• 대한유전성대사질환학회지
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• 제14권2호
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• pp.174-177
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• 2014

단독 메틸말론산혈증은 상염색체 열성으로 유전되는 선천성 유전대사질환으로 methylmalonyl-coenzyme A mutase (MCM)의 결핍에 의해 야기된다. MCM를 코딩하는 MUT 유전자의 돌연변이가 단독 메틸말론산 혈증의 주된 원인이다. 저자들은 생후 15일 여아가 신생아 선별검사를 통하여 C3-acylcarnitine (C3)이 증가되어 있었던 증례를 경험하였다. 환아의 혈장 homocysteine은 정상이었고, 소변 methylmalonic acid는 증가되어 있어서 단독 메틸말론산혈증이 의심되었다. 환아는 단백제한식이와 함께 carnitine 보충요법을 시작하였고, 생후 3개월까지 특별한 증상없이 정상적인 성장을 하고 있다. MUT 유전자 검사를 시행하였으며, 환아는 c.323G>A와 c.1672+2T>C (IVS8 (+2)T>C 변이를 각각 이형접합자로 가지고 있었다. 이중 c.1672+2T>C (IVS8(+2)T>C)은 이전에 보고되지 않은 새로운 돌연변이로 이에 증례 보고하는 바이다.

• 환경생물
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• 제22권3호
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• pp.472-477
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• 2004

본 연구에서는 감마선으로 유도된 돌연변이체들에서 공통으로 발현되는 방사선 관련 유전자들의 발현을 연구하기 위하여, B. lentimorbus WJ5 의 방사선 유도 돌연변이체에서 발현되는 유전자를 DNA microarray로 동시에 탐색하였다. DNA microarray는 B. lentimorbus WJ5 genome을 무작위로 절단하여 2,000 단편으로 구성하였으며, 감마선 $(^{60}/Co)$으로 유도된 7 돌연변이체의 발현을 정량적으로 관찰하였다. 클러스터 분석결과 발현된 408 유전자 중 27개가 감마선 유도 돌연변이체 모두에서 유의하게 발현이 증가되었다. 특히, 복구(mutL, mutM) 에너지 대사 (acsA, sdhB, pgk, yhjB, citB), protease (npr), 산화자극에 대한 환원 (HMM)관련 유전자들이 동시에 증가되었다. 이는 감마선 유도 돌연변이체들에서 자발적인 직/간접 복구 관련 유전자의 발현 증가는 방사선 노출 직후 보이는 stress response와는 다른 현상임을 나타내는 것으로 생각된다.

• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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• 제5권1호
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• pp.7-12
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• 2000

The expression of the mouse $\alpha-amylase$ gene in the methylotrophic yeast, P pastoris was investigated. The mouse $\alpha-amylase$ gene was inserted into the multi-cloning site of a Pichi a expression vector, pPIC9, yielding a new expression vector pME624. The plasmid pME624 was digested with SalI or BglII, and was introduced into P. pastoris strain GSl15 by the PEG1000 method. Fifty-three transformants were obtained by the transplacement of pME624 digested with SaiII or BglII into the HIS4locus $(38\;of\;Mut^+\;clone)$ or into the AOX1 locus $(15\;of\;Mut^s\;clone)$. Southern blot was carried out in 11 transformants, which showed that the mouse $\alpha-amylase$ gene was integrated into the Pichia chromosome. When the second screening was performed in shaker culture, transformant G2 showed the highest $\alpha-amylase$ activity, 290 units/ml after 3-day culture, among 53 transformants. When this expression level of the mouse $\alpha-amylase$ gene is compared with that in recombinant Saccharomyces cerevisiae harboring a plasmid encoding the same mouse $\alpha-amylase$ gene, the specific enzyme activity is eight fold higher than that of the recombinant S. cerevisiae.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제14권2호
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• pp.80-85
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• 2017

Methylmalonic acidemia (MMA) is an autosomal recessive metabolic disorder characterized by an abnormal accumulation of methylmalonyl-CoA and methylmalonate in body fluids without hyperhomocysteinemia. Cardiac disease is a rarely known lethal complication of MMA, herein, we report a Korean neonate diagnosed with MMA on the basis of biochemical and genetic findings, who developed cardiomyopathy, resulting in sudden death. The patient presented vomiting and lethargy at 3 days of age. Initially, the patient had an increased plasma propionylcarnitine/acetylcarnitine concentration ratio of 0.49 in a tandem mass spectrometry analysis and an elevated ammonia level of $537{\mu}mol/L$. Urine organic acid analysis showed increased excretion of methylmalonate. Subsequent sequence analysis of the methylmalonyl-CoA mutase (MUT) gene revealed compound heterozygous mutations c.323G>A (p.Arg108His) in exon 1 and c.1033_1034del (p. Leu345Serfs*15) in exon 4, the latter being a novel mutation. In summary, this is the first case of MMA and cardiomyopathy in Korea that was confirmed by genetic analysis to involve a novel MUT mutation.

• Animal cells and systems
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• 제1권3호
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• pp.451-455
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• 1997

The effects of nalidixic acid, mitomycin C, and cadmium chloride $(CdCI_2)$ on the activity of 8-hydroxyguanine $(oh^8Gua)$ endonuclease, a DNA repair enzyme for oxidatively modified guanine, $(oh^8Gua$ were studied. Nalidixic acid and mitomycin C, typical inducers of the S0S DNA repair response in E. coli, showed different effects. Nalidixic acid raised the activity of this enzyme, but mitomycin C did not show such an effect. Cadmium chloride also induced the enzyme activity, These results show that the expression of $oh^8$ Gua endonuclease is regulated by multiple factors and can be induced under stressful conditions. In an attempt to demonstrate the importance of this enzyme in defense against DNA damage and mutagenesis, we also characterized mutM mutant for its oh8 Gua endonuclease activity. The mutM mutant showed no detectable $oh^8$ Gua endonuclease activity, unlike its wild type showing high activity. In addition, paraquat, a superoxide producing compound, failed to elevate $oh^8Gua$ endonuclease activity in this mutant. These results suggest that the mutM gene is identical to the $oh^8Gua$ endonuclease gene of E. coli. Taken together with previous reports, these results suggest that $oh^8Gua$ endonuclease plays a crucial role in the protection of aerobically growing organisms from threats of oxidative DNA damage and mutation.

• 대한유전성대사질환학회지
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• 제19권1호
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• pp.12-19
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• 2019

목적: 코발라민(Cobalamin)과 동반되지 않은 독립형 메틸말론산혈증(methylmalonic acidemia)은 프로피오네이트 대사 질환으로 상염색체 열성으로 유전된다. Methylmalonyl-CoA mutase (MCM)효소발현에 관련된 유전자인 MMUT에는 유전자 결함에는 두 가지 아형이 있다. $Mut^0$은 효소 활성도가 완전히 없는 것이고 Mut-형은 효소활성도가 저하되어 있지만 hydroxocobalamin (OHCbl) 보충으로 잔여효소의 활성도가 증가될 수 있는 형이다. 본 연구의 목적은 한국인 MMA 환아에서 코발라민의 반응성과 돌연변이를 조사하는 것이다. 방법: 최적의 치료를 위해 MCM 활성도와 비타민 $B_{12}$ 반응성을 측정하기 위하여 섬유 아세포의 체세포 보완 분석을 사용하여 10명의 MMA 환자를 평가했다. MMUT 유전자는 MMA 돌연변이의 염기서열을 확인하였다. 결과: $^{14}C-propionate$의 첨가는 OHCbl에 반응이 없는 모든 환자에서 낮게 나타났다. $^{14}C-methyltetrahydrofolate$와 $^{57}Co-cyanocobalamin$의 투여 후 모두 정상범위 내에 있었다. 아데노 실 코발라민의 합성은 낮지 만 메틸 코발라민의 합성은 적절하였다. 보완 분석 결과 모든 환자들은 $mut^0$ 유형이었다. DNA 염기서열분석결과에서 2개의 새로운 돌연변이, p.Gln267Ter 및 p.Ile697Phe를 포함하여 12개의 상이한 MMUT 돌연변이를 확인하였다. 신생아에서 증상이 나타나며 $mut^0$ 형인 MMA 환자 10례 모두에서 코발라민 반응을 보이지 않았다. 결론: 본 연구에서는 모든 한국 MMA 환자에서 코발라민 반응을 시험한 결과 음성이었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제19권9호
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• pp.966-971
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• 2009

Peroxidase from Coprinus cinereus (CiP) has attracted attention for its high specific activity and broad substrate spectrum compared with other peroxidases. In this study, the functional expression of this peroxidase was successfully achieved in the methylotrophic yeast Pichia pastoris. The expression level of CiP was increased by varying the microbial hosts and the expression promoters. Since a signal sequence, such as the alpha mating factor of Saccharomyces cerevisiae, was placed preceding the cDNA of the CiP coding gene, expressed recombinant CiP (rCiP) was secreted into the culture broth. The Mut Pichia pastoris host showed a 3-fold higher peroxidase activity, as well as 2-fold higher growth rate, compared with the $Mut^s $ Pichia pastoris host. Furthermore, the AOX1 promoter facilitated a 5-fold higher expression of rCiP than did the GAP promoter.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제51권9호
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• pp.964-970
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• 2008

목 적 : 메틸말로닌산뇨증과 프로피오닌산뇨증은 상염색체 열성으로 유전되는 아미노산 대사 이상 질환으로, methylmalonyl-CoA mutase와 propionyl-CoA carboxylse의 결함에 의해 발생하며 최근 유전자형에 대한 연구가 활발히 이루어지고 있다. 저자들은 단일기관에서 경험한 이 질환군의 임상 양상과 유전자형에 대해 조사하고자 하였다. 방 법 : 1993년부터 2007년까지 서울아산병원 소아과에서 유기산뇨증으로 진단된 20례를 대상으로 질병의 종류, 진단시 연령과 임상 양상, 유전자형, 검사 소견, 치료와 예후 등을 후향적으로 분석하였다. 혈장 암모니아, 소변 유기산 분석과 혈장 아미노산을 조사하였고, 유전자분석은 메틸말로닌산뇨증에서는 MUT, MMAA, MMAB 와 MMACHC 유전자를, 프로피오닌산뇨증에서는 PCCA와 PCCB 유전자를 분석하였다. 결 과 : 유기산뇨증으로 진단된 환아는 모두 20명이었으며, 그 중 메틸말로닌산뇨증이 12명(남아 8명, 여아 4명), 프로피오닌산뇨증이 8명(남아 6명, 여아 2명)이었다. 신생아 대사이상 검사로 진단된 환아가 5명이었으며, 6명은 신생아기에 급성 증상으로 발현하였고, 9명은 1개월 이후 발현한 지발형이었다. 신생아기 발현형에서는 6명 중 5명이 구토와 기면을 주증상으로 내원하였으며, 지발형에서는 구토와 기면 이외에도 발달 지연, 보행 장애, 혈소판 감소증 등 다양한 임상 양상을 보였다. 예후로는 메틸말로닌산뇨증 환아 중 2명(17%)이 2세경에 고암모니아혈증과 대사성 산증으로 사망하였으며, 7명(58%)이 정상발달을 보였다. 프로피오닌산뇨증 환아는 1명이 사망하였고, 4명(50%)이 정상 발달을 보이고 있다. 증상의 발현시기에 따라서는 신생아기 발현형에서 6명중에서 2명은 사망, 2명은 정상 발달, 2명은 발달지연을 보이고 있는 것에 비해, 증상 없이 신생아 대사이상 검사로 진단된 환아 중에는 2명(40%)이 정상발달을 보이고 있고, 지발형에서는 7명(63%)이 정상 발달을 보이고 있다. 유전자형은 메틸말로닌산뇨증 전례에서 규명되었으며 10명은 MUT 유전자에서 11종의 서로 다른 돌연변이가 발견되었는데 대부분 nonsense 돌연변이였다. 비타민 B12 반응형 환아 2명에서는 MMACHC 유전자에서 3종의 서로 다른 돌연변이가 발견되었으며 프로피오닌산뇨증에서는 16개 대립유전자 중 14개에서 PCCA와 PCCB 유전자의 돌연변이가 규명되었다. 결 론 : 유기산뇨증은 진단이 지연되면 매우 치명적이나, 조기에 의심하여 진단하고 적절히 치료하면 좋은 예후를 기대할 수 있는 질환이다. 유기산뇨증의 유전자형의 분석은 정확한 진단을 가능하게 할 뿐 아니라 유전상담, 산전 진단 및 표현형의 예측에도 도움이 된다.

• Animal Bioscience
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• 제34권5호
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• pp.801-810
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• 2021

Objective: microRNAs (miRNAs) can play a role in a variety of physiological and pathological processes, and their role is achieved by regulating the expression of target genes. Our previous high-throughput sequencing found that ssc-miR-185 plays an important regulatory role in piglet diarrhea, but its specific target genes and functions in intestinal porcine epithelial cell (IPEC-J2) are still unclear. We intended to verify the target relationship between porcine miR-185 and cell division cycle 42 (CDC42) gene in IPEC-J2 and to explore the effect of miR-185 on the proliferation of IPEC-J2 cells. Methods: The TargetScan, miRDB, and miRanda software were used to predict the target genes of porcine miR-185, and CDC42 was selected as a candidate target gene. The CDC42-3' UTR-wild type (WT) and CDC42-3'UTR-mutant type (MUT) segments were successfully cloned into pmirGLO luciferase vector, and the luciferase activity was detected after co-transfection with miR-185 mimics and pmirGLO-CDC42-3'UTR. The expression level of CDC42 was analyzed using quantitative polymerase chain reaction and Western blot. The proliferation of IPEC-J2 was detected using cell counting kit-8 (CCK-8), methylthiazolyldiphenyl-tetrazolium bromide (MTT), and 5-ethynyl-2'-deoxyuridine (EdU) assays. Results: Double enzyme digestion and sequencing confirmed that CDC42-3'UTR-WT and CDC42-3'UTR-MUT were successfully cloned into pmirGLO luciferase reporter vector, and the luciferase activity was significantly reduced after co-transfection with miR-185 mimics and CDC42-3'UTR-WT. Further we found that the mRNA and protein expression level of CDC42 were down-regulated after transfection with miR-185 mimics, while the opposite trend was observed after transfection with miR-185 inhibitor (p<0.01). In addition, the CCK-8, MTT, and EdU results demonstrated that miR-185 promotes IPEC-J2 cells proliferation by targeting CDC42. Conclusion: These findings indicate that porcine miR-185 can directly target CDC42 and promote the proliferation of IPEC-J2 cells. However, the detailed regulatory mechanism of miR-185/CDC42 axis in piglets' resistance to diarrhea is yet to be elucidated in further investigation.

• The Plant Pathology Journal
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• 제36권5호
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• pp.440-449
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• 2020

The purpose of this study was to analyze the genetic and pathogenic characteristics of Ralstonia pseudosolanacearum in roses in Korea, and to examine the similarities and differences between Korean isolates and the first-reported European strains. Between 2017 and 2019, seventeen isolates from rose plants were identified as R. pseudosolanacearum using Ralstonia-specific primers. All 17 isolates were identified as race 1 using race-specific primers, and were confirmed as biovar 3 due to their ability to utilize carbon sources. Multiplex PCR using phylotype discriminating specific primers identified the 17 isolates as phylotype I. Sequevar comparison with reference sequevars using the sequences of the egl, mutS, and fliC genes, and only the egl gene, revealed that the strains evaluated in this study corresponded to sequevar I-33. The pathogenicity in roses differed depending on the rose cultivars. The different methods used for the genetic characterization of R. pseudosolanacearum indicate that the 17 rose bacterial wilt isolates had the same genetic characteristics. The lack of genetic variation in these isolates indicates their recent introduction from other countries (likely European countries). Therefore, appropriate quarantine and control measures should be taken in order to avoid further increases in the pathogenicity and/or secondary host range of R. pseudosolanacearum through genetic mutation.