The genomes of Arabidopsis and rice have been fully sequenced. Genomic sequencing provides global information about genome structure and organization. A comprehensive research account of our recent studies conducted on genome painting, comparative genomics and genome fusion is provided in order to project the prospects of plant cytogenetic research in post-genomics era. Genome analysis by GISH using genome painting is demonstrated as an excellent means suitable for visualization of a whole genome, since total genomic DNA representing the overall molecular composition of the genome is used as a probe. FISH on extended DNA fibers has been developed for high-resolution FISH and has contributed to determining the copy number and order of genes. We have also mapped a number of genes involving starch synthesis on wheat chromosomes by FISH and compared the position of these genes on linkage map of rice. Macro synteny between wheat and rice can be observed by comparing the location of these genes in spite of the fact that the size of DNA per chromosome differs by 20 fold in two. Moreover, to approach our goal towards making bread and udon noodles from rice flour in future by incorporating bread making and the noodle qualifies in rice, we have been successful in introducing large genomic DNA fragments containing agronomically important genes of wheat into a rice by successive introduction of large insert BAC clones, there by expanding genetic variability in rice. We call this method genome fusion.
Several plant and microbial genes that could confer disease resistance in transgenic rice plants are being cloned and characterized. We are currently constructing transgenic rice lines that overexpress the gene products, such as a galactinol synthase, a defensin, and a bacterial ACC deaminase. Subtractive hybridization of a rice cDNA library constructed from the Xanthomonas oryzae-infected ice leaves resulted in isolation of many inducible cDNA clones including a elongation factor EF2, a oryzain alpha, a catalase, a aldehyde dehydrogenase, a S-adenosylmethionine synthetase, a caffeic acid O-methyltransferase, a glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, a light-regulated protein, nKY transcription factors, and a nucleotide diphosphate kinase. Some genes among those may be useful genetic sources for construction of disease resistant transgenic rice. Full lengths of the rice OsFIERG and a rice oryzain genomic clones were cloned, and serial deletion fragments of the promoter regions of these genes were fused with GUS reporter gene in pCAMBIA1201, respectively. Promoter activities of these constructs will be examined upon various stresses and Pathogen infections to obtain the pathogen specific inducible-promoter. This work was supported by a grant from BioGreen 21 Program, Rural Development Administration, Republic of Korea.
2005년은 전년에 비해 기온이 낮았고 강수량이 적었다. 벼 흰잎마름병, 세균성벼알마름병, 벼 깨씨무늬병, 벼 이삭도열병, 배나무 겹무늬병 등이 2004년에 비해 증가하였다. 특히 벼 깨씨무늬병은 전년에 비해 4배 이상 병 발생이 증가하였다. 벼 이삭도열병이 전년 0.7%에서 2005년 2%로 증가된 것은 출수기 동안 평균기온은 높았고 강수일수, 강수량 및 습도가 높아 잎도열병균이 이삭으로의 전파를 촉진한 것으로 추정되었다. 기타 조사된 병들은 전년에 비해 감소 혹은 유사한 수준이었다. 벼 잎도열병, 시설참외 시들음증상, 흰가루병 및 노균병은 전년에 비해 크게 감소되었다.
포장에서 도열병에 대하여 저항성이 다른 6개의 벼 품종을 일정한 환경조건에서 재배하여 벼 잎에 함유되어 있는 탄수화물, 아미노산 및 페놀화합물 함량과 식물의 여러 발육시기 및 벼 잎의 나이가 어떠한 관계가 있는지 연구하였다. 벼가 발육하는 동안 벼 잎에 함유되어 있는 탄수화물, 총 아미노산 및 페놀 화합물의 함량에 있어서 감수성 품종과 성체식물저항성 품종간에 유의차는 없었다. 단지 성체식물저항성 품종인 도봉만이 식물이 발육하는 동안 다른 품종에 비해 inositol함량이 가장 적었다. sucrose, inositol, glucose 및 fructose 함량은 모든 품종에서 5엽기보다 8엽기에서 증가하였으나 12엽기에서는 약간 감소하였다. 반면에 총 아미노산과 페놀화합물은 식물이 발육하는 동안 점차로 감소하였다. 건전한 5엽이 노쇠함에 따라 가용성 아미노산과 페놀화합물의 함량은 점차 증가하였으나 품종간의 품종간의 유의차는 없었다. 특히 도봉품종의 노쇠한 5엽에서 페놀화합물이 가장 높았다. 벼가 성숙하여 감에 따라 또한 노쇠한 벼 잎에서 도열병에 대하여 저항성이 증가되는 것은 아마도 도열병의 발생에 상이하게 작용하는 벼의 발육과 벼 잎이 노쇠하는 동안에 일어나는 생리적인 변화에서 기인하는 상이한 현상일지도 모른다.
The study was carried out to determine the changes of growth characteristics, anthocyanidin, and brown rice yield grown at coast and inland areas apart from the east coastline of Gyeongsangbuk-do province. Number of spikelets per panicle was much more increased in inland area. Regional difference in number of spikelets per panicle was observed in Jeongjinju cultivar. Among these red rice cultivars, the highest brown rice yield was Jeongjinju rice cultivar having 702 kg in inland area and 692 ㎏ in coast area, respectively. Anthocyanidin content ranged 524 to $610{\mu}g/g$ dry weight basis. Cyanidin content was 11.4 to 14.0 times higher than that of delphinidin under coast and inland area. Anthocyanidin content was higher in rice cultivar grown at coast area. Highest head brown rice rate was only observed in Geonganghongmi to 95.2 at coast area and 95.4 inland area. In considering brown rice yield and pigment content, Hongjinju rice cultivar was recommended in optimal pigment rice cultivar in eastern coast of Gyeongsangbuk-do Province.
Since the major important factors limiting plant growth and crop productivity are environmental stresses, of which low temperature is the most serious. It has been well known that many physiological processes are alterant in response to the environmental stress. With regard to the relationship between plant hormones and the regulation of chilling tolerance in rice seedlings, the major physiological roles of plant hormones: abscisic acid, ethylene and polyamines are evaluated and discussed in this paper. Rice seedlings were grown in culture solution to examine the effect of such plant hormones on physiological characters related to chilling tolerance and also to compare the different responses among tested cultivars. Intact seedlings about 14 day-old were chilled at conditions of 5$^{\circ}C$ and 80% relative humidity for various period. Cis-(+)-ABA content was measured by the indirect ELISA technique. Polyamine content and ethylene production in leaves were determined by means of HPLC and GC respectively. Chilling damage of seedlings was evaluated by electrolyte leakage, TTC viability assay or servival test. Our experiment results described here demonstrated the physiological functions of ABA, ethylene, and polyamines related to the regulation of chilling tolerance in rice seedlings. Levels of cis-(+)-ABA in leaves or xylem sap of rice seedlings increased rapidly in response to 5$^{\circ}C$ treatment. The tolerant cultivars had significant higher level of endogenous ABA than the sensitive ones. The ($\pm$)-ABA pretreatment for 48 h increased the chilling tolerance of the sensitive indica cultivar. One possible function of abscisic acid is the adjustment of plants to avoid chilling-induced water stress. Accumulation of proline and other compatible solutes is assumed to be another factor in the prevention of chilling injuies by abscisic acid. In addition, the expression of ABA-responsive gene is reported in some plants and may be involving in the acclimation to low temperature. Ethylene and its immediate precusor, 1-amincyclopropane-1-carboxylic acid(ACC) increased significantly after 5$^{\circ}C$ treatment. The activity of ACC synthase which converts S-adenosylmethionine (SAM) to ACC enhanced earlier than the increase of ethylene and ACC. Low temperature increased ACC synthase activity, whereas prolonged chilling treatment damaged the conversion of ACC to ethylene. It was shown that application of Ethphon was beneficial to recovering from chilling injury in rice seedlings. However, the physiological functions of chilling-induced ethylene are still unclear. Polyamines are thought to be a potential plant hormone and may be involving in the regulation of chilling response. Results indicated that chilling treatment induced a remarkable increase of polyamines, especially putrescine content in rice seedlings. The relative higher putrescine content was found in chilling-tolerant cultivar and the maximal level of enhanced putrescine in shoot of chilling cultivar(TNG. 67) was about 8 folds of controls at two days after chilling. The accumulation of polyamines may protect membrane structure or buffer ionic imbalance from chilling damage. Stress physiology is a rapidly expanding field. Plant growth regulators that improve tolerance to low temperature may affect stress protein production. The molecular or gene approaches will help us to elucidate the functions of plant hormones related to the regulation of chilling tolerance in plants in the near future.
Sang-Kyu Lee;Soo-Jung Lee;Na-Yeon Ryoo;Jang-Wook Lee;Seok-Yoon Yoon;Woon-Chul Shin;Se-Ho Ko;Deok Chun Yang;Youn-Hyung Lee
한국자원식물학회:학술대회논문집
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한국자원식물학회 2003년도 춘계 학술발표대회
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pp.126-126
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2003
Sucrose-phosphate synthase (SPS) is a key regulatory enzyme in sucrose synthesis. To investigate the role of SPS in carbon partitioning, we produced transgenic rice plants overexpressing a cyanobacterial SPS from Synechocystis sp. PCC 6803. The gene was expressed under the control of the maize Ubil promoter in transgenic plants. Southern and Northern blot analyses confirmed the integration and the expression of the transgene in four transgenic rice lines. All of the four transgenic! lines analyzed showed abnormal vegetative and reproductive developments. Analysis of SPS activities and primary metabolites in the transgenic rice plants will be presented.
Application of herbicide for rice cropping is inevitable but notorious for its side effect of environmental pollution. Precision fanning will be one of important tools for the least input and sustainable fanning and could be achieved by implementation of the variable rating technology. If a device to detect weeds in rice field is available, herbicide could be applied only to the places where it is needed by the manner of the variable rating technology. The study was carried out to develop an algorithm of image processing to detect weeds in rice field using a machine vision system of multi-spectral digital images. A series of multi-spectral rice field picture of 560, 680 and 800 nm of center wavelengths were acquired from the 27th day to the 39th day after transplanting in the ineffective tillering stage of a rice growing period. A discrimination model to distinguish pixels of weeds from those of rice plant and weed image was developed. The model was proved as having accuracies of 83.6% and 58.9% for identifying the rice plant and the weed, respectively. The model was used in the algorithm to differentiate weed images from mingled images of rice plant and weed in a frame of rice field picture. The developed algorithm was tested with the acquired rice field pictures and resulted that 82.7%, 11.9% and 5.4% of weeds in the pictures were noted as the correctly detected, the undetected and the misclassified as rice, respectively, and 81.9% and 18.0% of rice plants in the pictures were marked as the correctly detected and the misclassified as weed, respectively.
Rice is a main crop and rice field is the most important farmland in Korea. This study was conducted to propose the methodology assessing impact and vulnerability on rice production by climate change at the regional and national level in Korea. We evaluated a vulnerability of rice paddy according to the outbreak of a main disease and pest of a rice plant. As results, Jeju-do, Gyeongsangnam-do, and Jeollanam-do were more vulnerable area than others. In contrast, the southern central region including Gyeonggi-do was less vulnerable than others. The vulnerable index was significantly higher in 2050s (0.5589) than in present (0.3500). This result showed that the vulnerable to the disease and pest enlarge in the future. The adaptive capacity highly contributed to the vulnerability assessment index. The daily maximum temperature of June and the daily average temperature from May to August also contributed the climate exposure index. The area of occurring sheath blight, rice leaf blast and striped rice borer was related to the system sensitivity index. The ability of water supply (readjustment area of arable land per paddy field area) and rice production technique (rice yield per hectare) were the highly contributed variables to the adaption capacity index.
Kim, Byung-Ryun;Han, Seong-Sook;Hwan, Roh-Jae;Park, Seong-Ho;Ryu, Jae-Dang
한국식물병리학회:학술대회논문집
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한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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pp.64.2-64
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2003
Twenty-seven monogenic rice lines harboring major resistant gene for blast were screened to analyze their resistance spectrum to Korean blast fungus population using 190 isolates collected from 1985 to 2002. Especially, the monogenic line containing Pi-9 gene was screened using 320 isolates. Based on the monogenic lines-blast isolate interactions, the 27 rice lines were classified into 9 groups. The chinese rice cultivar LTH showed susceptible to all the tested isolates. Those lines IRBLz-Fu, ERBL5-M and IRBL9-W harboring Pi-z, Pi-5, and Pi-9, respectively showed broader spectrum of resistance than those rice lines having Pi-19, Pi-7 etc. Interestingly, the Pi-9 gene(IRBL9-W) showed resistance to most isolates collected before 2000, but it showed susceptible reactions to 5% and 20% of blast fungus population in 2001 and 2002, respectively. Population of virulent isolates to Pi-ta, Pi-b, and Pi-7 also were increased in 2002 compared to those before 2000.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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