• The Korean Journal of Ecology
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• 제18권2호
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• pp.275-283
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• 1995

Seral changes in floristic composition during abandoned field succession after shifting cultivation was investigated in eastern Kangwon-Do, Korea. According to the DCA ordination based on the floristic composition, sere of the dominant species was shown as follows: Digitaria sanguinalis, Persicaria spp., Commelina communis etc. in the annual stage (0∼1 years); Erigeron spp., Artemisia spp., Rubus crataegus etc. in the Erigeron-Artemisia stage (2∼6 years); Pinus densiflora, Salix spp., Miscanthus sinensis, Arundinella hirta etc. in the shrub - earlier tree stage (10∼25 years); P. densiflora, Quercus mongolica, Spodiopogon sibiricus etc. in the mid-tree stage (25∼50 years); Q. mongolica, Tripterigium regelii, Lespedeza maximowiczii, Carex siderosticta etc. in the latter tree stage (50∼80 years). In mid-tree stage, size-frequency distribution of P. densiflora was plotted as a platycurtic curve and that of Q. mongolica as a reverse J-shaped curve, which meant P. densiflora was thinned through interspecific competition and Q. mongolica was regenerated by itself in the later tree stage.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제26권2호
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• pp.114-119
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• 2011

본 연구에서는 신선편의 채소와 과일에서 주로 검출되는 대장균(E. coli Ol577:H7), 리스테리아(L. monocytogenes), 살모넬라(Salmonella, spp.), 형색포도상구균(S. aureus)을 검출하고 동정할 수 있는 real time PCR 방법을 melting curve 분석을 활용하여 single tube 반응으로 두 종의 식중독균을 동시 검출하는 방법을 개발하고자 하였다. 대장균의 ${\beta}$-glucuronidase (uidA), 황색포도상구균의 thermonuclease (nuc), 리스테리아의 hemolycin (hly), 살모넬라의 tetrahionate reductase (ttr) 를 특이적으로 검출할 수 있는 4종의 프라이머 세트에 대한 real-time PCR의 melting curve 분석을 통하여 황색포도상구균과 대장균 동시분석 시 $T_m$ 값이 $80.6{\pm}0.9^{\circ}C$와 $86.9{\pm}0.5^{\circ}C$, 리스테리아와 살모넬라 동시분석 시 Tm 값이 $80.4{\pm}0.6^{\circ}C$와 $88.1{\pm}0.11^{\circ}C$로 확인하였고, 그 결과 정제되어진 각 식중독균의 genomic DNA를 주형으로 한 duplex real-time PCR 방법이 uniplex real-time PCR 방법과 마찬가지로 10 genome equivalents 까지 검출할 수 있는 민감도를 나타내었다. 또한, 양배추에 네 종의 식중독균을 접종하고, 증균배양 없이 DNA를 추출하여 duplex real-time PCR 을 수행한 결과 모든 식종목균에서 $10^3$ CFU/g의 검출 한계를 나타내었다. 결과적으로 개발된 melting curve 분석을 이용한 duplex real-time PCR 방법은 식품안전 증진을 위한 시간, 노동력, 비용 절감에 있어서 유효한 방법이 될 것으로 판단된다.

• 제어로봇시스템학회논문지
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• 제22권3호
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• pp.217-225
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• 2016

In this paper, we propose an improved path planning method and obstacle avoidance algorithm for two-wheel mobile robots, which can be effectively applied in an environment where obstacles can be represented by circles. Firstly, we briefly introduce the rapidly exploring random tree (RRT) and single polar polynomial (SPP) algorithm. Secondly, we present additional two methods for applying our proposed method. Thirdly, we propose a global path planning, smoothing and obstacle avoidance method that combines the RRT and SPP algorithms. Finally, we present a simulation using our proposed method and check the feasibility. This shows that proposed method is better than existing methods in terms of the optimality of the trajectory and the satisfaction of the kinematic constraints.

• 한국식품영양과학회지
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• 제39권10호
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• pp.1522-1527
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• 2010

식품에 극소량 존재하는 Salmonella spp.를 real-time PCR로 검출 시 필요한 최소시간을 구하고자 하였다. Sal-F, Sal-R 서열이 primer로 사용되었으며 sal-P 서열이 probe로 사용되었다. BPW에서 산출된 검출한계는 $3.77{\times}10^2\;cfu/mL$로 측정되었다. BPW에 인위적으로 Salmonella spp.를 접종하였으며 성장곡선을 구하였다. 성장곡선은 y＝$0.0127x^2$+0.5927x-0.4317($R^2$=0.99) 식을 나타내었다. 25 g 시료에 1 cell의 Salmonella spp.가 존재한다고 가정할 경우, 시료처리 과정에서 10배로 희석되므로 초기 균 농도는 0.004 cfu/mL 이며 이 농도에서 검출한계까지의 균수 증가가 발생해야 real-time PCR로 검출이 가능할 것으로 판단되었다. 성장곡선에서 균수 증가에 필요한 시간을 측정해 본 결과 7시간20분으로 산출되었으며 따라서 PCR 수행시간을 포함하여 10시간이면 검출이 가능함을 알 수 있었다. 식품에서의 실증실험을 위하여 시중에서 판매되고 있는 신선편이 양배추를 구하여 25 g에 1~10 cfu의 수준으로 S. Typhimurium을 인위접종한 후 real-time PCR 방법과 식품공전방법으로 검출하였을 때 두 방법 모두 동일하게 30개중 29개 시료에 대하여 음성을 나타내었다.

• 한국작물학회지
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• 제51권4호
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• pp.362-368
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• 2006

A pot experiment was conducted to investigate the effects of soil burial depth on seedling emergences of rice (Oryza sativa) and Echinochloa spp. and to model such effects for mathematical prediction of seedling emergences. When the Gompertz curve was fitted at each soil depth, the parameter C decreased in a logistic form with increasing soil depth, while the parameter M increased in an exponential form and the parameter B appeared to be constant. The Gompertz curve was combined by incorporating the logistic model for the parameter C, the exponential model for the parameter M, and the constant for the parameter B. This combined model well described seedling emergence of rice and Echinochloa species as influenced by soil burial depth and predicted seedling emergence at a given time after sowing and a soil burial depth. Thus, the combined model can be used to simulate seedling emergence of crop sown in different soil depths and weeds present in various soil depths.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제19권1호
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• pp.346-354
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• 2018

의료용 초음파 장치의 프로브에서 일반적으로 검사자와 피 검사자가 접촉이 가장 많은 부위 중 무작위로 3부분을 임의로 선정하여 프로브에 상제하고 있는 병원균을 검출하여 병원균의 종류와 균수를 알아보았다. 또한 검출된 병원균에 대하여 프로폴리스 추출액, 소독용 에탄올, 소독용 티슈를 이용하여 각 각 소독 후 병원균의 사멸정도를 정량적으로 알아보았다. 그 결과 선형 프로브에서는 S. aureus(32.3%), Bacillus spp.(26.1%), Micrococcus spp.(21.5%), CNS(20%)가 검출되었고, 볼록형 프로브에서는 S. aureus(26.2%), Strepto coccus(24.3%), Entero coccus(19.5%), Micrococcus spp.(15.5%), CNS(14.6%), 부채꼴 프로브에서는 S. aureus(24.1%). Micrococcus spp(24.1%), Entero coccus(20.7%), Strepto coccus(17.2%), CNS(13.8%)순으로 검출되었다. 검출된 병원균을 대상으로 소독을 위해 선정한 3가지 소독액을 이용하여 소독한 결과 소독용 에탄올의 경우 대부분의 병원균을 사멸시켰으며 최소 91.3 %에서 최대 100 %의 사멸효과로 가장 큰 소독 효과가 있는 것으로 분석되었다(P>0.05). 또한 프로폴리스 추출액과 소독용 티슈의 경우 모든 소독용 에탄올에 비해 소독효과는 낮았으나 소독효과에는 통계적으로 유의한 것으로 분석되었다(P>0.05). 실험결과를 보면 대부분의 초음파 프로브에서 다양한 병원균이 검출되었으며, 소독용 에탄올, 소독용 티슈의 소독효과가 있었으며 특히 프로폴리스 추출액을 이용한 소독도 병원균 사멸에 효과가 있는 것으로 분석되어 향 후 검사자와 피검사자의 접촉이 많은 초음파 프로브 소독 시 적용한다면 감염예방에 있어 도움이 될 것으로 사료된다.

• 한국식품조리과학회지
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• 제25권1호
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• pp.45-54
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• 2009

Contamination levels of aerobic colony counts, coliforms and pathogenic bacteria were tested in fried rice dishes to monitor quality for risk management. The prevalence of Bacillus cereus in dishes from 8 Chinese-style restaurants and 2 institutional foodservices was 10%, and the bacteria's contamination levels was 3.47 log CFU/g. Echerichia coli, Staphylococcus aureus, and Salmonella were not detected in any of the 10 samples. However, for their aerobic colony counts and numbers of isolated coliforms, the samples were 30% and 70% over the microbial criteria, respectively, for ready-to-eat foods presented in the Korean Food Code. This suggests that fried rice dishes, although cooked with oil at high temperature, require special care. For the prediction of the growth curve of B. cereus spp. in the fried rice samples, an experiment design of 3 storage temperatures ($7^{\circ}C$, $35^{\circ}C$, $57^{\circ}C$) x 5 storage times (0 h, 2 h, 4 h, 6 h, 24 h) was applied. The sample exposed to $35^{\circ}C$ showed no B. cereus spp. at 0 h; however, there was a tendency of slow growth (1.0 log CFU/g) after 4 hours of storage and then faster growth at 6 h (3.7 log CFU/g) and 12 h (4.7 log CFU/g), showing a growth rate of 0.56 log CFU/g/hr. These results indicate that fried rice, despite being heat-treated, can become heavily contaminated with B. cereus spp. when held over 2 hours at room temperature. However, the samples stored at $7^{\circ}C$ and $57^{\circ}C$ over 24 hours were not contaminated with B. cereus. Based on these results, management guidelines for controlling B. cereus are suggested.

• Genomics & Informatics
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• 제16권4호
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• pp.26.1-26.12
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• 2018

Shigella spp. constitutes some of the key pathogens responsible for the global burden of diarrhoeal disease. With over 164 million reported cases per annum, shigellosis accounts for 1.1 million deaths each year. Majority of these cases occur among the children of the developing nations and the emergence of multi-drug resistance Shigella strains in clinical isolates demands the development of better/new drugs against this pathogen. The genome of Shigella flexneri was extensively analyzed and found 4,362 proteins among which the functions of 674 proteins, termed as hypothetical proteins (HPs) had not been previously elucidated. Amino acid sequences of all these 674 HPs were studied and the functions of a total of 39 HPs have been assigned with high level of confidence. Here we have utilized a combination of the latest versions of databases to assign the precise function of HPs for which no experimental information is available. These HPs were found to belong to various classes of proteins such as enzymes, binding proteins, signal transducers, lipoprotein, transporters, virulence and other proteins. Evaluation of the performance of the various computational tools conducted using receiver operating characteristic curve analysis and a resoundingly high average accuracy of 93.6% were obtained. Our comprehensive analysis will help to gain greater understanding for the development of many novel potential therapeutic interventions to defeat Shigella infection.

• 환경생물
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• 제23권3호
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• pp.304-314
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• 2005

대청호 남조세균 수화 기작에 대한 이해를 돕고자, 1997년부터 2002년까지 (2000년 제외)의 조사 자료를 바탕으로 남조세균 군집 특성을 해석하고 수화 발달 단계를 3단계로 구분하여 환경요인과의 관련성을 파악하였다. 남조세균 수화의 시작은 6월 하순부터 시작하며, 강과 호소의 중간 성향을 가진 정점 1부터 발생하였다. 대청호의 수화 발생 기간은 댐축 앞 지점인 정점 4를 기준으로 하는 경우, 약 $60\~70$일이었으나, 1999년의 경우는 7월 19일부터 11일로 이례적인 현상이었다. Microcystis aeruginosa은 6월에 출현하기 시작하여 1998년과 2002년은 8월 말에서 9월 초, 1999년과 2001년은 7월 말에 절정을 이루었다. M. aeruginosa의 현존량이 처음 증가하는 시기는 1998년은 6월 22일, 1999년은 6월 28일,2001년은 7월 4일 그리고 2002년은 6월 25일로 모두 표층 수온이 $25^{\circ}C$를 넘는 시기였다. M. aeruginosa의 구성비는 식물플랑크톤 현존량에 대해서는 $68.1\%,$ 남조세균에 대해서는 $74.2\%$, Microcystis속에 대해서는 $88.8\%$이었다. M. aeruginosa의 연도별 남조세균 대비 구성비는 1998년 $30.3\%,$ 1999년 $34.\6%,$ 2001년 $94.4\%,$ 2002년 $42.9\%$이었다. 1998년 Anabaenu spp.는 4월부터 출현하기 시작하여 8월 하순부터 9월 중순까지 정점에 따라 $1.0{\times}10^4\;cells\;mL^{-1}$ 이상으로 분석되었다. Anabaena속은 준비기에 남조세균 수화 추이에 한 축을 담당하고 있었다. 소멸기에서는 Anabaena spp., Oscillatorin spp., Aphanizomenon flos-aquae가 M. aeruginosa의 소멸을 대신하여 현존량이 증가하는 것으로 나타났다. 남조세균 수화에 미치는 강우의 영향은 시기별로 달라, 준비기의 강우는 남조세균 성장을 돕고, 소멸기의 강우는 남조세균의 소멸을 가속화하는 것으로 해석되었다. 수화기에는 강우의 양이 많을 경우에는 수화 발달을 저해하였으나, 적을 경우에는 그 영향력이 낮았다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제61권3호
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• pp.84-89
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• 2018

Purpose: Timely antibiotic therapy in selected cases of diarrhea associated with bacterial infections can reduce the duration and severity of illness and prevent complications. The availability of a predictive index before identification of causative bacteria would aid in the choice of a therapeutic agent. Methods: The study included patients admitted to the pediatrics unit at Konyang University Hospital for acute inflammatory diarrhea from August 1, 2015 to July 31, 2016 who underwent multiplex polymerase chain reaction testing. Of 248 patients, 83 had positive results. The clinical symptoms and blood test results were examined in 61 patients with Campylobacter spp. (25 patients), Salmonella spp. (18 patients), and Clostridium perfringens (18 patients) infections. The mean age of the 61 patients (male:femal=31:30) was $84.0{\pm}54.8months$, and the mean hospital stay was $4.6{\pm}1.7days$. Results: There were no statistical differences in sex, age, clinical symptoms, or signs. Patients with Campylobacter infection were significantly older (P=0.00). C-reactive protein (CRP) levels in patients with Campylobacter infection were higher than those in the other 2 groups, at $9.6{\pm}6.1mg/dL$. The results of receiver-operating characteristic curve analysis showed that the cutoff age was ${\geq}103.5months$ (sensitivity, 72%; specificity, 86%) and the CRP cutoff level was ${\geq}4.55mg/dL$ (sensitivity, 80%; specificity, 69%). Conclusion: Age (${\geq}103.5months$) and higher CRP level (${\geq}4.55mg/dL$) were good predictors of Campylobacter enterocolitis. If neither criterion was met, Campylobacter enterocolitis was unlikely (negative predictive value 97.2%). When both criteria were met, Campylobacter enterocolitis was highly likely.