• 제목/요약/키워드: RORA

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RORA 유전자 다형성과 한국인 젊은 성인에서 일중선호도와의 연관성 (Association of the RORA Gene Polymorphism and Diurnal Preference in a Young Korean Population)

  • 주훈;조철현;문정호;김린;이헌정
    • 수면정신생리
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    • 제23권1호
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    • pp.25-28
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    • 2016
  • 목 적 : Retinoid-related orphan receptor A (RORA) 유전자가 일주기리듬의 조절에 영향을 미친다는 사실이 알려져 왔다. 본 연구에서는 RORA 유전자다형성과 일중선호도의 연관성을 한국인 젊은 성인을 대상으로 분석하였다. 방 법 : 광고를 통해 모집한 504명의 젊은 성인이 최종적으로 대상에 포함되었다. 모든 대상은 13문항 composite scale for morningness (CSM)를 작성하였다. RORA rs11071547 단일염기다형성은 PCR 기반한 실험 방법을 통하여 분석하였다. 결 과 : CSM 점수결과 일중선호도는 RORA rs11071547 SNP의 유전자형과 대립유전자 보유여부에 따라 차이를 보이지 않았다. 결 론 : 이러한 연구결과는 RORA rs11071547 SNP가 일중선호도에 중요한 역할을 하지 않을 가능성을 보여준다.

RORA 유전자 다형성과 기분 및 행동의 계절성 변동의 연관성 (Association of the RORA Gene Polymorphism and Seasonal Variations in Mood and Behavior)

  • 김해인;소수정;양희정;송현미;문정호;윤호경;강승걸;박영민;이승환;김린;이헌정
    • 수면정신생리
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    • 제20권2호
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    • pp.63-68
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    • 2013
  • 목 적 : 일주기 유전자 다형성이 계절성 기분 장애의 발병 기전과 연관이 있다는 여러 연구 결과들이 보고되었다. 본 연구에서는 한국에 거주하는 건강한 성인을 대상으로 RORA (Retinoid-related orphan receptor A)유전자의 다형성과 계절성 변동의 관계를 살펴보고자 하였다. 방 법 : 신문 광고를 통해 모집한 507명의 지역사회 인구를 대상으로 하였다. 기분과 행동의 계절적 변동은 Seasonality Pattern Assessment Questionnaire(SPAQ)를 이용하여 평가하였다. RORA rs11071547 SNP는 PCR을 이용하여 유전자형 분석을 하였다. 여름형은 교란 요소로 작용할 것으로 판단되어, 29명의 여름형은 제외한 총 478명의 대상자를 분석하였다. 계절성군과 비계절성군의 유전자형 분포의 비교는 Chi-square test를 이용하였고, 전반적 계절성 점수(Global seasonality score, GSS)와 RORA rs11071547의 연관성은 ANCOVA로 분석하였다. 결 과 : 연구 참여자 507명 중 12.1%(겨울형 9.3%, 여름형 2.8%)가 SAD에 해당하였다. 계절성군과 비계절성군간의 RORA rs11071547의 유전자형 분포는 통계적으로 유의한 차이는 없었다. 전반적 계절성 점수(GSS)와 세부 항목인 수면시간, 사회활동, 기분, 에너지 수준에서 유의한 차이는 관찰되지 않았다. 그러나 세부 항목 중 체중과 식욕에서는 C 대립유전자 동형접함체군에서 유의하게 점수가 높은 양상을 관찰할 수 있었다(p=0.026, p=0.034). 결 론 : 본 연구에 참여한 대상자들에서 RORA 유전자 다형성이 체중과 식욕의 계절성 변화에 주요한 역할을 하며, 계절성 기분 장애의 감수성과도 어느 정도 연관이 있을 것으로 생각된다.

Neuronal differentiation and developmental characteristics in the dentate gyrus of staggerer mutant mice

  • Yi, Sun-Shin;Hwang, In-Koo;Shin, Jae-Hoon;Baek, Sung-Hee;Yoon, Yeo-Sung;Seong, Je-Kyung
    • BMB Reports
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    • 제43권2호
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    • pp.122-126
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    • 2010
  • Homozygous staggerer ($RORa^{sg/sg}$) mice showed a severe ataxia caused by cerebellum degeneration. Decreased and dysfunctional Rora is a main cause of this neurologic phenotype. The phenotype of staggerer mice has been well known in cerebellum. However, there has been rarely reported about cerebrum even though of staggerer is expressed in merely cerebellum but hippocampus, thalamus, cortex, and olfactory bulb. The expressions of Ki67, doublecortin (DCX), and NeuN, which are cell proliferation, neuronal differentiation and mature neuron markers, respectively, were measured with immunohistechemistry in dentate gyrus in staggerer mice in order to uncover whether staggerer can affect the change in dentate gyrus. The immunoreactivities of DCX and NeuN were significantly reduced in the dentate gyrus of staggerer mice than normal control, while Ki67 were rarely unchanged in staggerer mice. These results suggest that staggerer mutation has an influence on the neuronal differentiation and development not only in cerebellum but also in dentate gyrus.

BFlow, HYSEP, PART, Digital Filter 를 이용한 XML 기반 수문 분석 시스템의 개발 및 적용 (Development and Application of XML-based Hydrograph Analysis Tool with BFlow, HYSEP, PART, and Digital Filters)

  • 문종필;김성준;;;임경재
    • 한국수자원학회:학술대회논문집
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    • 한국수자원학회 2011년도 학술발표회
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    • pp.375-375
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    • 2011
  • 유역에서 강우에 따라 유출이 발생하면 지표면을 따라 하천으로 유입되거나, 땅속으로 침투하여 깊은 대수층으로 유입되던지 기저유출 형태로 하천으로 유입된다. 이렇듯 하천을 구성하는 중요 두 가지 요소인 직접유출량과 기저유출량을 정확히 산정하는 것이 유역 수자원관리 및 비점오염원 관리에 매우 중요한 부분이라 할 수 있다. 그동안 하천에서 측정된 유출량에서 직접유출과 기저유출을 분리하기 위한 많은 연구가 진행되어 왔으며, 최근에는 주관적인 면을 배제하고 장기실측 유량자료를 이용하여 기저유출을 분리할 수 있는 BFlow, HYSEP, PART, RORA, RECESS, 디지털 필터링 모형 등 많은 프로그램들이 개발되어 활용되어 오고 있다. 또한 최근에는 인터넷을 통해 활용할 수 있는 Web 기반 WHAT 프로그램이 개발되어 전 세계적으로 널리 활용되고 있다. 이에 본 연구에서는 XML 프로그래밍 기법을 이용하여 WHAT 프로그램을 확장한 Expaned XML-based WHAT (EX-WHAT) 시스템 (http://www.EnvSys.co.kr/~exwhat)을 개발 하였다. 기존의 시스템에서는 USGS 일유량자료를 URL을 통해 WHAT 서버에 저장한 후 이를 가공하여 수문 분석을 수행하였으나, 이번 연구를 통해서 개발된 시스템은 XML/Parser를 이용하여 USGS 서버에 저장되어 있는 일유량자료를 바로 읽어서 수문분석을 수행할 수 있게 되었다. 이 EXWHAT 시스템에는 BFlow, HYSEP, PART, Digital Filters 와 같은 엔진이 사용되고 있다. 본 연구에서 개발된 EX-WHAT 분석결과는 XML 형식으로 제공되고 있기 때문에, 다른 Web/Desktop 기반의 관련 프로그램에서 바로 활용될 수 있을 것이라 판단된다. 특히 EX-WHAT 분석결과는 유역관리, 기저유출을 통한 비점오염원 관리 평가, 지속가능한 지하수 고나리 등 다양한 수문/비점오염 연구/실무에 활용될 수 있을 것이라 판단된다.

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Comet Assay to Detect the DNA Breakages in the Tissue of the Purple Clam ( Saxidomus purpuratus) and the Blood of the Olive Flounder (Paralichthys olivaceus) Exposed to 5 PAHs

  • Lee, Taek-Kyun;Kim, So-Jung;Park, Eun-Seok;Rora Oh;Yun, Hee-Young;Man Chang
    • 한국환경독성학회:학술대회논문집
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    • 한국환경독성학회 2003년도 추계국제학술대회
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    • pp.159-159
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    • 2003
  • Comet assay is a potential monitoring tool because DNA strand breakage may be produced by a wide range of agents. The comet assay, also called the single-cell gell electrophoresis (SCGE) assay, is rapid and sensitive method for the detection of DNA damage in cells. This study was performed for the identification of DNA damage in the cells from flounders and clams exposed to PAHs. As a control experiments, flounder and clam cells were exposed to $H_2O$$_2$. The cells exposed to $H_2O$$_2$ were displayed a typical nuclei movement DNA damage of cells were significantly increased when the isolated cells from the blood of flounders and the tissue of clams were in vitro exposed to the different concentrations (5, 10, 50, 100 ppb) of five kinds of PAHs (benzo[a]pyrene, pyrene, fluoranthene, anthrancene, and phenanthrene). For the in vivo test, flounders and clams were exposed to the different concentrations of BaP for 4 days. The results showed that DNA strand breakage was effected by the concentration of BaP and the duration of exposure. In high concentration of BaP, the mean tail lengths of nuclei was longer than it In low concentration, while the mean size of head DNA decreased. In this research, both in vitro and in vivo genotoxicity of PAHs could be biomonitored by the comet assay. Especially, clams and flounders seem to be useful as materials for monitoring genotoxic damage by comet assay.

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DD-PCR을 이용한 벤조피렌 노출 조피볼락의 차등 발현 유전자 분석 (Analysis of Gene Expression in Benzo[a]pyrene-exposed Sebastes schlegeli using Differential Display Polymerase Chain Reaction)

  • 염승식;우선옥;최은석;김소정;오로라;이석찬;이택견
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
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    • 제20권1호
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    • pp.67-73
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    • 2005
  • 오염물질의 노출에 의해 발현이 변화되는 유전자의 발굴은 외부환경 자극에 대한 적응이나 반응의 메커니즘을 알아내는뎨 중요한 정보를 제공하며, 오염물질에 반응하는 유전자는 환경오염을 감지하는 분자 마커로 개발될 수 있다. DD-PCR 기법은 차등 발현 유전자들을 발굴해내기 위한 유용한 방법으로 사용되어 왔고, 본 연구는 이 방법을 이용하여 벤조피렌에 반응하는 조피볼락 유전자들의 발굴을 목적으로 진행되었다. 간조직에서 추출한 RNA로부터 벤조피렌의 노출에 의해 발현 양이 달라진 12개의 클론을 발굴하였고, 그 염기서 열을 분석하였다. 또한 벤조피렌의 노출시간을 각각 6, 12, 24시간으로 달리한 조피볼락에서 12개의 클론 중 4개의 클론에 대해 northern blot 분석이 실시되었으며, 이들 모두 노출시간에 따 라 발현양이 증가 또는 감소하는 것이 확인되었다. 본 연구결과는 오염물질의 영향에 의한 유전자들의 발현에 관한 전반적인 지식을 제공하였고, 나아가 환경오염이나 외부 스트레스를 감지해 낼 수 있는 바이오마커의 개발을 위한 첫 단계로서의 정보를 제공할 수 있을 것으로 생각된다.