• 제목/요약/키워드: Rank Normalization

검색결과 17건 처리시간 0.019초

Quantifying Quality: Research Performance Evaluation in Korean Universities

  • Yang, Kiduk;Lee, Hyekyung
    • Journal of Information Science Theory and Practice
    • /
    • 제6권3호
    • /
    • pp.45-60
    • /
    • 2018
  • Research performance evaluation in Korean universities follows strict guidelines that specify scoring systems for publication venue categories and formulas for co-authorship credit allocation. To find out how the standards differ across universities and how they differ from bibliometric research evaluation measures, this study analyzed 25 standards from major Korean universities and rankings produced by applying standards and bibliometric measures such as publication and citation counts, normalized impact score, and h-index to the publication data of 195 tenure-track professors of library and information science departments in 35 Korean universities. The study also introduced a novel impact score normalization method to refine the methodology from prior studies. The results showed the university standards to be mostly similar to one another but quite different from citation-driven measures, which suggests the standards are not quite successful in quantifying the quality of research as originally intended.

Adaptive low-resolution palmprint image recognition based on channel attention mechanism and modified deep residual network

  • Xu, Xuebin;Meng, Kan;Xing, Xiaomin;Chen, Chen
    • KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
    • /
    • 제16권3호
    • /
    • pp.757-770
    • /
    • 2022
  • Palmprint recognition has drawn increasingly attentions in the past decade due to its uniqueness and reliability. Traditional palmprint recognition methods usually use high-resolution images as the identification basis so that they can achieve relatively high precision. However, high-resolution images mean more computation cost in the recognition process, which usually cannot be guaranteed in mobile computing. Therefore, this paper proposes an improved low-resolution palmprint image recognition method based on residual networks. The main contributions include: 1) We introduce a channel attention mechanism to refactor the extracted feature maps, which can pay more attention to the informative feature maps and suppress the useless ones. 2) The ResStage group structure proposed by us divides the original residual block into three stages, and we stabilize the signal characteristics before each stage by means of BN normalization operation to enhance the feature channel. Comparison experiments are conducted on a public dataset provided by the Hong Kong Polytechnic University. Experimental results show that the proposed method achieve a rank-1 accuracy of 98.17% when tested on low-resolution images with the size of 12dpi, which outperforms all the compared methods obviously.

PPIA, HPRT1, and YWHAZ are suitable reference genes for quantitative polymerase chain reaction assay of the hypothalamic-pituitary-gonadal axis in sows

  • Kim, Hwan-Deuk;Jo, Chan-Hee;Choe, Yong-Ho;Lee, Hyeon-Jeong;Jang, Min;Bae, Seul-Gi;Yun, Sung-Ho;Lee, Sung-Lim;Rho, Gyu-Jin;Kim, Seung-Joon;Lee, Won-Jae
    • Animal Bioscience
    • /
    • 제35권12호
    • /
    • pp.1850-1859
    • /
    • 2022
  • Objective: The quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (qPCR) is the most accurate and reliable technique for analysis of gene expression. Endogenous reference genes (RGs) have been used to normalize qPCR data, although their expression may vary in different tissues and experimental conditions. Verification of the stability of RGs in selected samples is a prerequisite for reliable results. Therefore, we attempted to identify the most stable RGs in the hypothalamic-pituitary-gonadal (HPG) axis in sows. Methods: The cycle threshold values of nine commonly used RGs (18S, HPRT1, GAPDH, RPL4, PPIA, B2M, YWHAZ, ACTB, and SDHA) from HPG axis-related tissues in the domestic sows in the different stages of estrus cycle were analyzed using two RG-finding programs, geNorm and Normfinder, to rank the stability of the pool of RGs. In addition, the effect of the most and least stable RGs was examined by normalization of the target gene, gonadotropin-releasing hormone (GnRH), in the hypothalamus. Results: PPIA, HPRT1, and YWHAZ were the most stable RGs in the HPG axis-related tissues in sows regardless of the stages of estrus cycle. In contrast, traditional RGs, including 18S and ACTB, were found to be the least stable under these experimental conditions. In particular, in the normalization of GnRH expression in the hypothalamus against several stable RGs, PPIA, HPRT1, and YWHAZ, could generate significant (p<0.05) elevation of GnRH in the preovulatory phase compared to the luteal phase, but the traditional RGs with the least stability (18S and ACTB) did not show a significant difference between groups. Conclusion: These results indicate the importance of verifying RG stability prior to commencing research and may contribute to experimental design in the field of animal reproductive physiology as reference data.

정보력 있는 유전자 선택 방법 조합을 이용한 마이크로어레이 분류 시스템 구현 (The Implement of System on Microarry Classification Using Combination of Signigicant Gene Selection Method)

  • 박수영;정채영
    • 한국정보통신학회논문지
    • /
    • 제12권2호
    • /
    • pp.315-320
    • /
    • 2008
  • 오늘날 인간 genome프로젝트와 같은 종합적인 연구의 궁극적 목적을 달성하기 위해서는 이들 연구로부터 획득한 대량의 관련 데이터에 대해 새로운 현실적 의미를 부여할 수 있어야 한다. 이러한 맥락에서 유전자 발현 분석 시스템과 염기 서열 분석 시스템의 구축이 포스트 genome 시대를 맞이하여 새롭게 주복을 받고 있다. 최근에는 종양의 특정 부 클래스가 특정 염색체와 관련되어 있다는 사실이 밝혀지면서, 마이크로어레이는 유전자 발현 정보를 기반으로 암의 분류와 예측을 통한 진단 분야에도 활용되기 시작했다. 본 논문에서는 암에 걸린 흰쥐 외피 기간 세포 분화 실험에서 얻어진 3840 유전자의 마이크로어레이 cDNA를 이용하여 데이터의 정규화를 거쳐 정보력 있는 유전자 목록을 별도로 추출할 수 있는 시스템을 고안하고 보다 정보력 있는 유전자를 선택하기 위해 조합 방법을 제안하였다. 그리고 제안한 시스템과 방법론의 가능성을 실험을 통해 검증하였다. 그 결과 PC-ED 조합이 98.74%의 정확도와 0.04%의 MSE를 보여 단일 유사성 척도를 사용하여 유전자 목록을 생성하고 실험을 수행한 경우보다 분류 성능이 향상되었다.

Selection and evaluation of reference genes for gene expression using quantitative real-time PCR in Mythimna separata walker (Lepidoptera: Noctuidae)

  • ZHANG, Bai-Zhong;LIU, Jun-Jie;CHEN, Xi-Ling;YUAN, Guo-Hui
    • Entomological Research
    • /
    • 제48권5호
    • /
    • pp.390-399
    • /
    • 2018
  • In order to precisely assess gene expression levels, the suitable internal reference genes must be served to quantify real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR) data. For armyworm, Mythimna separata, which reference genes are suitable for assessing the level of transcriptional expression of target genes have yet to be explored. In this study, eight common reference genes, including ${\beta}$-actin (${\beta}$-ACT), 18 s ribosomal (18S), 28S ribosomal (28S), glyceraldehyde-3-phosphate (GAPDH), elongation fator-alpha ($EF1{\alpha}$), TATA box binding protein (TBP), ribosomal protein L7 (RPL7), and alpha-tubulin (${\alpha}$-TUB) that in different developmental stages, tissues and insecticide treatments of M. separata were evaluated. To further explore whether these genes were suitable to serve as endogenous controls, three software-based approaches (geNorm, BestKeeper, and NormFinder), the delta Ct method, and one web-based comprehensive tool (RefFinder) were employed to analyze and rank the tested genes. The optimal number of reference genes was determined using the geNorm program, and the suitability of particular reference genes was empirically validated according to normalized HSP70, and MsepCYP321A10 gene expression data. We found that the most suitable reference genes for the different experimental conditions. For developmental stages, 28S/RPL7 were the optimal reference genes, both $RPL7/EF1{\alpha}$ were suitable for experiments of different tissues, whereas for insecticide treatments, $28S/{\alpha}-TUB$ were suitable for normalizations of expression data. In addition, $28S/{\alpha}-TUB$ were the suitable reference genes because they have the most stable expression among different developmental stages, tissues and insecticide treatments. Our work is the first report on reference gene selection in M. separata, and might serve as a precedent for future gene expression studies.

단면 형상 영상을 이용한 3차원 모델 검색 (3D Model Retrieval Using Sliced Shape Image)

  • 박유신;서융호;윤용인;권준식;최종수
    • 대한전자공학회논문지SP
    • /
    • 제45권6호
    • /
    • pp.27-37
    • /
    • 2008
  • 멀티미디어 기술과 콘텐츠의 발달로 3차원 데이터의 사용 범위가 넓어지고, 이를 보다 효율적으로 관리하고 검색하기 위한 시스템이 필요하다. 본 논문은 효율적인 3차원 모델의 형상 기반 검색을 하기위해 모델의 특징을 추출하는 단면 형상 영상 방법을 제안한다. 3차원 모델의 특징 기술자는 모델에 대한 위치, 회전, 크기에 불변해야 하므로 모델을 정규화 시키는 작업이 필요하다. 본 논문에서는 주성분 분석 방법을 이용하여 정규화하였다. 제안한 알고리즘은 주성분 분석을 통해 각 축의 방향 성분을 찾고, 각 축에 직교하는 n 개의 평면을 생성한다. 이 평면은 각 축의 방향과 직교 성분을 갖으며 단면 형상 영상을 구하는데 사용된다. 단면 형상 영상은 3차원 모델과 각 평면이 교차해서 생기는 2차원 평면 영상이다. 제안한 3차원 모델의 특징 기술자는 단면 형상 영상의 중심점과 2차원 형상(shape)을 이루는 직선까지의 유클리디안 거리(distance)값들의 분포도이다. 검색 성능 평가는 MPEG-7에서 제시한 표준 평가 방법인 표준화된 수정 검색 순위의 평균(ANMRR)을 이용하였고 제안한 방법의 우수성을 실험 결과를 통해 입증하였다.

뇌하수체 선종의 방사선치료 결과 (The Result of Radiotherapy for Pituitary Adenoma)

  • 이현주;양광모;조흥래;손승창;서현숙
    • Radiation Oncology Journal
    • /
    • 제15권4호
    • /
    • pp.297-303
    • /
    • 1997
  • 목적 : 수술 및 방사선치료를 받았던 뇌하수체 선종 환자들을 대상으로 후향적 분석을 통해 방사선치료 역할을 규명해 보고자한다. 대상 및 방법 : 1984년 5월부터 1995년 7월까지 인제대학교부속 백병원 치료방사선과에서 치료를 받은 뇌하수체 선종 환자 27명을 대상으로 분석을 시행하였다. 추적기간은 12-146개월(중앙값 97개월)이었다. 성비는 남:여=17. 10이었다. 기능성 선종과 비기능성 선종은 각각 22례, 5례였고, 기능성 선종중 유즙분비, 성장호르몬, 부신피질호르몬 분비는 각각 11, 9, 2례에서 나타났다. 미세선종은 4례였고, 거대선종중 2cm 이하는 9례, 2cm 이상은 14례이었다. 치료방법은 11례에서 접형골 경유 선종절제술 후 방사선치료를 받았고, 9례에서 개두술과 종양제거 후 방사선치료를 받았다. 방사선 치료만 받은 환자는 7례였다. 방사선 치료는 4MV 선형가속기로 5040-5580cGy(중앙값 5040cGy)/5-7주를 조사하였다. 결과 : 5년 및 10년 전체생존율은 95.5%이었고, 국소관해율은 23/26(88.5%)이었다. 치료전 시력감소를 호소한 환자의 12/15(80%)에서 치료후에 시력회복을 보였으며, 시야결손환자는 l1/12(91.7%)에서 치료후 시야회복을 보였다. 호르몬 수치가 추적가능하였던 환자 12명중 유즙 분비종은 54(71.4%), 성장호르몬 4/4, 부신피질 호르몬 III에서 회복을 보였다. 임상적으로 치료후 합병증은 범하수체기능저하증이 2례에서 나타난 것을 제외하고는 미미하였다. 무병생존율의 예후인자로 호르몬 분비 유무(기능성 VS 비기능성), 종양크기, 조사선량 및 조사야 크기 등을 분석하였는데 유의한 차이는 없었다. 결론 :뇌하수체 선종에서 수술후 방사선치료 및 방사선치료단독으로 높은 생존율과 국소 관해율을 보여주었고, 수술후 종양에 의한 증상 및 징후의 회복에 효과가 있었다. 예후인자 분석에서 호르몬 분비유무, 종양크기, 조사선량 및 조사야 크기 등이 모두 통계학적으로 유의한 차이가 없었다.

  • PDF