• Journal of Veterinary Science
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• 제21권5호
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• pp.79.1-79.12
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• 2020

Background: Recently, the pork industry of Thailand faced an epidemic of highly virulent strains of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV), which spread throughout Southeast Asia, including the Lao People's Democratic Republic and Cambodia. Hence, the rapid and on-site screening of infected pigs on a farm is essential. Objectives: To develop the new aptamer as a biosensor for detection PRRSV which are rapid and on-site screening of infected pig. Methods: New aptamers against PRSSV were identified using the combined techniques of capillary electrophoresis, colorimetric assay by gold nanoparticles, and quartz crystal microbalance (QCM). Results: Thirty-six candidate aptamers of the PRRSV were identified from the systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX) by capillary electrophoresis. Only 8 out of 36 aptamers could bind to the PRSSV, as shown in a colorimetric assay. Of the 8 aptamers tested, only the 1F aptamer could bind specifically to the PRSSV when presented with the classical swine fever virus and a pseudo rabies virus. The QCM was used to confirm the specificity and sensitivity of the 1F aptamer with a detection limit of 1.87 × 10¹⁰ particles. Conclusions: SELEX screening of the aptamer equipped with capillary electrophoresis potentially revealed promising candidates for detecting the PRRSV. The 1F aptamer exhibited the highest specificity and selectivity against the PRRSV. These findings suggest that 1F is a promising aptamer for further developing a novel PRRSV rapid detection kit.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제14권7호
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• pp.3419-3424
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• 2013

B형간염표면 항원 및 항체(HBsAg와 anti-HBs)에 대한 검사 방법으로 화학발광면역검사법(CIA)을 포함한 면역검사법을 주로 사용하고 있으나 최근 간편한 면역크로마토그래피법(ICA)의 사용이 늘고 있는 추세이다. 본 연구에서는 CIA법을 이용한 정량검사법과 비교하여 신속검사인 ICA법의 민감도를 평가하고자 하였다. 대학병원에 간염검사를 의뢰한 검체 중 CIA법에서 양성 및 음성으로 나온 120 검체를 선정하여 ICA법으로 분석하였다. ICA법과 CIA법의 일치율은 항원 97%와 항체 90%로 나타났다. 항원검사의 ICA법 민감도, 특이도, 양성예측도, 음성예측도는 각각 97%, 100%, 100% 및 96.8%로 나타났으며, 항체검사는 각각 90%, 93.3%, 93.1% 및 90.3%로 나타났다. ICA법을 임상에서 사용 시 결과판독에 주의가 필요하며, 낮은 역가의 경우 검출되지 않는 제한점이 있으므로 예민도가 높은 다른 검사법을 이용하여 이중검사를 시행해야 할 것으로 사료된다.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제49권3호
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• pp.281-289
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• 2000

배경 : 결핵의 진단에 있어 결핵균 배양검사는 결핵의 확진 검사이지만 배양에 최소한 6-8주가 소요되어 진단 및 치료가 지연되는 단점이 있다. PCR 법은 신속하고 예민하게 결핵균을 검출할 수 있지만 위양성율과 위음성율이 높아 문제시 되고 있다. 최근에 개발된 LCR법과 PCR-Hybridization은 PCR 법 보다도 민감하게 결핵균을 검출할 수 있는 것으로 알려져 있다. 이에 저자들은 하상균 배양을 기준으로 in house PCR, LCR 및 PCR- Hybridization 각각의 임상적 유용성을 알아보고자 한다. 방법 : 1998년 8월에 결핵진단을 위해 세브란스 병원 임상 병리과에 의뢰된 75검체를 대상으로 AFB 도말 염색 검사, 결핵균 배양 검사(3% Ogawa 배지, 8주간), in house PCR, LCR(Abbott LCx kit) 및 PCR Hybridization을 시행하여 각각의 민간도와 특이도를 평가해보았다. 결과 : 항산균 배양법을 기준으로 판단할 때 in house PCR, LCR(Abbott LCx kit) 및 PCR-Hybridization의 민감도는 각각 40%, 80%, 100%였고 특이도는 98.6%, 94.3%, 94.3%였다. 결론 : LCR법과 PCR-Hybridization은 결핵균 검출에 있어 우수한 민감도와 특이도를 보여 결핵의 조기진단에 유용할 것으로 사료된다.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제25권4호
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• pp.376-387
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• 2010

식품으로부터 식중독세균을 검출하는 대부분의 전통적인 방법들은 분리하고자 하는 미생물에 적합한 선택배지에 의존할 수밖에 없다. 이러한 선택배지들은 높은 경제성에도 불구하고 오래 걸려 때를 놓치게 되는 소요 시간이 항상 걸림돌로 작용하고 있으며, 하나의 선택배지로 한의 균만을 선택적으로 분리해 내는 등의 단점이 있다. 이러한 단점을 최소화하기 위하여 IMS 등 면역학적 또는 분자생물학적 기법들을 접목시키고 있고, 증균에서 분리와 확인을 동시에 할 수 있는 package 형태의 제품들이 시판되고 있다. 또한 이러한 제품 중 일부는 국제표준기구로부터 인증을 받았고 대부분 chromogenic 기질을 함유한 선택배지들이 포함되어 있을 만큼 신뢰도가 높다고 할 수 있다. 그러나 선택배지 자체만은 이들 단점을 해결할 수 없어 항체를 활용한 신속, 간편하고 환경친화적인 ELISA법, 검출장비가 불필요하여 가장 신속, 간편하게 현장에서 사용하도록 기술을 향상시킨 paper-strip kit나 ELISA 분석 시 직면하는 시료의 matrix effect를 최소화할 수 있다는 장점을 지닌 형광면역분석법(fluoroimmunoassay)등 새로운 기술이 용도에 맞게 다양하게 개발되고 있다. 또한 동시진단 능력이 우수한 현장 진단형 시스템이 개발될 경우, 향후 신 시장 창출, 바이오칩 기술발전, 식중독균을 포함한 위해 미생물의 동시진단 및 역학조사 등에 지대한 기여를 할 것으로 판단된다. 식품에서 식품위해미생물 검출에 있어서 가장 이상적인 방법은 검출 과정이 간단하고 경제적이며 정확하여야 한다는 것이다. 또한 정량적 결과 산출이 가능하여야 하고, 자동화된 방법으로 전환이 가능하여야 산업에 적용될 수 있다는 것인데, 이러한 이상적인 검출방법은 현재까지 존재하지 않는다. 다만, 여러 방법들이 각각의 장점을 갖고 있을 뿐이다. 즉, 현실적 대안은 현재까지 개발된 각각의 방법을 목적과 대상에 따라 시의적절하게 병용 사용하여야 한다는 것이다.

• 한국재난정보학회 논문집
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• 제10권3호
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• pp.452-457
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• 2014

화학재난 발생시 현장대응 요원들은 사건 원인물질의 성상과 잔류오염 농도를 신속 정확하게 파악해야 한다. 또한 화학재난 현장에서의 적절한 대응절차 진행을 위해서는 화학물질의 성상과 오염농도 확인은 필수적이다. 이를 위해 현장에서 사용하는 각 장비의 특징을 알아보고자 한다. 현장대응장비는 모든 화학물질을 확인할 수 없으며, 각 장비별로 물질탐지에 제한적이다. 장비별 물질탐지 범위와 상호보완성을 고려해야 한다. 본 연구에서는 현장 활용장비인 간이탐지 킷과 검지관식 탐지장비, 전자식 탐지장비의 신속한 현장 활용을 위한 대응절차를 마련하여 현장대응에 도움을 주고자 한다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제21권1호
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• pp.100-108
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• 2011

A method for the rapid detection and quantification of Newcastle disease virus (NDV) produced in an animal cell culture-based production system was developed to enhance the speed of the NDV vaccine manufacturing process. A SYBR Green I-based real-time RT-PCR was designed with a conventional, inexpensive RT-PCR kit targeting the F gene of the NDV LaSota strain. The method developed in this study was validated for specificity, accuracy, precision, linearity, limit of detection (LOD), limit of quantification (LOQ), and robustness. The validation results satisfied the predetermined acceptance criteria. The validated method was used to quantify virus samples produced in an animal cell culture-based production system. The method was able to quantify the NDV samples from mid- or late-production phases, but not effective on samples from the early-production phase. For comparison with other quantifiable methods, immunoblotting, plaque assay, and tissue culture infectious dose 50 ($TCID_{50}$) assay were also performed with the NDV samples. The results demonstrated that the real-time RT-PCR method is suitable for the rapid quantification of virus particles produced in an animal cell-culture-based production system irrespective of viral infectivity.

• 대한수의학회지
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• 제39권4호
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• pp.806-810
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• 1999

A multiplex-polymerase chain reaction (PCR) assay was used to detect staphylococcal enterotoxin production by 12 strains of Staphylococcus aureus isolated from clinical specimens. To evaluate the efficacy and/or sensitivity of this method, the results were compared to those obtained with the reversed passive latex agglutination kit (SET-RPLA, Denka Seiken, Japan). Of 10 strains positive by PCR were positive by RPLA but two strains, representing high sensitivity of the former method. Enterotoxin B was the most prevalent by the two methods. The kappa index between the two methods was 0.826, indicating a higher agreement and fully reliable for use. These results would suggest that sensitive, inexpensive, and relatively rapid multiplex-PCR technique may be an effective means for the detection of staphylococcal enterotoxin genes as an alternative to traditional methods such as kits or immunological methods, which depend upon the amount of enterotoxin produced.

• 대한소아치과학회지
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• 제41권4호
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• pp.292-297
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• 2014

구강 병원체의 검출 방법은 여러 가지가 있지만 그 중 PCR을 이용한 검출이 확실하고 빠른 방법으로 알려져 있다. PCR을 위한 많은 DNA 추출법이 사용되고 있으나 상업적인 DNA 추출 kit들은 일반적으로 가격이 비싸고 절차가 여러 단계로 되어있으며, 그 외의 방법은 페놀과 클로로포름과 같은 유해한 화학물질을 써야하는 등의 단점이 있다. 이 연구에서 NaOH 용액을 이용한 개선된 DNA 추출 방법은 치아우식증, 치주염과 관련된 병원체를 빠르고 간단하며 비용-효율적으로 검출하였다. 세균으로부터 DNA를 추출하기 위한 boiling은 기존의 10분이 아닌 1분으로 충분하였고 $4^{\circ}C$에서 최소 13개월 이상 DNA의 보관이 가능하였으며 sonication 유무에 따른 차이는 없었다. 따라서, 이 방법은 상업적인 kit나 유해한 화학물질을 쓰지 않고서도 타액 표본으로부터 직접적으로 빠른 시간 내에 DNA를 추출하여 병원체의 유무 결과를 확인하는데 매우 적합할 것으로 생각한다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제56권5호
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• pp.447-452
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• 2018

Prompt diagnosis of malaria cases with rapid diagnostic tests (RDTs) has been widely adopted as an effective malaria diagnostic tool in many malaria endemic countries, primarily due to their easy operation, fast result output, and straightforward interpretation. However, there has been controversy about the diagnostic accuracy of RDTs. This study was conducted to evaluate the diagnostic performances of the 2 commercially available malaria RDT kits, RapiGEN Malaria Ag Pf/Pv (pLDH/pLDH) and Asan $EasyTest^{TM}$ Malaria Ag Pf/Pv (HRP-2/pLDH) for their abilities to detect Plasmodium species in blood samples collected from Ugandan patients with malaria. To evaluate the diagnostic performances of these 2 RDT kits, 229 blood samples were tested for malaria infection by microscopic examination and a species-specific nested polymerase chain reaction. The detection sensitivities for P. falciparum of Malaria Ag Pf/Pv (pLDH/pLDH) and Asan $EasyTest^{TM}$ Malaria Ag Pf/Pv (HRP-2/pLDH) were 87.83% and 89.57%, respectively. The specificities of the 2 RDTs were 100% for P. falciparum and mixed P. falciparum/P. vivax infections. These results suggest that the 2 RDT kits showed reasonable levels of diagnostic performances for detection of the malaria parasites from Ugandan patients. However, neither kit could effectively detect P. falciparum infections with low parasitaemia (<$500parasites/{\mu}l$).

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제54권3호
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• pp.375-380
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• 2016

Angiostrongyliasis is difficult to be diagnosed for the reason that no ideal method can be used. Serologic tests require specific equipment and are not always available in poverty-stricken zone and are time-consuming. A lateral flow immunoassay (LFIA) may be useful for angiostrongyliasis control. We established a LFIA for the diagnosis of angiostrongyliasis based on 2 monoclonal antibodies (mAbs) against antigens of Angiostrongylus cantonensis adults. The sensitivity and specificity were 91.1% and 100% in LFIA, while those of commercial ELISA kit was 97.8% and 86.3%, respectively. Youden index was 0.91 in LFIA and 0.84 in commercial ELISA kit. LFIA showed detection limit of 1 ng/ml of A. cantonensis ES antigens. This LFIA was simple, rapid, highly sensitive and specific, which opened an alternative approach for the diagnosis of human angiostrongyliasis.