria sp.는 URP-PCR 핵산지문 분석 결과 다른 Alternaria 종들과 차이가 인정됨으로 이 균은 미기록인 신종의 Alternaria로 사료되었다. A.infectoria는 다른 Alternaria 종들과 ITS 분석 및 URP-PCR 핵산지문분석에서 큰 차이를 보임으로서 뚜렷이 구별되는 종으로 판단되었다.

• ALGAE
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• 제17권4호
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• pp.203-216
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• 2002

• 대한전기학회:학술대회논문집
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• 대한전기학회 2008년도 학술대회 논문집 정보 및 제어부문
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• pp.448-449
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• 2008

본 논문에서는 이동 로봇의 경로 추종을 위해서, 비선형 모델 예측 슬라이딩 모드 제어(nonlinear model predictive strung mode control) 기법을 제안한다. 본 논문에서 제안한 방법에서는 미래의 슬라이딩 평면을 예측하고, 이에 따른 최적화된 제어기를 유도함으로써 슬라이딩 모드 제어기 단독으로 사용하는 제언 시스템에 비해 성능을 향상시킬 수 있다. 마지막으로 컴퓨터 시뮬레이션을 통해 본 논문에서 제안한 제어기의 성능을 검증하고자한다.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제14권4호
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• pp.1067-1082
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• 2003

In this paper, we propose a randomized response model with discrete quantitative attribute by three-stage cluster sampling for obtaining discrete quantitative data by using the Liu & Chow model(1976), when the population was made up of sensitive discrete quantitative clusters. We obtain the minimum variance by calculating the optimum number of fsu, ssu, tsu under the some given constant cost. And we obtain the minimum cost under the some given accuracy.

• 한국정보처리학회:학술대회논문집
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• 한국정보처리학회 2022년도 춘계학술발표대회
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• pp.102-105
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• 2022

굿플에이SSU는 사용자가 자신의 선행에 대한 경험을 공유하고 다른 사용자의 선행을 칭찬하며 선행을 독려하는 소셜네트워크서비스이다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제12권1호
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• pp.129-138
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• 1999

If rumen bacteria can be manipulated to utilize nutrients (i.e., ammonia and plant cell wall carbohydrates) more completely and efficiently, the need for protein supplementation can be reduced or eliminated and the digestion of fiber in forage or agricultural residue-based diets could be enhanced. However, these approaches require a complete and accurate description of the rumen community, as well as methods for the rapid and accurate detection of microbial density, diversity, phylogeny, and gene expression. Molecular ecology techniques based on small subunit (SSU) rRNA sequences, nucleic acid probes and the polymerase chain reaction (PCR) can potentially provide a complete description of the microbial ecology of the rumen of ruminant animals. The development of these molecular tools will result in greater insights into community structure and activity of gut microbial ecosystems in relation to functional interactions between different bacteria, spatial and temporal relationships between different microorganisms and between microorganisms and reed panicles. Molecular approaches based on SSU rRNA serve to evaluate the presence of specific sequences in the community and provide a link between knowledge obtained from pure cultures and the microbial populations they represent in the rumen. The successful development and application of these methods promises to provide opportunities to link distribution and identity of gastrointestinal microbes in their natural environment with their genetic potential and in situ activities. The use of approaches for assessing pupulation dynamics as well as for assessing community functionality will result in an increased understanding and a complete description of the gastrointestinal communities of production animals fed under different dietary regimes, and lead to new strategies for improving animal growth.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제34권4호
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• pp.259-266
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• 1996

형태학적 제3군 가시아메바의 taxonomic validity는 아직 확실하지 않다. 이번 연구에서 제3군에 속하는 6종의 가시 아메바 즉 A. culbertsoni A. healyi A. palestinensis. A. pustulosa, A. royreba 및 A. lenticulata의 type strain들의 동위효소. 미토콘트리아 DNA 및 small subunit(ssu) rDNA의 Restriction Fragment Length Polymorphism(RFLP) 양상을 비교하여 이들의 taxonomic validity를 검토하였다. 미토콘드리아 DNA의 RFLP 양상은 분리주간에 서로 심한 차이를 보였다. A. palestinensis와 A. pustulosc는 거의 동일한 rDNA RFLP(추정 염기 치환율 2.6%) 및 동위효소의 양상을 보여 A. palestinensis와 A. pustulosc는 같은 종으로 판단되었다. 그외의 종들은 서로 아주 다양한 rDNA RFLP 및 동위효소의 양상을 나타내어 독립종으로 인정되었다.

• Mycobiology
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• 제42권2호
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• pp.174-180
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• 2014

We analyzed the genetic diversity of Cylindrocarpon destructans isolates obtained from Korean ginseng (i.e., Panax ginseng) roots by performing virulence tests and nuclear ribosomal gene internal transcribed spacer (ITS) and mitochondrial small subunit (mt SSU) rDNA sequence analysis. The phylogenetic relationship analysis performed using ITS DNA sequences and isolates from other hosts helped confirm that all the Korean C. destructans isolates belonged to Nectria/Neonectria radicicola complex. The results of in vivo and ex vivo virulence tests showed that the C. destructans isolates could be divided into two groups according to their distinctive difference in virulence and the genetic diversity. The highly virulent Korean isolates in pathogenicity group II (PG II), together with foreign isolates from P. ginseng and P. quinquefolius, formed a single group. The weakly virulent isolates in pathogenicity group I, together with the foreign isolates from other host plants, formed another group and exhibited a greater genetic diversity than the isolates of PG II, as confirmed by the mt SSU rDNA sequence analysis. In addition, as the weakly virulent Korean isolates were genetically very similar to the foreign isolates from other hosts, they were likely to originate from hosts other than the ginseng plants.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제54권4호
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• pp.423-429
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• 2016

Cryptosporidium is an important pathogen causing gastrointestinal disease in snakes and is distributed worldwide. The main objectives of this study were to detect and identify Cryptosporidium species in captive snakes from exotic pet shops and snake farms in Thailand. In total, 165 fecal samples were examined from 8 snake species, boa constrictor (Boa constrictor constrictor), corn snake (Elaphe guttata), ball python (Python regius), milk snake (Lampropeltis triangulum), king snake (Lampropeltis getula), rock python (Python sebae), rainbow boa (Epicrates cenchria), and carpet python (Morelia spilota). Cryptosporidium oocysts were examined using the dimethyl sulfoxide (DMSO)-modified acid-fast staining and a molecular method based on nested-PCR, PCR-RFLP analysis, and sequencing amplification of the SSU rRNA gene. DMSO-modified acid-fast staining revealed the presence of Cryptosporidium oocysts in 12 out of 165 (7.3%) samples, whereas PCR produced positive results in 40 (24.2%) samples. Molecular characterization indicated the presence of Cryptosporidium parvum (mouse genotype) as the most common species in 24 samples (60%) from 5 species of snake followed by Cryptosporidium serpentis in 9 samples (22.5%) from 2 species of snake and Cryptosporidium muris in 3 samples (7.5%) from P. regius.