• Journal of Plant Biotechnology
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• 제31권4호
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• pp.319-323
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• 2004

Euphorbia lathyris의 유관세포로부터 분비되는 수용성 latex단백질을 10% SDS-polyacrylamide 전기영동으로 분리하여 특징적으로 잘 나타나고 있는 ELp65, ELp55, ELp43, ELp32 그리고 ELp23 등의 주요단백질을 확인하였다. 이들 latex 주요단백질들 중에서 ELp65는 ammonium sulfate 침전, gel permeation chromatography 그리고 ion exchange chromatography 등의 방법으로 순수 분리하였는데 ELp65의 N-terminal amino acid 서열분석에 의하면 이는 토마토의 p69a subtilisin-like pretense의 mature peptide의 앞부분과 강한 유사성을 지니고 있었으며 식물방어와 관련된 기능이 제시되었다. PCR증폭에 의하여 클로닝된 토마토의 p69a DNA를 probe로 이용하여 Southern blot hybridization을 수행한 결과 E. lathyris genome은 토마토의 subtilisin-like proteases와 유사한 정보를 지닐 수도 있는 3-5 유전자들로 구성된 gene family가 분석되었다.

• Bioinformatics and Biosystems
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• 제1권2호
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• pp.109-114
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• 2006

프로테오믹스에서 얻는 탄뎀 질량 스펙트럼은 효소로 가수분해된 펩타이드의 전구이온(precursor ion) 분자량과 펩타이드에 에너지를 가하여 생성된 이온조각(fragment ion)들의 분자량값들로 구성된다. 탄뎀 질량스펙트럼의 전구이온 분자량은 단백질 서열 데이터베이스에서의 검객 과정에서 가장 먼저 고려하는 값이다. 단백질 검색 프로그램은 단백질 서열 중에 스펙트럼의 전구이온으로부터 계산된 분자량과 일치하는 펩타이드 서열들을 찾아내고, 이들 중의 하나를 이온조각들의 분자량 정보를 이용해서 선택한다. 이 때에 전구이온의 분자량은 사용자가 지정한 오차범위 내에서 일치하는 감을 검색하는데, 이때의 오차범위는 질량분석기의 정확도에 따라 결정된다. 본 논문에서는 인간 혈액의 혈장시료로부터 FT LTQ 질량분석기를 통해 얻어진 탄뎀 질량 스펙트럼에서 전구이온 분자량의 분포를 역순서열을 이용하여 분석하였다. 전구이온 분자량의 분포를 재해석하여 실험값의 정확도를 보정하고 단백질 동정의 성능을 향상시키는 방법을 모색하였다.

• 한국수산과학회지
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• 제29권2호
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• pp.246-255
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• 1996

연속식 3단계 막반응기로부터 각 단계별로 분리한 가자미피 젤라틴 가수분해물의 항산화성을 측정한 결과, 2단계 가수분해물의 항산화력이 가장 뛰어날 뿐만 아니라, 천연항산화제인 $\alpha-tocopherol$보다 $10\%$ 정도의 높은 항산화력을 나타낸 반면, 1단계 및 3단계 가수분해물은 $\alpha-tocopherol$보다 오히려 $10\~15\%$ 정도 낮은 항산화력을 보였다. 가수분해물의 첨가한 농도에 따른 항산화성은 유지중량에 대해 $1.0\%(w/w)$로 첨가한 농도에서 최대 항산화력을 나타내었다. 한편, 천연항산화제인 $\alpha-tocopherol$과 합성항산화제인 BHT와의 상승효과를 검토한 결과, 각 단계별 가수분해물은 $\alpha-tocopherol$과 우수한 상승효과를 관찰할 수 있었으며, 그 중 2단계 가수분해물의 상승효과가 가장 강하였다. 또한 항산화성이 가장 뛰어난 2단계 가수분해물로부터 gel column, ion exchange column 및 ODS column을 사용하여 항산화력이 특히 우수한 부분만을 분리한 단일 펩티드를 간세포에 첨가하여 세포생존율에 미치는 효과를 관찰한 결과, TBHP의 독성에 대해 펩티드 첨가구가 무첨가구에 비해 세포생존을 연장시켰으며, lipid peroxidation측정에서도 세포의 산화를 억제함으로써 세포의 생존율을 높였다.

• 한국식품과학회지
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• 제27권2호
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• pp.230-234
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• 1995

식품 유래의 생리활성 peptide를 분리할 목적으로 전통발효식품인 된장으로부터 혈압강하기능을 가지는 ACE(angiotensin converting enzyme)저해활성 peptide를 분획하였다. 시판 된장의 동결건조분말을 냉수로 추출했을 때 총질소의 회수율은 추출시간 30분에 73.3%를 보였다. 용매추출액에서 고분자 polypeptide를 제거하고 저분자 peptide만을 얻기 위해 PM-10 membrane(Amicon)을 이용하여 3시간 동안 한외여과한 결과, 질소성분의 회수율은 80.8%, 염의 회수율은 99.2%에 달했고 투과액의 ACE $IC_{50}$은 $41.8{\mu}g/ml$이었다. 한외여과 투과액을 reverse phase prep-HPLC로 분획하여 7개의 획분을 얻었으며, 그 중 F5분획물의 ACE저해활성이 $IC_{50}=6.8{\mu}g/ml$로 비활성이 가장 높았다. 염은 F1분획물에서 모두 회수되었다. F5분획물을 ion exchange prep-HPLC로 다시 분획하여 얻은 5개의 모든 획분에서 높은 비활성을 보였다($IC_{50}=2.5{\sim}8.3{\mu}g/ml$). 그 중 F53분획물의 비활성이 가장 높았으며($IC_{50}=2.5{\mu}g/ml$), F53의 구성아미노산 분석 결과 histidine의 함량이 특징적으로 높았다.

• KSBB Journal
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• 제25권4호
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• pp.395-400
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• 2010

본 연구에서는 파파인으로 가수분해된 피브로인 펩타이드에 글리세롤을 추가하고 동일한 효소인 파파인을 이용하여 글리세릴 에스터 결합을 형성시키는 반응을 수행하였다. 피브로인 펩타이드 10%와 글리세롤 50% 포함된 반응용액을 pH 3, $40^{\circ}C$의 반응 조건에서 글리세릴 에스터가 생성됨을 ESI 질량 분석을 통하여 확인하였다. 아울러 반응전 시료의 펩타이드의 조성과 생성된 글리세릴 펩타이드 에스터의 조성으로부터 헥사 및 옥타펩타이드의 비율은 감소하였고 디펩타이드와 테트라펩타이드의 글리세릴 에스터가 반응 생성물을 주로 구성되어 있으며 특히 AG-OGl의 조성이 증가하였음을 확인하였다. 글리세릴 펩타이드를 양이온교환수지 칼럼을 사용하여 미반응된 펩타이드와 분리하여 17.8%의 수율로 수득하였고, 이 시료를 FT-IR로 분석하여 펩타이드의 C말단의 $COO^-$의 감소를 확인하여 글리세릴 펩타이드임을 재확인하였다.

• 한국식품영양과학회지
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• 제42권7호
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• pp.1162-1166
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• 2013

해바라기씨박 단백질 가수분해물로부터 철분 결합 펩타이드를 분리하기 위해 해바라기씨박 단백질을 단백 가수분해 효소인 alcalase와 flavourzyme을 이용하여 가수분해하였고, 가수분해물을 3 kDa 이하로 한외여과를 하였다. 한외여과된 가수분해물은 QAE Sephadex$^{TM}$ A-25 column과 Superdex$^{TM}$ peptide 10/300 GL column을 사용하여 철분 결합 펩타이드를 분리하였고, 분리된 분획 중 철분 결합력이 가장 높은 F22를 얻었다. 본 연구에서 얻어진 해바라기씨박 단백질 가수분해물로부터 분리된 분획들은 향후 기능성식품 소재 원료로 사용될 수 있다고 판단된다.

• BMB Reports
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• 제40권1호
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• pp.113-118
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• 2007

Tolaasin, a pore-forming peptide toxin, is produced by Pseudomonas tolaasii and causes brown blotch disease of the cultivated mushrooms. P. tolaasii 6264 was isolated from the oyster mushroom damaged by the disease in Korean. In order to isolate tolaasin molecules, the supernatant of bacterial culture was harvested at the stationary phase of growth. Tolaasin was prepared by ammonium sulfate precipitation and three steps of chromatograpies, including a gel permeation and two ion exchange chromatographies. Specific hemolytic activity of tolaasin was increased from 1.7 to 162.0 HU $mg^{-1}$ protein, a 98-fold increase, and the purification yield was 16.3%. Tolaasin preparation obtained at each purification step was analyzed by HPLC and SDS-PAGE. Two major peptides were detected from all chromatographic preparations. Their molecular masses were analyzed by MALDI-TOF mass spectrometry and they were identified as tolaasin I and tolaasin II. These results demonstrate that the method used in this study is simple, time-saving, and successful for the preparation of tolaasin.

• Mass Spectrometry Letters
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• 제6권2호
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• pp.31-37
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• 2015

Phosphorylation upon protein is well known to a key regulator that implicates in modulating many cellular processes like growth, migration, and differentiation. Up to date, grafting of multidimensional separation techniques onto advanced mass spectrometry (MS) has emerged as a promising tool for figuring out the biological functions of phosphorylation in a cell. However, advanced MS-based phosphoproteomics is still challenging, due to its intrinsic issues, i.e., low stoichiometry, less susceptibility in positive ion mode, and low abundance in biological sample. To overcome these bottlenecks, diverse techniques (e.g., SCX, HILIC, ERLIC, IMAC, TiO₂, etc.) are continuously developed for on-/off-line enrichment of phosphorylated protein (or peptide) from biological samples, thereby helping qualitative/quantitative determination of phosphorylated protein and its phosphorylated sites. In this review, we introduce to the overall views of enrichment tools that are universally used to selectively isolate targeted phosphorylated protein (or peptide) from ordinary ones before MS-based phospoproteomic analysis.

• Mass Spectrometry Letters
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• 제9권2호
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• pp.56-60
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• 2018

In this study, matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) was applied to the TEMPO-assisted FRIPS for the first time. We found that 3-HPA is the optimal matrix for the analysis of p-TEMPO-Bz-Sc-peptides, which gives minimal precursor fragmentations. MALDI-TOF/TOF experiments on p-TEMPO-Bz-Sc-peptides yielded mainly $[a_n+H]^+$, $[z_n+H]^+$, and $[y_n]^+-type$ products, indicating that radical-driven peptide fragmentation occurs in MALDI-TOF/TOF-MS.

• Journal of Photoscience
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• 제8권3_4호
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• pp.123-126
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• 2001

We have attempted to determine the Germanium ion (G $e^{4+}$) effect on the human body by observing the formation of artificial lipid membrane and photolysis in the mineral water containing G $e^{4+}$ ion. The artificial lipid membrane is prepared by using the phospholipid in the Germanium water and the formation efficiency of the liposomes is compared with those obtained in the plain mineral water without G $e^{4+}$ ion. This work shows that the liposomes are formed in the Germanium water better than in the non-Germanium water. The liposomes can be photolyzed by superoxide anion ( $O_{2-}$$^{.}$) produced in the presence of some peptide such as NAT (N-acethyl-L-tryptophan). However, this is inhibited by superoxide dismutase (SOD), and it was found that the activity of SOD on the inhibition of the liposomes oxidative damage is higher in the Germanium water than in the non-Germanium water. It is concluded that the G $e^{4+}$ ion in mineral water helps the formation of new cell as well as elevation of SOD activity for the lipid oxidation.n.