• 제목/요약/키워드: Peptide photodissociation

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Optimization of Reflectron for Kinetic and Mechanistic Studies with Multiplexed Multiple Tandem (MSn) Time-of-flight Mass Spectrometry

  • Bae, Yong-Jin;Yoon, So-Hee;Moon, Jeong-Hee;Kim, Myung-Soo
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제31권1호
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    • pp.92-99
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    • 2010
  • Photoexcitation of a precursor ion inside a cell floated at high voltage installed in a tandem time-of-flight (TOF) mass spectrometer provides triple tandem mass spectrometric information and allows kinetic and mechanistic studies. In this work, the factors affecting, or downgrading, the performance of the technique were identified. Ion-optical and computational analyses showed that an optimum instrument could be designed by utilizing a reflectron with linear-plus-quadratic potential inside. Theoretical predictions were confirmed by tests with instruments built with different ion-optical layout. With optimized instruments, masses of intermediate ions in the consecutive dissociation of a precursor ion could be determined with the maximum error of $\pm5$ Da. We also observed excellent agreement in dynamical parameters (critical energy and entropy) for the dissociation of a model peptide ion determined by instruments with different ion-optical layout operated under optimum conditions. This suggests that these parameters can be determined reliably by the kinetic method developed previously when properly designed and operated tandem TOF instruments are used.

Tyr-Ala 펩타이드 이온의 전자전이 분광 연구 (Electronic Spectroscopy of Protonated Tyr-Ala Dipeptide Ions)

  • 최창민;권장숙;김환진;윤태오;양민오;김남준
    • 대한화학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.318-323
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    • 2007
  • 양성자가 결합된 티로신-알라닌 펩타이드 이온(YAH+)의 전자전이 광분해 스펙트럼을 이 이온의 가 장 낮은 에너지의 전자전이가 관측되는 34500~36700 cm-1 영역에서 얻었다. YAH+ 이온은 전자분무 이온화법 을 이용하여 기체상에서 생성하였고 생성된 이온의 저장 및 검출은 4중극자 이온 트랩과 반사판 비행시간 질 량분석기가 결합된 혼성 질량분석기를 이용하였다. 이온 트랩에 저장된 YAH+ 이온에 레이저 펄스를 쪼여주어 광분해 반응을 유발한 후 그 광분해 정도를 레이저 파장에 따라 측정함으로써 전자전이 광분해 스펙트럼을 얻 었다. 이 스펙트럼에는 두 개의 넓은 폭을 가진 피크가 관측되었으며 시간-의존 밀도함수 법(Time-dependent density functional method, TD-DFT)을 이용한 계산을 통해 각각 YAH+의 S1과 S2 전이로 지정하였다. 관측된 피 크들의 넓은 폭은 상온에서 존재 가능한 YAH+의 여러 이형태체들의 전자전이 간 겹침과 또한, 상온에서 형성 된 이온의 들뜬 진동에너지 준위로부터의 전자전이 즉, 뜨거운 띠(hot band)들 때문인 것으로 설명하였다.