한국의 중부지역을 중심한 11개 지역으로부터 수집한 자료를 재료로 하여 감자바이러스를 분석한 결과 potato virus X, potato virus Y, potato virus S의 3종류의 감자바이러스 계통이 우리나라에 분포하고 있음을 알았다. 이들의 민합감심 비율은 81%를 나타냈으며 강원도 지방이 가장 적었다. 기중 pvx의 제성질을 조사한 결과 dilution end point는 $10^{-6}$ , thermal inactivation point는 7$0^{\circ}C$를 나타냈다. 입자의 크기는 550~650ml사이였다. 기중 600ml이 80%를 갖는 PVX계통이였다.
Potato virus X (PVX), the type member of Potexvirus genus, is a flexuous rod-shaped virus containing a single-stranded (+) RNA. Infection by PVX produces genomic plus- and minus-strand RNAs and two major subgenomic RNAs (sgRNAs). To understand the mechanism for PVX replication, we are studying the cis- and/or trans-acting elements required for RNA replication. Previous studies have shown that the conserved sequences located upstream of two major sgRNAs, as well as elements in the 5' non-translated region (NTR) affect accumulation of genomic and sg RNAs. Complementarity between sequences at the 5' NTR and those located upstream of two major sgRNAs and the binding of host protein(s) to the 5' NTR have shown to be important for PVX RNA replication. The 5 NTR of PVX contains single-stranded AC-rich sequence and stem-loop structure. The potential role(s) of these cis-elements on virus replication, assembly, and their interaction with viral and host protein(s) during virus infection will be discussed based on the data obtained by in vitro binding, in vitro assembly, gel shift mobility assay, host gene expression profiling using various mutants at these regions.
감자바이러스X(PVX)의 진단과 동정을 위하여 PVX를 순수분리 순화하여 항혈청을 제조하였다. PVX는 지표식물과 전자현미경으로 순수분리하여 도마도애서 증식한 개량된 방법으로 순화하었다. 순화된 PVX의 순화도는 0.59mg/ml이었으며, 이를 1-2ml씩 7일 간격으로 5회 토끼에 주사하였다. 마지막 주사후 10일에 채혈하여 항혈청을 분리하였다. 제조된 항혈청의 력가는 미량침강법에서 1/1024이었고. 한천내확산법에서도 판명한 반응을 관찰할 수 있었다.
Potato virus X (PVX-KO) showing mild mosaic and stunting symptoms on potato (Solanum tuberosum) in Kangwon area has been isolated and characterized. EM observation of the purified virus particles showed flexuous rod shape of about 520 nm in length. The coat protein (CP) of the virus had a molecular weight of 31 kDa in SDS-PAGE analysis, and the viral RNA was approximately 6.4 kb in size in denatured agarose gel electro-phoresis. In gel-immunodiffusion tests, it reacted strongly with an antiserum to common PVX from BIOREABAAG (USA). A rabbit antiserum was produced using purified virus and used for routine PVX detection by ELISA. Cultivated potatoes in Kangwon and other areas were frequently infected with PVX-KO. Both Datura stramonium and Nicotiana tabaccum cultivars developed necrotic local lesions 5 days after inoculation, and systemic mosaic symptoms with vein clearing 2 weeks after inoculation. All the features agree with the description of other PVX strains. To confirm and determine PVX strains, reverse transcription-polymerase chain reaction experiment was conducted using specific primers for viral CP. Amplified DNA fragments were cloned and sequenced. Results showed nucleotide sequence homologies of about 88 to 99% to other PVX strains. Based on CP amino acid sequence deduced from nucleotide sequences and host range studies PVX-KO is considered a member of the type X subgroup of PVX.
Park, Kyung-Seok;Paul, Diby;Ryu, Kyung-Ryl;Kim, Eun-Yung;Kim, Yong-Ki
The Plant Pathology Journal
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제22권4호
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pp.360-363
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2006
Efficacy of plant growth promoting rhizobacteria(PGPR) Bacillus vallismortis strain EXTN-1 has been proved in eliciting induced systemic resistance(ISR) in several crops. The present paper described the beneficial effects of EXTN-1 in potato as increase in yield and chlorophyll content, and plant protection against Potato Virus Y and X(PVY & PVX). EXTN-1 induced systemic resistance to the plants resulting in significant disease suppression in the field. Also the plants under treatment with EXTN-1 had higher chlorophyll content. The bacterized plants had significantly higher yields over the untreated control plants. The strain induced activation of defense genes, PR-1a and PDF 1.2 in transgenic tobacco model, which indicated the possible role of both SA, and JA pathways in EXTN-1 mediated plant protection against crop diseases.
우리나라 잎담배에 발생하고 있는 바이러스의 종류와 감염상을 조사하기 위하여 전주지방에서 Burley종 (Burley-21) 20개체, 부천연초시험장 포장에시 황색종(Hicks) 20개체를 병징별로 채집하여 혈청학적인 방법에 의해 실시했다. 검정대상 바이러스는 Tobacco mosaic virus(TMV), Cucumber mosaic virus(CMV), Alfalfa mosaic virus (AMV), Potato virus X(PVX) 및 Potato virus Y(PVY)등 5종으로 TMV, AMV, CMV는 한천내확산법으로 PVX, PVY는 미량침강법으로 실시하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 공시이병개체중에서 TMV, CMV, AMV, P X 및 PVY 등 5종의 바이러스가 검출되었다. 2. 조사된 40개체중 각 바이러스의 감염율은 AMV $67.5\%$, CMV $60.0\%$, TMV$47.5\%$PVY$17.5\%$, PVX$10.0\%$의 순이었다. 3. Burley종에서는 TMV감염율이 $15.0\%$로 황색종의 $80.0\%$보다 현저히 낮았다. 4. 조사된 각 개체는 단독감염으로부터 2-4종의 바이러스로 다양하게 혼합감염을 나타냈으며 이 중 단독감염이 $37.5\%$, 혼합감염이 $62.5\%$이었다.
2001년 이후 2005년까지 북측의 씨감자 생산은 남북 협력으로 순조롭게 진행되어 일부는 이미 3급종자(G3)까지 공급되어 증식되고 있는 실정이다. 특히 씨감자 생산 체계의 상위단계인 조직 배양과 양액씨감자(G0) 생산에서는 성공적이었으며, 다음 단계인 1급(G1)$\sim$4급종자(G4)를 어떻게 무병, 격리 조건에서 감염율을 적게 유지, 증식, 관리하느냐에 달려 있다고 해도 과언이 아닐 것이다. 벌써 상위단게 씨감자 생산의 효과가 나타나기 시작하고 있어, 특히 남북한의 지속적인 협력이 절실하다고 할 수 있다.
$Potato$$virus$$X$ (PVX) replication is precisely regulated by regulatory viral sequences and by viral and/or host proteins. In a previous study, we identified a 54-kDa cellular tobacco protein that bound to a region within the first 46 nucleotides (nt) of the 5' non-translated region (NTR) of the viral genome. Optimal binding was dependent upon the presence of an ACCA sequence at nt 10-13. To identify host factors that bind to 5' NTR elements including AC-rich sequences as well as stemloop 1 (SL1), we used northwestern blotting and matrixassisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry for peptide mass fingerprinting. We screened several host factors that might affect PVX replication and selected a candidate protein, $Nicotiana$$tabacum$ WRKY transcription factor 1 (NtWRKY1). We used a $Tobacco$$rattle$$virus$ (TRV)-based virus-induced gene silencing (VIGS) system to investigate the role of NtWRKY1 in PVX replication. Silencing of $WRKY1$ in $Nicotiana$$benthamiana$ caused lethal apical necrosis and allowed an increase in PVX RNA accumulation. This result could reflect the balancing of PVX accumulation in a systemic $N.$$benthamiana$ host to maintain PVX survival and still produce a suitable appearance of mosaic and mottle symptoms. Our results suggest that PVX may recruit the WRKY transcription factor, which binds to the 5' NTR of viral genomic RNA and acts as a key regulator of viral infection.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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