• 제목/요약/키워드: PAT1

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RIS 모델을 이용한 폴리알킬렌테레프탈레이트의 평형 고리 올리고머에 관한 연구 (A Study on the Equilibrium Cyclic Oligomer of Poly(alkylene terephthalate) by Using RIS Model)

  • 육지호;류동일
    • 폴리머
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    • 제24권2호
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    • pp.182-193
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    • 2000
  • 폴리알킬렌테레프탈레이트 (PAT)의 고리 올리고머의 몰 고리화 정수(molar cyclization equilibrium constants)를 회전 이성 상태 (rotational isomeric state) (RIS) 모델에 의해Monte Carlo 모사로부터 얻었다. Jacobson-Stockmayer 이론과 이를 보완한 Flory, Suter, 그리고 Mutter의 방법으로는 각 PAT의 고리 올리고머의 함량과 분포를 잘 설명할 수 없었다. RIS모델을 이용한 직접 계산법으로는 반응거리를 ${\gamma}$=0.5 < ${\gamma}^{2}$> $^{1/2}$로 잡아준 경우에 모든 PAT에 대해서 실험치에 가까운 고리 올리고머의 분포를 얻었다. 또한 각 PAT의 입체형태의 변화에 따른 몰고리화 정수의 변화를 고찰하기 위하여 PAT 반복단위 중의 통계적 가중치 rl과 필를 변화시키면서 각 PAT의 몰 고리화 정수를 구하였다. 여러 반응거리와 ${\gamma}$=0.5 < ${\gamma}^{2}$> $^{1/2}$로 설정한 경우에 ${\sigma}_{1}$${\sigma}_{2}$의 변화에 모든 PAT의 평형 고리 올리고머의 함량이 약간 변하기는 하나 그 분포는 그대로유지되었다. 각 PAT의 몰 고리화 정수는 주어진 입체배열에 의해서 일차적으로 결정이 되며 입체형태의 변화에 의해서도 다소 영향을 받는다는 것을 알았다.

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APP tail 1 (PAT1)과 kinesin light chains (KLCs)의 tetratricopeptide repeat (TPR) domain을 통한 결합 (APP Tail 1 (PAT1) Interacts with Kinesin Light Chains (KLCs) through the Tetratricopeptide Repeat (TPR) Domain)

  • 장원희;김상진;정영주;전희재;문일수;석대현
    • 생명과학회지
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    • 제22권12호
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    • pp.1608-1613
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    • 2012
  • KIF5/Kinesin-I는 경쇄(light chain)를 통하여 결합함으로써 다양한 운반체들을 미세소관을 따라 운반한다. Kinesin light chains (KLCs)은 tetratricopeptide repeat (TPR) 영역을 매개로 운반체와 결합한다. 현재까지 KLCs와 결합하는 많은 운반체들이 확인되었으나 KLCs가 어떻게 특정운반체를 인식하여 결합하는지는 아직 확실히 밝혀지지 않았다. 본 연구에서 KLC1의 TPR 영역과 결합하는 단백질을 분리하기 위하여 효모 two-hybrid system을 이용하여 탐색한 결과 amyloid precursor protein (APP)과 결합하는 것으로 보고된 protein interacting with APP tail 1 (PAT1)을 분리하였다. KLC1은 PAT1의 C-말단 부위와 결합하며, PAT1은 KLC1의 TPR 영역을 포함한 부위와 결합함을 효모 two-hybrid assay로 확인하였다. 또한 PAT1는 KLC2와도 결합하였지만 kinesin heavy chains (KHCs)인 KIF5A, KIF5B, KIF5C와는 결합하지 않았다. 단백질간 결합은 glutathione S-transferase (GST) pull-down assay와 공동면역침강으로도 확인하였다. 생쥐의 뇌 파쇄액을 PAT1 항체와 APP 항체로 면역침강을 행한 결과 KLC와 KHCs가 같이 침강하였다. 이러한 결과들은 PAT1이 Kinesin-I와 APP 포함 소포간의 상호작용을 매개한다는 것을 시사한다.

Transformation and Expression of the PAT Gene in Arabidopsis Tryptophan Mutants

  • Lim, Seon-Hee;Kim, Young-Soon;Cheong, Hyeon-Sook
    • Journal of Plant Biology
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    • 제39권4호
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    • pp.243-247
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    • 1996
  • Phosphoribosylanthranilate transferase (PAT) catalyzes the second step of the tryptophan biosynthetic pathway and is encoded by a single-copy gene that complements all the visible phenotypes of the tryptophan mutant (trp1-100) of Arabidopsis. The trp1-100 is blue fluorescent under UV light becuase it accumulates anthranilate. To obtain a plant with reduced PAT activity, PAT1 genes with several internal deletions in different promoter regions (pHS 101, pHS102, pHS104, pHS105, and pHS107) were induced into trp1-100 via Agrobacterium. Then, homozygous T3 plants were isolated and examined for blue fluorescence. Introduction of the PAT1 gene fusants results in the reversion of fluorescence phenotype except in the case of pHS105. These results prompted us to perform a parallel analysis of anthranilate synthase and PAT interms of the genetic complementation. A plant line carrying pHS105 gene fusant does not completely complement the blue fluorescence but it accumulates less anthranilate than trp1-100. The activity of PAT was reduced in the transgenic mutant as well. The plant carrying these constructs will add to the growing collection of molecular tools for the study of the indolic secondary metabolism.

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고등식물의 유용 유전자 크로닝을 위한 분자적 접근 (Molecular Approaches for Cloning of Important Higher Plant Genes)

  • 정현숙
    • KSBB Journal
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    • 제10권1호
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    • pp.89-96
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    • 1995
  • A rabidopsis thaliana의 trpl 변이 식물체는 uv 하에서 푸른 형광 빛을 발하며, phosphoribosyl anthranilate transferase를 encoding하는 유전자가 결여되어 있다. 이 유전자를 PATl이라고 하며, 많 은 미 생물에서 phospho ribosyl anthranilate trans ferase와 homologous하다. 트럽토판 생합성에서 이 효소가 결여되면 anthranilate가 축적되며 형광 빛 을 발하게 된다. PATl 의 유전자 조절을 알아보기 위하여, PATl 유전자의 promoter를 단계 별로 삭제하여 트립토판 변이 식물체의 형질전환과 재분화를 시도하였다. 이 러한 유전자 조작을 통하여 이 유전자의 발현 양상을 조절하는 promoter 요소와 작용을 확인할 수 있으리라고 생각된다. 또한 PAT의 항체를 사용한 Immunoassay를 통하여 형질전환체 의 단백질 양의 변화를 분석한 결과 PATl의 완전 한 promoter를 가진 pHSI07의 형질전환체는 대조구보다 2배의 단백질 양을 나타냄으로서 2쌍의 PAT 유전자가 발현되었음을 알 수 있었다. PATl 은 selection marker와 reporter 유전자로서 분자유 전학연구에 공헌할 수 였으리라고 생각된다.

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제초제저항성 GM 잔디에서 발현된 PAT 단백질의 알레르겐 유발 가능성 및 독성 평가 (Allergenicity and toxicity evaluation of the PAT protein expressed in herbicide-tolerant genetically modified Zoysia japonica)

  • 정혜린;선현진;강지남;강홍규;이효연
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제47권4호
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    • pp.316-323
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    • 2020
  • 본 연구는 제초제저항성 GM 들잔디에서 발현된 PAT 단백질의 잠재적인 알레르기성 및 독성을 평가하기 위해 수행되었다. PAT 단백질의 in silico 분석에서 PAT 단백질은 알려진 알레르겐 또는 독성 단백질과 유사성을 보이지 않았다. PAT 단백질은 80개의 아미노산으로 이루어진 절편에 걸쳐 기지의 알레르겐과 35% 미만의 아미노산 서열 상동성을 보였고, 기지의 알레르겐과 연속한 8개의 아미노산에서 일치하는 서열도 확인되지 않았다. 또한 제초제저항성 GM 들잔디에서 발현된 PAT 단백질은 펩신 존재 하의 인공위액에서 매우 빠르게 분해되었고, GM 들잔디에서 발현된 PAT 단백질은 번역 후 수식(glycosylation)도 일어나지 않았음이 확인되었다. 경구투여 독성 시험에서는 체중 1 kg 당 4,000 mg 을 투여한 실험구에서도 PAT 단백질 투여 후 마우스에서 사망이나 독성 영향은 관찰되지 않았다. 이들 결과는 제초제저항성 GM 들잔디에서 발현된 PAT 단백질이 잠재적 알레르겐이나 독소로 작용할 가능성이 없음을 시사한다.

제초제 Basta를 이용한 Phosphinothricin Acetyltransferase 유전자로 형질전환된 현사시 3호의 효율적인 선발 (An Effective Selection of PAT Gene Transformed Populus alba $\{times}$ Populus glandulosa No.3 using Herbicide Basta Treatment)

  • 오경은;문흥규;박재인;양덕춘
    • 한국자원식물학회지
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    • 제17권1호
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    • pp.28-33
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    • 2004
  • 본 연구는 개량 포플러 현사시 3호를 재료로 제초제 저항성 유전자 PAT으로 형질전환시 킨 다음 제초제 Basta처리에 의한 효율적인 형질전환체 선발을 목적으로 시험되었다. Basta 처리에 따른 캘러스유도, 부정아유도 및 액아유도 시험을 통해 조직치사 농도는 1.0mg/L로 결정할 수 있었으며, 이 농도처리에 의해 형질전환체의 조기선발에 사용하였다. 이 농도처리로 비형질전환체는 모두 고사되었지만, 형질전환체는 정상적으로 반응을 보이며, 생육이 가능하였다 .한편, 형질전환체에 제초제를 직접 살포한 결과, 정상적 생육이 가능했고, PAT activity측정 결과에서도 양성 반응을 나타내어 현사시 3호 세포내에 PAT유전자가 정상 발현됨이 확인되었다. 이로써 현사시에 PAT유전자 도입 및 발현을 위하여 제초제 Basta 처 리와 PAT assay가 매우 효과적인 것으로 나타났다.

Comparison of mastoid air cell volume in patients with or without a pneumatized articular tubercle

  • Adisen, Mehmet Zahit;Aydogdu, Merve
    • Imaging Science in Dentistry
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    • 제52권1호
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    • pp.27-32
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    • 2022
  • Purpose: The aim of this study was to compare mastoid air cell volumes in patients with or without a pneumatized articular tubercle (PAT) on cone-beam computed tomography (CBCT) images. Materials and Methods: The CBCT images of 224 patients were retrospectively analyzed for the presence of PAT. The Digital Imaging and Communications in Medicine data of 30 patients with PAT and 30 individuals without PAT were transferred to 3D Doctor Software. Mastoid air cell volumes were measured using semi-automatic segmentation on axial sections. Data were analyzed using SPSS version 20.0. Results: The patients with PAT and those without PAT had a mean mastoid volume of 6.31±2.86 cm3 and 3.25±1.99 cm3, respectively. There were statistically significant differences in mastoid air cell volumes between patients with and without PAT regardless of sex and mastoid air cell side (P<0.05). Conclusion: The detection of PAT on routine dental radiographic examinations might be a potential prognostic factor that could be used to detect extensive pneumatization in the temporal bone. Clinicians should be aware that there may be widespread pneumatization of mastoid air cells in patients in whom PAT is detected. Advanced imaging should be performed in these cases, and possible complications due to surgical interventions should be considered.

공정분석기술: 제약산업에서의 기술개발 사례 및 현황 (Process analytical technology (PAT): field applications and current status in pharmaceutical industries)

  • 우영아;김종윤;박용준;연제원;송규석;김효진
    • 분석과학
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    • 제22권1호
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    • pp.35-43
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    • 2009
  • 단순히 완제품만을 평가하는 기존의 방법에서 제조 공정의 보다 깊은 이해와 공정 제어를 통한 품질 확보가 PAT (공정분석기술, process analytical technology)가 지향하고 있는 핵심이다. 생산 상 위험 요소가 많이 발생하는 공정을 제어할 수 있는 목적으로 새로운 실시간 공정 제어 기술을 개발하는 것이 PAT 연구 내용이다. 공정 단계에 대한 이해, 공정에 필요한 여러 가지 변수 및 공정 생산품의 평가 기술은 PAT를 수행하기 위한 기술적 핵심 요소이다. 이에 관련하여 다국적 제약회사의 실제 공정에서의 실시간 품질관리 사례는 상당히 많은 것으로 알려져 있으나, 제조공정 및 분석 기술 자체가 기업 비밀인 경우가 많아 관련 정보는 극히 제한되어 있다. 본 총설을 통하여 실제 제약 산업 현장에서 활용되고 있는 적용사례를 소개하고, 각 제조 공정 및 완제품 실시간 품질 관리를 위한 PAT 연구 사례 및 기술개발 현황에 대하여 언급하고자 한다.

한국인 갑상선 유두상암종 환자에서 XPC-PAT 유전자 다형 (XPC-PAT Polymorphism in Korean Thyroid Papillary Carcinoma)

  • 태경;이근영;김희옥;이용섭;이형석;안유헌
    • 대한두경부종양학회지
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    • 제22권2호
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    • pp.117-122
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    • 2006
  • Background and Objectives : Thyroid carcinoma is the sixth commonest cancer in Korea and the papillary carcinoma is the most common type(88%) of the malignant thyroid tumors. Bulky DNA adducts formed by the carcinogens are repaired by DNA repair process, but failure to repair this DNA damage can cause mutations in oncogenes and tumor suppressor genes resulting in tumor formation. The xeroderma pigmentosum group C(XPC) gene is essential for this repair procedure and the XPC-PolyAT(PAT) polymorphisms may alter DNA repair capacity(DRC) and genetic susceptibility to cancer. Subjects and Methods : In a case-control study of 113 Korean patients with pathologically diagnosed thyroid papillary carcinoma and 65 control subjects, we investigated the association between the three XPC-PAT gene polymorphisms and thyroid papillary cancer susceptibility. Results : The frequency of the variant XPC-PAT allele was lower in the cases(0.349) than in the controls (0.423), but the difference was not significant(p=0.140). Using logistic regression adjusting for age and sex, risk for thyroid papillary cancer was not increased in the XPC-PAT-/+ and XPC-PAT+/+ compared to XPCPAT-/-(adjusted overall odds ratio[95% confidence intervals;95%CI]=0.52[0.26-1.03] and 0.62 [0.22-1.75], respectively; trend test, p=0.167). Conclusion : There are no relationship between the XPC-PAT polymorphism and the risk of thyroid papillary carcinoma in Korean population. Based on our results, XPC-PAT polymorphism do not modulate genetic susceptibility to thyroid papillary cancer.

Polyoxyethylene-Alkyl Citric Diester-Triethanolamine의 생분해 및 독성에 관한 조사 연구 (The Biodegradability and Toxicity of Polyoxyethylene-Alkyl Citric Diester-Triethanolamine Detergent)

  • 권숙표;정용
    • 약학회지
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    • 제23권1호
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    • pp.1-6
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    • 1979
  • The authors investigated the biodegradability and toxicity of polyoxyethylene-alkyl citric diester-triethanolamine(PAT), which is one of new non-ionic detergents. 1) The PAT is very biodegradable, which 50% is biodegraded for one day and 100% for eight days by the activated sludge treatment and 40% for one day and 93% for eight days by the aerobic domestic sewage treatment. 2) $LD_{50}$ of PAT for chicken, mouse, and rat by oral adminstration are 7.1g/kg, 8.4g/kg and 14.0g/kg reactively. 3) $TL_{m}$ of PAT for goldfish is 64.0mg/l in 24bours. 4) No reaction for humun skin is determined by PAT.

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