• 제목/요약/키워드: KNP

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돼지 Melanocortin 4 Receptor (MC4R) 유전자의 육질연관성 분석 (Characterization and Evaluation of Melanocortin 4 Receptor (MC4R) Gene Effect on Pork Quality Traits in Pigs)

  • 노정건;김상욱;최정석;최양일;김종주;최봉환;김태헌;김관석
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제54권1호
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    • pp.1-8
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    • 2012
  • 본 연구는 한국재래돼지의 MC4R 유전자 내의 단일염기변이들을 규명하고 그 유전자형 효과가 유전자표지인자를 이용한 선발(Marker assisted selection, MAS)에 활용 가능한지를 검증하기 위해서 수행되었다. 한국재래돼지의 MC4R 유전자 총 염기서열을 분석하기 위해 6개의 Primer들을 이용하여 증폭산물을 생성하였으며, 염기서열분석을 통해 총 6개(c.-780C>G, c-135C>T, c.175C>T-Leu59Leu, c.707A>G-Arg236His, c.892A>G-Asp298Asn, c.*430A>T)의 단일염기변이를 발견하였다. 한국재래돼지 MC4R 유전자내의 총 6개의 단일염기변이들간의 연관불균형과 반수체 분석을 통해 단일염기변이들간의 연관성을 분석하였으며, c.-780C>G, c-135C>T, c.175C>T-Leu59Leu, c.707A>G-Arg236His와 c.*430A>T는 완전한 연관불균형을 이루고 있었고, c.892A>G(Asp298Asn) 단일염기변이만 $r^2$-value가 0.028, D'-value가 0.348로 연관불균형 정도가 매우 낮았다. c.707A>G (Arg236His)와 c.892A>G (Asp298Asn) 단일염기변이들을 선발하여 PCR-RFLP 유전자형 분석방법을 이용해 돼지 5품종간의 유전자형 빈도를 추정한 결과, c.707A>G (Arg236His) 단일염기변이는 요크셔 품종 집단에서 오직 A (His) 대립유전자를 관찰할 수 있었으며, 나머지 한국재래돼지, 랜드레이스, 버크셔와 듀록 품종에서는 G 대립유전자의 고정으로 나타났다. c.707A>G 단일염기변이와 육질형질을 484두에서 연관성 분석을 실시한 결과, 조지방, 등심 내의 수분, 육색, 적색도 그리고 황색도 등에서 유의적인 연관성을 관찰할 수 있었다. c.892A>G (Asp298Asn) 단일염기변이의 유전자형 빈도는 품종별로 차이가 났으며, A (Asn) 대립유전자의 빈도가 가장 높은 품종은 듀록으로 나타났고, G (Asp) 대립유전자의 빈도가 가장 높은 품종은 한국재래돼지로 조사되었다. c.892A>G (Asp 298Asn) 단일염기변이와 돼지 4 집단의 육질형질을 1,126두에서 분석한 결과, 등지방두께에 고도의 유의적인 효과를 관찰할 수 있었다(P<0.002). AA 유전자형을 가진 개체가 AG나 GG 유전자형을 가진 개체보다 등지방두께가 두꺼운 것을 확인할 수 있었다. 본 연구의 결과를 통해 MC4R 유전자 내의 c.892A>G (Asp298Asn) 단일염기변이는 돼지의 선발개량에 유전자표지인자로서 충분한 효과가 있음을 검증하였다.

Human Impact on Diversity and Abundance of Baboon (Papio kindae)-edible Fleshy-fruited Trees in Miombo Forests of the Kundelungu National Park, D.R. Congo

  • Kazaba, Paul Kaseya;Numbi, Desire Mujike;Muledi, Jonathan Ilunga;Shutcha, Mylor Ngoy;Tshikung, Didier Kambol;Sowunmi, Akindayo Abiodun;Aweto, Albert Orodena
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제36권3호
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    • pp.175-186
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    • 2020
  • This study approaches, from a floristic perspective, the under-researched human-primate competition for forest resources. Investigating the human impact on fruit trees edible for Kinda baboons (Papio kindae Lönnberg), we have collated dietary data on a free-ranging troop and floristic information on two forest sites of the Kundelungu National Park (KNP), Democratic Republic of Congo: the relatively intact Integral Zone (IZ) and the human-disturbed Annex Zone (AZ). Trees with DBH≥10 cm have been identified, counted and measured throughout 22 sample plots (11 per site), each measuring 1,000 ㎡. A total of seven woody species whose fruits are eaten by Kinda baboons were recorded. Four of them, namely the Sycamore fig Ficus sycomorus L., the Mobola plum Parinari curatellifolia Planch. ex Benth, the Kudu berry Pseudolachnostylis maprouneifolia Pax and the Monkey orange Strychnos innocua Delile were found in both sites, while the Large-leaved jackal-berry Diosyros kirkii Hiern and the Buffalo thorn Ziziphus mucronata Willd. were exclusively in the IZ, and Strychnos cocculoides Baker only in the AZ. Compared to the IZ, the AZ had lower values of stem density, species richness and diversity indices, suggesting a negative human impact on baboon-edible trees, in line with our hypothesis. Moreover, as was expected, human activities decreased the abundance of larger baboon-edible fruit trees. However, the size-class distribution of P. curatellifolia depicted a reverse J-curve in the AZ. The abundant younger P. curatellifolia trees remaining in that human-disturbed site constitute an important food stock for baboons, if well preserved. These results also illustrate the critical role of rangers' patrols, formerly more frequent (and presumably efficient) in the IZ than in the AZ of the Park. Their implications on baboons and miombo forests are discussed from both the research and conservation perspectives.

돼지 PGK 2 유전자의 단일염기다형성 및 성장 형질과의 연관성 구명 (Association of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) in the PGK 2 Gene with Growth Traits in Pigs)

  • 장홍철;김상욱;임다정;김재영;조규호;김명직;이지웅;최봉환;김태헌
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제53권1호
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    • pp.15-22
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    • 2011
  • 자돈의 생시 체중은 자돈의 이유 체중 및 생존율에도 크게 영향을 미친다. 또한 출하 시까지 돼지의 성장률 뿐만아니라 출하 일령 단축 및 출하 체중과도 밀접한 연관성이 있는 것으로 알려져 있다. 본 연구는 돼지 7번 염색체의 PGK 2 (phosphoglycerate kinase 2) 유전자의 promoter 영역 및 transcription 영역에 해당하는 DNA 염기서열을 유전체 구조분석을 통해 20개의 SNP (Single Nucleotide Polymorpism)를 발굴하였고, 발굴된 SNP 중 PGK 2 유전자의 전사 조절 영역 내 g.122 T>G 다형을 재래돼지와 Landrace를 이용한 $F_2$ 집단 268두 자돈의 성장 형질과의 연관성 분석을 실시한 결과, 생시 체중(p<0.01) 및 3주령 체중(p<0.001)에서 통계적으로 고도의 유의적 연관성이 있음을 확인 할 수 있었다. 따라서 본 연구를 통하여 확인된 PGK 2 유전자의 promoter 영역 내 성장 형질 관련 SNP는 건강한 자돈 및 종돈을 조기 선발하기 위한 유전자 marker로 활용 가능성을 제시하였다.