• 제목/요약/키워드: Numerical taxonomy

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忠武灣 海水의 腐生細菌 分布와 相關係數 分析에 關하여 (Distribution of saprophytic bacteria and correlation-coefficient analysis in the seawater of Chungmu bay, Korea.)

  • 홍순우;하영칠;안태영
    • 한국해양학회지
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    • 제20권3호
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    • pp.62-69
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    • 1985
  • 忠武灣에서 分離한 108個의 菌株에 대하여 고전적 분류방법과 수리적 분류방법을 비교하고, 균주간의 相關關係數를 구하여 유사성을 確認하였다. 수리적 분류에서는 고전적 분류와는 달리 Gram(+)와 Gram(-) 菌株가 전체 cluster에 分散되어있고, coccus와 rod가 분리되었으며, genus간의 分類는 수리적 방법과 고전적 방법사이에 連關性이 크게 나타났다. 下層에서 採取된 균주는 다른 層에 비해 균주간의 분류학적 유사성이 떨어지는 것으로 나타났다. 또한 灣 內部 (Group I)의 菌株와 外部 (Group II)의 菌株間의 거리는 각 Group內의 菌株間의 연관성보다 적은 것으로 나타났으며, 干潮時 海水에서 분리된 균주와 滿潮時 분리된 균주간에는 연관성이 적음이 확인 되었다.

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한국산 길쭉먼지벌레족의 수리분류(II) (Numerical Taxonomy of the Tribe Pterostichini Sloane from Korea(II))

  • 박종균;권용정
    • Current Research on Agriculture and Life Sciences
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    • 제14권
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    • pp.1-14
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    • 1996
  • 한국산(韓國産) 길쭉먼지벌레족(族)을 대상으로 "NC"값을 인정하지 않은 상태에서 정성적(定性的) 형태형질(形態形質)을 근거(根據)로 표현론적(表現論的) 수리분류방식(數理分類方式)을 이용(利用)한 군분석(群分析)을 실시하였다. 그 결과(結果), 비록 일부 종(種)에서는 전통분류(傳統分類) 결과(結果)와 다소 일치(一致)하지 않은 경우도 있었으나 대부분 경험적(經驗的) 분류(分類)와 유사(類似)한 경향(傾向)을 나타내었다. 그리고 대부분 종(種)들이 기대(期待)한 속(屬) 또는 아속(亞屬)내에 분포(分布)하였다.

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Isolation, Characterization and Numerical Taxonomy of Novel Oxalate-oxidizing Bacteria

  • Sahin, Nurettin;Gokler, Isa;Tamer, Abdurrahman
    • Journal of Microbiology
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    • 제40권2호
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    • pp.109-118
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    • 2002
  • The present work is aimed at providing additional new pure cultures of oxalate utilizing bacteria and its preliminary characterization for further work in the field of oxalate-metabolism and taxonomic studies. The taxonomy of 14 mesophilic, aerobic oxalotrophic bacteria isolated by an enrichment culture technique from soils rhizosphers, and the juice of the petiole/stem tissue of plants was investigated. Isolates were characterized with 95 morphological, biochemical and physiological tests. Cellular lipid components and carotenoids of isolates were also studied as an aid to taxonomic characterization. All isolates were Gram-negative, oxidase and catalase positive and no growth factors were required. In addition to oxalates, some of the strains grow on methanol and/or formate. The taxonomic similarities among isolates, reference strains or previously reported oxalotrophic bacteria were analysed by using the Simple Matching (S/ sub SM/) and Jaccard (S$\_$J/) Coefficients. Clustering was performed by using the unweighted pair group method with arithmetic averages (UPGMA) algorithm. The oxalotrophic strains formed five major and two single-member clusters at the 70-86% similarity level. Based on the numerical taxonomy, isolates were separated into three phenotypic groups. Pink-pigmented strains belonged to Methylobacterium extorquens, yellow-pigmented strains were most similar to Pseudomonas sp. YOx and Xanthobacter autorophicus, and heterogeneous non-pigmented strains were closely related to genera Azospirillum, Ancylobacter, Burkholderia and Pseudomonas. New strains belonged to the genera Pseudomonas, Azospirillum and Ancylobacter that differ taxonomically from other known oxalate oxidizers were obtained. Numerical analysis indicated that some strains of the yellow-pigmented and nonpigmented clusters might represent new species.

A Secure, Hierarchical and Clustered Multipath Routing Protocol for Homogenous Wireless Sensor Networks: Based on the Numerical Taxonomy Technique

  • Hossein Jadidoleslamy
    • International Journal of Computer Science & Network Security
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    • 제23권8호
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    • pp.121-136
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    • 2023
  • Wireless Sensor Networks (WSNs) have many potential applications and unique challenges. Some problems of WSNs are: severe resources' constraints, low reliability and fault tolerant, low throughput, low scalability, low Quality of Service (QoS) and insecure operational environments. One significant solution against mentioned problems is hierarchical and clustering-based multipath routing. But, existent algorithms have many weaknesses such as: high overhead, security vulnerabilities, address-centric, low-scalability, permanent usage of optimal paths and severe resources' consumption. As a result, this paper is proposed an energy-aware, congestion-aware, location-based, data-centric, scalable, hierarchical and clustering-based multipath routing algorithm based on Numerical Taxonomy technique for homogenous WSNs. Finally, performance of the proposed algorithm has been compared with performance of LEACH routing algorithm; results of simulations and statistical-mathematical analysis are showing the proposed algorithm has been improved in terms of parameters like balanced resources' consumption such as energy and bandwidth, throughput, reliability and fault tolerant, accuracy, QoS such as average rate of packet delivery and WSNs' lifetime.

Streptomyces melanosporofaciens가 생산하는 새로운 항생물질 I. 생산균의 분류 . 동정 (New Antibiotics Produced by SEreptomyces mekmosporofaciens I. Taxonomy of the producing microorganism)

  • 김시관;김상석;김창한
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제18권6호
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    • pp.624-632
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    • 1990
  • 새로운 phthalic acid 유도체 및 염기성 마크로라이드 항생물질을 생산하는 strain 88-GT-161은 numerical taxonomic data base에 의거 Streptomyces melanosporofaciens로 동정되었으나, 139 단위 특성 중 4가지 단위에 있어. S.violaceoniger 혹은 S.violaceusniger로 대표되는 cluster No.32에 속하는 6균주의 공통된 특성과 분명히 다른 특성을 나타냈다. 따라서 본 논문에서는 strain 88-GT-161의 분류. 동정학적 특성에 대하여 보고하고자 한다.

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Heterophyidae에 관한 수리분류학적 연구 (A numerical taxonomic study on heterophyid trematodes)

  • 김기홍;윤영한
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제29권1호
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    • pp.55-66
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    • 1991
  • Heterophyidae과에 속하는 Matagenimus yokegawai, Metagonimus Miyata Type, M. takahashii, Heterophyes disbar, H. heterophyes, H. nocens, Heterophyepsis continua, Pygidiopsis summa, Stellanpchasmusfaltatus, Stittodora lari 등 총 21 Operational Taxonomic Unit(OTU)를 사용하여 수리분류학적 연구를 시도하였다. 형질은 절대 측정치가 아닌 상대적 비율을 주로 사용하였으며, 형질수는 26개를 사용하였다. 각 형질간의 유사도를 측정하여 상관계수를 계산한 후 Ward의 방법에 의한 집괴 분석 및 인자 분석을 수행하였다. 분석 결과 Metagonimus 속(genus) 그룹은 Metagonimus yokogawai, Metagonimus Miyata Type, M. takahashii 등 3개의 표현군으로 구분이 되었으며, Metagenimus Miyata Type은 M. takahashii 의 아종 수준으로 분류되었다. Heterophyes 속 그룹은 Heterophyes dispar, H. heterophyes, Jf. nocens 등 명확한 3개의 표현 군으로 구분되며, H. nocens는 H. heterophyes의 아종이 아닌 뚜렷한 종의 수준에서 분류됨을 나타내었다. 그 외의 종들도 역시 뚜렷한 표현 군으로 분류되었으며, 이로부터 흡충류에 있어서도 수리분류학적 방법에 의해 분류가 명화한 분류군의 한계를 규정하는데 많은 도움을 줄 수 있을 것으로 사료된다.

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Taxonomic implications of multivariate analyses of Egyptian Ononis L. (Fabaceae) based on morphological traits

  • FAYED, Abdel Aziz A.;EL-HADIDY, Azza M.H.;FARIED, Ahmed M.;OLWEY, Asmaa O.
    • 식물분류학회지
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    • 제49권1호
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    • pp.13-27
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    • 2019
  • Numerical taxonomy is employed to determine the phenetic proximity of the Egyptian taxa belonging to the genus Ononis L. A classical clustering analysis and a principal component analysis (PCA) were used to separate 57 macro- and micromorphological characters in order to circumscribe 11 taxa of Ononis. A clustering analysis using the unweighted pair-group method with the arithmetic means (UPGMA) method gives the highest co-phenetic correlation. Results from clustering and PCA revealed the segregation of five groups. Our results are in line, to some certain degree, with the traditional sub-sectional concept, as can be seen in the grouping of the representative members of the subsections Diffusae and Mittisimae together and the representative members of the subsections Viscosae and Natrix. The phenetic uniqueness of Ononis variegata and O. reclinata subsp. mollis was formally established. However, our findings contradict the classic sectional concept; this opinion was suggested earlier in previous phylogenetic circumscriptions of the genus. The most useful characters that provide taxonomic clarity were discussed.

낙동강 하구에서 분리한 Aeromonas spp.의 수리학적 분류 및 특성 (Characteristics and Numerical Taxonomy of Aeromonas spp. Isolated from Naktong Estuary)

  • 전도용;하영칠
    • 미생물학회지
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    • 제27권4호
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    • pp.385-390
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    • 1989
  • 1986년 8월부터 12월까지 낙동강 하구에서 161주의 운동성 Aeromona를 분리한 후 42가지의 형태학적, 생화학적 특성은 조사하여 cluster 분석을 한 결과 85% 유사도 수준에서의 3개의 주 cluster와 84% 유사도 수준에서의 2개의 소수 cluster의 5 cluster로 나눌 수 있었다. 각 cluster는 MR반응과 glucose으로부터의 가스생성 여부의 생화학석 특성에 의하여 구분이 되었다. 2개의 소수 cluster를 포함한 5새의 cluster는 교차응집 실험에 의해 크게 2개의 혈청학적 cluster로 나뉘어졌으며, 이러한 결과는 독성실험에 의한 grouping 결과와 일치하였다.

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