• 제목/요약/키워드: PNA

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HomePNA 2.0에서의 새로운 충돌해결 알고리즘 (A Novel collision resolution algorithm in HomePNA 2.0)

  • 윤원진;김희천;정민영
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2004년도 추계학술발표논문집(상)
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    • pp.579-582
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    • 2004
  • HomePNA(Home Phoneline Networking Alliance)는 가정에서 전화선을 이용하여 2대 이상의 통신기기들을 서로 공유할 수 있도록 하는 네트웍 솔루션으로, HomePNA2.0은 기존의 HomePNAl.0과 호환성을 유지하면서도 10Mbps로 전송 가능한 새로운 규격이다. 1999년에 규격이 발표되었으며, CSMA/CD를 기반으로 한 DFPQ (Distribute Fair Priority Queueing)방식의 충돌해결 방법을 사용하고 있다. 본 논문에서는 기존 DFPQ에 기반을 둔 새로운 알고리즘을 제안하고, 기존 DFPQ와 비교 및 분석한다.

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HFC-CATV 망에서 동적 우선순위 충돌해결알고리즘에 관한 연구 (Study on Dynamic Priority Collision Resolution Algorithm in HFC-CATV Network)

  • 이수연;정진욱
    • 정보처리학회논문지C
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    • 제10C권5호
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    • pp.611-616
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    • 2003
  • 최근 HFC(Hybrid Fiber Coax) CATV 망이 초고속망의 하부구조로 자리를 잡아가고 있다. HFC-CATV 망의 상향채널은 가입자에서 헤드엔드로 데이터 전송시 500가입자 이상이 공유하기 때문에 충돌이 발생하게 된다. 특히, 음성, 비디오 그리고 데이터와 같은 다양한 종류의 트래픽 QoS(Qualify of Service)를 만족시키기 위해서 서비스별로 우선순위를 고려한 알고리즘이 요구되어진다. IEEE 802.14에서 제안된 우선순위 기반 3진 트리(Ternary tree)알고리즘은 정적 PNA(Priority New Access) 슬롯 구조를 가진다. 이 방법은 실시간으로 변화하는 트래픽의 요구 지연(request delay)이 높게 유지되며 서로 다른 우선순위 트래픽의 요구 경쟁 확률이 동일하다는 문제점을 가지고 있다. 따라서, 본 논문에서는 동적 PNA(Priority New Access) 슬롯 구조를 제안하여 높은 우선순위 트래픽의 요구지연을 낮게 하고 새로운 스테이션에 대해 우선순위 별로 경쟁 확률을 다르게 하는 알고리즘을 제안한다. 동일한 조건하에 두 알고리즘에 대해 요구지연 값을 비교 분석하였다. 성능 분석 결과 동적 PNA 우선순위 충돌해결알고리즘이 정적 PNA 우선순위 충돌해결알고리즘보다 낮은 요구지연을 가진다는 것을 확인할 수 있었다.

Novel Peptide Nucleic Acid Melting Array for the Detection and Genotyping of Toxoplasma gondii

  • Suh, Soo Hwan;Yun, Han Seong;Lee, Sang-Eun;Kwak, Hyo-Sun
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제47권4호
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    • pp.645-650
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    • 2019
  • Despite differences in virulence between strains of Toxoplasma gondii, rapid and accurate genotyping methods are lacking. In this study, a method was developed to detect and genotype T. gondii in food and environmental samples using PCR and a novel peptide nucleic acid (PNA) melting array. An alignment of genome sequences for T. gondii type I, II, and III obtained from NCBI was generated, and a single nucleotide polymorphism analysis was performed to identify targets for PCR amplification and a PNA melting array. Prior to the PNA melting array, conventional PCR was used to amplify GRA6 of T. gondii. After amplification, the PNA melting array was performed using two different PNA hybridization probes with fluorescent labels (FAM and HEX) and quenchers. Melting curves for each probe were used to determine genotypes and identify mutations. A 214-bp region of the GRA6 gene of T. gondii was successfully amplified by PCR. For all T. gondii strains (type I, II, and III) used to evaluate specificity, the correct genotypes were determined by the PNA melting array. Non-T. gondii strains, including 14 foodborne pathogens and 3 protozoan parasites, such as Giardia lamblia, Cryptosporidium parvum, and Entamoeba histolytica, showed no signal, suggesting that the assay has a high specificity. Although this is only a proof-of-concept study, the assay is promising for the fast and reliable genotyping of T. gondii from food and environmental samples.

발생기 흰쥐 대뇌 피질의 복합당질에 미치는 ethylene glycol monoethyl ether의 영향 (The Effects of EGEE on Lectins Binding Pattern of Rat Cerebral Cortex in Developmental Phase)

  • 이응희;조운복
    • 생명과학회지
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    • 제16권6호
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    • pp.1014-1028
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    • 2006
  • 발생기 흰쥐 대뇌피질 발생에 따른 복합당질의 발현 양상 및 이에 미치는 EGEE 영향을 구명하기 위해, 태생 14일, 태생 18일, 생후 수유기 및 이유기와 성제 대뇌를 각 부위로 나누어 복합당질의 당잔기 변화 양상을 9종의 biotinylated lectin(DBA, SBA, PNA, BSL-1, sWGA, RCA-1, UEA-1 Con A 및 LCA)으로 관찰하였다. EGEE 투여시 발생기에 따라 대뇌피질층에 공통적으로 나타나는 렉틴은 Con A 와 LCA 이었고, PNA와 RCA-1은 피질 부위에 따라 부분적으로 나타나 대조군에 비해 결합반응을 보인 렉틴의 수가 감소하였고 DBA, SBA, BSL-1, RCA-1 및 UEA-1은 나타나지 않았다. EGEE 투여시 전 시기에 걸쳐 Con A는 대조군과 유사한 반응을, LCA는 대조군에 비해 태생기, 수유기 및 이유기 때에 반응성이 증가되어 나타났다. 태생기 때 SBA와 sWGA에는 반응성이 나타나지 않았고, PNA는 전두엽피질과 후두엽피질에서 감소하였으며, 두정엽피질과 측두엽피질에서는 반응이 없었다. 수유기 때 PNA는 대조군에 비해 반응이 감소되었고, sWGA에는 반응이 없었으며, 이유기 때에는 sWGA와 PNA에 반응이 나타나지 않았다. 그리고, 성체기 때에는 PNA와 sWGA에 반응이 없었고, Con A에 대해 반응이 감소되었으며, LCA는 전두엽피질와 후두엽피질에서 반응이 감소되었다. 위의 결과로 보아, 환경 호르몬인 EGEE가 대뇌피질의 각 부위에 미치는 영향의 차이는 있지만, 대뇌피질 분화와 성장에 조직병리학적으로 심한 영향을 마치고, 특히 수유기에서 제일 심하였고, 대뇌피질의 $galactosyl-({\beta}-1,3)-N-acetyl-D-galactosamine$, ${\beta}-N-acetyl-D-galactosamine$, ${\beta}-N-acetyl-D-glucosamine$은 감소하고, ${\alpha}-D-mannose$${\alpha}-D-glucose$가 증가하여 이들 당대사에 심한 영향을 미치며, 태생기, 수유기에서 제일 심한 영향을 미쳤다.

EGFR 돌연변이 검출에 있어 PNA-Mediated Real-Time PCR Clamping과 직접 염기서열 분석법의 비교 분석 (Comparative Analysis of Peptide Nucleic Acid (PNA)-Mediated Real-Time PCR Clamping and DNA Direct Sequencing for EGFR Mutation Detection)

  • 김희정;김완섭;신경철;이관호;김미진;이정은;송규상;김선영;이계영
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제70권1호
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    • pp.21-27
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    • 2011
  • Background: Although the gold standard method for research trials on epidermal growth factor receptor (EGFR) mutations has been direct sequencing, this approach has the limitations of low sensitivity and of being time-consuming. Peptide nucleic acid (PNA)-mediated polymerase chain reaction (PCR) clamping is known to be a more sensitive detection tool. The aim of this study was to compare the detection rate of $EGFR$ mutation and EGFR-tyrosine kinase inhibitor (TKI) responsiveness according to $EGFR$ mutation status using both methodologies. Methods: Clinical specimens from 112 NSCLC patients were analyzed for $EGFR$ mutations in exons 18, 19, 20, and 21. All clinical data and tumor specimens were obtained from 3 university hospitals in Korea. After genomic DNA was extracted from paraffin-embedded tissue specimens, both PNA-mediated PCR clamping and direct-sequencing were performed. The results and clinical response to $EGFR$-TKIs were compared. Results: Sequencing revealed a total of 35 (22.9%) mutations: 8 missense mutations in exon 21 and 26 deletion mutations in exon 19. PNA-mediated PCR clamping showed the presence of genomic alterations in 45 (28.3%) samples, including the 32 identified by sequencing plus 13 additional samples (6 in exon 19 and 7 in exon 21). Conclusion: PNA-mediated PCR clamping is simple and rapid, as well as a more sensitive method for screening of genomic alterations in $EGFR$ gene compared to direct sequencing. This data suggests that PNA-mediated PCR clamping should be implemented as a useful screening tool for detection of $EGFR$ mutations in clinical setting.

진해만에서 분리한 무독성 Alexandrium tamarense (Dinophyceae) 동정을 위한 molecular probe 이용 (Species Identification of Nontoxic Alexandrium tamarense (Dinophyceae) from Chinhae Bay, Korea, Using Molecular Probes)

  • Cho, Eun-Seob
    • 생명과학회지
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    • 제14권2호
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    • pp.301-308
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    • 2004
  • 진해만에서 분리한 무독성 Alexandrium tamarense와 이미 보고된 독성을 가진 A. tamarense종 간의 접속공, 제1상판, 후속공의 형태를 상호 비교하였다. 형태적으로 독성종과 거의 일치되지만, HPLC나 생체실험에서 진해만에서 새롭게 분리한 종은 독성이 전혀 나타나지 않았다. lectin반응결과 무독종 A. tamarense은 PNA와 강한 반응을 보여, 세포표면에 lactose나 galactose와 같은 물질이 많이 분포하고 있음을 보였다. 또한, 단백질 전기영동시 무독종은 유독종과 달리 21 kDa 정도 부위에서 종 특이적 밴드를 보였다. 따라서 PNA lectin이나 면역학적 방법을 이용하면 무독종 A. famarense을 신속하게 동정하는데 이용될 수 있다.

생쥐 난자와 초기배아의 렉틴 결합양상의 변화에 관한 연구

  • 계명찬;전용필
    • 한국동물학회지
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    • 제37권1호
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    • pp.120-129
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    • 1994
  • 생쥐의 배우자간 인식과 수란관과 난자의 상호작용을 연구하기 위하여 수정 전후의 난자와 배아에 형광으로 표지된 5가지 렉틴(UEA-1. LCA, PNA RCA-1, GSL-1)을 처리하여 투명대, 위낭강 원형질 막에서 렉틴의 결합양상을 관찰하였다. 미수정난자 및 수정란의 투명 대에는 UIA-1을 제외한 4가지 렉틴이 결합하였다. PNA RCA-1, GSL-1은 투명대의 의총보다 내층에 강하게 결합되었고 UEA-1과 LCA는 투명대의 전층에서 미약하지만 고르게 결합하였다 배란된 난자의 위난강은 LCA와 PNA에 의해 결합되었으며 UEA-1은 수정 이후부터 GSL-1은 2-세포기 이후부터 위난강에 결합하였다. 난구세포를 제거하고 체외성숙을 일으킨 난자의 위난강에는 5가지 렉틴 모두 결합하지 않았다. 난자와 배아의 원형질막은 PNA. RCA-1, GSL-1에 의해 결합되었고, LCA 및 UEA기은 수정 이후부터 원형질막에 결합하였다. 이상의 결과에서 glucosamine, N-acetylgalactoamine 관기를 함유한 물질이 난구세포에서 생성되어 위난강에 축적되며 배란 후부터 난자의 위난강내 탄수화물관기는 수란관내액의 영향을 받는 것으로 사료된다. 난자 투명대의 탄수화물관기는 내층에 밀집되어 분포하는데 이는 정자의 투명대 관입 조절과 관련된 것으로 사료된다. 수정 후 난자의 원형질막 표면에 fucose와 mannose 등의 탄수화물 잔기가 새로이 노출되며 초기배아 발생동안 위난강에 존재하는 구조물의 렉틴 결합 특성이 유지되었다.

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후두각화증에서 이형성 유무에 따른 렉틴 반응 (LECTIN BINDING PATTERNS IN LARYNGEAL KERATOSIS WITH ATYPIA)

  • 김광문;김기령;윤주헌;장미숙;조정일
    • 대한기관식도과학회:학술대회논문집
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    • 대한기관식도과학회 1991년도 제25차 학술대회 연제순서 및 초록
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    • pp.16-16
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    • 1991
  • 렉틴(Lectins)은 세포막의 당단백질의 과당류 말단기에 특이적으로 결합하는 비면역성의 당단백질 혹은 단백질을 말하는데 정상세포와 변형된 세포에서 렉틴반응의 차이가 남으로써 요즘에는 렉틴을 병리학적 진단에 이용 가능하게 되었다. “Loss of contact inhibition”은 세포 악성화의 중요한 특징으로 세포의 악성화는 세포막의 구조의 변화와 관계가 있을 것으로 알려져 왔으며 1989년 후두암에서 PNA의 반응이 양성 반응을 나타낸다고 보고되어 저자들은 7가지의 렉틴을 이용하여 후두암전구증의 하나인 후두각화증에서 이형성(Atypia)의 존재유무에 따른 렉틴 반응의 변화를 알아보고자 본 연구를 시행하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 이형성이 없는 단순 후두각화증에서는 Con A와 WGA만이 기저세포에 반응이 있었으며, 후두각화증의 가장 중요한 부위인 극세포층에서는 WGA, RCA-I, PNA, SBA, UEA-I, DBA가 세포질에는 반응이 없이 세포간교에만 염색이 되는것을 관찰할 수 있었고 Con A는 반대로 극세포층의 세포질에 반응을 하였으나 세포간교에는 반응이 없었다. 2. 이형성을 동반한 후두각화증에서, 기저세포에서는 반응의 차이가 없었고 극세포층에서는 UEA-I, RCA-I. WGA, PNA, SBA는 세포간교에서 반응이 나타나지 않았고 세포질에서 양성 반응을 관찰 할 수 있었으며 DBA, Con-A에서는 반응의 차이를 관찰 할 수 없었다. 따라서 후두각화증의 극세포층 세포막에서 UEA-I, RCA-I, WGA, PNA, SBA 반응의 소실은 후두암으로의 진행과 밀접한 관계가 있는 이형성의 존재를 암시한다하겠다.

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Pd/C촉매하 파라니트로아닐린 수소첨가에 의한 고순도 파라페닐렌디아민의 합성공정 (Synthesis of High Purity p-Phenylenediamine from p-Nitroaniline by Catalytic Hydrogenation)

  • 조철군;정광보
    • 공업화학
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    • 제10권8호
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    • pp.1210-1215
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    • 1999
  • Pd/C촉매가 부유되어 있는 3상 슬러리 반응기에서 원료 p-nitroaniline(PNA)를 수소 첨가시켜 고순도의 p-phenylenediamine(PPD)를 합성하는 최적 반응조건을 구하였다. 수소첨가 반응시 활성점에서 수소부족을 줄이고 불순물의 생성을 감소시킬 수 있도록, 기체-액체, 액체-촉매사이의 물질전달 저항을 최소화하고 표면반응속도가 율속할 수 있게 반응조건을 설정하였다. 이 반응조건은 온도 $60^{\circ}C$, 압력 60~70 psig, 촉매농도 1~2 g-cat/L일 때가 최적이었으며, 반응속도는 PNA 농도에 0차, 수소 반응압력에 1차를 각각 보여주었으며, 총괄반응속도식은 $R_A=6.44{\times}10^6{\cdot}H{\cdot}P{\cdot}m{\cdot}$exp(-4659/T)로 나타났다.

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목단피지황탕(牧丹皮地黃湯)이 위점막손상(胃粘膜損傷)에 미치는 영향(影響) (Effects of Mokdanpijihwang-tang on gastric mucosal damage in mice)

  • 박성식;이지영
    • 사상체질의학회지
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    • 제12권2호
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    • pp.171-183
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    • 2000
  • 1. Back ground and purpose An experimental study has done to examine the effect of defense and cure gastric mucasal damage of Mokdan-pijihwang-tang. 2. Methods Mice had intragastric injected with MJ extract before indomethacin treatment which induces homorrhage infarct and erosion artificially. Degree of lipid peroxidation, general morphology, change of mucous cell, the distribution of PNA, ICAM and distribution of apoptotic cell were objected. (Abbreviation) MJ : Mokdanpijihwang-tang, PNA : Peanut Agglutinin, ICAM : Intercellular Adhesion Molecule 3 Results 1) The degree of lipid peroxidation in INDO-group had increased conspicuously than control group. But the degree of lipid peroxidation in MJ-group had decreased than INDO-group and these decline had probability. 2) After indomethacin treatment, hemorrhage infarct and erosion had increased in stomach body. But in MJ-group, the configuration is normal, except the group intragastric injected with MJ extract at hour 24 before indomethacin treatment. 3) Surface mucous cell and neck mucous had disappeared in INDO-group. But in MJ-group tormal distribution had shown like control group except the group intragastric injected with MJ extract at hour 24 before indomethacin treatment. 4) PNA positive reaction had not shown in INDO-group. But medium PNA positive reaction had shown In Mj-group. 5) ICAM positive reacted cell had shown in INDO-group. The decrease of ICAM positive cell were shown than INDO-group. 6) A number of apoptotic cell was distributed in hemorrhagic erosion. A few number of apoptotic cell was distributed in MJ-group except some surface mucous. 4. Conclusion These results suggest that MJ has an effect on cure of gastric mucosal damage.

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