• 제목/요약/키워드: Restricted Maximum Likelihood (REML)

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Genetic and Phenotypic Parameter Estimates of Body Weight at Different Ages and Yearling Fleece Weight in Markhoz Goats

  • Rashidi, A.;Sheikahmadi, M.;Rostamzadeh, J.;Shrestha, J.N.B.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제21권10호
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    • pp.1395-1403
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    • 2008
  • The objective of the present study was to estimate genetic parameters for economic traits in Markhoz goats. Data collected from 1993 to 2006 by the Markhoz goat Performance Testing Station in Sanandaj, Iran, were analyzed. The traits recorded as body weight performance at birth (BW), weaning (WW), six month (6MW), nine month (9MW), yearling (YW) and yearling fleece weight (YFW) were investigated. Least square analyses were used for estimation of environmental effects. Genetic parameters were estimated with single and multi trait analysis using restricted maximum likelihood (REML) procedures, under animal models. By ignoring or including maternal additive genetic effects and maternal permanent environmental effects, five different models were fitted for each trait. The effects of sex, type of birth, age of dam and year of birth on the all body weights were significant (p<0.01), but had no effects on YFW except year of birth. Age of kids had significant influences on WW and 6MW (p<0.01). A log likelihood ratio test was carried out for choosing the most suitable model for each trait. Total heritability estimates for YFW and growth traits varied from 0.16 for YFW and WW to 0.41 for YW. For all traits, maternal heritability was lower than direct heritability, ranging from 0.06 for BW to 0.01 for 6MW and 9MW. The magnitude of $c^2$ was more substantial for BW than the others, and relative importance was reduced from 0.12 for BW to 0.04 for 9MW. The direct additive genetic correlations estimates were positive and varied from 0.21 between BW-YW to 0.96 between WW-6MW. Direct additive genetic correlations between YFW and body weight traits were positive and ranged from 0.14 between BW-YFW to 0.67 between 6MW-YFW. For all traits, the corresponding estimates for phenotypic correlation were positive and lower than genetic correlations. The maternal additive genetic correlations between various traits were varied and ranged from -0.19 between 9MW-YFW to 0.96 between 6MW-9MW. The estimates of the maternal permanent environmental correlations between various traits were positive and ranged from 0.33 between WW-YFW to 0.93 between WW-6MW. Also, the environmental correlations between various traits ranged from 0.01 between BW-YFW and WW-YFW to 0.70 between 9MW-YW. Estimates of genetic parameters for various traits in this study confirm that selection should be applied on WW for genetic improvement in Markhoz goats.

Genetic Parameter Estimates of Carcass Traits under National Scale Breeding Scheme for Beef Cattle

  • Do, ChangHee;Park, ByungHo;Kim, SiDong;Choi, TaeJung;Yang, BohSuk;Park, SuBong;Song, HyungJun
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제29권8호
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    • pp.1083-1094
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    • 2016
  • Carcass and price traits of 72,969 Hanwoo cows, bulls and steers aged 16 to 80 months at slaughter collected from 2002 to 2013 at 75 beef packing plants in Korea were analyzed to determine heritability, correlation and breeding value using the Multi-Trait restricted maximum likelihood (REML) animal model procedure. The traits included carcass measurements, scores and grades at 24 h postmortem and bid prices at auction. Relatively high heritability was found for maturity ($0.41{\pm}0.031$), while moderate heritability estimates were obtained for backfat thickness ($0.20{\pm}0.018$), longissimus muscle (LM) area ($0.23{\pm}0.020$), carcass weight ($0.28{\pm}0.019$), yield index ($0.20{\pm}0.018$), yield grade ($0.16{\pm}0.017$), marbling ($0.28{\pm}0.021$), texture ($0.14{\pm}0.016$), quality grade ($0.26{\pm}0.016$) and price/kg ($0.24{\pm}0.025$). Relatively low heritability estimates were observed for meat color ($0.06{\pm}0.013$) and fat color ($0.06{\pm}0.012$). Heritability estimates for most traits were lower than those in the literature. Genetic correlations of carcass measurements with characteristic scores or quality grade of carcass ranged from -0.27 to +0.21. Genetic correlations of yield grade with backfat thickness, LM area and carcass weight were 0.91, -0.43, and -0.09, respectively. Genetic correlations of quality grade with scores of marbling, meat color, fat color and texture were -0.99, 0.48, 0.47, and 0.98, respectively. Genetic correlations of price/kg with LM area, carcass weight, marbling, meat color, texture and maturity were 0.57, 0.64, 0.76, -0.41, -0.79, and -0.42, respectively. Genetic correlations of carcass price with LM area, carcass weight, marbling and texture were 0.61, 0.57, 0.64, and -0.73, respectively, with standard errors ranging from ${\pm}0.047$ to ${\pm}0.058$. The mean carcass weight breeding values increased by more than 8 kg, whereas the mean marbling scores decreased by approximately 0.2 from 2000 through 2009. Overall, the results suggest that genetic improvement of productivity and carcass quality could be obtained under the national scale breeding scheme of Korea for Hanwoo and that continuous efforts to improve the breeding scheme should be made to increase genetic progress.

한국 재래 돼지 근교 계통 돈의 산육 형질에 대한 유전모수 및 표준 성장 곡선 추정에 관한 연구 (Study on Estimation of Genetic Parameters for the Meat Production Traits and the Standard Growth Curve in the Inbred Line of Korean Native Pig)

  • 김명직;조규호;전기준;김영화;박준철;정현정;김인철;권오섭;진현주;김진형;이학교
    • 한국수정란이식학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.143-147
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    • 2007
  • 본 연구는 재래 돼지의 산육 능력을 개량하기 위한 기초 자료를 제공하기 위하여 축산과학원에서 2001년부터 2006년까지 20 kg에 검정을 개시하고 70 kg에 검정을 종료하여 발육 능력을 조사한 546개의 재래 돼지 산육 능력 검정 자료를 활용하여 유전모수를 추정하였으며, 재래 돼지 사육 농가의 사양방법 개선을 위하여 2003년부터 2005년까지 조사된 재래 돼지성돈 및 검정돈 132두의 발육 단계별 체중 및 체위 조사 자료를 다중 회귀 분석하여 재래 돼지 발육 표준 자료를 제시하였다. 재래 돼지의 주요 산육 능력에 대한 유전력을 추정한 결과, 일당 증체량과 등지방 두께에서 중도의 유전력이 나타나는 것을 확인하였으며, 체중 및 체위에 대한 성장 곡선을 추정한 결과 11개월령 이후는 체장, 체고 및 흉폭의 변화가 거의 없는 것을 확인할 수 있었다. 이와 같은 결과를 통하여 본 연구에서 추정한 재래 돼지 산육 형질의 유전모수를 이용하여 육종가 추정과 후보돈 선발에 적용함으로써 유전적 개량을 증대시키고, 발육 단계별 체중 및 체위 표준 자료를 재래 돼지 능력향상 연구와 사육 방법 개선을 위한 기초 자료로 활용함으로써 재래 돼지의 산업화에 기여할 수 있을 것으로 기대된다.

한우 도체형질의 환경효과 및 유전모수의 추정 (Estimation of Environmental Effect and Genetic Parameters for The Carcass Traits in Hanwoo (Korean Cattle))

  • 문원곤;김병우;노승희;김효선;정대진;선두원;김경남;윤영탁;정진형;전진태;이정규
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제49권6호
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    • pp.689-698
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    • 2007
  • 2007년 한․미 FTA 협상 체결로 미국산 쇠고기 수입이 재개된 현재 육질과 가격면에서 우수한 수입육이 늘어나고 있는 상황에서 한우의 경쟁력강화를 위해 많은 노력이 이루어지고 있다. 한우개량농가는 송아지 생산량의 빠른 증가와 송아지 폐사율의 감소로 사육기술이 향상되어지고 있으며, 1993년 이후부터 한우 경쟁력강화를 위해 육질개량에 중점을 두고 거세를 통한 장기 비육으로 1등급이상의 출현율이 점차 증가하는 추세를 보이고 있다. 소비자의 식육패턴도 양적인 측면에서 질적인 측면으로 변화하고 있다. 고급육의 생산은 품종(Course 등, 1989), 성별, 연령(Hunsley 등, 1971) 등에 의하여 결정될 수가 있다. 한우 도체형질에 관한 연구는 국내에서도 최근 박과 박(2002)과 노 등(2004)이 연구 보고하였으나 이는 후대검정우와 후대축들의 도체형질에 관한 연구였으며, 일반 한우 사육농가의 도체형질에 관한 연구는 이루어 지지 않고 있다. 환경효과의 경우 대부분의 연구가 출생년도-계절, 출생지역의 효과를 추정하였으며, 도축년도, 도축계절, 도축지역에 관한 연구는 이루어 지지 않고 있다. 본 연구에서는 일반 한우사육농가에서 출하하여 도축한 축산물등급판정소의 등급판정결과를 이용하여 도축년도, 도축계절, 성, 도축지역이 도체형질에 어떠한 영향을 미치는지 추정하고, 도체형질에 대해 REML(Restricted Maximum Likelihood) 방법으로 유전력 및 유전모수를 추정하여 일반 한우사육농가에서 출하한 개체의 도체형질에 관해 알아봄으로써 후대검정우나 후대축이 아닌 우리나라 전체 도축우에 대한 기초자료를 제공하고자 한다.

개체모형에 의한 한우의 성장단계별 체중의 유전모수 추정 (Estimation of Genetic Parameters of Body Weight by Growth Periods for Hanwoo Using Animal Model)

  • 최재관;전기준;이창우;나기준;이채영;김종복
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제45권5호
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    • pp.667-678
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    • 2003
  • 본 연구는 축산기술연구소 대관령지소에서 1990년부터 2000년 사이에 조사된 체중 측정 자료 1,736개 기록을 이용하여 한우의 성장단계별 체중과 증체량의 유전적 특성을 파악하고 어미소의 산유능력과 송아지의 체중 및 성장률과의 유전적 관련성을 파악하기 위해 실시하였다. 연구에 필요한 유전(공)분산성분 추정은 제한최대우도법(dfREML)을 이용하여 실시하였는데 본 연구에서 얻어진 결과를 요약하면 다음과 같다. 1) 생시체중의 상가적 개체유전력 추정치는 개체유전효과만을 고려한 모델I로 분석했을때 전체집단에서 0.54, 암컷집단에서 0.52 그리고 수컷 집단에서 0.36으로 추정되었으며 개체유전효과와 영구환경효과를 고려한 모델II로 분석했을 때 전체집단에서 0.45, 암컷집단에서 0.41 그리고 수컷 집단에서 0.24로 추정되었다. 2) 3개월령 체중의 개체유전력은 전체집단이 0.30(모델I) 및 0.17(모델Ⅱ), 암컷이 0.10(모델I) 및 0.08(모델Ⅱ), 그리고 수컷이 0.13(모델I) 및 0.03(모델Ⅱ)이고, 전체 표현형 분산 중 영구환경효과 분산이 차지하는 비율은 전체집단이 0.13, 암컷이 0.08 그리고 수컷이 0.22로서 개체유전력 추정치는 암컷집단과 수컷집단간에 큰 차이가 없었다. 3) 4개월령(이유시) 체중의 경우 암컷과 수컷을 별도로 분리하여 추정했을 때의 유전력 추정치는 전체자료에서 추정한 유전력 추정치에 비해 작았는데, 모델I로 분석했을 때 전체집단에서는 0.47인 반면 암컷과 수컷 집단에서는 각각 0.33 및 0.28이었으며 모델II로 분석했을 때는 전체집단에서 0.38인 반면 암컷과 수컷 집단에서는 각각 0.21 및 0.21이었다. 4) 6개월령 체중은 비교적 중도의 유전력(0.36~0.20)을 보였으나, 12개월령부터 24개월령까지 체중에서는 낮은 유전력(0.13~0.05)을 보였다.

종돈의 주요 경제형질에 대한 유전모수 및 유전적 변화 추세 추정에 대한 연구 (Estimation of Genetic Parameters and Genetic Trends for Major Economic Traits in Swine)

  • 강현성;남기창;;김경태;이명섭;윤종택;서강석
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제54권2호
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    • pp.89-94
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    • 2012
  • 본 연구에서는 18,668두의 농장 검정된 종돈 자료를 이용하여 유전모수 및 육종가를 추정하였다. 2007년부터 5월부터 2011년 4월까지 영광 소재 N종돈장에서 검정된 Duroc, Berkshire, Landrace 및 Yorkshire종 18,668두에 대한 자료를 근거로 하여 돼지의 주요 경제형질인 90 kg 도달일령, 등지방두께 및 등심단면적에 대한 유전력, 유전상관, 표현형상관 및 육종가를 다형질 Animal model을 이용하여 추정하였다. 본 연구에서 추정된 Duroc종에 대한 90kg 도달일령, 등지방두께 및 등심단면적에 대한 유전력은 0.22, 0.62, 0.37로 추정되었으며 Berkshire종의 유전력은 0.52, 0.57 및 0.32로 나타났고 Landrace종의 각 형질의 유전력은 0.26, 0.51 및 0.23이었으며 Yorkshire종의 유전력은 0.29, 0.47 및 0.26을 나타내었다. 본 연구에서 추정된 Duroc의 주요 경제 형질간의 유전 상관 및 표현형 상관은 90 kg 도달일령과, 등지방두께, 등심단면적, 등지방와 등심단면적간에 각각 유전, 표현형상관 0.24, -0.25과 0.11, -0.21 그리고 -0.41 및 -0.19로 추정되었으며 Berkshire종 유전 상관 및 표현형 상관은 -0.01, -0.35 및 0.01, -0.28 그리고 등지방두께에 대한 등심단면적은 -0.68 및 -0.22를 나타내었다. Landrace종의 경우 유전 상관 및 표현형 상관이 90 kg 도달일령과, 등지방두께, 등심단면적, 등지방두께와 등심단면적간에 각각 유전, 표현형 상관 0.01,.-0.23과 0.03, -0.37 그리고 -0.17 및 -0.24로 추정 되었으며 Yorkshire종은 0.01, -0.23 및 0.03, -0.37 그리고 -0.17, -0.24로 추정 되었다. 연도별 유전적 개량 추세를 살펴보면 90 kg 도달일령의 경우 매년도달일령이 짧아지는 것을 나타냈으며 등지방두께의 경우 모든 품종에서 매년 두꺼워지는 것을 보였고 등심단면적은 각 품종이 매년 증감을 반복하는 것을 나타냈다.

종돈의 성장 및 체형 형질에 대한 유전력 및 유전모수 추정에 관한 연구 (Estimation of Heritability and Genetic Parameter for Growth and Body Traits of Pig)

  • 강현성;남기창;김경태;나종삼;서강석
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제54권2호
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    • pp.83-87
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    • 2012
  • 본 연구에서는 18,668두의 자가검정 및 입회검정된 돼지 자료를 이용하여 유전모수를 추정하였다. 2007년부터 2011년 4월까지 전라남도 영광 소재 N 종돈장에서 검정된 Duroc, Berkshire, Landrace 및 Yorkshire종 18,668두에 대한 자료를 근거로 하여 돼지의 주요 산육형질인 일당증체량, 체고 및 체장에 대한 유전력, 유전상관 및 표현형상관을 다형질 Animal model을 이용하여 추정하였다. 본 연구에서 추정된 Duroc종에 대한 일당증체량, 체고 및 체장에 대한 유전력은 0.22, 0.37, 0.4로 추정되었으며 Berkshire종의 유전력은 0.58, 0.34 및 0.48로 나타났고 Landrace종의 각 형질의 유전력은 0.26, 0.41 및 0.52이었으며 Yorkshire종의 유전력은 0.28, 0.39 및 0.43을 나타내었다. 본 연구에서 추정된Duroc의 주요 경제 형질간의 유전 상관 및 표현형 상관은 일당 증체량과, 체고, 체장, 체고와 체장간에 각각 유전, 표현형 상관 0.33, 0.47과 0.42, 0.48 그리고 0.57 및 0.41로 추정되었으며 Berkshire종 유전 상관 및 표현형 상관은 0.75, 0.70 및 0.53, 0.58 그리고 체고의 대한 체장은 0.69 및 0.57을 나타내었다. Landrace종의 경우 유전 상관 및 표현형 상관이 일당증체량과, 체고, 체장, 체고와 체장간에 각각 유전, 표현형 상관 0.17, 0.38과 0.34, 0.46 그리고 0.61 및 0.52로 추정 되었으며 Yorkshire종은 0.50, 0.53 및 0.47, 0.56 그리고 0.71, 0.59로 추정되었다.

요크셔종에 대한 경제형질의 유전모수 추정 (Estimation of Genetic Parameters for Economic Traits in Yorkshire)

  • 송광림;김병우;김시동;최진성;김명직;이정규
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제44권5호
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    • pp.499-506
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    • 2002
  • 본 연구는 1994년부터 2000년까지 축산기술연구소 종축개량부에서 사육된 Yorkshire종 돼지 2,111두의 자료를 근거로 하여 주요 경제형질인 일당증체량, 90kg 도달 일령, 등지방두께에 대한 유전력, 유전상관, 표현형상관을 추정하기 위하여 MTDFREML Package에서 Animal model를 이용하여 분석하였다. 본 연구에서 얻은 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 분석한 돼지의 주요 경제형질의 평균치는 등지방두께가 1.476 0.241cm, 일당증체량이 0.871 0.124kg, 90kg 도달 일령이 145.397 11.718일이었다. 2. 분석한 형질들의 유전력은 등지방두께가 0.55, 일당증체량이 0.55, 90kg 도달 일령이 0.56으로 전체적으로 고도의 유전력을 보였다. 3. 분석한 형질들의 유전상관은 일당증체량과 90kg 도달 일령에서는 -0.82, 일당증체량과 등지방두께 에서는 0.10, 90kg 도달 일령과 등지방두께 사이에서는 -0.25로 나타났다. 조사된 형질들의 표현형상관은 일당증체량과 90kg 도달 일령에서는 -0.77, 일당증체량과 등지방두께 에서는 0.02, 90kg 도달 일령과 등지방두께 사이에서는 -0.05로 나타났다. 등지방두께에 대한 일당증체량과 90kg 도달 일령사이의 표현형상관은 낮게 나타났지만 유전상관은 다소 높게 나타나 개량시 이점에 대하여 고려하여야 할 것이라 사료된다. 유전력에 있어서는 주요 경제형질 모두 고도의 유전력을 나타내어 적절한 선발 및 사양관리가 이루어진다면 Yorkshire종에 대한 유전적 개량량이 높을 것으로 사료된다.