검정해면 (Halichondlia okadai)에 공생하는 것으로 추정되는 항균성을 가진 방선균주를 분리하여 SEM, 형태학적, 화학 분류학적 방법에 의하여 균주를 동정하였으며, 이 균주를 marin broth 2216 배지에서 대량 b배양하여 균사체로부터 항균물질을 각종 HPLC에 의하여 분리하고 X선 결정 구조 해석. MS, NMR spectrum에 의하여 구조를 확인하였다. ISP 2 배지에서 $30^{\circ}C$, 7일간 배양 결과, 기질균사는 갈색을 띄었고 그 위로 ivory색의 기중균사를 형성하였다. spore chain은 flexibilis로서 10개 이상의 oval 형의 포자가 사슬을 형성하고 있었으며 표면은 smooth하였다. 한편. 화학적 특성으로는 L-form의 DAP를 가지며 특징적인 당이 없는 cell wall type I 이었고. 인지질은 PII형 이었으며, 주요 지방산은 iso-14 : 0, anteiso-15 : 0, iso-16 : 0, 16 : 0 및 iso-17:0 이었다. 이들 결과와 Bergey's Manual에 의해 이 균주는 Strptomyces sp.로 동정하였다. 대량 배양한 동결 건조 균체 70g으로 부터 10mg의 연한 노란색의 항균 물질을 분리 정제하였다. 질량 분석에서 이 물질의 분자량은 466으로 확인되었고, 이를 benzene-acetone 용매중에서 결정화하여 X선 결정 구조 해석을 행한 결과 indolo[2,3-a]carbazole alkaloid의 staurosporine 으로 판명되었으며 proton 및 carbon NMR data도 이와 잘 일치하였다.
L-Azetidine-2-carboxylic acid (A-2-C), a four-membered cyclic imino acid has been identified in certain plants, and the microorganism Actinoplanes ferrugineus. The imino acid A-2-C has a physiological significance as an antgaonist of proline during peptide synthesis. The biosynthetic mechanism for the formation of A-2-C has not been studied in any detail. By using various amino acids such as methionine and S-adenosyl-L-methionine labeled with deuterium or carbon-14, the details of the biosynthetic pathway and a possible mechanism for the formation of L-A-2-C in .4. ferrugineus have been unravelled, Both in vivo and in vitro experimental results suggest the biosynthesis of L-A-2-C is mediated by a confactor containing a carbonyl group, probably pyridoxal Phosphate. S-Adenosyl-L-methionine, which seems to be the direct biosynthetic substrate, has undergone a f-displacement by an ${\alpha}$-amino group of the amino acid portion of the substrate S-adenosyl-L-methionine potentially via a vinylglycine intermediate. The overall stereochemical events at the ${\beta}$-carbon of the substrate have been shown to inversion of configuration. The overall stereochemical events at the -position of the sub- strate have also been shown to occur with inversion of configuration. The ${\beta}$, ${\gamma}$-elimination reaction of the substrate seems to follow a cisoidal-type mechanism and the addition portion of the reaction a transoidal-type mechanism . The assignment of the proton NMR of A-2-C has been deduced by apply- ing NOE difference experiments, Gd(III) line-broadening experiments and 2D-NOESY experiments of regio-and stereospecificially deuterated A-2-C's.
Helicobacter pylori (H. pylori) survives in acidic and fluctuating pH conditions of the stomach. The pH effect on H. pylori proteins is important for the advanced understanding of its evolution and viability, although this bacterium has the molecular machinery that neutralizes the acidic condition. HP1492 is known as a conserved NifU-like protein from H. pylori. NifU is a nitrogen fixation protein that mediates the transfer of iron-sulfur (Fe-S) cluster to iron-sulfur proteins like ferredoxin. Commonly, the monomeric reduced state of NifU can be converted to the dimeric oxidized state by intermolecular disulfide bond formation. Because it remains unclear that HP1492 actually behaves as known NifU protein, we first found that this protein can adopt both oxidized and reduced forms using size exclusion chromatography. Circular dichroism experiment showed that HP1492 is relatively well-structured at pH 6.5, compared to other pH conditions. On the basis of the backbone resonance assignment of HP1492, we further characterized the residues that are sensitive to pH using NMR spectroscopy. These residues showing large chemical shift changes could be mapped onto the secondary structure of the protein. Our results could provide the foundation for structural and biophysical studies on a wide spectrum of NifU proteins.
The isomeric intermediates, $3{\alpha}$and $3{\beta}-amino-5{\alpha}-cholestane required for the synthesis of N-nitrosoureas, N-(2-chloroethyl)-N-nitrosocarbamoyl-$3{\alpha}-amino-5{\alpha}$-cholestane (9), N-methyl-N-nitrosocarbamoyl-3${\alpha}-amino-5{\alpha}-cholestane$ (10), N-(2-chloroethyl)-N-nitrosocarbamoyl-$3{\beta}-amino-5{\alpha}-cholestane$: (7), and N-methyl-N-nitrosocarbamoyl-$3{\beta}-amino-5{\alpha}-cholestane$ (8) were obtained through the $LiAlH_{4}$ reduction of $5{\alpha}$-cholestan-3-one oxime, followed by the chromatographic separation: the assignment of the stereochemistry of both isomers were based on the shape and chemical shift of $C_{3}$-proton resonances on their NMR spectra and on the elution mobility on the TLC. The urea intermediates, N-(2-chloroethyl) carbamoyl-3.alpha.-amino-5.alpha.-cholestane (13), N-methylcarbamoyl-$3{\alpha}-amino-5{\alpha}-cholestane$ (14), N-(2-chloroethyl) carbamoyl-$3{\beta}-amino-5{\alpha}-cholestane (11) and N-methyl-$3{\beta}-amino-5{\alpha}$-cholestane (12) were prepared by the treatment of each isomers ($3{\alpha}$-amino-and $3{\beta}-amino-5{\alpha}$-cholestane) with alkyl isocyanates in anhydrous $CHCl_{3}$, and the corresponding nitrosoureas, 7-10 were obtained by the nitrosation of the ureas, 11-14, with AcOH (or HCOOH)/$NaNO_{2}$ in ice-cold condition. The inhibitory activity of the nitrosoureas, 7-10, and their intermediates, 12-14 towards the growth of L1210 murine leukemia cells, were examined. Among them, the compounds 9 and 10 exhibited high activity having $ED_{50}$ to be 5.5g/ml and 6.1g/ml, respectively.
시설내 토양으로부터 식물병원균에 활성을 갖는 길항균을 탐색하는 과정에서 주요 식물 병원균인 Phytophthora capsici, Botrytis cinerea, Rhizoctonia solani, Pythium ultimum 및 Fusarium oxysporum에 활성을 갖는 4종류의 길항균(AF1, AE2, AE3, AF4)을 분리하였다. 이들 중 가장 높은 활성을 나타낸 AE2균을 동정한 결과, 생육한 균은 짙은 오렌지색과 황갈색을 띄었으며, 현미경의 morphology는 column형의 conidial head와 foot cell로 부터 곧게 뻗은 분생자와 2중층의 포자낭병을 형성했다. 그리고 MY20 agar 배지에서 투명한 둥근세포의 형성등이 Aspergillus terreus의 형태와 일치 하였다. Pot에서 병원균과 A. terreus를 동시에 처리하여 오이의 생육을 조사한 결과, 토양중량당 A. terreus의 균체를 1% 처리에 40%, 5% 처리에 57%, 10% 처리에는 75% 병발생율을 억제시켰다. 그리고 A. terreus의 배양여액으로부터 activity-guided fractionation을 실시하여 항진균성 물질인 화합물 I 을 얻었다. $^1H$, $^{13}C\;NMR$, DEPT, $^1H-^1H\;COSY$, HMQC, HMBC 및 질량스텍트럼을 분석한 결과 화합물 I 은 butyrolactone I (${\alpha}$-oxo-${\beta}$-(p-hydroxyphenyl)-${\gamma}$-(p-hydroxy-m-3,3-dimethyl-allylbenzyl)-${\gamma}$-methoxycarbonyl-${\gamma}$-butyrolactone, $C_{24}H_{24}O_7$, M.W. = 424)로 동정되었다.
식물 근권미생물은 식물의 뿌리 표면과 내부에 정착하면서 식물생장 촉진물질을 분비하여 식물생육에 직접적인 영향을 주거나, 항균물질을 분비하여 병원균으로부터 식물 근권환경을 보호하여 식물의 생육을 촉진하게 된다. 이러한 활성을 갖고 있는 미생물을 분리하여 동정하며, 항균물질을 분리, 동정하여 지속농업의 발전과 농업환경의 보전을 위하여 연구를 실시하였다. 논토양으로부터 식물생육촉진활성과 항균활성을 갖는 RRj 228균주를 분리하여, 생리 생화학적방법과 유전학적 방법으로 동정한 결과, Pseudomonas sp.로 동정되었다. RRj 228균주는 B. cinerea, P. ultimum, P. capsici와 R. solani에도 높은 항균활성을 보였으며, 특히 고추탄저병원균인 C. acutatum에 강력한 항균활성을 나타냈다. RRj 228균의 배양여액을 C. acutatum, R. solani 및 P. ultimum에 대한 $ED_{50}$값을 측정한 결과 0.14, 0.16, 0.29 mg/ml로 나타났다. 항균활성물질은 RRj 228 배양여액으로부터 각종 크로마토그라피법으로 순수분리하고, NMR과 GC/MS 등의 기기분석을 실시하여 구조를 Phenazine-1-carboxylic acid (분자량 224)로 동정하였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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