The aim of this study was to ana1yze T-cell lymphoma invasion and metastasis-inducing factor 1 (Tiam1) expression in 1ung cancer patients. A total of 204 patients with lung cancer tissue lesions were enrolled in the present study, along with 40 cases of normal lung tissue and 40 of normal fetal lung tissue. Tiam1 protein expression level was determined using intensity quantitative analysis, for comparison in lung cancer, metastatic, normal lung, and fetal lung tissue. The positive unit (PU) of Tiam1 was $13.5{\pm}5.42$ in lung cancer,$5.67{\pm}1.56$ in norma1 epithelial cells, and $5.89{\pm}1.45$ in fetal lung epithelial cells. The value in the lung cancer tissue was significantly higher than that in the normal lung tissue and the fetal lung tissue (P<0.01). The Tiam1 PU values with lymph node metastasis and without 1ymph node metastasis were $15.2{\pm}4.34$ and $12.5{\pm}4.23$, respectively, and the difference was statistically significant (P<0.05). The Tiam1 PU values in different tumor, nodes, metastasis (TNM) stages, III-IV period, and I-II phase were $14.7{\pm}4.14$ and $11.0{\pm}5.34$ (P<0.05). A correlation was found between Tiam1 expression and the age of patient, tumor size, tumor type, and tumor differentiation. Tiam1 protein expression in the lung tumor tissue is significantly higher than that in the normal lung tissue and fetal lung tissue. Tiam1 expression may be closely related to lung cancer development and metastasis.
Kim, In-Young;Lee, Sun-Ho;Rha, Sun-Young;Kim, Byung-Soo
Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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2004.11a
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pp.272-278
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2004
Recently, Pepe et al. (2003) employed the receiver operating characteristic (ROC) approach to rank candidate genes from a microarray experiment that can be used for the biomarker development with the ultimate purpose of the population screening of a cancer, In the cancer microarray experiment based on n patients the researcher often wants to compare the tumor tissue with the normal tissue within the same individual using a common reference RNA. This design is referred to as a reference design or an indirect design. Ideally, this experiment produces n pairs of microarray data, where each pair consists of two sets of microarray data resulting from reference versus normal tissue and reference versus tumor tissue hybridizations. However, for certain individuals either normal tissue or tumor tissue is not large enough for the experimenter to extract enough RNA for conducting the microarray experiment, hence there are missing values either in the normal or tumor tissue data. Practically, we have $n_1$ pairs of complete observations, $n_2$ 'normal only' and $n_3$ 'tumor only' data for the microarray experiment with n patients, where n=$n_1$+$n_2$+$n_3$. We refer to this data set as a mixed data set, as it contains a mix of fully observed and partially observed pair data. This mixed data set was actually observed in the microarray experiment based on human tissues, where human tissues were obtained during the surgical operations of cancer patients. Pepe et al. (2003) provide the rationale of using ROC approach based on two independent samples for ranking candidate gene instead of using t or Mann -Whitney statistics. We first modify ROC approach of ranking genes to a paired data set and further extend it to a mixed data set by taking a weighted average of two ROC values obtained by the paired data set and two independent data sets.
Objective: To assess the expression of vascular normalization genes in different molecular subtypes of breast cancer and to determine whether molecular subtypes with a higher vascular normalization gene expression can be identified using dynamic contrast-enhanced (DCE) magnetic resonance imaging (MRI) and intravoxel incoherent motion (IVIM) diffusion-weighted imaging (DWI). Materials and Methods: This prospective study evaluated 306 female (mean age ± standard deviation, 50 ± 10 years), recruited between January 2014 and August 2017, who had de novo breast cancer larger than 1 cm in diameter (308 tumors). DCE MRI followed by IVIM DWI studies using 11 different b-values (0 to 1200 s/mm2) were performed on a 1.5T MRI system. The Tofts model and segmented biexponential IVIM analysis were used. For each tumor, the molecular subtype (according to six [I-VI] subtypes and PAM50 subtypes), expression profile of genes for vascular normalization, pericytes, and normal vascular signatures were determined using freshly frozen tissue. Statistical associations between imaging parameters and molecular subtypes were examined using logistic regression or linear regression with a significance level of p = 0.05. Results: Breast cancer subtypes III and VI and PAM50 subtypes luminal A and normal-like exhibited a higher expression of genes for vascular normalization, pericyte markers, and normal vessel function signature (p < 0.001 for all) compared to other subtypes. Subtypes III and VI and PAM50 subtypes luminal A and normal-like, versus the remaining subtypes, showed significant associations with Ktrans, kep, vp, and IAUGCBN90 on DEC MRI, with relatively smaller values in the former. The subtype grouping was significantly associated with D, with relatively less restricted diffusion in subtypes III and VI and PAM50 subtypes luminal A and normal-like. Conclusion: DCE MRI and IVIM parameters may identify molecular subtypes of breast cancers with a different vascular normalization gene expression.
Journal of Information Technology Applications and Management
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v.12
no.4
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pp.25-31
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2005
We know that the Hurst Exponent (HE) is a real number in [0, 1] which denotes randomness of time series. in this research, we suggest non-linear analysis of human biological signals through HE. The feasibility of human biological signals using inductive incitement provides Some diagnosis for active treatment. In our experiment, we measured the heartbeat through the MCG, 29 healthy and 34 abnormal subjects ostensibly. The raw data of acupuncture incitement are supported by opinions of gross examination and pathological diagnosis. The mean values of HE are 0.345, 0.755 and 0.805 for the periods of before, during and after acupuncture treatment, respectively in case of abnormal subjects. On the other hand, the mean values, 0.808, 0.797 and 0.785 are for normal cases, correspondingly. From this data, we show that HE is very significant in abnormal controls according to an acupuncture incitement, and the incitement effect is evidently extracted in abnormal subjects. But, in normal subjects, the incitement effect is meaningless.
The Transactions of The Korean Institute of Electrical Engineers
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v.57
no.3
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pp.494-500
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2008
This paper presents the analyzed result of the series arc fault current by using the discrete wavelet transform. The series arcing is caused by a loose connection in series with the load circuit. The series arc current is limited to a moderate value by the resistance of the device connected to the circuit, such as an appliance or a lighting system. The amount of energy in the sparks from the series arcing is less than in the case of parallel arcing but only a few amps are enough to be a fire hazard. Therefore, it is hard to detect the distinctive difference between a normal current and a intermittent arc current. This paper, presents the variation of the ratio of peak values and RMS values of the series arc fault current, and proposes the novel series arc fault detecting method by using the discrete wavelet transform. Loads such as a CFL lamp, a vacuum cleaner, a personal computer, and a television, which has the very similar normal current with the arc current, were selected to confirm the novel method.
Clinical signs, serum chemical values and histological findings of hepatic tissue after partial and complete obstruction of common bile duct in Korean goats were investigated. Abnormal clinical signs were not observed in partial obstruction of common bile duct, but in complete obstruction clinical signs such as jaundice, urine color change, were observed. Serum total bilirubin, total cholesterol, aspartate aminotransferase, sorbitol dehydrogenase, gamma glutamyltranspeptidase, and total protein values increased on the 1-4th day and then gradually decreased to normal level in partial obstruction. However, they tend to increase persistently by the 24th day in complete obstruction of common bileduct. Histologic features of hepatic tissue in partial obstruction were not changed as compared with normal hepatic tissue. On the other hand, in complete obstruction of common bite duct there were moderate bile duct proliferation in a portal area, rupture of bile canaliculi, phagocytosis of bile pigment by Kupffer cells, periportal fibrosis, intrahepatic bile stasis and hepatic cell necrosis.
Transcranial doppler ultrasonography (TCD) is a new, non-invasive and easily applicable method to evaluate cerebral hemodynamics. Last 10 years, its use in Korea has been dramatically expanded, but the qualification of TCD laboratory has yet to be settled. Since duplex sonography is seldom used in Korea, we have to depend totally on TCD to evaluate cerebral hemodynamic changes. Thus, all of the available data from every detectabler cerebral arteries has to be obtained for accurate interpretation of TCD measurements. Moreover, flow direction and wave form should be concerned in addition to the flow velocity. In this article, I present technique to measure the anterior, meddle and posterior cerebral arteries, the internal carotid artery siphon and at cervical level, and the vertebral and the basilar artery, and normal values for these measurements which is essential for the adequate interpretation.
Zinc is an essential trace element. Previos methods for the determination of zinc in serum have been difficult and reported findings must be treated with caution. The normal range of zinc in serum varies significantly according to different methods and author. The scope of this work was to establish the normal range of zinc in serum values in healthy Korean persons. Methods are described for the determination of zinc in serum diluted ten-fold with deionised water using Hitachi Model 207, atomic absorption spectrophotometer. The values of zinc in serum of 23 healthy Korean persons by atomic absorption spectroscopy ranged from 87.6 to $131.2\;{\mu}g/100\;ml$ with the mean value $109.1\;{\mu}g/100\;ml$ and standard deviation 10.86. In this method, satifactory result was obtained with regard to the coefficient variation and recoveries of added zinc in the measurenents.
This study was undertaken to investigate the exact values of the cephalometric standards of Hellman dental age III B groups of Korean in the reontgenocephalometry. The subjects consisted of 25 males and the same number of females with the normal occlusion and acceptable profile. Each lateral cephalometric head film was taken with the teeth in occlusion and the Focal-film distance was 300cm. Their linear and angular measurements were made directly. The following conclusions were obtained; 1) The author made the tables of standard deviation from the measured values. 2) The degree of the facial convexity of Korean children was larger than that of the white. 3) The labial inclination of the lower central incisor in male was a little greater than that in female.
Hematologic values were determined in blood samples obtained from 203 normal, healthy Jindo dogs of both sexes that ranged in age from 3 months to 10 years. Age-related differences were detected for the total erythrocyte count, hemoglobin content, PCV and the number of eosinophils. The persistent eosinophilia appears to be due to the dirofilariasis and flea-allergy dermatitis.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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