From the Panax ginseng chloroplast, the psbE and psbF genes, encoding the $\alpha$- and $\beta$-subunits of cytochrome b-559 of the photosystem II reaction center, respectively, were cloned and characterized. The psbE and psbF genes were composed of 252 and 117 nucleotides, respectively. The deduced amino acid sequence of the $\alpha$-subunits showed 95%, 93%, and 91% homology to monocots, dicots, and liverwort, respectively, whereas the $\beta$-subunits showed approximately 98% to 95% homology to the same species. Southern blot analysis revealed that a single copy of the psbEF gene exists in the chloroplast plastid. Northern blot analysis indicated that the psbE and psbF genes are cotranscribed as a polycistron.
한국 공영방송은 정체성 위기와 함께 지배구조 개선 논의에 직면해 있다. 공영방송의 위기 원인을 분석하기 위해 공영방송 종사자와 미디어 관련 전문가의 인식을 바탕으로, 공영방송의 거버넌스 구성요인에 대해 유형화를 시도하였다. 연구 결과는 다음과 같이 요약된다. 첫째, 공영방송 거버넌스는 시장 영향력, 정치적 영향, 전문직주의, 공영방송 제도보장 등 4개 요인으로 유형화되었다. 둘째, 공영방송 거버넌스 요인 중 정치적 영향만이 공영방송의 위기 인식에 유의적인 영향을 미치는 것으로 분석되었다. 셋째, KBS이사회를 구성하는 방식과 인원 비율이 정치적 영향 요인에 유의적인 영향을 미치는 것으로 분석되었다. 이러한 연구결과는 한국 공영방송이 정당성과 정체성 확보를 위해 정치적 영향으로부터 떨어진 공영방송 지배구조 개선이 필요함을 확인해 준다.
The psbA gene of photo system II was cloned and characterized from the P. ginseng chloroplast. The psbA gene is composed of 1,062 nucleotides. The overall amino acid sequence shows 99% and 98% identities to dicots and monocots of higher plants, respectively. Southern blot analysis revealed that a single copy of the psbA gene existed in the chloroplast genome. Northern blot analysis of the in vivo accumulation of the psbA transcript, after being grown under the different intensities (5%, 10%, 20%, and 100%) of daylight, indicated that the steady-state level of the psbA transcript was not significantly affected by light intensity.
The psbC gene, encoding the intrinsic chlorophyll-binding protein of CP43, one of the PS core complex polypeptides, was cloned from the Panax ginseng chloroplast, which is composed of 1,422 nucleotides and the overall nucleotide sequence shows more than 84% identity to those of eukaryotic photosynthetic organisms. The predicted topology of CP43, based on hydropathy analysis, includes six membrane-spanning ${\alpha}-helices$ resulting in three lumenal and four stromal loops. The putative translation start codon for the psbC gene is located at 48 nucleotides upstream from the stop codon of the psbD gene whose product is also a component of the PSII reaction center, implying that the promoter of the psbC gene is possibly located in the middle of the structural gene of the psbD gene. Northern blot analysis of the in vivo accumulation of the psbC transcript from the plants grown under the various growth light intensities (5%, 10%, 20%, and 100%) of daylight indicated that the steady-state level of the psbC transcript was not significantly affected by light intensity.
Photosynthesis uses light energy to drive the oxidation of water at an oxygen-evolving catalytic site within photosystem II (PSII). Chlorophyll binding by the photosystem II subunit S protein, PsbS, was found to be necessary for energy-dependent quenching (qE), the major energy-dependent component of non-photochemical quenching (NPQ) in Arabidopsis thaliana. It is proposed that PsbS acts as a trigger of the conformational change that leads to the establishment of nonphotochemical quenching. However, the exact structure and function of PsbS in PSII are still unknown. Here, we clone and express the recombinant PsbS gene from Arabidopsis thaliana in E. coli and purify the resulting homogeneous protein. We used various biochemical and biophysical techniques to elucidate PsbS structure and function, including circular dichroism (CD), fluorescence, and DSC. The protein shows optimal stability at $4^{\circ}C$ and pH 7.5. The CD spectra of PsbS show that the conformational changes of the protein were strongly dependent on pH conditions. The CD curve for PsbS at pH 10.5 curve had the deepest negative peak and the peak of PsbS at pH 4.5 was the least negative. The fluorescence emission spectrum of the purified PsbS protein was also measured, and the ${\lambda}_{max}$ was found to be at 328 nm. PsbS revealed some structural changes under varying temperature and oxygen gas condition.
소수성실리카를 안정제로 하는 현탁중합반응법을 이용하여 합성한 스티렌(St)/부틸메타크릴레이트(BMA) 공중합체 (co-PSB) 입자의 전단점도를 모세관 레오미터 (capillary rheometer)를 이용하여 $170^{\circ}C$에서 측정하였다. co-PSB 입자의 전단점도는 중량평균분자량이 74,800 g/mol 이하인 경우 낮은 전단속도에서는 뉴톤거동을 보였다. 중량평균분자량이 136,800 g/mol을 초과하면서 전단점도는 전단속도의 전 영역에 걸쳐 감소하였고 전단속도에 대한 기울기의 절대값은 분자량의 증가와 함께 증가하였다. St/BMA의 구성비가 7/3, 5/5 및 3/7의 co-PSB 입자는 유사한 분자량을 나타내었지만 BMA의 구성비가 증가하면서 유리전이온도와 전단점도는 감소하였다. St/BMA의 구성비가 1/9 인 co-PSB의 경우 유리전이온도는 더욱 감소하였으나 초기 전단점도는 크게 증가하였다. 카본블랙을 함유하는 co-PSB 복합체 입자의 전단점도는 카본블랙의 증가에 따라 증가하였으나, 카본블랙의 농도에 따른 전단점도의 변화는 분자량 및/혹은 구성비의 변화 효과에 비교하여 미약하였다.
Zygnema is a conjugating filamentous green algal genus that is distributed in a broad range of freshwater habitats, from sea level to alpine summits. Although more than 150 species have been described worldwide, their taxonomy remains unclear, probably owing to their relatively simple morphology. We investigated the detailed morphology of Korean Zygnema species, combined with analysis of the plastid psbA gene from 22 specimens of the genus and putative relatives, in order to develope a key to their identification and isolation, and to determine their relationships. We recognized two species of Zygnema; Z. insigne and Z. leiospermum, based on morphological characters such as width of the vegetative cell, position of zygospores, dimensions and form of spores, shape of female gametangia, and color of mesospores. The analysis of psbA data was consistent with morphological comparison. The pairwise divergence between two species was 3.7-4.1% (34-38 bp) in psbA sequences. The phylogeny of psbA revealed the monophyly of Z. insigne and Z. leiospermum together with two isolates of Z. circumcarinatum from Germany and Scotland. This is the first report on the psbA gene phylogeny of Zygnema.
Photosynthetic bacteria (PSB) play an important role in water purification, and their application is beneficial for sustainable aquaculture. However, maintaining the microbial stability of PSB from subculturing to preservation is a challenging task. Since improvement in the microbial stability of PSB is a crucial parameter, optimized conditions for cell immobilization and lyophilization were investigated. In PSB immobilization, 0.1-M CaCl2 was found to be the most effective divalent metal ion solution in terms of cost-effectiveness, resulting in beads with a 4-mm diameter and high loading (1.91×109 CFU/mL) of viable cells. Maintenance of cell viability, external appearance, and color of PSB beads was best in 3.5% NaCl during storage. In lyophilization, the addition of skim milk (9%) and dextrose (2%) as cryoprotective additives allowed the highest cell viability. Over an 18-week shrimp breeding period, when optimally manufactured beads and lyophilized powder of PSB were applied to shrimp aquaculture water, NH4+, NO3-, and NO2- were more effectively removed by 55%, 100%, and 100%, respectively, compared to controls. Thus, microbial stability of PSB through optimized cell immobilization and lyophilization was successfully enhanced, enabling a wide application.
본 연구는 DNA수준에서 인삼의 종내 및 종간 개체간의 유전변이를 확인할 수 있는 새로운 방법인 PCR-aided RFLP를 사용하여 품종육성의 기초자료로 삼고자 수행하였다. 인삼의 엽록체 DNA중 psbA gene과 rbcL gene을 제한효소처리하여 그 band 양상을 조사하고자 하였다. Chloroplast DNA 중 psbA gene과 rbcL gene을 분리하기 위하여 각각 psbA-N, psbA-C primer 및 rbcL-N, PX-1 primer를 사용한 결과 적정 분자량인 psbA gene은 1,008bp에서, rbcL gene은 1,336 bp에서 band가 나타났다. 또한 atpB gene, rpoB gene, trn gene을 분리하기 위한 primer를 사용한 결과 역시 예상 대로 1,366bp, 900bp, 1,500bp, 1,008bp에서 band가 나타났다. PCR에 의하여 분리한 psbA gene과 rbcL gene을 sau3A, Taq1, Alu1, HaeIII 등의 제한효소로 절단하여 RFLP양상을 조사한 결과 모든 인삼에서 TaqI 제한효소 처리구에서 KG Line 과 종 및 변종간 모두 절단이 되었으며 800bp에서 band가 위치하고 있다. AluI의 제한효소 처리구에서도 KG Line과 유전자원에서 800bp인 동일한 band를 보였다. 제한효소 HaeIII에서는 KG Line의 경우 500bp의 위치에서 희미하게 band를 동일하게 보였다. 그러나 유전자원에 있어 HaeIII 제한효소처리구에서는 band가 관찰되지 않아 KG Line과 차이를 보였다. 모든 chloroplast gene은 PCR 증폭에 의하여 밴드를 형성하였으나 제한효소 처리후 각 인삼 종내 또는 종간 식별이 용이하지 않아서 좀 더 많은 제한효소를 사용하거나 증폭된 DNA를 염기서열을 분석하여 비교하는 방법이 고려 되어야 할 것으로 사료된다.
연구배경: 기계호흡을 하고 있는 환자에서 폐렴은 흔히 일어나는 병원 감염이며 사망률도 높은 것으로 알려져 있으나 임상적인 폐렴 진단 기준이나 일반적으로 시행하는 객담의 정성배양법은 폐렴 진단에 오류가 많기 때문에 PSB를 이용한 정량배양법이 진단에 이용되고 있으나, PSB를 쉽게 이용할 수 없는 경우가 있어 비교적 용이하게 이용할 수 있는 EA의 정량배양의 진단적 가치에 대하여 연구하였다. 방법: 72시간 이상 기계호흡을 하고 있는 환자중 임상적으로 폐렴이 의심되는 환자 10명과, 대조군 5명을 대상으로 EA와 PSB를 이용하여 추출한 객담을 정량 배양하였다. 결과: EA와 PSB의 정량배양에서 폐렴의 진단 기준을 각각 $10^5cfu/ml$, $10^3cfu/ml$으로 정할때 PSB에서 민감도 70%, 특이도 80%, 양성예측치 88%, 음정예측치 57%, 정확도 73%, EA에서 민감도 70%, 특이도 60%, 양성예측치 78%, 음성예측치 50%, 정확도 67%였다. 결론: 저자들의 조사결과 기계호흡을 하는 환자의 폐렴진단에서 객담의 정량배양시 cut-off point를 EA에서 $10^5cfu/ml$ 이상 배양된 경우로 정할때, 민감도 70%, 특이도 60%, 양성예측도 78%로서 특이도가 EA 보다 높은 PSB를 대치하지는 못하지만 기관지 내시경을 사용할 수 없는 환자에서 유용하리라고 추측되나 더 많은 연구가 필요하리라 사료된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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