Progressive familial intrahepatic cholestasis (PFIC) is a group of severe genetic disorders, inherited in an autosomal recessive manner, causing cholestasis of hepatocellular origin, later progressing to biliary cirrhosis and liver failure. This is the first report of PFIC type 1 with novel compound heterozygous mutations in Korea. The patient was presented with intrahepatic cholestasis, a normal level of serum ${\gamma}-glutamyl$ transferase, steatorrhea, and growth failure. Genetic testing of this patient revealed novel compound heterozygous mutations (p.Glu585Ter and p.Leu749Pro) in the ATP8B1 gene. After a liver transplantation at age 19 months, the patient developed severe post-transplant steatohepatitis.
Permanent neonatal diabetes mellitus refers to diabetes that occurs before the age of 6 months and persists through life. It is a rare disorder affecting one in 0.2-0.5 million live births. Mutations in the gene KCNJ11, encoding the subunit Kir6.2, and ABCC8, encoding SUR1 of the ATP-sensitive potassium ($K_{ATP}$) channel, are the most common causes of permanent neonatal diabetes mellitus. Sulfonylureas close the $K_{ATP}$ channel and increase insulin secretion. KCNJ11 and ABCC8 mutations have important therapeutic implications because sulfonylurea therapy can be effective in treating patients with mutations in the potassium channel subunits. The mutation type, the presence of neurological features, and the duration of diabetes are known to be the major factors affecting the treatment outcome after switching to sulfonylurea therapy. More than 30 mutations in the KCNJ11 gene have been identified. Here, we present our experience with a patient carrying a novel p.H186D heterozygous mutation in the KCNJ11 gene who was successfully treated with oral sulfonylurea.
Kim, Yoon-Myung;Seo, Go Hun;Kim, Gu-Hwan;Yoo, Han-Wook;Lee, Beom Hee
Journal of Genetic Medicine
/
v.14
no.1
/
pp.23-26
/
2017
Isolated 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase deficiency is an autosomal recessive disorder affecting leucine metabolism; it is one of the most common inborn metabolic diseases detected in newborn screening. Mutations in the genes MCCC1 or MCCC2 cause a defect in the enzyme 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase, with MCCC2 mutations being the form predominantly reported in Korea. The majority of infants identified by neonatal screening usually appear to be asymptomatic and remain healthy; however, some patients have been reported to exhibit mild to severe metabolic decompensation and neurologic manifestations. Here we report the clinical features of a patient with asymptomatic 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase deficiency and novel heterozygous MCCC1 mutations.
Background: Missense and frame-shift mutations within the dimer forming domain of the caspase 8 gene have been identified in several cancers. However, the genetic status of this region in precancerous lesions, like oral submucous fibrosis (OSMF), and well differentiated oral squamous cell carcinomas (OSCCs) in patients from southern region of India is not known, and hence the present study was designed to address this issue. Materials and Methods: Genomic DNA isolated from biopsy tissues of thirty one oral submucous fibrosis and twenty five OSCC samples were subjected to PCR amplification with intronic primers flanking exon 7 of the caspase 8 gene. The PCR amplicons were subsequently subjected to direct sequencing to elucidate the status of mutation. Results: Sequence analysis identified a frame-shift and a novel missense mutation in two out of twenty five OSCC samples. The frame-shift mutation was due to a two base pair deletion (c.1225_1226delTG), while the missense mutation was due to substitution of wild type cysteine residue with phenylalanine at codon 426 (C426F). The missense mutation, however, was found to be heterozygous as the wild type C426C codon was also present. None of the OSMF samples carried mutations. Conclusions: The identification of mutations in OSCC lesions but not OSMF suggests that dimer forming domain mutations in caspase 8 may be limited to malignant lesions. The absence of mutations in OSMF also suggests that the samples analyzed in the present study may not have acquired transforming potential. To the best of our knowledge this is the first study to have explored and identified frame-shift and novel missense mutations in OSCC tissue samples.
Purpose: Progressive familial intrahepatic cholestasis (PFIC) is a rare genetic autosomal recessive disease caused by mutations in ATP8B1, ABCB11 or ABCB4. Mutational analysis of these genes is a reliable approach to identify the disorder. Methods: We collected and analyzed relevant data related to clinical diagnosis, biological investigation, and molecular determination in nine children carrying these gene mutations, who were from unrelated families in South China. Results: Of the nine patients (five males, four females) with PFIC, one case of PFIC1, four cases of PFIC2, and four cases of PFIC3 were diagnosed. Except in patient no. 8, jaundice and severe pruritus were the major clinical signs in all forms. γ-glutamyl transpeptidase was low in patients with PFIC1/PFIC2, and remained mildly elevated in patients with PFIC3. We identified 15 different mutations, including nine novel mutations (p.R470HfsX8, p.Q794X and p.I1170T of ABCB11 gene mutations, p.G319R, p.A1047P, p.G1074R, p.T830NfsX11, p.A1047PfsX8 and p.N1048TfsX of ABCB4 gene mutations) and six known mutations (p.G446R and p.F529del of ATP8B1 gene mutations, p.A588V, p.G1004D and p.R1057X of ABCB11 gene mutations, p.P479L of ABCB4 gene mutations). The results showed that compared with other regions, these three types of PFIC genes had different mutational spectrum in China. Conclusion: The study expands the genotypic spectrum of PFIC. We identified nine novel mutations of PFIC and our findings could help in the diagnosis and treatment of this disease.
Mutations of MYO15A are generally known to cause severe to profound hearing loss throughout all frequencies. Here, we found two novel MYO15A mutations, c.3871C>T (p.L1291F) and c.5835T>G (p.Y1945X) in an affected individual carrying congenital profound sensorineural hearing loss (SNHL) through targeted resequencing of 134 known deafness genes. The variant, p.L1291F and p.Y1945X, resided in the myosin motor and IQ2 domains, respectively. The p.L1291F variant was predicted to affect the structure of the actin-binding site from three-dimensional protein modeling, thereby interfering with the correct interaction between actin and myosin. From the literature analysis, mutations in the N-terminal domain were more frequently associated with residual hearing at low frequencies than mutations in the other regions of this gene. Therefore we suggest a hypothetical genotype-phenotype correlation whereby MYO15A mutations that affect domains other than the N-terminal domain, lead to profound SNHL throughout all frequencies and mutations that affect the N-terminal domain, result in residual hearing at low frequencies. This genotype-phenotype correlation suggests that preservation of residual hearing during auditory rehabilitation like cochlear implantation should be intended for those who carry mutations in the N-terminal domain and that individuals with mutations elsewhere in MYO15A require early cochlear implantation to timely initiate speech development.
Background: Streptomycin (SM) is recommended by the World Health Organization (WHO) as a part of standard regimens for retreating multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) cases. The incidence of MDR-TB in retreatment cases was 19% in Thailand. To date, information on SM resistance (SMR) gene mutations correlated to the SMR of Mycobacterium tuberculosis Thai isolates is limited. In this study, the mutations in rpsL, rrs, gidB, and whiB7 were investigated and their association to SMR and the lineage of M. tuberculosis were explored. Methods: The lineages of 287 M. tuberculosis collected from 2007 to 2011 were identified by spoligotyping. Drug susceptibility profiles were evaluated by the absolute concentration method. Mutations in SMR genes of 46 SM-resistant and 55 SM-susceptible isolates were examined by DNA sequencing. Results: Three rpsL (Lys43Arg, Lys88Arg, and Lys88Thr) and two gidB (Trp45Ter and Gly69Asp) mutations were present exclusively in the SM resistant M. tuberculosis. Lys43Arg rpsL was the most predominant SMR mutations (69.6%) and prevailed among Beijing isolates (p<0.001). No SMR-related mutation in was found rrs. The combination of rpsL and gidB mutations provided 76.1% sensitivity for detecting SMR in M. tuberculosis Thai isolates. whiB7 was not responsible for SMR in SM resistant isolates lacking rpsL and rrs mutations. The significance of the three gidB mutations, 276A>C, 615A>G, and 330G>T, as lineage signatures for Beijing and EAI were underscored. This study identified 423G>A gidB as a novel sub-lineage marker for EAI6-BGD1. Conclusion: Our study suggested that the majority of SMR in M. tuberculosis Thai isolates were responsible by rpsL and gidB polymorphisms constantly providing the novel lineage specific makers.
Background: : Familial adenomatous polyposis (FAP) is an autosomal dominant inherited disease mainly caused by mutations of the adenomatous polyposis coli (APC) gene with almost complete penetrance. These colorectal polyps are precancerous lesions that will inevitable develop into colorectal cancer at the median age of 40-year old if total proctocolectomy is not performed. So identification of APC germline mutations has great implications for genetic counseling and management of FAP patients. In this study, we screened APC germline mutations in Chinese FAP patients, in order to find novel mutations and the APC gene germline mutation characteristics of Chinese FAP patients. Materials and Methods: The FAP patients were diagnosed by clinical manifestations, family histories, endoscope and biopsy. Then patients peripheral blood samples were collected, afterwards, genomic DNA was extracted. The mutation analysis of the APC gene was conducted by direct polymerase chain reaction (PCR) sequencing for micromutations and multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) for large duplications and/or deletions. Results: We found 6 micromutations out of 14 FAP pedigrees, while there were no large duplications and/or deletions found. These germline mutations are c.5432C>T(p. Ser1811Leu), two c.3926_3930delAAAAG (p.Glu1309AspfsX4), c.3921_3924delAAAA (p.Ile1307MetfsX13), c3184_3187delCAAA(p.Gln1061AspfsX59) and c4127_4126delAT (p.Tyr1376LysfsX9), respectively, and all deletion mutations resulted in a premature stop codon. At the same time, we found c.3921_3924delAAAA and two c.3926_3930delAAAAG are located in AAAAG short tandem repeats, c3184_3187delCAAA is located in the CAAA interrupted direct repeats, and c4127_4128 del AT is located in the 5'-CCTGAACA-3', 3'-ACAAGTCC-5 palindromes (inverted repeats) of the APC gene. Furthermore, deletion mutations are mostly located at condon 1309. Conclusions: Though there were no novel mutations found as the pathogenic gene of FAP in this study, we found nucleotide sequence containing short tandem repeats and palindromes (inverted repeats), especially the 5 bp base deletion at codon 1309, are mutations in high incidence area in APC gene,.
Background: Tetracycline is an antibiotic widely used for the treatment of Helicobacter pylori infection, but its effectiveness is decreasing due to increasing bacterial resistance. The aim of this study was to investigate the occurrence of 16S rRNA mutations associated with resistance or reduced susceptibility to tetracycline ofHelicobacter pylori by real-time PCR (RT-PCR) assays from culture. Materials and Methods: Tetracycline susceptibility and minimal inhibition concentration (MIC) was determined by the Epsilometer test (Etest) method. A LightCycler assay developed to detect these mutations was applied to DNA extracted from culture. The 16S rRNA of these isolates was sequenced and resistance-associated mutations were identified. From 104 isolates of H. pylori examined, 11 showed resistance to tetracycline. Results: LightCycler assay was applied to DNA extracted from 11 tetracycline-susceptible and 11 tetracycline resistance H. pylori isolates. In our study the sequencing of the H. pylori wild types in 16 s rRNA gene were AGA 926-928 with MIC (0.016 to $0.5{\mu}g/ml$), while the sequencing and MIC for resistant were GGA and AGC, (0.75 to $1.5{\mu}g/ml$), respectively. Also we found a novel mutation in 2 strains with $84^{\circ}C$ as their melting temperatures and exhibition of an A939C mutation. Conclusions: We conclude that real-time PCR is an excellent method for determination of H. pylori tetracycline resistance related mutations that could be used directly on biopsy specimens.
Leukemia is the abnormal increase of hematopoietic progenitor cells in tissues, resulting in anemia, increased susceptibility to infection and impaired blood clotting. The adenosine deaminase (ADA) gene is an important druggable target for the treatment of leukemia patients. Genetic and molecular analyses were performed to determine the effects of ADA gene mutations in 20 leukemia patients in the Korean population. To analyze the relationship between genotype and phenotype, the ADA genomic DNAs - including 1,092 bp of 12 exons and partial intron sequences flanking each exon - were sequenced and compared. In this study, the known mutations in other diseases, more than 50 mutations already reported in patients with severe combined immunodeficiency disease (SCID) and autism, were not found, but two novel mutations in leukemia patients were discovered. They include one nonsense mutation (A>C at nt position 478, F101F) and one missense mutation (G>A at nt position 778, E260K). One missense mutation (G>A at nt position 22, D8Y) was also detected in 20 normal control patients (allelic frequency of 7.5%). Interestingly, subjects in the Korean population retained 2 bp insertion at the intron 6 (IVS6-52insGC), something that has never been shown in other populations. The genetic study to find out the correlation between the mutant alleles and leukemia patients revealed no association statistically (p>0.05). The mutation found in leukemia needs further study to determine its possibility as a molecular marker for the diagnosis of leukemia.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.