• 제목/요약/키워드: RNA Polymerase II

검색결과 155건 처리시간 0.025초

Species Diversity of Endophytic Fungi Isolated from Taxus cuspidata Inhabiting Mt. Hallasan, Korea

  • Jae-Eui Cha;Hyeok Park;Ahn-Heum Eom
    • 한국균학회지
    • /
    • 제51권4호
    • /
    • pp.419-428
    • /
    • 2023
  • Several endophytic fungal strains were isolated from Taxus cuspidata and identified by molecular analysis of the internal transcribed spacer and RNA polymerase II second largest subunit. This study aimed to determine the relative abundance and compare the species diversity of endophytic fungal communities within needle leaves and twigs. We identified a total of 49 endophytic fungal species. Notably, two species, Trichoderma dingleyae and Xylaria cubensis, were discovered to be previously unrecorded in Korea. The fungal communities in both plant tissues demonstrated distinct species composition. Differences were observed in the relative abundance and species diversity index between needle leaves and twigs. Our findings suggest that the host plant tissues influence the species diversity of endophytic fungal communities.

Upregulation of Renal Renin-Angiotensin System in Rats with Adriamycin-Induced Nephrosis

  • Kim, Soo-Wan;Lee, Jong-Un;Han, Sang-Woong;Ryu, Jun-Ho;Oh, Yoon-Wha;Kim, Nam-Ho;Choi, Ki-Chul;Kim, Ho-Jung
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
    • /
    • 제6권2호
    • /
    • pp.127-130
    • /
    • 2002
  • The present study was aimed to investigate whether the adriamycin-induced nephrosis is associated with an altered regulation of local renin-angiotensin system (RAS) in the kidney. Rats were subjected to a single injection of adriamycin (2 mg/kg body weight, IV) and kept for 6 weeks to allow the development of nephrosis. They were then divided into two groups, and supplied with and without cilazapril, an angiotensin converting enzyme (ACE) inhibitor, in drinking water (100 mg/l) for additional 6 weeks. Another group without adriamycin-treatment served as control. The mRNA expression of renin, ACE, type 1 and type 2 angiotensin II receptors (AT1R, AT2R), and transforming growth factor $(TGF)-{\beta}1$ was determined in the cortex of the kidney by reverse transcription-polymerase chain reaction. Adriamycin treatment resulted in heavy proteinuria. Accordingly, the mRNA expression of renin, ACE, and AT1R was increased in the renal cortex, while that of AT2R was decreased. Co-treatment with cilazapril attenuated the degree of proteinuria. While not affecting the altered expression of renin, cilazapril decreased the expression of ACE to the control level. Cilazapril further increased the expression of AT1R, while it restored the decreased expression of AT2R. The expression of $(TGF)-{\beta}1$ was increased by the treatment with adriamycin, which was abolished by cilazapril. An altered expression of local RAS components may be causally related with the development of adriamycin-induced nephrosis, in which AT1R is for and AT2R is against the development of nephrosis.

Dronedarone Attenuates Ang II-Induced Myocardial Hypertrophy Through Regulating SIRT1/FOXO3/PKIA Axis

  • Cheng Chen;Song Hu;Heng-Jing Hu;Zhi-Xuan Liu;Xin-Teng Wu;Tao Zou;Hua Su
    • Korean Circulation Journal
    • /
    • 제54권4호
    • /
    • pp.172-186
    • /
    • 2024
  • Background and Objectives: Long-term pathological myocardial hypertrophy (MH) seriously affects the normal function of the heart. Dronedarone was reported to attenuate left ventricular hypertrophy of mice. However, the molecular regulatory mechanism of dronedarone in MH is unclear. Methods: Angiotensin II (Ang II) was used to induce cell hypertrophy of H9C2 cells. Transverse aortic constriction (TAC) surgery was performed to establish a rat model of MH. Cell size was evaluated using crystal violet staining and rhodamine phalloidin staining. Reverse transcription quantitative polymerase chain reaction and western blot were performed to detect the mRNA and protein expressions of genes. JASPAR and luciferase activity were conducted to predict and validate interaction between forkhead box O3 (FOXO3) and protein kinase inhibitor alpha (PKIA) promoter. Results: Ang II treatment induced cell hypertrophy and inhibited sirtuin 1 (SIRT1) expression, which were reversed by dronedarone. SIRT1 overexpression or PKIA overexpression enhanced dronedarone-mediated suppression of cell hypertrophy in Ang II-induced H9C2 cells. Mechanistically, SIRT1 elevated FOXO3 expression through SIRT1- mediated deacetylation of FOXO3 and FOXO3 upregulated PKIA expression through interacting with PKIA promoter. Moreover, SIRT1 silencing compromised dronedarone-mediated suppression of cell hypertrophy, while PKIA upregulation abolished the influences of SIRT1 silencing. More importantly, dronedarone improved TAC surgery-induced MH and impairment of cardiac function of rats via affecting SIRT1/FOXO3/PKIA axis. Conclusions: Dronedarone alleviated MH through mediating SIRT1/FOXO3/PKIA axis, which provide more evidences for dronedarone against MH.

우렁쉥이(Halocynthia roretzi) 껍질로부터 분리된 다당류의 면역증강 효과 (Immune-Enhancing Effects of Polysaccharides Isolated from Ascidian (Halocynthia roretzi) Tunic)

  • 이대훈;홍주헌
    • 한국식품영양과학회지
    • /
    • 제44권5호
    • /
    • pp.673-680
    • /
    • 2015
  • 본 연구에서는 우렁쉥이 껍질 유래 다당류의 기능성식품 소재로의 활용 가능성을 확인하기 위하여 조다당류의 분리 및 정제를 통해 획분을 얻었으며 다양한 면역증강 효과를 확인하였다. 건조된 조다당류를 DEAE-sepharose CL-6B를 이용하여 크로마토그래피한 후 총당 및 uronic acid 함량을 분석한 결과, 증류수로 용출되는 비흡착 획분(APF-I, fraction No. 11~17)과 흡착된 후 NaCl 용액에 의해 용출되는 획분(APF-II, fraction No. 22~37)을 얻었다. 정제된 APF-I 및 APF-II의 이화학적 특성으로 총당 함량은 각각 66.62%, 27.03%, uronic acid 함량은 47.53%, 15.87%, hexosamine 함량은 16.62%, 46.79% 및 단백질 함량은 2.43%, 4.94%로 나타났다. APF-I 및 APF-II에 대해 RAW 264.7 세포에 처리하여 독성을 평가한 결과 $5{\mu}g/mL$ 농도까지 유의적으로 세포사멸이 나타나지 않아 세포독성이 없음을 확인할 수 있었다. Nitric oxide 생산량은 APF-I이 $5{\mu}g/mL$ 농도에서 $22.23{\mu}m$ 함량을 나타내어 LPS 대비 73.48%로 타 구간에 비해 높은 생성량을 나타내었으며, cytokine 생성량(TNF-${\alpha}$ 및 IL-6) 또한 APF-I $5{\mu}g/mL$ 농도에서 각각 LPS 대비 104%, 100.1%를 나타내어 LPS와 유사한 생성량을 나타내었다. Polymerase chain reaction을 통한 면역관련 유전자 발현 분석 결과, iNOS, COX-2, TNF-${\alpha}$, IL-6에서 APF-I 구간에서 LPS 처리군 보다 높은 발현량을 나타내어 면역증강을 목적으로 한 기능성식품 개발에 활용 가능하다고 사료된다.

꽃도라지 뿌리썩음병을 일으키는 Fusarium solani 의 특성 (Characterization of Fusarium solani Causing Fusarium Root Rot of Lisianthus in Korea)

  • 최효원;홍성기;이영기;김점순;이재금;김효원;강은혜;이은형
    • 한국균학회지
    • /
    • 제45권1호
    • /
    • pp.74-82
    • /
    • 2017
  • 꽃도라지(Eustoma grandiflorum)는 국내에서 장식용 화훼류로 널리 이용되는 절화류이다. 2015년 경기도 여주와 경남 김해 지역에서 꽃도라지가 시들고, 지제부가 잘록해지면서 위축되고, 뿌리가 썩는 증상이 나타났다. 병든 식물체는 포장이나 육묘상자에서 황화되고, 뿌리 발육이 저해되었고, 진전되면 전체적으로 황화되면서 시들고, 위축되며, 결국 2~3개월 안에 완전히 말라 죽는다. 병든 식물체 지제부에서 Fusarium균이 분리되었고, 9개 균주를 단포자 분리하여 형태적 특성을 조사한 결과, Fusarium solani로 동정되었다. 대형포자는 통통하고, 직선형이거나 약간 굽은 초승달 모양이고, 소형분생포자는 긴mono형태의 분생포자원세포에서 false head상으로 형성되었다. 후벽포자는 균사 중간 혹은 끝부분에 풍부하게 형성되었다. 이와 같은 동정 결과는 translation elongation factor 1 alpha (TEF)와 RNA polymerase II subunit (RPB2) 유전자의 염기서열 분석으로 재확인되었다. 그 결과, 분리 균주는 NCBI GenBank에 등록된 F. solani와 TEF 유전자는 99.2~99.9%, RPB2 유전자는 98.0~98.1%의 상동성을 나타내었다. 건전한 꽃도라지 유묘의 뿌리를 포자현탁액에 침지 접종하여 병원성 검정을 수행한 결과, 접종 7일 이내에 접종한 식물체에서만 병징이 관찰되었다. 따라서 이 병을 F. solani에 의한 꽃도라지 뿌리썩음병으로 명명하며, 병의 발생을 국내에서 처음으로 보고한다.

Gaucher병에서 resveratrol의 세포주기 조절자 p21을 통한 세포보호 효과 연구 (Resveratrol Upregulates p21, Cell Cycle Regulator, in Gaucher Disease Cells)

  • 김동현;허태회;김준범;김성조
    • 생명과학회지
    • /
    • 제20권8호
    • /
    • pp.1281-1286
    • /
    • 2010
  • 고셔병은 세포내의 글루코세레브로시데이즈의 결핍으로 인하여 리소좀 내의 글루코세레브로사이드가 분해되지 못하고 축적되는 질환으로 알려져 있으며, 유형의 종류에 따라 신경퇴행성 질환으로 나타나는 것으로 보고되어 있으나 아직까지 정확한 기전이 밝혀져 있지 않다. 본 논문에서는 항산화 효과 및 신경보호 효과가 있는 것으로 알려진 레스베라트롤을 고셔병 환자의 fibroblast 세포에 투여하여 세포 생존율 변화 여부 및 세포주기 조절에 관하여 분자 생물학적 기전을 알아보고자 하였다. 고셔병 세포의 p21의 mRNA 발현 수준과 단백질 발현 양상을 확인한 결과 mRNA 상의 정량적 차이는 관찰되지 않았으나 단백질 발현수준은 레스베라트롤의 농도가 높아짐에 따라 증가 되는 것을 확인하였다. 또한 세포사멸의 표지 인자 단백질로 알려진 PARP의 변화양상을 확인한 결과 레스베라트롤의 농도가 높아짐에 따라 감소하는 것을 확인 할 수 있었다. 이를 통해 폴리페놀계 천연물인 레스베라트롤이 고셔병에서 세포 손상을 치유하며, 궁극적으로 세포사멸을 억제하는 효과를 가져올 것으로 생각할 수 있으며, 본 질환에서 병증을 완화 시킬 수 있을 것으로 사료된다.

콜라겐 유도 관절염 동물 모델에 대한 동충하초 복합추출물의 치료 효과 (Healing Effect of Cordyceps Militaris Extract Complex on Collagen II-Induced Arthritis Rats)

  • 오승준;이은정
    • 한방재활의학과학회지
    • /
    • 제32권3호
    • /
    • pp.1-11
    • /
    • 2022
  • Objectives This study was designed to evaluate the healing effect of Cordyceps Militaris (CM) on collagen II-induced arthritis rats. Methods Sprague-Dawley rats were randomly divided into 6 groups (normal, control, positive control, CM with low/medium/high dosage each). Type II collagen mixed with complete Freund's adjuvant (with 1:1 v/v) was injected subcutaneously, and the mixture was injected in a same manner one week after the first injection to boost arthritis. Arthritis index, paw thickness and von Frey test were conducted to observe physical changes. hematoxylin and eosin (H&E) staining was performed to observe knee cartilage. The levels of messenger RNA (mRNA) expressions of interleukin (IL)-1𝛽, IL-6, tumor necrosis factor-alpha (TNF-𝛼) in spleen were assessed by real-time polymerase chain reaction. Results Rheumatoid arthritis is an autoimmune disease that occurs on multiple joints and can lead to temporary shape change of bones or organ failure in severe cases. Here, we aimed to determine the effect of CM extract on rheumatoid arthritis by measuring paw thickness, arthritis index, conducting von Frey test and H&E staining, and evaluating the level of IL-1𝛽, IL-6, TNF-𝛼. As a result, paw thickness, arthritis index significantly decreased in low concentration group, hind leg became less sensitive in all expermental groups. Also, histological analysis showed that the damage of knee cartilage was prevented in all experimental groups. The level of mRNA of IL-1𝛽, IL-6, and TNF-𝛼 in spleen was analyzed to decide the effectiveness of CM extract. IL-1𝛽 did not show significant change, but IL-6 and TNF-𝛼 showed significant decrease in at least one of the experimental groups. Conclusions CM showed protective effect on knee tissue destruction and improved the physical conditions of the leg involving arthritis. Also, it showed that CM has anti-inflammatory effect on specific cytokines inducing rheumatoid arthritis. In conclusion, this study demonstrated that the therapeutic potential of CM for the treatment rheumatoid arthritis, and set the foundation for the further studies.

소아 Helicobacter pylori 감염에서 Clarithromycin 내성과 연관된 23S rRNA의 돌연변이 (Detection of 23S rRNA Mutation Associated with Clarithromycin Resistance in Children with Helicobacter pylori Infection)

  • 고재성;양혜란;서정기
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
    • /
    • 제7권2호
    • /
    • pp.137-142
    • /
    • 2004
  • 목적: 우리 나라 소아에 감염된 H. pylori에서 PCR RFLP를 이용하여 clarithromycin 내성의 원인으로 알려진 23S rRNA의 돌연변이를 찾아내고, cagA, vacA 유전형과 clarithromycin 내성 돌연변이 사이에 연관이 있는지 알아보고자 하였다. 방법: 서울대학교병원 소아과에서 위내시경검사를 통해 H. pylori 위염으로 진단 받은 환아 27명의 내시경 생검 조직에서 H. pylori cagA, vacA 유전자를 증폭하여 유전형을 조사하였다. H. pylori의 23 rRNA V domain을 조사하기 위해 증폭한 후, PCR 산물은 BsaI과 MboII 제한효소로 처리하여 PCR RFLP를 이용하여 돌연변이 여부를 판정하였다. 결과: A2143G 돌연변이가 1명에서, A2144G 돌연변이가 4명에서 발견되어 18.5%가 clarithromycin 내성으로 관찰되었다. cagA 양성이 25명(93%)이었고, vacA s1a/m1이 6명(22%), s1a/m2가 3명(11%), s1c/m1이 16명(59%), s1c/m2가 1명(4%)이었다. clarithromycin 내성 돌연변이를 보이는 경우는 모두 cagA 양성이었고 s1a/m1이 2명, s1c/m1이 2명으로 특정 유전형이 clarithromycin 내성 돌연변이와 연관성을 보이지 않았다. 결론: 위점막 조직에서 PCR-RFLP를 이용한 H. pylori의 clarithromycin 내성 검사는 항생제를 선택하는데 유용하다고 생각된다. Clarithromycin 내성 돌연변이는 cagA, vacA 유전형과 연관성이 없었다.

  • PDF

생쥐 난자와 착상전 초기배아에서 DNA 메틸전이효소 전사물의 발현 (Expression of DNA Methyltransferase Transcripts in The Oocytes and Preimplantation Embryos in Mouse)

  • 김종월;이양한;강승호;한성원;전일경;김성례;김문규
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
    • /
    • 제2권2호
    • /
    • pp.197-203
    • /
    • 1998
  • 포유류 배아발생 중 DNA 메틸화는 세포분화와 유전자발현에서 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있다. 그러나, 생쥐 착상전 초기배아 발생 중 메틸화효소에 의해 유지되는 DNA 메틸화의 중요성과 자세한 기작은 잘 이해되고 있지 않다. 이 연구에서 DNA 메틸화의 역할에 관하여 알아보기 위하여, 성숙난자와 착상전 초기배아에서 DNA 메틸전이효소의 발현양상을 조사하였다. 이를 위해, DNA 메틸전이효소를 암호화하고 있는 cDNA에서 primer를 고안하였다. Primer의 정확도와 PCR조건의 적합화를 통하여, DNA MTase 전사물이 성숙난자와 착상전 초기배아에서 검출되었다. DNA MTase의 mRNA량은 성숙난자에서 가장 높으며, 전핵시기까지 비슷한 정도로 유지되었다. 이후 8-세포기까지 지속적으로 감소하다 상실기 배아에서 다시 검출되어 포배기까지 증가하는 양상을 보였다. 그리고, RNA polymerase II 억제제를 전핵시기 배아에 처리하여, 난자와 전핵시기 배아에 다량 존재하는 전사물이 모계유래인 것을 확인하였다. 결국, 난자와 전핵시기 배아에 상대적으로 다량 존재하는 DNA 메틸전이효소의 전사물은 아마도 착상전 초기배아에서 DHA 메틸화의 유지에 필요하며, 착상전 초기배아 발생에 있어서 유전자발현과 세포분화에 영향을 줄 것임을 시사하고 있다.

  • PDF

Rapid Detection of Noroviruses in Fecal Samples and Shellfish by Nucleic Acid Sequence-based Amplification

  • Kou Xiaoxia;Wu Qingping;Zhang Jumei;Fan Hongying
    • Journal of Microbiology
    • /
    • 제44권4호
    • /
    • pp.403-408
    • /
    • 2006
  • The purpose of this study was to determine the efficacy of a nucleic acid sequence-based amplification (NASBA) method of detecting noroviruses in artificially and naturally contaminated shellfish. We used 58 fecal samples that tested positive for noroviruses with electron microscopy (EM) to develop an NASBA assay for these viruses. Oligonucleotide primers targeting the polymerase coding region were used to amplify the viral RNA in an isothermal process that resulted in the accumulation of RNA amplicons. These amplicons were detected by hybridization with digoxigenin-labeled oligonucleotide probes that were highly specific for genogroup I (GI) and genogroup II (GII) of noroviruses. The expected band of 327bp appeared in denaturing agarose gel without any nonspecific band. The specific signal for each amplicon was obtained through Northern blotting in many repeats. All fecal samples of which 46(79.3%) belonged to GII and 12(20.6%) belonged to GI were positive for noroviruses by EM and by NASBA. Target RNA concentrations as low as 5pg/ml were detected in fecal specimens using NASBA. When the assay was applied to artificially contaminated shellfish, the sensitivity to nucleic acid was 100pg/1.5g shellfish tissue. The potential use of this assay was also confirmed in naturally contaminated shellfish collected from different ponds in Guangzhou city of China, of which 24 (18.76%) out of 128 samples were positive for noroviruses; of these, 19 (79.6%) belonged to GII and 5 (20.4%) belonged to GI. The NASBA assay provided a more rapid and efficient way of detecting noroviruses in fecal samples and demonstrated its potential for detecting noroviruses in food and environmental samples with high specificity and sensitivity.