• 제목/요약/키워드: SHANNON`S DIVERSITY

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울릉도 성인봉 원시림의 산림군집구조 (Vegetation Structure of the Songinbong Virgin Forest(Natural Monument) in Ullungdo, Korea)

  • 한봉호;김동완;조현서
    • 한국환경생태학회지
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    • 제12권2호
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    • pp.138-146
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    • 1998
  • 울릉도 성인봉 원시림의 식생구조를 밝히기 위해 400$m^2$(20m$\times$20m)의 조사구 10개를 설치하였다. 성인봉원시림은 우산고로쇠, 너도밤나무가 우점종이었으며 너도밤나무군집. 우산고로쇠-너도밤나무군집. 우산고로쇠군집으로 나누어졌다. 울릉도의 지리적 입지와 식생 특성상 각 군집의 Shannon 종다양도는 0.5150~0.8437로 낮은 편이었다. 상대우점치 분석, 흉고직경급별 분포 분석 등 군집구조 분석 결과, 성인봉 원시림은 성숙한 산림으로 현 상태를 오랜 기간 동안 지속적으로 유지할 것으로 판단되었다. 수목 생장유형 분석 결과, 과거 너도 밤나무림이 우점하던 성인봉 원시림에서 교란에 의해 우산고로쇠의 세력이 확대된 것으로 추정되었다.

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순천만에 자생하는 염생식물의 뿌리로부터 분리된 내생진균의 유전적 다양성 (Genetic Diversity of Endophytic Fungi Isolated from the Roots of Halophytes Naturally Growing in Suncheon Bay)

  • 서영교;김미애;유영현;윤혁준;우주리;이경민;김종국
    • 한국균학회지
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    • 제40권1호
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    • pp.7-10
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    • 2012
  • 순천만에 자생하는 2종의 염생식물의 뿌리로부터 내생 진균을 분리하였다. 사용 되어진 염생식물은 칠면초와 천일사초이며, 스트렙토마이신이 포함된 최소배지를 사용하여 내생진균을 배양한 후 순수 분리하였다. 분리된 15 내 생진균 균주 rDNA의 ITS 영역의 염기서열을 분석한 결과 칠면초에서 5속, 천일사초에서 7속의 내생진균이 확인되었다. 그리고 Shannon's diversity index(H')를 이용하여 칠면초와 천일사초로부터 분리된 내생진균들의 종 다양성은 각각 1.561과 1.889로 확인되었으며 유연관계를 확인하기 위하여 계통분석을 수행하였다. 순천만 자생식물인 칠면초와 천일사초의 내생진균에서 자낭균문 Pezizomycotina 아문이 많이 분포하고 있음을 알 수 있었으며, Pezizomycotina 아문 중에서도 Sordariomycetes 강, Dothideomycetes 강, Eurotiomycetes 강에 속하는 내생진균이 칠면초와 천일사초에 모두 분포는 것을 확인하였다.

ISSR 표지자를 이용한 느릅나무 자연집단의 유전변이 분석 (Population Genetic Variation of Ulmus davidiana var. japonica in South Korea Based on ISSR Markers)

  • 안지영;홍경낙;이제완;양병훈
    • 한국산림과학회지
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    • 제102권4호
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    • pp.560-565
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    • 2013
  • 국내의 느릅나무(Ulmus davidiana var. japonica) 집단에 대한 유전구조와 유전다양성을 분석하였다. 느릅나무 7개 자연집단, 171개체에 대하여 7개 ISSR 표지자를 이용하여 총45개의 다형적 증폭산물을 확인하였다. 유효대립인자와 다형적 유전자좌 비율의 평균값은 1.5개와 89%이었다. Shannon의 다양성 지수(I)가 0.435, 빈도주의 방법에 의한 이형접합도 기대치($H_e$)는 0.289, 베이즈 추정에 의한 이형접합도 기대치(hs)가 0.323으로 나타났다. AMOVA 분석에서 느릅나무 집단의 유전변이 중 4.2%가 집단간 차이(${\Phi}_{ST}=0.042$)에 기인하였으며, 95.8%를 집단내 개체들이 보유하고 있었다. 베이즈 추정에 의한 집단간 유전분화율(${\theta}^{II}$)은 0.043으로 나타났다. 국내 느릅나무 집단의 유전다양성은 다른 느릅나무속 수종과 유사한 수준에 해당하였으나, 집단간 유전분화 정도는 매우 낮았다. 베이즈 근사추정에서 집단별 고정지수(평균 $PS-F_{IS}=0.822$)나 집단 특이적 유전분화율(평균 $PS-F_{ST}=0.101$)에서 유의할 만한 차이를 보이는 집단은 없었다. 군집분석과 주성분분석에서 7개의 집단들을 3개 군집으로 나눌 수 있었으나, 두 방법의 군집 양상은 일치하지 않았다. 또한 베이즈 군집분석에서 집단간 유연관계와 지리적 분포의 상관성을 확인할 수 없었다.

설악산 대청봉 눈잣나무(Pinus pumila (Pall.) Regel) 집단의 유전다양성과 공간적 유전구조 (Genetic Diversity and Spatial Genetic Structure of Dwarf Stone Pine in Daecheongbong Area, Mt. Seorak)

  • 송정호;임효인;홍경낙;장경환;홍용표
    • 한국자원식물학회지
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    • 제25권4호
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    • pp.407-415
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    • 2012
  • 눈잣나무는 동북아시아가 주 분포지로 남한에서는 설악산 고산지역에만 제한적으로 분포한다. 본 연구는 설악산 눈잣나무 집단의 분포형태와 특성, 유전다양성 및 공간분포에 따른 유전구조를 파악하였다. 선발된 9개 I-SSR primer에서 총 78개 I-SSR 증폭산물을 얻었으며, 30개의 단형성 증폭산물을 제외한 48개의 증폭산물을 분석에 이용하였다. 조사구(40 m ${\times}$ 70 m)에는 눈잣나무 65개체가 자생하고 있었으며, 채집한 눈잣나무의 위치자료를 바탕으로 군집지수를 계산한 결과 약하게 집중분포(Aggregation Index = 0.871)하고 있음을 확인하였다. 모든 개체에 대하여 I-SSR 유전자형을 비교한 결과, 65개체 중 유전자형이 서로 다른 40개의 genet이 식별되었다. 유전자형 비율(G/N)은 61.5%, 유전자형 다양성(D)은 0.977, 유전자형 균등도(E)는 0.909로 각각 나타났다. Shannon의 다양성지수(I = 0.567)는 적은 개체수와 제한적 분포에도 불구하고 다른 수종들에 비해 비교적 높은 유전다양성을 나타났다. 공간적 자기상관 분석을 실시한 결과 조사지역 내의 눈잣나무 집단은 12 m 이내에서 유전적으로 유사한 군락구조를 갖고 있는 것으로 나타났다. Mantel 검정 결과 유전적 거리와 지리적 거리간에 낮은 상관관계를 나타내 눈잣나무 집단이 초기에 여러 개의 모수에서 형성된 것으로 추정되었다. 본 연구결과 설악산 눈잣나무 집단의 현지외 유전자 보존을 위한 표본추출 전략은 최소 12 m 이상의 거리를 두는 것이 효율적인 것으로 나타났다.

오대산 물황철나무(Populus koreana) 집단의 유전다양성 및 공간적 유전구조 분석 (Genetic Diversity and Spatial Genetic Structure of Populus koreana Population in Mt. Odae, Korea)

  • 신수경;송정호;임효인;장경환;홍경낙;이제완
    • 한국산림과학회지
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    • 제103권1호
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    • pp.59-64
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    • 2014
  • 본 연구에서는 물황철나무(Populus koreana Rehder) 집단을 대상으로 I-SSR 표지자를 이용해 유전다양성과 유전적 공간구조를 분석하였다. 물황철나무는 중국, 러시아 극동지역과 북한의 고산 계곡부 등에 서식하는 낙엽활엽 교목이다. 물황철나무는 남한에서 강원도 일대에 제한적으로 분포한다. 특히 오대산 집단은 물황철나무의 남방한계지로서 유전자원보존의 중요성이 강조된다. 8개의 I-SSR primer로 유전다양성을 추정한 결과, Shannon의 다양성 지수(I)는 0.230, 이형접합도의 기대치(He)는 0.151로 유사한 생활사를 갖는 타 수종에 비해 유전다양성이 매우 낮게 나타났다. 유전적 군락을 확인하기 위해 공간적 자기상관성 분석을 수행한 결과, 조사 지역 내의 물황철나무 집단은 400 m 이내에서 유전적으로 유사한 군락구조를 갖고 있는 것으로 나타났다. 물황철나무 집단의 현지외 유전자 보존을 위한 표본추출 시, 개체 간 거리를 400 m 이상으로 두는 것이 효율적일 것으로 판단된다.

The Classification of Forest Communities by Cluster Analysis in Mt. Seokbyung Experimental Forest of Gangwon-Do

  • Chung, Sang-Hoon;Kim, Ji-Hong
    • 한국산림과학회지
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    • 제99권5호
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    • pp.736-743
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    • 2010
  • This study examined the ecological attributes of classified forest community by cluster analysis in the mixed forest of Mt. Seokbyung Experimental Forest of Gangwon-Do. The vegetation data were collected in randomly established 51 sample plots (2.04 ha) and analysis adopted the cluster analysis, importance value index, and Shannon's diversity index. Main results were as follows; 1) the study area was classified into 4 clusters (A, B, C and D). 2) The cluster A was dominated by Pinus densiflora with an importance value of 71.6%. The most dominant species in the cluster B and cluster C were Larix leptolepis (57.1%) and Quercus mongolica (40.2%), respectively. Finally, The cluster D was dominated by P. densiflora (30.6%) and Q. mongolica (31.0%) with the mixed forest. 3) In the P. densiflora community (cluster A), distribution of DBH class showed a reverse J-shaped curve. In the L. leptolepis community (cluster B), individuals of dominant species had the bell-shaped distribution. Oak species indicated uniform distribution of DBH class (under 25 cm) in the mixed P. densiflora - Q. mongolica community (cluster D). 4) The species diversity index of the communities in descending order were: Pinus densiflora - Q. mongolica community > Larix leptolepis community > Pinus densiflora community > Quercus mongolica community.

ISSR을 이용한 고추나물 집단의 유전적 다양성과 계통학적 연구

  • 허홍욱;허만규;강동호
    • 생명과학회지
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    • 제17권6호통권86호
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    • pp.805-810
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    • 2007
  • Inter simple sequence repeat (ISSR) markers were performed in order to analyse the phylogenetic relationships of eight Hypericum electum populations in Korea. The six primers were produced 37 reproducible ISSR bands. Analysis of ISSR from individual plants of Korean H. erectum resulted in 22 polymorphic bands with 59.5%. Across populations, the mean number of alleles per locus was 1.348 and Shannon's information index was 0.203.Population Mt. Gyeryong had the highest expected genetic diversity (0.175) among all populations. When species were grouped by eight populations, within group diversity was 0.140 (Hs), while among group diversity was 0.472 (G$_{ST}$) on a per locus basis. The estimated gene flow (Nm) for H. erectum was very low (0.561). It is suggested that reproductive isolation by the isolation of geographical distance among H. electum populations and genetic drift may have played roles in shaping the population structure of this species. In phonetic tree, all populations were well separated from each other. Thus, ISSR markers are very effective in classifying natural population levels of genus Hypericum in Korea.

Physical Properties of Soils in Relation to Forest Composition in Moist Temperate Valley Slopes of the Central Western Himalaya

  • Sharma, C.M.;Gairola, Sumeet;Ghildiyal, S.K.;Suyal, Sarvesh
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제26권2호
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    • pp.117-129
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    • 2010
  • The present study was undertaken in moist temperate forest of Mandal-Chopta area in the Garhwal region of Uttarakhand, India. The aim of the present study was to assess the physical properties of soils in relation to the forest structure and composition. Twelve forest types according to the altitude, slope aspect and species compositions were selected for the study. Physical properties of soil i.e., soil colour, soil texture (per cent of sand, silt and clay), moisture content, water holding capacity, porosity, bulk density (gm/$cm^3$) and void ratio were analyzed for three different depths viz., (i) 'upper' (0-10 cm), (ii) 'middle' (11-30 cm) and (iii) 'lower' (31-60 cm) in all the selected forest types. Phytosociological and diversity parameters viz. total basal cover ($Gha^{-1}$), stem density ($Nha^{-1}$), tree species richness, Simpson concentration of dominance and Shannon-Wiener diversity index were also calculated for each forest type. This study also provides the comparisons between the results of physical analysis of the present study with numerous other previous studies in the temperate Himalayan region of the Uttarakhand.

수학적 모형을 이용한 저서성 대형무척추동물 군집지수-조사면적 관계 해석 (Analysis on the Relationship between Biological Indices and Survey Area of Benthic Macroinvertebrates Using Mathematical Model)

  • 공동수;김아름
    • 한국물환경학회지
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    • 제31권6호
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    • pp.610-618
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    • 2015
  • This study was conducted to find out the influence of sample size (accumulated survey areas) on the seven biological indices of benthic macroinvertebrates. BMI, the index similar to Zeilika-Marvan’s saprobic index, tended to be independent on the variations of sample size. The other indices (Shannon-Weaver’s diversity, Margalef’s richness, Menhinick’s richness, Pielou’s evenness, and Lenat’s EPT index) showed the considerable variations along with the increase of sample size and environmental conditions. To get the appropriate index values, it should be sampled at least 6 replicates more based on 30×30cm Surber sampler. In addition, the habitat heterogeneity index of benthic macroinvertebrates suggested in this study, it will be able to be used for evaluating the heterogeneity of habitats.

능동산의 양사면에서 식물 군락과 종 분포 (Plant Community and Species Distribution In Both Slopes of the Mt. Neungdong)

  • 허만규
    • 생명과학회지
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    • 제19권6호
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    • pp.693-697
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    • 2009
  • 본 조사는 능동산의 산림지 2곳에 대한 목본류의 다양성 양상을 조사하기 위해 12 plot $(100{\times}100 m)$를 설정하였다. 흉고직경 10 cm 이상의 목본류 2,157 그루를 동정한 결과 총 35과 135종이었다. 최소 유의성 차이(LSD)에서 지역 A (울주군 석남사 방향)가 지역 B (밀양시 얼음골 방향)보다 높았다. Shannon-Wiener의 다양성 지수에서 지역 A는 1.822, 지역 B는 2.118로 두 지역간 유의한 차이가 있었다(F=4.12, p<0.05). 곰솔-갈참나무군락이 두 지역에서 우점 하였다. 그러나 지역 A의 중간 고도는 소나무가 우점인 반면 지역 B의 중간 고도부위는 참나무속 식물군락과 서어나무군락이 우점 하였다. 공간 분포 분석에서 능동산의 동서지역의 식물상은 서로 이질적이며 미세기후와 패치(patchy)구조를 나타내었다.