• 미생물학회지
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• 제31권4호
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• pp.267-273
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• 1993

Escherichia coli 의 superoxide 라디칼 유도발현성 유전자의 탐색을 위하여 먼저 superoxide 라디칼에 의하여 발현이 유도되는 프로모터를 탐색하였다. 이를 위햐여, 프로모터 탐색벡터인 pJAC4 를 이용하여 E. coli MG1655 균주로부터 프로모터 library 를 구성하였다. Ampicillin 농도구 배정판법을 이용하여 프로모터 세기가 다른 클론들을 구별하여 프로모터 세기가 약한 것부터 중간정도까지 383개의 클론을 선별하였다. 이들 프로모터 클론들의 superoxide 라디칼 유도발현성을 paraquat 를 첨가한 ampicilin 농도구배평판에서 조사하였다. 이중 3개의 클론이 paraquat 에 의하여 유도됨을 확인하였고, 유도배율은 1.4-4배 정도이었다. 이들 프로모터의 염기서열을 결정한 결과 기종의 database 에 등록되어 있는 E. coli 염기서열들과는 다른 새로운 유전자임을 알았다. 이들 프로모터에 대하여 primer 연장법과 SS1 뉴클리아제 분석을 총하여 전사개시 자리를 결정하였고, paraquat 처리시 mRNA 의 양이 증가함을 관찰하였다. 특히 클론5의 경우는 두개의 전사개시 위치를 가지고 있으며, paraquat 처리시 상위 부분의 전사개시자리가 성택적으로 사용됨을 알 수 있었다. 프로모터 서열을 검색한 결과, RNA 중합효소($E\sigma^{70}$)에 의햐여 인지되는 -10과 -35부위를 가진 클론은 클론 5 뿐이었고, 나머지는 보존된 염기서열을 찾을 수 없었다. 이는 이들 프로모터들이 독특한 부류에 속하는 종류들로서, 새로운 전사조절인자를 요구할 가능성을 시사한다.

• 미생물학회지
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• 제36권2호
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• pp.142-149
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• 2000

국내에서 유행하는 Plasmodium vivax의 유전자를 조작하여 만든 재조항 Circumsporozrozite(CS) 단백질 (22)을 이용하여 말라리아에 대한 혈청학적 검사의 유용성을 평가하였다. 최초발병일로부터 진단까지 걸린 기간을 기준으로 환자들의 면역반응을 Western blot으로 알아본 결과, 15일 이내에 진단받은 환자들은 43.8%(14/32)가 양성반응을 보였고, 16일 이상 경과한 환자들은 94.4%(17/18)가 양성반응을 보여 전체적으로는 62%(31/50)의 양성률을 보였다. Blood stage 항원에 대한 항체를 갖고 있음에도 불구하고 재조합 CS단백질 항원에 대해 음성인 환자들이 22.6%(7/31)였다. 비유행지 주민(경북 예천군)들은 10.7%(3/28),유행시 주민(인천시 강화군)들은 27.6%(13/47)의 재조합 CS 단백질에 대한 항체 양성을 보였다. 재조합 CS 단백질 항원의 역학조사시 유용성을 알아보기 위하여 말라리아 유행지인 경기도 파주시 조산리, 마정리, 항양리, 뇌조리 거주 주민 422명의 전혈을 채취하여 혈액도말법과 중합효소연쇄 반응법으로 항원검사를 실시하였으며 blood stage 항원을 이용한 간접면역형광법과 재조합 CS 단백질 항원을 이용한 효소면역측정법으로 말라리아 항체보유 여부를 조사하였다. 혈액도말법에서는 422명 모두 음성이었으나, 중합효소연쇄반응법에서는 2명(0.47%)이 양성이었다. 간접면역형광법에서는 42명(9.95%), 재조합 CS 단백질 항원을 이용한 효소변역측정법에서는 71명(16.82%)이 양성으로 나타났다. 두 검사에서 모두 항체 양성을 보인 사람은 8명(11.27%)에 불과하였다.

• 미생물학회지
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• 제32권2호
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• pp.102-108
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• 1994

ABF1(Autonomously replicating sequence Binding Factor 1)은 효모 genome에서 $RTCRYN_5ACG$의 염기 서열을 가지고 있는 promoter, mating-type silencer, ARS에 결합하는 DNA binding 단백질이다. E. coli 에서 ABF1 유전자를 발현하기 위하여, ABF1 유전자를 pMAL-c2 벡터에 cloning하였다.(pMAHW). pMAHW를 E. coli에 형질전환하여, ABF1 융합단백질을 발현시키고, amylose resin affinity chromatography에 의하여 분리하였다. Factor Xa protease를 이용하여 분리된 융합단백질로부터 maltose binding protein을 잘라낸 후에 gel retardation analysis 방법으로 분리된 ABF1이 ARS1에 결합하는 능력을 지니고 있음을 확인하였다. DNA 결합에 관련된 부위를 찾기 위하여, 비전형적인 zinc finger motif가 위치하는 자리에서 pMAHW의 ABF1 유전자에 His-61을 다른 아미노산으로 치환하였다. DNA binding 부위로 추정되는 ABF1 단백질의 중간지역에 Leu-353, Leu-360를 다른 아미노산으로 치환하였다. Site-specific mutagenesis 를 통해 만들어진 mutant를 gel retardation analysis와 complementation test를 통해서 비전형적인 zinc finger motif이외에 다른 DNA binding motif가 있는 것을 알 수 있었다.

• 미생물학회지
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• 제54권3호
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• pp.272-279
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• 2018

본 연구는 여드름을 유발하는 세균인 Propionibacterium acnes에 대해 다양한 토양에서 분리된 세균 균주들의 항균효과를 조사하기 위해 수행되었다. 수백 개의 분리 세균균주 중 Paenibacillus elgii DS381과 Paenibacillus elgii DS1515, Burkhoderia gladioli DS518, Streptomyces lienomycini DS620는 2가지 균주의 P. acnes에 대해 높은 항균활성을 나타내었다. 이 분리균주들은 agar well diffusion test에서 15.5~34.3 mm 직경의 저해대를 형성하였으며, 특히 DS620는 가장 큰 저해대 직경(28.3~34.3 mm)을 나타내었다. 분리 균주가 생성하는 항균 물질은 DS381과 DS1515 균주의 경우lipopeptide (pelgipeptin, paenipeptin), DS518은 protease, 그리고 DS620은 anthracycline 인 것으로 추정되며, 이들 모두 P. acnes에 대해매우낮은 최소저해농도를 나타내었다[DS381와 DS1515 (0.078 mg/ml), DS518 (0.312 mg/ml), DS620 (0.000078 mg/ml)]. P. acnes를 대상으로 한 time-kill assay에서는 네 균주의 항균물질이 모두 24시간 이내에 P. acnes를 완전히 사멸시켰다. 이 결과는 네 가지 항균활성 균주들이 분비하는 항균물질들이 여드름을 유발하는 P. acnes에 대하여 효율적인 치료 소재로 사용될 수 있는 가능성을 보여준다.

• 한국식품과학회지
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• 제32권5호
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• pp.1198-1205
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• 2000

은행잎 엑스 3종류를 이용하여 활성산소와 염중관련 아라키돈산 유리의 억제능을 보았다. 은행잎 엑스, Ginkgolide A, Ginkgolide B의 3종류 모두 pyrogallol 자동산화에서는 항산화능을 발휘하지 못하였으나, DPPH법의 전자공여능에서는 환원력을 나타내었다. 10 ${\mu}M$ 과산화수소($IC_{50}=10\;{\mu}M$)로 U937의 지질과산화 유도 시 은행잎 엑스 3종류 모두 400 ${\mu}g/mL$이상에서는 보호하였으나, 은행잎 엑스가 가장 좋았다. 단백질 분해실험에서는 Ginkgolide A만이 효과가 좋아 50 ${\mu}g/mL$에서도 거의 억제하였다. TPA와 calcimycin을 U937에 첨가하여 염중 유도의 중요 물질인 아라키돈산 유리를 유도하였다. 이 아라키돈산 유리 유도 시 은행잎 엑스 3종류 모두 10 ${\mu}g/mL$에서도 뛰어난 억제능을 보였으며, 특히 Ginkgolide B는 유도 시에 비하여 11배 억제하였으며, 비유도시인 대조군보다도 약 4배의 억제능을 보였다. 따라서 은행잎 엑스가 항산화능에 의해 아라키돈산 유리를 억제하는 것이 아니라 아라키돈산 유리의 전 단계의 어느 부분을 강하게 억제하여 아라키돈산 유리가 저해되는 것으로 생각된다.

• Journal of Microbiology
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• 제41권3호
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• pp.207-211
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• 2003

Extracellular protease, from Aeromonas hydrophila Ni 39, was purified 16.7-fold to electrophoretic homogeneity with an overall yield of 19.9％, through a purification procedure of acetone precipitation, and Q Sepharose and Sephacryl S-200 chromatographies. The isoelectric point of the enzyme was 6.0 and the molecular mass, as determined by Sephacryl S-200 HR chromatography, was found to be about 102 kDa. SDS/PAGE revealed that the enzyme consisted of two subunits, with molecular masses of 65.9 kDa. Under standard assay conditions, the apparent $K_{m}$ value of the enzyme toward casein was 0.32 mg/ml. About 90％ of the proteolytic activity remained after heating at 60$^{\circ}C$ for 30 min. The highest rate of azocasein hydrolysis for the enzyme was reached at 60$^{\circ}C$, and the optimum pH of the enzyme was 9.0. The enzyme was inhibited by the serine protease inhibitor, phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF), by about 87.9％, but not by E64, EDTA, pepstatin or 1,10-phenanthroline. The enzyme activity was inhibited slightly by Ca$\^$2＋/, Mg$\^$2＋/ and Zn/supb 2＋/ ions.

• 한국축산식품학회지
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• 제38권4호
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• pp.664-678
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• 2018

This study was carried out to establish shelf life for pork cutlet of ground meat and pork lard by using various quality indicators and to understand how quality changes in these products are accelerated by temperature. The samples were selected and purchased from markets in Korea, and the chosen quality indicators were total aerobic counts and coliform group in microbiological analyses, thiobarbituric acid reactive substances assay, volatile basic nitrogen, pH, acid value, and peroxide value in physical chemical analyses, and sensory evaluation. The pork cutlet samples were stored at $-18^{\circ}C$, $-6^{\circ}C$, and $-1^{\circ}C$, whereas pork lard samples were stored at $10^{\circ}C$, $25^{\circ}C$, $35^{\circ}C$, and $45^{\circ}C$. These temperature conditions were set to real distribution conditions. The samples were then analyzed using various models including of reaction orders, arrhenius equation, and $Q_{10}$ value. The quality limits for each sample were calculated, and shelf life was estimated. The results of this experiment highlighted the importance of temperature control during the distribution process of these products and revealed that temperature is a useful parameter for the establishment of a basic database for shelf life.

• Biomolecules & Therapeutics
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• 제5권2호
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• pp.179-186
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• 1997

The pharmacokinetics and tissue distribution of DWP20373, a novel fluoroquinolone, were examined in rats and beagle dogs after a single intravenous and oral administration. Analysis of DWP20373 in plasma, tissue, and urine was performed by both HPLC and microbiological assay. The plasma drug concentration declined biexponentially both rats and beagle dogs. In the rats, the terminal drug elimination half-life (t$_{1}$2$\beta$/) was 64 min (IV) and 57 min (PO) by bioassay, and 76 min (IV) and 77 min (PO) by HPLC. Whereas in beagle dogs, t$_{1}$2$\beta$/ was 196 min (IV) and 350 min (PO). The volume of distribution at steady-state (Vd$_{ss}$ ) was 811 ml/kg (bioassay) and 2061 ml/kg (HPLC) in rats, and 2738 ml/kg (bioassay) in beagle dogs. The total body clearance (Cl$_{t}$) of DWP20373 was 10 ml/min/kg (bioassay) and 7 ml/min/kg (HPLC) in rats, and 11 m1/min/kg (bioassay) in beagle dogs. The extent of bioavailability after oral administration was 49% (bioassay) and 67% (HPLC) in rats, and 84% (bioassay) in beagle dogs. The 24-h urinary recovery, measured by bioassay, was 2.7% after oral dosing and 5.5% after intravenous dosing in rats. Serum protein binding ratio determined at 27g/ml was 78%. This drug was also distributed in tissues in the decreasing order of liver, kidney, spleen, lung, heart, and muscle determined at 30 min after oral administration.on.

• Journal of Microbiology
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• 제40권4호
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• pp.282-288
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• 2002

Since culture of Helicobacter pylori is relatively insensitive and cumbersome, molecular detection and typing of H. pylori isolates are gaining importance for strain differentiation. In the present study genomic DNA of 42 gastric biopsies and H. pylori isolates from corresponding patients were analyzed and compared by PCR-based RFLP assay. The 1,132-bp product representing an internal portion of ureC gene of H. pylori was amplified by PCR and digested with restriction enzymes HindⅢ, AiuⅠ and PvuⅠ. The HindⅢ, AluⅠ and PvuⅠ digestion produced 4, 7, and 2 distinguishable RFLP patterns respectively from 42-H. pylori isolates. By combining all three restriction enzyme digestions, 15 RFLP patterns were observed. However, when PCR products from 42 gastric biopsy specimens were digested by restriction enzymes HindⅢ, AluⅠ and PvuⅠ, we observed 5, 8 and 2 RFLP patterns, respectively. Patterns from 34 of 42 gastric biopsy specimens matched those of corresponding H. pylori isolates from respective patients. Patterns from the remaining eight biopsy specimens differed and appeared to represent infection with two H. pylori strains. The patterns of one strain from each of these biopsies was identical to that of the isolate from corresponding patients and the second pattern presumably represented the co-infecting strain. From the study, it appears that PCR-based RFLP analysis is a useful primary tool to detect and is distinguish H. pylori strains from gastric biopsy specimens and is superior to culture techniques in the diagnosis of infection with multiple strains of H. pylori.

• Journal of Microbiology
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• 제42권3호
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• pp.211-215
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• 2004

Toxoplasmosis has been well known as an important human infection to consider especially in pregnant women. Although many serologic methods are available, the diagnosis of toxoplasmosis can be extremely difficult. The presence of increased levels of Toxoplasma-specific IgG antibodies indicates an infection, but it does not differentiate between a recent and past infection. The purpose of our study was to compare the performance of the ELISA T. gondii IgG/IgM test, a widely used enzyme-linked immunosorbent assay, to the ELISA IgG avidity method. One hundred and four serum samples (from 38 males and 66 females) were tested and evaluated from symptomatic patients (chorioretinitis, lymphadenopathy), and from women in their first trimester of pregnancy who were suspected of having toxoplasmosis, The high IgG avidity and ELISA IgG antibody levels were in agreement for 51 of the specimens (49.0％). Thirty-eight discrepant (borderline) results from the IgG avidity method were positive for IgM (3 specimens) and IgG (37 specimens). Interestingly, out of the eight serum samples that were positive for both IgG and IgM antibodies, two samples were low IgG avidity, and three samples were borderline. There was no statistically significant relation observed between the results of the IgG avidity method and the ELISA IgG test, and the IgG avidity method and ELISA IgM test (X$^2$=1.987; p=0.370 and X$^2$=2.152; p=0.341, respectively). The IgG avidity method was considered easy to perform and an acceptable approach for the differentiation of discrepant results (recent/chronic) and for the current detection of T. gondii antibodies. We concluded that the determination of IgG avidity is a helpful tool for the diagnosis of the ocular form of toxoplasmosis and it is a safe method for screening this disease in the first trimester of pregnancy.