Bovine gastricsin catalyzes peptide synthesis over an optimum range of pH 4~5, resulting in satisfactory yields of methyl esters and p-nitroanilides of benzyloxycarbonyl tetra- to hexa-peptides, provided that hydrophobic amino acid residues form new peptide bonds. The effectiveness of the enzyme also depends on the nature of adjacent amino acid residues. An aspartic proteinase with a characteristic gastricsin specificity pattern would be useful for the synthesis of middle-length peptides.
Protein inhibitors are proteins or peptides capable of inhibiting catalytic activities of proteolytic enzymes. They are grouped primarily as either serine, cysteine, aspartic or metallto-proteinase inhibitors. Pretense inhibitors have been hewn since the end of the last century in nematodes and human blood serum, and their ubiquitous distribution in microorganisms, animals and plants has been widely documented. (omitted)
Lactic acid bacteria (LAB) have been used as starter cultures in the manufacturing processes of fermented dairy products such as cheese and yogurt. LAB have a proteolytic system to use the nitrogen source from milk for their growth. The proteolytic system involved in casein utilization provides cells with essential amino acids during growth in milk and is also of industrial importance, because of its contribution to the development of the organoleptic properties such as flavor of fermented milk products. In the most extensively studied LAB, Lactococcus lactis, the main features of the proteolytic system comprise 3 groups. The first is proteinase, which initially cleaves the milk protein to peptides. The second group consists of transport systems for the internalization of oligopeptides, which are involved in the cellular uptake of small peptides and amino acids. The third group, peptidases in the cell, cleaves peptides into smaller peptides and amino acids. This review is to provide the information about the proteolytic system of LAB.
Kim, Joong-Jae;Masui, Ryoji;Kuramitsu, Seiki;Seo, Jin-Ho;Kim, Kwang;Sung, Moon-Hee
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제18권3호
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pp.490-496
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2008
Symbiobacterium toebii is a commensal symbiotic thermophile that cannot grow without support from a partner bacterium. We investigated the properties of Symbiobacterium growth-supporting factors (SGSFs) produced by the partner bacterium Geobacillus toebii. SGSFs occurred in both the cell-free extract (CFE) and culture supernatant of G. toebii and might comprise multifarious materials because of their different biological properties. The heavy SGSF contained in the cytosolic component exhibited heat- and proteinase-sensitive proteinaceous properties and had a molecular mass of >50 kDa. In contrast, the light SGSF contained in the extracellular component exhibited heat-stable, proteinase-resistant, nonprotein properties and had a molecular mass of <10 kDa. Under morphological examination using light microscopy, S. toebii cultured with the culture supernatant of G. toebii was filamentous, whereas S. toebii cultured with the CFE of G. toebii was rod-shaped. These results strongly suggest that the SGSFs produced by G. toebii comprise two or more types that differ in their growth-supporting mechanisms, although all support the growth of S. toebii. Upon the examination of the distribution of SGSFs in other bacteria, both cytosolic and extracellular components of Geobacillus kaustophilus, Escherichia coli, and Bacillus subtilis had detectable growth-supporting effects for S. toebii, indicating that common SGSF materials are widely present in various bacterial strains.
충청남도 목천과 충청북도 오창 근교의 토양으로부터 망간을 산화하는 64 집락을 분리하고 이 중 망간 산화능이 가장 우수한 한 균주를 최종 선별하여 생리, 생화학적 특성을 조사하고, 16S rRNA 염기 서열분석 등을 통하여 동정한 결과 최종 선별된 균주는 Aeromonas sp. MN44로 확인되었다. 최종 선별된 Aeromenas sp. MN44는 lactose를 제외한 여러 당들은 이용하지 못하였으며, 중금속내성은 lithium과 manganese에 대해서는 mg/ml 단위의 높은 농도까지 중금속 내성을 가지고 있었지만 cadmium에는 전혀 내성을 나타내지 않았다. 또 kanamycin, chloramphenicol, ampicillin, tetracycline, spectinomycin등 조사한 모든 항생제에 대해 전혀 내성을 갖지 않았다. Aeromonas sp. MN44가 생성하는 망간산화물질의 최적 pH는 pH 7.4로 확인되었으며, 이 균이 생성하는 망간 산화 factor는 proteinase K와 가열처리에 의해 저해되는 단백질이고, ammonium sulfate 침전과 ion exchange chromatography 그리고 gel filtration의 단계를 통해 부분 정제한 망간 산화 factor의 분자량은 약 113 kDa로 확인되었다.
메주로부터 곰팡이 및 세균 등에 생육 저해활성을 나타내는 균주 B. polyfermenticus CJ6을 분리 동정하였다. 분리 균주 B. polyfermenticus CJ6는 2단 대수기를 나타내는 생육 곡선상 특이점을 나타내었으며 배양 30시간 이후부터 최대 활성을 나타내었고 사멸기 이후 활성이 다소 감소되었으나 120시간까지 활성을 유지하였다. B. polyfermenticus CJ6의 항진균 활성 물질은 $70^{\circ}C$ 이상에서 활성이 감소되었으나 $121^{\circ}C$에서 15분간 열처리 시 역가가 완전히 소실되지 않았다. pH 안정성 실험에서는 pH $3.0{\sim}9.0$ 구간에서 안정한 활성을 나타내었으며, 각종 효소에 대한 영향에서 항진균 활성물질은 proteinase K, protease, ${\alpha}$-chymotrypsin 등의 단백분해효소 처리로 역가를 상실하거나 일부 감소되어 단백질성 물질임을 추정하였다. 균주의 항진균 활성 물질을 $C_{18}$ Sep-Pak column으로 부분 정제한 후 Tricine-SDS-PAGE 및 direct detection 실험을 통하여 분자량이 약 1.4 kDa의 물질임을 확인하였다. B. polyfermenticus CJ6가 생산하는 항진균 활성 물질은 기존에 거의 보고되지 않은 B. polyfermenticus 유래의 단백질성 항진균 활성 물질로서 천연보존제 및 천연항균제재로 사용이 기대되며, 이를 위하여 항진균 활성 물질들의 정제 및 구조분석 등의 연구가 필요하다.
In order to find a biochemical marker for late Iysosomes, we characterized two cDNAs which were cloned by using a monoclonal antibody (mAb) against Iysosomes in Amoeba proteus as a probe. The two cDNAs, a 1.3-kb cDNA in pBSK-Iys45 and a 1.6-kb cDNA in pBSK-Iys60, were found to encode proteins homologous to pepstatin-insensitive carboxyl proteinases (PICPs). E. coli transformed with pBSK-Iys45 produced two immunopositive polypeptides (45 and 43 kDa) and the cDNA in 1274 bases encoded a 44,733-Da protein (Lys45) of 420 amino acids containing one site for a core oligosaccharide. On the other hand, E. coli transformed with pBSK-Iys60 produced several polypeptides (64, 54, 45, 41, and 37 kDa) reacting with the mAb. The cDNA contained 1629 bases and encoded a 59,231-Da protein (Lys60) of 530 amino acids containing two sites for asparagine-linked core oligosaccharides. These two cDNAs showed identities of 60.3% in nucleotide sequences and 23.6% in amino acid sequences. Lys45 and Lys60 appeared to share XXEFQK as a common antigenic domain. The amino acid sequence of the Lys45 protein showed 17.4% identity and 40.9% similarity to that of PICP from Pseudomonas sp. 101. On the other hand, Lys60 showed a 24.3% identity and 51.9% similarity with human Iysosomal PICP in the amino acid sequence. A putative active center for serine protease, GTS*xxxxxFxG, was found to be conserved among PICP homologues. The two PICPs are the first reported enzymatic markers for late Iysosomes.
Carnation petals exhibit autocatalytic ethylene production and wilting during senescence. The autocatalytic ethylene production is induced by the expression of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) synthase and ACC oxidase genes, whereas the wilting of petals is related to expression of the cysteine proteinase (CP) gene. Until recently, it has been believed that these two phenomena, autocatalytic ethylene production and wilting, are regulated in concert in senescing carnation petals, since the two phenomena occurred closely in parallel. Our studies with petals of a transgenic carnation harboring a sense ACC oxidase transgene and petals of carnation flowers treated with 1,1-dimethyl-4-(phenylsulfonyl) semicarbazide showed that the expression of ACC synthase and ACC oxidase genes and that of CP are regulated differently in carnation psanetals. Interestingly, in the petals of transgenic carnation, the transcript for CP was accumulated but the transcripts for ACC synthase and ACC oxidase were not accumulated in response to exogenous ethylene. Based on these results, we hypothesized that two ethylene signaling pathways, one leading to the expression of ACC synthase and ACC oxidase genes and the other leading to the expression of CP gene, are functioning in senescing carnation petals.
Acanthamoeba infection is difficult to treat because of the resistance property of Acanthamoeba cyst against the host immune system, diverse antibiotics, and therapeutic agents. To identify encystation mediating factors of Acanthamoeba, we compared the transcription profile between cysts and trophozoites using microarray analysis. The DNA chip was composed of 12,544 genes based on expressed sequence tag (EST) from an Acanthamoeba ESTs database (DB) constructed in our laboratory, genetic information of Acanthamoeba from TBest DB, and all of Acanthamoeba related genes registered in the NCBI. Microarray analysis indicated that 701 genes showed higher expression than 2 folds in cysts than in trophozoites, and 859 genes were less expressed in cysts than in trophozoites. The results of real-time PCR analysis of randomly selected 9 genes of which expression was increased during cyst formation were coincided well with the microarray results. Eukaryotic orthologous groups (KOG) analysis showed an increment in T article (signal transduction mechanisms) and O article (posttranslational modification, protein turnover, and chaperones) whereas significant decrement of C article (energy production and conversion) during cyst formation. Especially, cystein proteinases showed high expression changes (282 folds) with significant increases in real-time PCR, suggesting a pivotal role of this proteinase in the cyst formation of Acanthamoeba. The present study provides important clues for the identification and characterization of encystation mediating factors of Acanthamoeba.
On the basis of the semen analysis in 66 subjects, they were divided into six different groups: Group I consisted of 16 normal subjects with sperm counts of over 40 ${\times}10^6$/ml and motility of over 40 percent, Group II, 7 subjects with normal sperm counts, but motility of under 40 percent, Group III, 15 oligospermic patients with under 40 ${\times}10^6$/ml, Group IV 14 azoospermic patients, Group V, 10 patients with vasectomy and Group VI, 4 abnormal patients with 2 cases of hypoplastic testis, 1 case of Klinefelter's syndrome and 1 case of testis tumor. After seperation of semen into sperm and seminal plasma by centrifugation, the protein contents and the activities of hyaluronidase, ${\beta}$-N acetylglucosaminidase, ${\beta}$-glucuronidase, arylsulfatase, acrosin and azocoll proteinase in seminal plasma were measured. Vasectomy group has 30 percent less of total protein than normal group. For the comparison of enzyme activities of seminal plasma, it could be assumed that the enzymes in seminal plasma were not contaminated with the enzymes of spermatozoa by testing the enzymes of the seminal plasma from the vasectomy and azoospermic groups. It had been reported that hyaluronidase was only released from spermatozoa, however, the result obtained in this investigation showed that azoospermic and vasectomy group had high specific activities of hyaluronidase. The results indicated that hyaluronidase was not only from the testis but also from the male accessory sexual glands. Oligospermic group (Group III) showed the lowest total activity of hyaluronidase among them. The specific activities of ${\beta}$ -N-acetylglucosaminidase was high in oligospermic group (Group III) and low in vasectomy group (Group V). These results were contradictory with the pattern of hyaluronidase activities. This indicated that the spermatozoa which were stayed in epididymis would increase the activity of this enzyme. The specific activity of ${\beta}$ - glucuronidase was low in oligospermic and vasectomy groups. Group VI including testis tumor had remarkably high arylsulfatase activity. Arylsulfatase, a typical lysosomal enzyme, has been known to be released unusually large amounts from certain tumor cells. Arylsulfatase was also released with high activities from azoospermic and vascetomy group. This result indicated that this enzyme was also released from the sources other than testis. Acrosin, a proteolytic enzyme locating in the sperm acrosome, was not found throughout all the samples of seminal plasma. The activities of azocoll proteinase, a non-specific neutral proteinase was nearly identical in all the groups. This enzyme must have been released from the sources other than testis.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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