We synthesized D-1,3-dioxolanyl acetate from D-mannose using Frazer-Reide reaction and D-1,3-oxathiolanyl acetate from either D-mannose or D-galactose in good yields. These acetates were conjugated with various disilylated pyrimidine base using trimethylsilyl trifluoromethane sulfonate as a Lewis acid catalyst to obtain 32 different D-nucleosides.
와 5-iodo-pyrimidine nucleoside 의 4'-thio 유도체들은 2,3,5-tri-O-aceytl-4-thio-D-ribofuranosyl chloride 와 5-halogeno-2,4-bis(trimethylsiloxy)pyrimidine의 chloromercury 유도체를 축합시킨후 보호작용기를 제거함으로써 합성하였다. 4'-Thio 유도체들의 생물학적 활성도는 예비시험에서는 이에 대응하는 4'-oxygen 유도체들과 큰 차이가 나지 않지만 4'-thio유도체가 비교적 더높은 활성을 가진다는 사실은 흥미로운 일이며 앞으로 생화학적인 고찰을 계속하는 것은 가치있는 일임을 보여주고 있다.
Pyrimidine salvage과정 및 de novo 합성과정에 작용하는 억제제들이 Toxeplasma gondii의 특이한 uracil 도입 과정에 미치는 영향을 방사능을 표지한 uracil과 thymidine을 사용하여 검토하였다. Dihydrofolate reductase (DHFR)에 작용하는 억제제인 methotreBate, pyrimethamine 그리고 thymidylate synthase(75)의 경쟁적 억제제인 fluoro-uridine, fluoro-dUMP, fluoro-uracil을 각각 처리한 경우, 그 농도에 비례적으로 uracil 표지가 감소 하였다. OMP decarboxylase에 작용하는 억제제인 azauridine에 대해서는 100$\mu$M 농도 이상에서도 uracil 표지량에 변화가 거의 없었다. 본 결과로부터 Toxoplasma가 uracil을 DNA로 도입할 때 dihydrofolate reductase와 thymidylate synthase가 관여하는 TMP biosynthesis 과정이 중요함을 알 수 있었고, uracil salvage 과정이 있는 다른 기생성 원충의 경우와 비교했을 때 Toxoplasmn에 있어서도 효율적인 다기능의 DHFR-75 system의 존재를 예상할 수 있었다. Thymidine 도입의 양상은 모든 경우에 있어 HL-60세포만의 경우와 Toxoplasma가 함께 배양된 HL-60세포에서 차이가 없었다. 이로부터 thymidine은 Toxoplasmn 성장을 반영하지 않음을 알 수 있었다. Toxoplasma의 특이한 uracil 표지와 Toxoplasma에 배타적인 thymidine 표지는 기생원충과 숙주세포의 성장, DNA합성 정도 및 이들 과정에 미치는 제제들의 영향을 쉽고 간단하게 연구할 수 있는 방법이 된다.
The DNA nucleosides(dA, dC, dG, dT)bound to gold nanoparticles (~13 nm) in aqueous solution has been studied as a probe by the SERS and their coordination structures have been proposed on the basis of them. According to UV-Visible absorption of gold nanoparticles after modifying with DNA nucleosides, the rates of absorption of dA, dC, and dG were much faster than that of dT as monitored by the aggregation kinetics at 700 nm. These data indicated that the nucleosides dA, dC, and dG had a higher affinity for the gold nanoparticles surface than nucleoside dT. As the result of SERS spectra, the binding modes of each of the nucleosides on gold nanoparticles have been assigned. A dA binds to gold nanoparticles via a N(7) nitrogen atom of the imidazole ring, which the C(6)-$NH_2$ group also participates in the coordination process. In the case of dC, it binds to the gold surface via a N(3) nitrogen atom of the pyrimidine ring with a partial contribution from the oxygen of C(2)=O group. A coordination of dG to the gold surfaces is also proposed. Although the dG has the two different nitrogens of a pyrimidine ring and the amino group, the N(1) nitrogen atom of a pyrimidine ring has a higher affinity after the hydrogen migrates to the amino group. Conversely, dT binds via the oxygen of the C(4)=O group of the pyrimidine ring. Accordingly, these data suggest that the nitrogen atom of the imidazole or the pyrimidine ring in the DNA nucleosides will bind more fast to the gold nanoparticles surfaces than the oxygen atom of the carbonyl group.
한국미생물학회 2006년도 International Meeting of the Microbiological Society of Korea
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pp.105-107
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2006
Two kinds of nucleoside hydrolases (NHs) encoded by rih1 and rih2 were cloned from Corynebacterium ammoniagenes using deoD- and gsk-defective Escherichia coli. Sequence analysis revealed that NH 1 was a protein of 337 aa with a deduced molecular mass of 35,892 Da, whereas NH 2 consisted of 308 aa with a calculated molecular mass of 32,310 Da. Experiments with crude extracts of IPTG-induced E. coli CGSC 6885(pTNU23) and 6885(pTNI12) indicated that the Rihl enzyme could catalyse the hydrolysis of uridine and cytidine and showed pyrimidine-specific ribonucleoside hydrolase activity. Rih2 was able to hydrolyse both purine and pyrimidine ribonucleosides with the following order of activity-inosine>adenosine>uridine>guanosine>xanthosine>cytidine-and was classified in the non-specific NHs family. rih1 and rih2 deletion mutants displayed a decrease in cell growth on minimal medium supplemented with pyrimidine and purine/pyrimidine nucleosides, respectively, compared with the wild-type strain. Growth of each mutant was substantially complemented by introducing rih1 and rih2, respectively. Furthermore, disruption of both rih1 and rih2 led to the inability of the mutant to utilize purine and pyrimidine nucleosides as sole carbon source on minimal medium. These results indicated that rih1 and rih2 play major roles in the salvage pathways of nucleosides in this micro-organism.
DNA samples extracted from Japanese cypress leaf tissues contain isopropyl alcohol-precipitable, high molecular weight compounds, which interfere ELISA for cyclobutane pyrimidine dimers (CPD). Removal of the compounds is achieved by DEAE ion-exchange column chromatography and improves the ELISA responses of the DNA. When extracting DNA repeatedly from the same leaf tissues, the DNA samples show CPD responses which increase with the order in sequential extraction, and hence for a reliable detennination of DNA lesion a thorough extraction of DNA is required. Clearing these two problems it was demonstrated that CPD level was slightly higher in the leaves of trees growing under full sunlight than in those growing under UBV -cut sunlight.
Strobilurins are one of the most important classes of agricultural fungicides. To discover new strobilurin derivatives with high activity against resistant pathogens, a series of novel ${\beta}$-methoxyacrylate analogues were designed and synthesized by integrating substituted pyrimidine with a strobilurin pharmacophore. The compounds were confirmed and characterized by infrared, $^1H$ nuclear magnetic resonance, elemental analysis and mass spectroscopy. The bioassays indicated that most of the compounds (1a-1h) exhibited potent antifungal activities against Colletotrichum orbiculare, Botrytis cinerea Pers and Phytophthora capsici Leonian at the concentration of 50 ${\mu}g/mL$. Exhilaratingly, compound 1d (R=3-trifluoromethylphenyl) showed better antifungal activity against all the tested fungi than the commercial strobilurin fungicide azoxystrobin.
Thiocarboxamidocinnamonitrile derivatives 2 under bar a-f reacted with 3-aminopyrazole derivative 3 under bar a-c to give the pyrazole[3, 2-b]pyrimidine derivatives 6 under bar a-p. Compounds 6 under bar a-p were used as starting material for syntheses of several heterocylic coompounds. Dehydrogenation of 6 under bar gave pyrazole[3, 2-b]pyrimidines 10 under bar a-d while its reaction with diethyl oxalate gave 11 under bar. Reactions of 6 under bar with formic acid gave pyrazolopyrimidines 17 under bar a-j, and pyrazolopyrimidopyrimidines 18 under bar a-j.
Hwang, Chang-Ho;Park, Jung-Sup;Won, Jeong-Hee;Kim, Jae-Nyoung;Ryu, Eung K.
Archives of Pharmacal Research
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제15권1호
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pp.69-72
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1992
Pyrimidine bases and their mucleosides were oxidatively iodinated at C-5 position by the reaction of iodine in DMF (dimethylformamide) with MCPBA (m-chloroperbenzoic acid) under mild conditions. For uracil derivatives such as uracil 1a. 1, 3-dimethyluracil 1b, uridine 1c, and 2'-deoxyuridine 1d, the corresponding 5-iodo derivatives were obtained in high yields (71-95%). The iodination of cytidine 3a and 2'-deoxycytidine 3b was achieved in moderate yields (41-56%).
항암성 또는 항 virus성 약물개발 목적으로 천연의 pyrimidine nucleoside의 구조유사체로 pyrimidine acyclonucleoside들을 합성하였다. Pyrimidine acyclonucleoside를 염기 uracil, thymine 및 5-fluorouracil을 원료로 하여 합성하고 구조를 NMR, IR data를 써서 확인하였다. 이들 합성 화합물들은 L$_{1210}$ 암세포를 이용하여 in vitro 항암성 작용을 검색하였다. 합성된 화합물들 중 5-fluorouraoil-acyclonucleoside들은 약간이나마 모 5FU보다 높은 항암성 작용을 보였다. 유도체들은 5-FU의 N$^1$에 glycosidic 결합이 아닌 alkyl 결합을 하고있어, 모 5FU를 그리 쉽게 유리시키리라 보아지지 않으므로 이들의 작용성은 acyclonucleoside형태일 것 같아 이들의 작용기전 연구가 필요하다고 보아진다. 한편 얻은 유도체들은 HSV-1 및 HSV-2를 이용하여 항 virus성 작용을 검색한 결과 2500$\mu\textrm{g}$/ml 농도에서 유의성 있는 억제 작용성을 보이지 않았다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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