• 제목/요약/키워드: PPIase purification

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Bacillus stearothermophilus Peptidyl Prolyl cis-trans Isomerase의 정제 및 유전자 분석 (Purification and Gene Analysis of Peptidyl Prolyl cia-trans Isomerase from Bacillus stearothermophilus)

  • 김동주
    • 한국식품영양학회지
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    • 제15권2호
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    • pp.104-111
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    • 2002
  • 호열균 B. stearotheymophilus으로부터 단백질 고차구조 형성을 촉진하는 내열성 PPIase를 정제하기 위해, 이 균체를 대량으로 배양 집균, 파쇄하여 효소활성을 측정하였다. 효소의 활성측정은 N-succinyl-Ala-Ala-Pro-Phe-p-nitroanilide(pAN)를 기질로 사용하였다. chymotrypsin은 기질 이성체(cis-trans 형)의 한쪽(trans)만을 특이적으로 분해하는 반응을 이용하여 PPIase 활성을 측정하였다. 호열균 추출시료로 부터 효소활성을 확인한 후, DEAE-sepharose CL-6B, Sephadex G-75로 정제 후, 최종적으로 Superose TM-12 (FPLC) gel-필트레이션으로 분자량 18kDa의 본 효소를 정제하였다. 정제한 효소의 화학적 특징을 조사한 결과 pH 7.5~8.0사이에 안정하였으며, 최적 pH는 8.0으로 나타났다. 그리고 $65^{\circ}C$에 30분간 열처리 후, 효소활성을 측정한 결과 50%이상의 잔존 활성을 갖는 내열성 효소임을 확인하였다. 정제 단백질의 N-말단 아미노산 분석은 Edman 분해법으로 39 아미노산 잔기를 결정하였다. 그리고 PPIase의 재구성(refolding) 반응은, 요소로 변성시킨 기질 RNase 1을 이용하여 이 단백질의 재구성 (refolding) 실험을 조사한 결과, PPIase는 변성 기질 RNase 1의 재구성(refolding)을 촉진하는데 높은 효과를 가지고 있었다. 호열균 유전자 라이브러리로부터 PPIase 유전자 약 3kb을 클로닝하였다. 재조합 플라스미드 cPI-40에서 프라이머(A-1, B-2)를 이용하여 PPIase N-말단을 코드하는 유전자를 PCR법으로 증폭하여, 염기배열을 결정한 결과 증폭된 단편은 165염기로 형성된 55 아미노산 잔기를 코드하는 open reading frame(ORF)가 연속되고 있었다. 그리고 Edman법으로 결정한 PPIase의 39아미노산 잔기가 이 배열내에 완전히 보존되어 있었다. 이 결과로부터 이 ORF는PPIase구조 유전자의 1/3에 해당하는 단편임을 확인하였다.

A New Cyclophilin Inhibitor from Ganoderma lucidum: Purification and Characterization

  • Lim, Jin-Ik;Jeong, Ki-Chul;Kang, In-Sug;Kim, Soo-Ja
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제25권7호
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    • pp.1055-1060
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    • 2004
  • A new inhibitor for peptidylprolyl cis-trans isomerase (PPIase) has been isolated from Ganoderma lucidum and purified to homogeneous state by organic solvent extraction. The purified PPIase inhibitor (GPI) is assumed to be a membrane-associated glycoprotein. GPI inhibits specifically the bovine brain PPIase, a cyclophilin, and has no effect on the FKBP activity. The results of our chemical modification study of GPI indicate the presence of Lys residue(s) at or near its binding site. Like CsA-cyclophilin complex, GPI-bovine brain PPIase complex strongly inhibits the calcineurin activity in vitro, suggesting the possible involvement of GPI in immunomodulating pathway by the formation of PPIase-inhibitor-calcineurin complex.

Cyclosporin A Binding Protein Type-19 kDa Peptidyl-Prolyl Cis/Trans Isomerase from Euglena gracilis

  • SONG HYUK-HWAN;PARK SUNG-YONG;LEE CHAN
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제15권5호
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    • pp.1047-1053
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    • 2005
  • Cyclosporin A binding protein type-19 kDa peptidyl-prolyl cis/trans isomerase (PPIases, EC 5.2.1.8) of Euglena gracilis was purified and some of its biochemical characters were elucidated. Purification of the PPIase was achieved by employing a series of steps involving ammonium sulfate precipitation, Superdex G-75 gel filtration chromatography, Mono­Q anion and Mono-S cation exchange chromatographies, and Superdex S-200 gel filtration chromatography on FPLC. Purified PPIase had a specific activity of 8,250 units/mg, showing a 27-fold increase compared with that of cell-free extract of Euglena gracilis. The enzyme consisted of a single polypeptide chain with a molecular mass of 19 kDa. It showed high substrate specificity to succinyl-Ala-Ala-Pro-Phe-p-nitroanilide, and $k_{car}/K_{m}$, for this substrate was found to be $61.19{\times}10^5/sec$. The isomer distributions were investigated at an equilibrium of seven different peptide substrates, varying Xaa in Suc-Ala-Xaa-Pro-Phe-p-nitroanilide in dimethylsulfoxide. The cis/trans equilibrium constants were estimated to be from 0.14 (Ile) to 0.63 (Gly), which correspond to $12.00\%\;to\;38.52\%$ of the cis population, respectively, under experimental condition. The enzyme was highly sensitive to the immunosuppressive ligand cyclosporin A, but not to other immunosuppressants such as FK506 and rapamycin. Thus, it appears to belong to the class of cyclophilin.