• 천문학회지
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• 제44권5호
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• pp.195-200
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• 2011

We have revisited the ACS Virgo Cluster Survey (ACSVCS), a Hubble Space Telescope program to obtain ACS/WFC g and z bands imaging for a sample of 100 early-type galaxies in the Virgo Cluster. In this study, we examine 51 nucleated early-type galaxies in the ACSVCS in order to look into the relationship between the photometric and structural properties of stellar nuclei and their host galaxies. We morphologically dissect galaxies into five classes. We note that (1) the stellar nuclei of dwarf early-type galaxies (dS0, dE, and dE,N) are generally fainter and bluer with g > 18.95 and (g-z) < 1.40 compared to some brighter and redder counterparts of the ellipticals (E) and lenticular galaxies (S0), (2) the g-band half-light radii of stellar nuclei of all dwarf early-type galaxies (dS0, dE, and dE,N) are smaller than 20 pc and their average is about 4 pc, and (3) the colors of red stellar nuclei with (g - z) > 1.40 in bright ellipticals and lenticular galaxies are bluer than their host galaxies colors. We also show that most of the unusually "red" stellar nuclei with (g-z) > 1.54 in the ACSVCS are the central parts of bright ellipticals and lenticular galaxies. Furthermore, we present multi photometric band color - color plots that can be used to break the age-metallicity degeneracy particularly by inclusion of the thermally pulsing-asymptotic giant branch (TP-AGB) phases of stellar evolution in the stellar population models.

• 한국해양공학회지
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• 제20권4호
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• pp.76-82
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• 2006

The large-eddy simulation(LES) technique, based an a message passing interface method(MPI), was applied to investigate the turbulent flaw phenomena around a ship. The Smagorinski model was used in the present LES simulation to simulate the turbulent flaw around a ship. The SPMD(sidsngle program multiple data) technique was used for parallelization of the program using MPI. All computations were performed an a 24-node PC cluster parallel machine, composed of 2.6 GHz CPU, which had been installed in the Advanced Ship Engineering Research Center(ASERC). Numerical simulations were performed for the Wigley hull, and the Series 60 hull(CB=0.6) using 1/4-, 1/2-, 1- and 2-million grid systems and the computational results had been compared to the experimental ones.

• 한국지구과학회:학술대회논문집
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• 한국지구과학회 2005년도 춘계학술발표회 논문집
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• pp.182-187
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• 2005

호남지방의 집중호우 예측 가능성을 향상시키기 위하여 레이더 자료동화를 이용한 예측가능성 제고, 광주지방의 고층자료를 분석하여 집중호우 발생시의 종관장을 해석하였다. 자료동화 자료로는 진도 S-band 레이더 원시자료를 이용한 고도별 수평 바람장을 산출하여 사용하였다. 또한, PC-cluster를 platform으로 사용하는 호남지방의 고해상도 기상예측시스템을 이용하여, 레이더 수평 바람장 자료의 동화가 집중호우 및 중규모 순환장 예측정확도에 미치는 영향을 살펴보았다.

• 한국자원식물학회지
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• 제36권3호
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• pp.237-255
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• 2023

Variations in phenotypic traits are important for onion genetic improvement. The aim of this study was to identify the phenotypic traits of temporary genetic resources and the best accessions for the development of onion breeding programs. Sixteen phenotypic traits of 79 onion accessions were studied. The descriptive statistics of phenotypic traits exhibited a high variation in onion accessions. Among the 79 evaluated accessions, 64.55% had a large bulb neck width and 44.30% had a circular bulb shape. Principal component analysis showed that six principal components (PCs) accounted for 72.65% of the total variation. The main factors contributing to PC1 were bulb weight, equatorial and bulb polar diameters, plant height, and degree of splitting into bulblets, whereas those contributing to PC2 were the bulb color of the epidermal cells of the fleshy scales and color of the dry skin on the bulb. The accessions were classified into three groups-clusters 1, 2, and 3. Cluster 2 accessions were the most suitable for selecting large and circular bulb-shaped onion cultivars. The phenotypic variation observed in this study may help to select potential accessions for breeding new onion cultivars.

• Bioinformatics and Biosystems
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• 제1권2호
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• pp.99-102
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• 2006

BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)는 서열 데이터베이스 탐색을 위하여 가장 많이 사용되는 프로그램이다. 전체 서열간의 최적 글로벌 정렬을 수행하는 대신에 지역적 유사성이 있는 부분을 찾아 서열 짝짓기를 수행하는 특징을 갖는다. 일반적인 연구자들은 서열 상동성 검색을 위해 NCBI에 접속하여 웹 브라우저를 통해 온라인으로 BLAST를 수행하게 되는데, 이 경우 사용자 각각의 네트워크 환경이나 입력할 데이터양에 따른 검색속도의 지연 및 제한 등과 같은 여러 문제에 부딪히게 되고, 또한 보안유지가 필요한 서열 데이터의 유출 가능성이 존재한다. 그러므로 대량의 서열 데이터에 대하여 빠르고 안전하게 BLAST 상동성 검색이 가능한 Local BLAST 검색 시스템의 필요성이 증대되고 있다. 본 연구에서는 NCBI의 Genbank에서 공개된 동물의 발현 유전자 단편들(ESTs)에 대한 데이터를 이용하여 소, 돼지, 닭, 등의 경제형질과 연관된 유용 유전자만을 추출하여 이들만으로 구성된 새로운 데이터베이스를 구축하였고, 또한 이들을 사용할 수 있는 새로운 검색시스템을 개발하였다 자체 제작한 Perl script를 사용하여 필요한 데이터를 축종별로 추출 하여 새로운 DB를 구축하였으며 이 속에는 소의 경우 650,046개, 돼지의 경우 368,120개, 닭의 경우 693,005개의 발현 유전자 단편들(ESTs)이 포함된다. 또한 이들 DB 분석이 가능한 Local Animal BLAST Web 검색시스템(http://bioinfo.kohost.net)을 고성능 병렬 PC Cluster 시스템과 연동하도록 자체 구축함으로써 본 시스템이 보다 효율적인 생물정보학 연구수행이 기여할 것으로 기대된다.

• 한국항행학회논문지
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• 제18권2호
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• pp.191-199
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• 2014

최근 IT 분야의 화두인 클라우드 컴퓨팅과 빅데이터 패러다임을 중소기업(Small and Medium Business: SMB) 차원에서 용이하게 활용하도록 지원하는 시도가 증가하고 있다. 이러한 노력의 일환으로, 본 논문에서는 프라이빗 클라우드 인프라 환경을 대상으로 하둡(Hadoop) 클러스터를 시험적으로 구축하는 프로토타입을 설계하고 구현한다. 프로토타입 구현은 싱글보드, PC, 그리고 서버를 이용하여 각각 수행하고, 그 성능을 테스트한다. 또한, ASA (American Standard Association) Dataset을 이용한 빅데이터 분석을 통해서 구축된 하둡 프로토타입을 활용하는 분석 소프트웨어 시스템의 성능을 통합적으로 검증한 결과를 제시한다. 이를 위해, R, 파이썬, D3, 자바와 같은 오픈소스를 이용하여 분석 소프트웨어 시스템을 구현하고, 테스트를 수행한다.

• 한국작물학회:학술대회논문집
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• 한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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• pp.71-71
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• 2017

Stable stand establishment is pre-requisite in direct rice seeding system for obtaining optimal yield of rice crop in rain-fed and waterlogged areas. Anaerobic condition on waterlogged soil causes low germination which significantly reduces crop yield. Due to low availability of tolerant genetic material for anaerobic germination, there is urgent need to evaluate rice germplasm for better germinability under anaerobic conditions. Seeds of the 185 rice accessions were evaluated for germination vigor and coleoptile length under anaerobic conditions. The variation among germplasm was tested for significance using analysis of variance and various multivariate components. Significant level of variation was observed among all accessions for germination vigor and coleoptiles length. Although highest mean values for coleoptiles length (2.1cm) and germination rate (60%) were observed in japonica accessions but maximum coleoptile length (4.68cm) and germination rate (96%) was found in indica genotype CO18. A highly significant and positive correlation was also observed between germination vigor and coleoptiles length, which signify the importance of elongated coleoptile under anaerobic conditions. The PCA analysis illustrated that 97.24% variation was accounted by PC1 while PC2 and PC3 explained 2.54% and 0.24% variation for germination vigor and coleoptile length. PCA scattered plot divided the accessions in four various groups. All AG tolerant accessions were included in group I. Likewise in the case of cluster analysis, two major clades (I and II) were formed. All accessions showing >40% germination rate were included in clade I, whereas all other accessions with <40% germination rate were grouped in clade II. Further more highly tolerant accessions (>80% germination) were grouped in sub-cluster IA.

• 한국정밀공학회:학술대회논문집
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• 한국정밀공학회 2006년도 춘계학술대회 논문집
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• pp.405-406
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• 2006

Recently, the flat display modules such as plasma or TFT-LCD employ thin crystallized panels which are normally weak to high level transient mechanical energy inputs. As a result, anti-shock performance is one of the most important design specifications for TFT-LCD modules. However, most of large display module designs are generated based on engineers own experiences. Also, a large-scale analysis to evaluate complex material and structural behaviors is one of interesting topic in diverse engineering and scientific fields. The utilization of massively parallel processors has also been a recent trend of high performance computing. The objective of this paper is to introduce a parallel process system which consists of general purpose finite element analysis solver as well as parallelized PC cluster. The parallel processing system is constructed using thirty-two processing elements and the finite element program is developed by adopting hierarchical domain decomposition method. In order to verify the efficiency of the established system, an impact analysis on thin and complex sub-parts of flat display modules is performed. The evaluation results showed a good agreement with the corresponding reference solutions, and thus, the parallel process system seems to be a useful tool fur the complex structural analysis such as IT related products.

• 한국생물정보학회:학술대회논문집
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• 한국생물정보시스템생물학회 2004년도 The 3rd Annual Conference for The Korean Society for Bioinformatics Association of Asian Societies for Bioinformatics 2004 Symposium
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• pp.296-306
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• 2004

LC/MS를 이용하여 펩타이드 혹은 단백질 같은 물질을 분석하는 실험이 급격히 늘어남에 따라 LC/MS 데이터를 자동으로 처리하는 기술에 대한 요구가 커지고 있다. 이러한 LC/MS 데이터의 자동 분석 기술에 대한 연구는 현재 활발히 진행되어 왔고, 이를 직접 구현한 여러 상용 소프트웨어들이 개발되어 있는 상태이다. LC/MS 데이터는 noise 제거, background 데이터 제거, deconvolution 알고리즘을 적용한 분자량(molecular weight) 할당 등의 작업을 거쳐 분석하게 된다. 이러한 과정을 거쳐 얻어진 분자량에 대한 데이터가 올바른 값인지 검증하는 작업이 필요하다. 본 논문에서는 이러한 검증 작업과 관련하여 Peak Clustering and Fitting(이하 PC&F)에 대한 알고리즘을 제안한다. PC&F은 peak 데이터들이 지니고 있는 속성에 대한 Mahalanobis distance를 이용하여 peak 데이터를 각 retention time에 따라 clustering 분석을 하는 작업이다. 본 논문에서 제안하는 PC&F 알고리즘을 Microsoft Visual C++ 6.0 MFC 환경에서 직접 개발한 소프트웨어(PeakClusterFitLCMS)로 실험하였다. 실험결과 PC&F 작업을 통해 동일한 구성물질로부터 발생한 peak 데이터를 모아서 보다 신뢰할 수 있는 분자량을 구할 수 있었고, 구성물질에 의해 발생되지 않은 noise peak 데이터를 찾아 제거시킬 수 있음을 확인할 수 있었다.

• 한국멀티미디어학회논문지
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• 제14권6호
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• pp.835-848
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• 2011

본 논문에서는 방대한 지형 데이터의 효과적 가시화를 위한 클라이언스-서버 기반의 분산/병렬 시스템을 제안한다. 이 시스템은 웹 기반으로 수행되는 클라이언트 GUI 프로그램과 복수의 PC 클러스터에서 구동되는 분산/병렬 서버 프로그램으로 구성된다. PC 뿐만 아니라 모바일 기기에서도 클라이언트 프로그램이 수행될 수 있도록 자바 기반의 OpenGL 그래픽스 라이브러리인 JOGL을 사용하여 GUI를 설계하였으며, 사용하는 기기의 현재 사용 가능한 메모리 크기와 화면의 최대 해상도 정보를 서버에게 전달하여 서버의 작업을 최소화하였다. 서버로 사용된 PC 클러스터는 분산된 지형 데이터를 액세스하고 이를 클라이언트로부터 받은 정보에 따라 적절히 리샘플링 한 후 이를 다시 전송하는 작업을 담당한다. 서버의 각 노드들뿐만 아니라 클라이언트까지 캐시 자료구조를 유지함으로써 분산된 방대한 지형 데이터의 반복 접근 시 발생되는 지연 시간을 최소화하도록 설계하였다.