During early development, a dramatic reduction in methylation levels occurs in mouse (Monk et al., 1987). The process of epigenetic reprogramming in early embryos erases gamete-specific methylation patterns inherited from the parents (Howlett & Reik 1991, Monk et al., 1987, Oswald et al., 2000, Sanford et al., 1984). This genome-wide demethylation process may be a prerequisite for the formation of pluripotent stem cells that are important for the later development (Reik & Surani 1997). During post-implantation development, a wave of de novo methylation takes place; most of the genomic DNA is methylated at defined developmental timepoints, whereas tissue-specific genes undergo demethylation in their tissues of expression (Kafri et al., 1992, Razin & Kafri 1994). Another demethylation-remethylation cycle of epigenetic reprogramming takes place during gametogenesis and is necessary for resetting of genomic imprinting (Solter 1988). The dynamic epigenetic reprogramming events appear to be basic and are probably conserved in eutherian mammals (see below). (omitted)
In this paper, we present the theory of computers and mathematics education based on the concept of microworlds for mathematics education. We lust look back some previous papers published in the journal of the Korea society of mathematical education series A and else where. Then we present the new view points regarding mircroworlds and mathematics curriculems, microworlds and mathematics teaching and teaming, microworld based problem centered teaming, and microworld based diagnostics and debuggings. We use JavaMAL microworld that is designed to make LOGO and dynamic geometry system in one microworld to give some examples to explain the necessary mathematics educational needs fur designing microworlds for mathematics education. The JavaMAL microworld is a web based microworld that is programmed using JAVA, and the user on use script language, menus, keyboard, and mouse interaction to use the environment.
Lee, Seung-Jun;Han, Sa Ra;Jeong, Jae Hyun;Kim, Jong-Duk
한국응용과학기술학회지
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제33권4호
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pp.667-675
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2016
Nanoemulsions are actively used in several applications for pharmaceutical, cosmetic and chemical industries. In this study, we propose the use of microfluidizer known as high pressure homogenizer to prepare lipid nanoemulsion as a potent cosmetic delivery carrier. The lipid nanoemulsions were prepared by O/W emulsion with hydrogenated lecithin and different type of oils. Effects of oil type on the stability of the lipid nanoemulsion were investigated with Dynamic Light Scattering (DLS) and Zeta-potential. Arbutin was used as model drug for transdermal administration through hairless mouse skin. Transdermal arbutin delivery using the lipid nanoemulsions was studied with HPLC method.
The backbone molecular dynamics of the C-terminal part of the mouse Cdt1 protein (tCdt1, residues 420-557) was studied by high field NMR spectroscopy. The Secondary structure of this protein was suggested by analyzing of chemical shift of backbone atoms with programs TALOS and PECAN, together with NOE connectivities from 3D $^{15}N-HSQC-NOESY$ data. Measurement of dynamic parameters $T_1,\;T_2$ and NOE and limited proteolysis experiment provided information for domain organization of tCdt1(420-557). Analysis of the experimental data showed that the C-terminal part of the tCdt1 has well folded domain for residues 455-553. The residues 420-453 including ${\alpha}-helix$ (432-441) are flexible and probably belong to other functional domain in intact full length Cdt1 protein.
Park, Jong-Moon;Han, Na-Young;Kim, Hokeun;Hwang, Injae;Kim, Jae Bum;Hahm, Ki-Baik;Lee, Sang-Won;Lee, Hookeun
Mass Spectrometry Letters
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제5권1호
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pp.16-23
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2014
Liquid chromatography based mass spectrometry (LC-MS) is a key technology for analyzing highly complex and dynamic proteome samples. With highly accurate and sensitive LC-MS analysis of complex proteome samples, efficient data processing is another critical issue to obtain more information from LC-MS data. A typical proteomic data processing starts with protein database search engine which assigns peptide sequences to MS/MS spectra and finds proteins. Although several search engines, such as SEQUEST and MASCOT, have been widely used, there is no unique standard way to interpret MS/MS spectra of peptides. Each search engine has pros and cons depending on types of mass spectrometers and physicochemical properties of peptides. In this study, we describe a novel data process pipeline which identifies more peptides and proteins by correcting precursor ion mass numbers and unifying multi search engines results. The pipeline utilizes two open-source software, iPE-MMR for mass number correction, and iProphet to combine several search results. The integrated pipeline identified 25% more proteins in mouse epididymal adipose tissue compared with the conventional method. Also the pipeline was validated using control and colitis induced colon tissue. The results of the present study shows that the integrated pipeline can efficiently identify increased number of proteins compared to the conventional method which can be a breakthrough in identification of a potential biomarker candidate.
멜라토닌(N-acetyl-5-methoxytryptamine)은 포유동물의 뇌의 송과선에서 분비되는 호르몬으로 수면과 생체 리듬 등을 조절하고 난소 기능과 번식에도 영향을 미친다. 또한, 강력한 scavenger로서 항산화제의 역할을 한다. 이 연구의 목적은 멜라토닌이 생쥐 난구세포-핵낭(germinal vesicle, GV) 시기 난자 복합체의 체외성숙에 미치는 영향을 알아보는 것이다. 3주령의 ICR 암컷 생쥐의 난소에서 회수된 난자-난구세포 복합체를 0, 0.1 nM, 10 nM, 1,000 nM의 멜라토닌이 첨가된 배양액에서 18시간 동안 배양하고, 제1극체의 방출 여부를 확인하여 성숙율을 확인하였다. 체외성숙 후 TUNEL assay와 성숙율이 가장 높게 나타났다. 체외성숙된 난자에서는 세포자연사가 나타나지 않았으나 난구세포에서는 관찰되었으며, 1,000 nM을 첨가하여 배양한 군의 난구세포는 유의하게 낮은 세포자연사를 나타냈다. 그리고 1,000 nM의 멜라토닌을 첨가한 군의 난구세포에서 멜라토닌 수용체의 mRNA가 대조군에 비해 낮게 발현되었다. 이상의 결과를 종합하면 체외성숙 배양액에 첨가된 멜라토닌은 난구세포의 세포자연사를 줄여줌으로써 생쥐 미성숙 난자의 체외성숙을 향상시키는 역할을 하는 것으로 사료된다.
Human hydatid disease (cystic echinococcosis, CE) is a chronic parasitic infection caused by the larval stage of the cestode Echinococcus granulosus. As the disease mainly affects the liver, approximately 70% of all identified CE cases are detected in this organ. Optical molecular imaging (OMI), a noninvasive imaging technique, has never been used in vivo with the specific molecular markers of CE. Thus, we aimed to construct an in vivo fluorescent imaging mouse model of CE to locate and quantify the presence of the parasites within the liver noninvasively. Drug-treated protoscolices were monitored after marking by JC-1 dye in in vitro and in vivo studies. This work describes for the first time the successful construction of an in vivo model of E. granulosus in a small living experimental animal to achieve dynamic monitoring and observation of multiple time points of the infection course. Using this model, we quantified and analyzed labeled protoscolices based on the intensities of their red and green fluorescence. Interestingly, the ratio of red to green fluorescence intensity not only revealed the location of protoscolices but also determined the viability of the parasites in vivo and in vivo tests. The noninvasive imaging model proposed in this work will be further studied for long-term detection and observation and may potentially be widely utilized in susceptibility testing and therapeutic effect evaluation.
Kang, Songhwa;Yun, Jisoo;Kim, Da Yeon;Jung, Seok Yun;Kim, Yeon Ju;Park, Ji Hye;Ji, Seung Taek;Jang, Woong Bi;Ha, Jongseong;Kim, Jae Ho;Baek, Sang Hong;Kwon, Sang-Mo
BMB Reports
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제51권2호
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pp.92-97
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2018
B cell leukemia/lymphoma 3 (Bcl3) plays a pivotal role in immune homeostasis, cellular proliferation, and cell survival, as a co-activator or co-repressor of transcription of the $NF-{\kappa}B$ family. Recently, it was reported that Bcl3 positively regulates pluripotency genes, including Oct4, in mouse embryonic stem cells (mESCs). However, the role of Bcl3 in the maintenance of pluripotency and self-renewal activity is not fully established. Here, we report the dynamic regulation of the proliferation, pluripotency, and self-renewal of mESCs by Bcl3 via an influence on Nanog transcriptional activity. Bcl3 expression is predominantly observed in immature mESCs, but significantly decreased during cell differentiation by LIF depletion and in mESC-derived EBs. Importantly, the knockdown of Bcl3 resulted in the loss of self-renewal ability and decreased cell proliferation. Similarly, the ectopic expression of Bcl3 also resulted in a significant reduction of proliferation, and the self-renewal of mESCs was demonstrated by alkaline phosphatase staining and clonogenic single cell-derived colony assay. We further examined that Bcl3-mediated regulation of Nanog transcriptional activity in mESCs, which indicated that Bcl3 acts as a transcriptional repressor of Nanog expression in mESCs. In conclusion, we demonstrated that a sufficient concentration of Bcl3 in mESCs plays a critical role in the maintenance of pluripotency and the self-renewal of mESCs via the regulation of Nanog transcriptional activity.
A myofiber of skeletal muscle is composed of myofibrils, sarcolemma (plasma membrane), and constameres, which anchor the myofibrils to the sarcolemma. Achvillin is a recently identified F-actin binding muscle protein, co-isolates with dystrophin and caveolin-3 in low-density sarcolemma of striated muscle, and colocalizes with dystrophin at costameres, the specialized adhesion sites in muscle. Archvillin also binds to nebulin and localizes at myofibrillar Z-discs, the lateral boundaries of the sarcomere in muscle. However other roles of archvillin on the dynamics of myofibrillogenesis remain to be defined. The goal of this study is, by using siRNA-mediated gene silencing technique, to investigate the effect of archvillin on the dynamics of myofibrillogenesis in cell culture of a mouse skeletal myogenic cell line (C2C12), where presumptive myoblasts withdraw from the cell cycle, fuse, undergo de novo myofibrillogenesis, and differentiate into mature myotubes. The roles of archvillin in the assembly and maintenance of myofibril and during the progression of myofibrillogenesis induced in skeletal myoblast following gene silencing in the cell culture were investigated. Fluorescence microscopy demonstrated that the distribution of archvillin was changed along the course of myofibril assembly with nebulin, vinculin and F-actin and then located at Z-lines with nebulin. Fluorescence microscopy demonstrated that knockdown of mouse archvillin expression led to an impaired assembly of new myofibrillar clusters and delayed fusion and myofibrillogenesis although the mouse archvillin siRNA did not affect those expressions of archvillin binding proteins, such as nebulin and F-actin. This result is corresponded with that of RT-PCR and western blots. When the perturbed archvillin was rescued by co-transfection with GFP or Red tagged human archvillin construct, the inhibited cell fusion and myotube formation was recovered. By using siRNA technique, archvillin was found to be involved in early stage of myofibrillogenesis. Therefore, the current data suggest the idea that archvillin plays critical roles on cell fusion and dynamic myofibril assembly.
모바일 단말 환경에서 상황 인식 컴퓨팅 기술은 유비쿼터스 컴퓨팅의 핵심 기술 중 하나이다. 상황 인식 컴퓨팅은 사용자의 활동에 따라 능동적으로 반응하는 컴퓨팅 응용들을 실현 가능하게 한다. 현재 모바일 단말은 데스크 탑 컴퓨터에 비해 사용자 인터페이스와 자원은 매우 제한적이다. 데스크 탑 사용자는 정지된 상태에서 사용자 인터페이스를 설계하는 반면에 모바일 사용자는 단말을 사용하는 동안 움직인다는 것을 가정해야 하기 때문에 기존의 대표적인 입출력 장치인 키보드와 마우스 같은 편리한 사용자 인터페이스를 제공할 수 없다. 본 논문에서는 인간이나 물체의 물리적인 활동 상태와 자세를 감지할 수 있는 가속도센서를 사용하여 모바일 단말에 적용함으로서 모바일 단말의 부족한 사용자 인터페이스를 보완하고 제한된 자원을 효율적으로 이용할 수 있는 지능형 제어 시스템을 소개한다. 제안된 시스템은 모바일 단말기 사용자의 활동 상태 (정적인 상태와 동적인 상태)와 모바일 단말을 보는 자세를 동시에 추정하였고, 그것의 응용인 지능형 제어 시스템은 사용자의 행동에 따라 모바일 단말기의 백라이트가 ON 또는 OFF 되는 것이다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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