Rhizobium fredii USDA191 은 대기 중의 질소를 환원하여 식물체의 생육에 필요한 질소원을 공급해주는 세균으로 다량의 체외 다당류를 합성한다. 전위요소 Tn5의 삽입에 의한 돌연변이 유도로 다당류결핍 변이주 R. fredii YKL293 가 분리되었으며 이 변이주로부터 Tn5 에 인접한 DNA 단편이 pUC19 에 클로닝되었고(plyk5293),이 DNA 단편을 탐침으로 하여 .lambda.NM1149 에 구성되 USDA191 genomic library 로부터 야생형체외다당류 합성관련 유전자(exo) 를 함유한 클론 .lambda. NM1149 22E 를 plaque 혼성화에 의하여 분리하였다. 클론 NM1149.22E 에 들어있는 exo 유전자를 pBR322 에 옮겨서 pJW33을 만들고, 재조합체 pJW33 을 Escherichia coli POII734 에 도입시켜 lacZ 구조유전자를 함유한 MudI 1734 가 exo 유전자의 프러모토와 융합되어 lacZ 구조유전자의 전사가 이루어지도록 하였다. 위와 같이 만들어진 재조합체 플라스미드 pUM21을 함유한 E. coli JM83 은 .betha.-galactosidase 를 합성하였으며, 야생형 tacZ 유전자를 갖고 있는 E. coli LE392 에 비해서 14-25배 정도 낮은 역가를 보였다.
An nlp (Ner like protein) gene from E. coli was previously cloned and sequenced. Here we show that expression of the sugar metabolism related genes, lacZ, malQ and malP, increased 2.5-to 8.3-fold in the presence of a plasmid containing the nlp gene. This suggested that the nlp gene could induce maltose- and lactose-metabolism coordinately with crp*1 in the absence of cAMP. Using the nlp-lacZ fusion gene, it was possible to show the promoter of nlp was active in vivo.
Engralied 5.7kb upstream sequence와 E. colilacZ의 융합 유전자를 가진 P[en-lacZ] 인자를 jumpstart 기법을 이용하여, ryXho25 strain의 초파리 48A 염색체 위치로부터 새로운 위치로 삽입하였다. 총 3315의 유전적 교배를 통해서, P[en-lacZ] 가 다른 염색체 상으로 삽인된 113 계통을 얻었다. X-gal 염색으로 이들 113 계통의 3령기 유충 조직에서의 $\beta$-galactosidase 발현을 조사하였다. 도한 113 계통 중 7계통이 열성치사돌연변이인 것으로 동정되었다. 이들 7 계통 중 초기 배발생 과정에서 치사하는 것으로 조사된 #1119의 초기 배발생 과정에서의 ${\beta}$-galactosidase 발현과 핵의 이동 및 세포화 양상을 조사하였다. 본 연구에서 얻어진 P[en-lacZ] 삽입 돌연변이체들은 앞으로 Drosophila 발생에 관련된 유전자들의 구조와 기능을 연구하는데 활용될 수 있을 것이다.
$\gamma$-Glutamyl transpeptidase (GGT, EC 2.3.2.2.) catalyzes the transfer of the $\gamma$-glutamyl moiety from $\gamma$-glutamyl containing ompounds, notably glutathione (GSH), to acceptor amino acids and peptides. A second gene (GGTII) encoding GGT was previously isolated and characterized from the fission yeast Schizosaccharomyces pombe. In the present work, the GGTII-lacZ fusion gene was constructed and used to study the transcriptional regulation of the S. pombe GGTII gene. The synthesis of $\beta$-galactosidase from the GGTII-lacZ fusion gene was significantly enhanced by NO-generating SNP and hydrogen peroxide in the wild type yeast cells. The GGTII mRNA level was increased in the wild-type S. pombe cells treated with SNP. However, the induction by SNP was abolished in the Pap1-negative S. pombe cells, implying that the induction by SNP of GGTII is mediated by Pap1. Fermentable carbon sources, such as glucose (at low concentrations), lactose and sucrose, as a sole carbon source, enhanced the synthesis of $\beta$-galactosidase from the GGTII-lacZ fusion gene in wild type KP1 cells but not in Pap1-negative cells. Glycerol, a non-fermentable carbon source, was also able to induce the synthesis of $\beta$-galactosidase from the fusion gene, but other non-fermentable carbon sources such as acetate and ethanol were not. Transcriptional induction of the GGTII gene by fermentable carbon sources was also confirmed by increased GGTII mRNA levels in the yeast cells grown with them. Nitrogen starvation was also able to induce the synthesis of $\beta$-galactosidase from the GGTII-lacZ fusion gene in a Pap1-dependent manner. On the basis of the results, it is concluded that the S. pombe GGTII gene is regulated by oxidative and metabolic stress.
Kim, Il-Man;Lee, Yong-Chan;Won, Jae-Seon;Choe, Mu-Hyeon
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제13권6호
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pp.976-983
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2003
Seven Escherichia coli cells defective with aerobic growth were isolated by the insertion of ${\lambda}placMu53$, a hybrid bacteriophage of ${\lambda}$ and Mu, which created a transcriptional fusion to lacZY. These insertion mutant cells were tested on an XG ($5-bromo-4-chloro-3-indolyl-{\beta}-D-galactopyranoside$) medium for anaerobic expression of lacZ by fusion to a promoter. The chromosomal DNA from these strains were digested by EcoRI, and the EcoRI fragments that contained the fused gene and lacZ sequence were identified by Southern hybridization, using lacZ containing plasmid as a probe. The EcoRI fragment from each strain was cloned and sequenced. The sequence data were compared with the GenBank database. The mutated gene of three strains, CYT4, CYT5, and OS11, was found to be identical, and it was nrdAB that encoded ribonucleoside diphosphate reductase. The gene nrdAB was at min 50.5 on the Escherichia coli linkage map and 2,348,084 on the physical map, and is involved in hemAe-related reduction-oxidation reaction. OS6 and OS14 mutant strains had insertion at min 8.3 and the mutated gene was hemB. The hemB encodes 5-aminolevulinate dehydratase or porphobilinogen synthase. The OS3 mutant had insertion in cydB at min 16.6. The cydAB encodes cytochrome d oxidase. In the case of OS1, the fusion was made with sucA, the E1 component of ${\alpha}-ketoglutarate$ dehydrogenase.
xylA 유전자의 프로모터상에서 조절양상을 조사하기 위하여 xylA 유전자의 프로모터(Pxyl)와 lacZ 유전자를 연결한 Pxyl-lacZ 융합 유전자를 제작하여 xylose에 의한 ${\beta}-galactosidase$ 생산의 조절양식을 조사하였다. xylA 프로모터 부위를 분리하여 lac 프로모터가 없는 고복제수의 lac 오페론 백터인 pMC1403에 클로닝시켜 pMCX191을 제작하여 reading frame에 변화가 없는 Pxyl-lacZ 융합 유전자를 만들었으며 이 벡터에서 Pxyl-lacZ 단편을 분리한 후 저복제수 벡터인 pLG339에 클로닝시켜 pLGX191을 제작하였다. 상기 플라스미드들을 xylA 변이주인 DH77에 형질전환시켜 Pxyl-lacZ 융합 유전자에서 ${\beta}-galactosidase$의 발현조절을 조사한 결과 xylose 농도에 따른 유도, glucose에 의한 발현억제 및 cAMP에 의한 억제해제 양상 등이 염색체상의xylA 유전자의 발현조절과 같은 경향을 나타내었다. pMCX191과 pLGX191을 이용하여 유전자 투여 량 효과를 본 결과도 복제수에 따른 차이가 크지 않았다. xylA 프로모터 부위내 조절영역를 추정하기 위해 구조유전자 상류 -209 bp를 포함한 xylA 유전자를 pUC19에 클로닝시킨 pUX30에서 프로모터 부위가 부분결손된 벡터들을 제작하여 결손부위의 염기서열을 확인하였다. 이들 부분결손 xylA 프로모터를 가진 xylA 유전자에서 xylose isomerase의 발현을 조사한 결과, 번역 개시점에서 -166 bp 이상의 영역을 결손시킨 pUX31과 pUX32의 경우pUX30과 비슷한 발현 양상을 보인 반면 -120 bp 이상의 영역을 결손시킨 pUX33과 pUX34에서는 모벡터에 비해 약 30% 수준의 발현을 보였다. 또한 pUX33과 pUX34에서는 xylose 유도시 cAMP에 의한 발현 촉진효과도 볼 수 없었다. -59 bp 이상의 부위가 결손된 pUX35의 경우에는 전혀 xylA 유전자의 발현이 일어나지 않았다. 이러한 결과로 볼때 xylA 프로모터내의 조절부위는 -165 bp에서 -59 bp 사이에 존재하는 것으로 추정되었다.
For the production of $B^{30}-homoserine$ human insulin precursor, four types of fusion peptides LacZ, MBP, GST, and His-tagged sequence were studied in this work. Recombinant E. coli JM 103 and E. coli JM 109 containing fusion peptides were cultivated at $37^{\circ}C$ for 1hr, and gene expression was occurred when 0.5mM of isopropyl-D-thiogalactoside(IPTG) was added to the culture broth, and followed by longer than 4hr fermentation respectively. DEAE-Sphacel and gel filtration chromatography, amylose and glutathione-Sepharose 4B affinity chromatography, and nickel-affinity chromatography system were employed as purification of $B^{30}-homoserine$ human insulin precursor. Recovery yields of His-tagged, LacZ, GST, and MBP fused $B^{30}-homoserine$ human insulin precursor resulted in 47%, 20%, 20%, and 18%, respectively.
We isolated a promoter inducible by paraquat, a superoxide-generating agent, from Escherichia coli using a promoter-probing plasmid pRS415. From sequence analysis we found out the promoter is for fpr ENCODING nadph : ferredoxin oxidoreductase. We constructed on operon fusion of lacZ gene with fpr promoter to monitor the expression of the gene in the single-copy state. LacZ expression generators, menadione and plumbagin, also induced the expression of .betha.-galactosidase in the fusion strain. On the other hand, no significant induction was observed by treatment with hydrogen peroxide, ethanol, and heat shock. Induction of .betha.-galactosidase was significantly reduced by introducing a .DELTA. sox 8 :: cat of soxS3 :: Tn10 mutation into the fusion strain, indicating that fpr gene is a member of the soxRS regulon. The transcriptional start site was determined by primer extension analysis. Possible roles of fpr induction in superoxide stress were discussed.
Escherichia coli RNase P is composed of a large RNA subunit (M1 RNA) and a small protein subunit (C5 protein). Since both subunits are assembled in a 1:1 ratio, expression of M1 RNA and C5 protein should be coordinately regulated for RNase P to be efficiently synthesized in the cell. However, it is not known yet how the coordination occurs. In this study, we investigated how overexpression of C5 protein affects expression of the rnpB gene encoding M1 RNA, using a lysogenic strain, which carries an rnpB-lacZ transcription fusion. Primer extension analysis of rnpB-lacZ fusion transcripts showed that the overexpression of C5 protein increased the amount of the fusion transcripts, suggesting that rnpB expression increases with the increase of intracellular level of C5 protein.
S. typhimurium cadBA operon의 발현에는 산성 pH와 고농도의 lysine 등 적어도 두 가지의 세포외부 신호가 요구된다. pH와 lysine신호에 따른 cadBA 발현 조절 기작을 이해하기 위하여, Tn10삽입, 자발적 돌연변이, EMS돌연변이 등을 수행하여 JF2238과 cadA-lacZ의 발현특성에 차이를 보이는 돌연변이체를 선별하였다. cadBA의 양성적 조절자의 유전자인 cadC내의 돌연변이 중 cadC4 돌연변이는 pH-비의존성, lysine-의존성 발현을, cadC6 돌연변이는 pH-비의존성, lysine-비의존성 cadA-lacZ 발현을 나타내었다. 산성 pH, lysine이 없는 조건에서 cadA-lacZ 발현을 유도하는 cadR::Tn10과 cadR3 돌연변이체를 분리하여 cadR이 lysine이 없는 조건에서 cadBA 발현을 음성적으로 조절하는 음성적 조절자의 유전자임을 알 수 있었다. cadR 돌연변이체는 lysine의 독성 유사체인 thiosine에 대해 내성($Ts^{r}$)을 나타냈으며, E. coli의 lysP 클론을 갖고 있는 pLYSP에 의해 돌연변이 형질이 보상되었다. 또한 lysine decarboxylase (CadA)의 반응산물인 cadaverine은 cadC+ 균주에서 cadA-lacZ 발현에 억제효과를 나타냈으나, cadC 돌연변이에는 억제효과가 나타나지 않았다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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