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Bacillus subtilis S54 균주를 이용한 고추 역병과 탄저병의 생물학적 방제 (Biological Control of Phytophthora Blight and Anthracnose Disease in Red-pepper Using Bacillus subtilis S54)

  • 이건웅;김명준;박준식;채종찬;소병율;주재은;이귀재
    • 식물병연구
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    • 제17권1호
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    • pp.86-89
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    • 2011
  • 고추 역병과 탄저병은 Phytophthora capsici와 Colletotrichum gloeosporioides에 의해 발병되는 병으로 세계적으로 많은 피해를 입히는 중요한 병원균이다. 이러한 병원균의 방제를 위하여 근권과 비근권에서 각각의 병원균 생장을 억제하는 능력이 뛰어난 5균주를 선발하였다. 선발된 분리주 중 S54균주는 in vitro와 in vivo 조건 모두에서 가장뛰어나게 병원균을 억제하였다. 하우스 실험에서도 역병과 탄저병 모두 80% 이상의 방제력을 보여주었다. 또한 S54균주의 동정을 위하여 16S rDNA 부분의 염기서열의 분석과 API 50CHB Kit를 실시하였으며, 그 결과 Bacillus subtilis로 동정하였다. 이러한 결과를 바탕으로 S54는 고추 역병과 탄저병을 방제할 수 있는 생물학적 방제제로의 가능성을 보여주었다고 할 수 있다.

CT를 이용한 혈복강의 등급: 비장 손상의 정도 및 회복의 객관화 (CT Based Hemoperitoneum Scoring for Clinicians: Objectifying the Severity of Splenic Injury and Recovery)

  • 신홍경;송라영;한호성;윤유석;조재영;황대욱;정규환;김영기;이우형
    • Journal of Trauma and Injury
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    • 제26권4호
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    • pp.273-279
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    • 2013
  • Purpose: In patients with splenic trauma, Computed Tomography (CT) scan is helpful in selecting treatment options and evaluating resolution after NOM (Non-Operative Management). The purpose of this study was to suggest a CT based hemoperitoneum (HP) scoring system that can easily be used by clinicians to evaluate the severity of injury and recovery. Methods: A retrospective review of patients with splenic trauma admitted to our hospital between May 2003 and January 2013 was conducted. Patients diagnosed with isolated spleen injury who had a CT scan on admission were included. 1 or 2 points were given according to location and amount of hematoma in the CT image. Using the existing ultrasonography (US) based HP scoring system, the same method was applied to obtain our CT based HP scoring (CBHS) system, which ranges from 0 to 8 points. The CBHS system can be easily used by clinicians for a quick assessment of splenic injury. Results: Of the 39 patients meeting the inclusion criteria, 6 patients were managed operatively and 33 nonoperatively. There was a significant difference in CBHS between the OM (operative management) group and the NOM group.(p=0.03) CBHS showed correlation with Hb (hemoglobin), Hct (hematocrit), spleen injury grade(AAST), and Hounsfield unit of ROI (Region of interest). (p=0.17, p=0.18, p<0.000, p=0.02, respectively) After successful NOM with stabilized Hb level, the amount of hemoperitoneum was scored in the follow-up CT. CBHS demonstrated correlation with decreased spleen injury grade, decreased Hounsfield unit of ROI (Region of interest) (p=0.039, p=0.049, respectively), and also objectively reflected patient recovery. Conclusion: CBHS can be used as an objective and intuitive tool for clinicians in grading the severity of splenic injury by scoring the amount of hemoperitoneum, and in assessing recovery.

살모넬라 C1 serogroup 특이 rfbM 유전자 증폭과 염기서열 분석 (DNA Sequence analysis and rfbM gene amplification using PCR for detect salmonella C1 serogroup)

  • 이성일;정석찬;문진산;박용호;이존화;김병수;백병걸
    • 대한수의학회지
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    • 제36권1호
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    • pp.109-118
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    • 1996
  • The Salmonella rfb gene encoding for the biosynthesis of the oligosaccharide-repeating units of the O-antigenic determinants was cloned and sequenced. A set of nucleotide primers(a forward and reverse) was selected to target a defined region of the guanosine diphospho-mannose(GDP-Man) pyrophosphorylase synthase gene : rfbM of Salmonella C serogroup. The primer set was used to develop a PCR-based rapid and specific detection system for Salmonella C1 serogroup. Amplification bands of predicted size(1,422bp) were generated from 11 different Salmonella C1 isolates. The bands were verified to be specific for the C1 serogroup by Southern blot analysis using reference homologous DNA specificity was further confirmed by the lack of reactivity with heterologous DNA derived from non-salmonella members of the family enterobacteriaeceae. A specificity of 100% was deduced along with a very high sensitivity shown by a detection limit of 1fg of a purified DNA template. The isolated DNA sequence was found to be 99.8% homologous to S montevideo but the related primers amplified with the predicted band sizes with all the Salmonella C1 serogroups tested. It is concluded that the PCR protocol based on the rfbM gene from S cholerasuis is optimal fast and specific for the detection of Salmonella C1 serogroup and also the corresponding probe is suitable for rapid detection of all Salmonella C1 serogroup DNA tested. This technology should facilitate the identification of contaminated pig products and for any other products contaminated with the Salmonalla C1 serogroup. The immediate impact of this developed method will be in the area of food safety of pig products with the potential prospect for adaptation to other food inspection technologies.

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Gene Expression Analysis of Methotrexate-induced Hepatotoxicity between in vitro and in vivo

  • Jung, Jin-Wook;Kim, Seung-Jun;Kim, Jun-Sup;Park, Joon-Suk;Yeom, Hye-Jung;Kim, Ji-Hoon;Her, Young-Sun;Lee, Yong-Soon;Kang, Jong-Soo;Lee, Gyoung-Jae;Kim, Yang-Seok;Kang, Kyung-Sun;Hwang, Seung-Yong
    • Molecular & Cellular Toxicology
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    • 제1권4호
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    • pp.256-261
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    • 2005
  • The recent DNA microarray technology enables us to understand gene expression profiling in cell line and animal models. The technology has potential possibility to comprehend mechanism of multiple genes were related to compounds which have toxicity in biological system. So, microarray system has been used for the prediction of toxicity through gene expression induced by toxicants. It has been shown that compounds with similar toxic mechanisms produce similar changes in gene expression in vivo system. Here we focus on the use of toxicogenomics for the determination of gene expression analysis associated with hepatotoxicity in rat liver and cell line (WB-F344). Methotrexate (MTX) is a chemotherapy agent that has been used for many years in the treatment of cancer because it affects cells that are rapidly dividing. Also it has been known the toxicity of MTX, in a MTX abortion, it stops embryonic cells from dividing and multiplying and is a non-surgical method of ending pregnancy in its early stages. We have shown DNA microarray analyses to assess MTX-specific expression profiles in vivo and in vitro. Male Sprague-Dawely VAF+ albino rats of 5-6 weeks old and WB-F344 cell line have been treated with MTX. Total RNA was isolated from Rat liver and cell line that has treated with MTX. 4.8 K cDNA microarray in house has been used for gene expression profiling of MTX treatment. We have found quite distinct gene expression patterns induced by MTX in a cell line and in vivo system.

Mid- to Long-term Results of Surgical Treatment of ASD in Patients over 60 Years Old

  • Jeong, In-Seok;Ahn, Byoung-Hee;Kim, Soon-Jin;Oh, Sang-Gi;Oh, Bong-Suk;Kim, Sang-Hyung
    • Journal of Chest Surgery
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    • 제44권2호
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    • pp.137-141
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    • 2011
  • Background: There is controversy about the benefit of surgical correction of an atrial septal defect (ASD) in patients over 60 years old. The purpose of this study was to determine whether surgical treatment is beneficial in those 60 years of age or older. Materials and Methods: We reviewed the clinical course of 57 patients (mean age: $63.54{\pm}5.59$ years) diagnosed with an isolated secundum ASD after the age of 60. The 24 patients (group A) who underwent surgical repair were compared with the 33 patients (group B) who were treated non-surgically. The mean follow-up period was $6.8{\pm}4.5$ years. Results: One operative death, 5 late deaths (20.8%) in group A, and 9 deaths (27.3%) in group B occurred in the study period. Symptomatic improvement was noted in 18 patients (75%) of group A after surgery. However 13 patients (39.4%) of group B showed symptomatic improvement during the follow-up period (p=0.012). The incidence of new atrial arrhythmia of the two groups was significantly different (16.7% vs 36.7%, p=0.038). The actuarial 10 year survival rate was 79% in group A and 73% in group B. Conclusion: Although surgical correction of ASD did not increase survival in patients over 60 years old, the surgical outcomes of ASD showed low operative mortality and resulted in symptomatic improvement in the majority of these patients. This study has shown the benefits of surgical closure of ASD even in advanced age in comparison to medical treatment.

Fabrication and characterization of $WSi_2$ nanocrystals memory device with $SiO_2$ / $HfO_2$ / $Al_2O_3$ tunnel layer

  • Lee, Hyo-Jun;Lee, Dong-Uk;Kim, Eun-Kyu;Son, Jung-Woo;Cho, Won-Ju
    • 한국진공학회:학술대회논문집
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    • 한국진공학회 2011년도 제40회 동계학술대회 초록집
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    • pp.134-134
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    • 2011
  • High-k dielectric materials such as $HfO_2$, $ZrO_2$ and $Al_2O_3$ increase gate capacitance and reduce gate leakage current in MOSFET structures. This behavior suggests that high-k materials will be promise candidates to substitute as a tunnel barrier. Furthermore, stack structure of low-k and high-k tunnel barrier named variable oxide thickness (VARIOT) is more efficient.[1] In this study, we fabricated the $WSi_2$ nanocrystals nonvolatile memory device with $SiO_2/HfO_2/Al_2O_3$ tunnel layer. The $WSi_2$ nano-floating gate capacitors were fabricated on p-type Si (100) wafers. After wafer cleaning, the phosphorus in-situ doped poly-Si layer with a thickness of 100 nm was deposited on isolated active region to confine source and drain. Then, on the gate region defined by using reactive ion etching, the barrier engineered multi-stack tunnel layers of $SiO_2/HfO_2/Al_2O_3$ (2 nm/1 nm/3 nm) were deposited the gate region on Si substrate by using atomic layer deposition. To fabricate $WSi_2$ nanocrystals, the ultrathin $WSi_2$ film with a thickness of 3-4 nm was deposited on the multi-stack tunnel layer by using direct current magnetron sputtering system [2]. Subsequently, the first post annealing process was carried out at $900^{\circ}C$ for 1 min by using rapid thermal annealing system in nitrogen gas ambient. The 15-nm-thick $SiO_2$ control layer was deposited by using ultra-high vacuum magnetron sputtering. For $SiO_2$ layer density, the second post annealing process was carried out at $900^{\circ}C$ for 30 seconds by using rapid thermal annealing system in nitrogen gas ambient. The aluminum gate electrodes of 200-nm thickness were formed by thermal evaporation. The electrical properties of devices were measured by using a HP 4156A precision semiconductor parameter analyzer with HP 41501A pulse generator, an Agillent 81104A 80MHz pulse/pattern generator and an Agillent E5250A low leakage switch mainframe. We will discuss the electrical properties for application next generation non-volatile memory device.

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국내 Bordetella pertussis 분리균주에서 Agglutinogen과 Fimbriae 혈청형 변이 분석 (Serotype Variations of Agglutinogen and Fimbriae in the Korean Isolates of Bordetella pertussis)

  • 정상운;문유미;성화영;강연호;유재연
    • 미생물학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.221-227
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    • 2008
  • Bordetella pertussis는 유아의 호흡기감염질환인 백일해의 원인균으로 배신도입에 의해 발생률이 크게 낮아졌다. 그러나 최근에 일부 백신접종률이 높은 국가에서 증가된 백일해 발생건수가 보고되고 있으며, 그 추정 원인 중에 하나는 백신주와 유행주 사이의 유전형 흑은 혈청형 변이 이다. 따라서 분리주에 대한 변이 현황을 유전형 혹은 혈청형 분석을 통하여 확인하는 것이 필요하고 국내에서 백일해 발병증가에 대한 가능성을 추정해야 한다. 이에 본 연구에서는 $1999\sim2006$년 사이에 분리된 국내 백일해 분리균주의 변이 양상을 agglutinogen과 fimbriae에 대한 혈청형 조사를 통해 확인하였다. 그 결과 agg 1과 fim 2가 국내 분리주에서 가장 많이 발견되는 혈청형이었고, 두 항원 모두 시대에 따른 혈청형 변이 현상이 확인되었으며, 특히 agglutinogen의 경우는 백신균주(agg 1,2)와는 다른 유형(agg 1)이 증가되는 유형으로 나타났다. 그러나 fimbriae의 경우는 백신균주(fim 2)와 동일한 유형이 증가되어 차이를 나타내었다. 이러한 결과는 백일해 발병증가가 나타나는 국가들에서도 확인되는 현상으로 국내에서의 백일해 발병증가에 대한 보다 정확한 예측을 위해서는 항원결정기 유전자에 대한 변이정도 및 정상인에서의 항체가 분포양상 등에 대한 연구가 필요할 것으로 사료된다.

태아 섬유아세포로 핵치환된 소 난자의 핵의 재구성과정과 체외 배발달 (Nuclear Remodeling and In Vitro Development of Bovine Oocytes Following Nuclear Transfer of Bovine Fetal Fibroblasts)

  • Um, J. H.;S. J. Uhm;Kim, N-H;Lee, H. T.;K. S. Chung
    • 한국가축번식학회지
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    • 제24권1호
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    • pp.59-67
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    • 2000
  • 본 연구는 핵이 제거된 소난자 내에 소의 태아 섬유아세포를 이식한 후 난자의 발달능력을 조사하였다. 소 태아 섬유아세포는 45일된 응성 태아로부터 분리한후 MitoTracker로 염색하고 세포 주기를 동기화시키지 않은 세포를 핵이 제거된 소난자의 위란강 내에 이식하였다. 섬유아세포와 소난자의 복합체는 전기 자극을 주어 융합시키는 방법을 이용하였으며, 융합된 난자는 Calcium ionophore와 6-DMAP를 이용하여 난활성을 유도시킨 다음 CR1aa 에서 배양하였다. 핵치환 된 난자의 핵은 핵질 응축과정, 팽대과정, 전핵 형성과정이 일어났으며, 이러한 과정에서 재구성된 난자는 분열 과정을 거쳐 18∼26시간 사이에는 2-세포기로 발달하였다. 섬유아세포의 미토콘드리아는 핵치환시 난자 내로 이전되었는데 이것들은 난자 내에서 빠르게 사라지는 것으로 관찰되었으며, 핵융합 후 8시간째에는 섬유아세포의 미토콘드리아가 전혀 관찰되지 않았다. 2-세포기로 분열된 난자의 21% 가 이식 가능한 단계인 배반포 단계까지 발달하였다. 이러한 결과는 소의 태아 섬유아세포가 탈핵된 소난자 내에서 성공적으로 재분화과정을 거치며, 이렇게 재조합 된 수정란은 배반포 단계까지 발달이 가능하다는 것을 보여주고 있다.

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막걸리에 접종한 Bacillus subtilis의 초고압에 대한 저항력 (The Resistance of Bacillus subtilis in Makgeolli to Hydrostatic Pressure)

  • 이은정;김주성;오세욱;김윤지
    • 한국식품과학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.312-316
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    • 2012
  • 막걸리에서 분리된 B. subtilis의 특성을 파악하고자 영양유무(buffer와 TSB), pH(pH 7과 4, 막걸리 pH 4), adaptation 조건에 따라 초고압에 의한 저감 효과를 살펴보았다. B. subtilis 포자는 영양유무, pH에 관계없이 환경 적응력이 있었고, 초고압에 의한 저감효과도 미미하게 관찰되었다. B. subtilis 영양세포는 영양유무와 pH에 따라 대조구(non-treatment)의 균수 차이가 관찰되었고, 초고압에 의한 저감 효과도 다르게 나타났다. B. subtilis 영양세포는 저온에서 영양과 pH가 불리한 환경에서 endospore를 형성하여 적응을 하게 되고 초고압에 의한 저감효과는 감소하는 것으로 나타났다. 특히 막걸리에 접종한 경우는 buffer(pH 4)와 TSB(pH 4)보다 적응력이 약한 것으로 관찰되었다. B. subtilis 포자를 접종한 막걸리의 저장 실험 결과, 내열성이 있으며 균의 증식은 관찰되지 않았다. 결론적으로, 막걸리에서 B. subtilis는 대부분 포자상태로 존재하며, 포자는 초고압에 대한 저항력이 큰 것을 알 수 있었다. 그러나 초고압은 영양세포 사멸에 효과적이었다.

시판 전통누룩의 젖산균 분리동정과 제조단양주의 품질특성 (Characteristics of Takju (a Cloudy Korean Rice Wine) Prepared with Nuruk (a Traditional Korean Rice Wine Fermentation Starter), and Identification of Lactic Acid Bacteria in Nuruk)

  • 박지희;정장호
    • 한국식품과학회지
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    • 제46권2호
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    • pp.153-164
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    • 2014
  • 본 연구는 일반 개량누룩 1종류(MN)와 시판되고 전통제조방식으로 제조된 4종류의 전통누룩(SH, SS, JJ, and SJ)을 구입하여 단양주를 제조하고 이들 단양주의 발효특성을 비교 분석하고자 하였다. 각 누룩으로 제조한 탁주의 pH는 담금 직후부터 24시간 까지 급격히 감소하는 경향을 보였고, 적정산도는 급격히 증가하였다. Maltose 함량은 담금 직후에는 0.49-2.68% (w/v)였고, glucose의 함량은 1.03-2.07% (w/v)으로 나타났다. T-SH와 T-SS의 ethanol 함량이 7일까지 높은 경향을 나타내었다. 전체적인 ethanol 의 함량은 12시간부터 ethanol의 함량이 증가하기 시작했으며, 발효 7일부터 21일까지 13.08-14.96% (w/v)로 유지되었다. 발효과정 중 유리아미노산 함량 분석 결과 glutamic acid, threonine, serine과 glycine 함량을 각각 T-JJ은 104.157, 42.855, 69.715, and 53.035 mg/100 g으로 가장 높았다. 탁주 유기산으로 lactic acid, citric acid, succinic acid, acetic acid가 주요 유기산으로 나타났으며 유기산총량은 T-SS, T-JJ 가 2286.21 mg/100 g, 1983.5 mg/100 g 순으로 가장 높은 값을 나타냈다. 총균수, 젖산균수, 효모 수 모두 시간이 지날수록 급격히 증가하다가 발효 1일에 감소하다 완만한 증가 후 발효가 끝나는 21일까지 점차 감소하는 비슷한 경향을 나타내었다. 관능검사결과 과일향은 T-SH, 단맛은 TSS, 신맛은 T-SS가 가장 높았으며 알코올향, 알코올맛, 쓴맛은 시료간 유의적으로 차이가 나타나지 않았다. 따라서 대체적으로 전통누룩으로 담근 탁주의 아미노산 함량과 유기산 함량이 개량누룩으로 담근 탁주의 아미노산 함량보다 높은 것으로 보아 전통누룩으로 담근 탁주의 다양성에 대한 잠재력을 확인할 수 있었다. 또한 각 누룩들의 젖산균을 분리동정하였는데 분리된 균들은 대체적으로 Leuconostoc, Weissella, Pediococcus과 Lactobacillus속에 속하였다.