연속식 2단계 막(MWCO 10,000, MWCO 5,000)반응기를 이용하여 어피젤라틴 가수분해물을 제조하여 그 가수분해물의 분자량, 아미노산조성 및 기능성에 대하여 검토하였다. 1단계 젤라틴 가수분해물의 분자량은 $8{\sim}10\;KDa$ 및 $4.5{\sim}6.5\;KDa$이 주종을 이루었으며, 2단계 가수분해물의 분자량은 $2{\sim}6\;KDa$ 및 2 KDa 이하의 저분자 펩타이드도 존재하였다. 어피젤라틴의 아미노산조성과 1단계 및 2단계 어피젤라틴 가수분해물의 아미노산조성 사이에는 거의 차이가 없었고, 감칠맛과 단맛에 관련이 있는 아미노산 함량이 전체의 $68{\sim}72%$에 달한 반면, 쓴맛을 내는 아미노산 함량은 $23{\sim}25%$에 불과하였으며, 1단계 가수분해물에 비해 2단계 가수분해물이 단맛과 감칠맛이 더 좋았다. 1단계 및 2단계 가수분해물의 용해도는 모든 pH영역에서 완전히 용해하였으나, 유화성 및 포말성은 거의 나타나지 않았다. 완충능은 2단계 가수분해물이 가장 높았으나, 점도는 모든 pH영역에서 거의 차이가 없었으며, 어피젤라틴 보다는 가수분해물의 점도가 더 낮았다. 그리고 2단계 가수분해물은 등온흡습도가 가장 높아 수분활성 저하제로서 이용할 수 있을 것으로 판단되었다.
양식산 새우(P.orientalis)로부터 0.05M 인산염 완충용액(pH 7.0)으로 carotenoprotein을 추출하고 DEAE-셀룰로오스, 반포화 황산암모늄 친전 및 GPC로 $\alpha$-form과 ${\beta}$-form 두 종류의 carotenoprotein을 분리 정제하였다. 최대 흡수파장은 ${\lambda}_{max}$= 480, 409, 318 및 280 nm였다. SEM과 XRD로 분자구조를 관찰하였으며, GPC와 PAGE로 측정한 분자량은 $\alpha$-form이 170KDa으로 분리되는 불균일한 이합체 구조였다. carotenoprotein 복합체의 아미노산, 중성지질, 인지질 및 유리지방산 조성을 분석하였고, 여러 가지 유기화학 반응과 UV/Vis,IR, $^1H$-NMR, MS 등으로 carotenoids분자구조를 측정한 결과 lipid-protein의 보호그룹으로서는 astaxanthin과 그 ester임이 확인되었다.
우리나라에서 대량 생산되고 있는 진주담치 근육에서 Triton X-100를 사용하여 carotenoprotein을 추출, 정제하여 그 특성을 실험한 결과를 요약하면 다음과 같다. Carotenoprotein(${\lambda}_{max}=462nm$)를 $20\%$(w/v) $(NH_4)_2SO_4$, DEAE-cellulose 이온교환수지 그리고 Sephacryl S-300 겔 크로마토그래피를 통해 정제한 결과, 정제도는 5배 증가하였고 수율은 $1.85\%$였으며, carotenoprotein의 분자량은 약 372KDa(gel filtration)이었고, SDS-PAG 전기영동으로 단백질의 subunit를 확인한 결과, 60KDa($23.70\%$), 46.9KDa($9.14\%$), 26KDa($49.14\%$) 및 13KDa($18.02\%$)로 이루어져 있었다. Carotenoprotein의 안정성은 pH 4.0 이하의 강산 및 pH 10.0 이상의 강알칼리에서는 단백질이 불안정하였고, SDS 변성제를 $0.2\%$(w/v)되게 첨가하여 녹인 후 가시부 영역($400{\sim}600nm$)에서 최대파장 변화를 보면 462nm에서 456nm로 약 6nm 단파장 영역으로 이동한 것을 알 수 있었다. Carotenoprotein의 구성아미노산 조성은 threonine이 $35.90\%$로 다른 아미노산에 비해 함량이 높았으며, 필수아미노산과 소수성 아미노산의 함량은 전체아미노산 함량의 각각 $62.76\%$와 $25.02\%$를 차지하였고, methionine, histidine 및 proline은 존재하지 않았다. Carotenoprotein 1g당 총지질의 함량은 256mg였고, 그 구성지방산의 조성은 polyene산이 $62.4\%$로 가장 많았고 다음으로 포화산($19.58\%$)및 monoene산($18\%$) 순이었다. 특히, 16:4n-3의 조성비가 $33.90\%$로 상당히 높게 나타났고, EPA, DHA 등 w3 계의 장쇄(長鎖)고도불포화지방산의 조성비가 $22.13\%$로 높게 나타났으며, 양적으로 많은 지방산은 포화산 중에는 palmitic acid($C_{16:0}$), monoene산 중에서는 palmitoleic acid($C_{16:1}$), polyene산 중에서는 hexadecatetraenoic acid($C_{16:4}$), eicosapentaenoic acid ($C_{20:5}$), docosahexaenoic acid($C_{22:6}$) 등이 함량이 많았다. Carotenoprotein으로부터 분리한 총 caroteoid 함량은 $8.80mg\%$였고, 주 carotenoid는 mytiloxanthin($74.79\%$), 3,4,3'-trihydroxy-7',8'-didehydro-${\beta}$-carotene($18.26\%$)였다.
Anti-CALLA Fab-RTA immunotoxins were constructed using two crosslinking agent, SMPT and SMCC, to generate a disulfide and a thioether bridge between Fab fragment of K269-65 MoAb and RTA toxin moieties, respectively. These immunotoxins were selectively immunoreative with CALLA$\^$+/ B-lineage Daudi cells. SMPT and SMCC mediated RTA immunotoxins were prepared with 49% and 53% of the RTA conjugation yields, respectively. SDS-PAGE analysis show that immunotoxins were constructed with major Fab-1 RTA (76kda), minor Fab-2RTA (106kda) and Fab-3RTA (136kda) compositions. The breakdown rates of immunotoxins were determined in the presence of glutathione by measuring the amount of reduced immunotoxins using size-exclusion HPLC. The SMCC immunotoxins were more resistant to the glutathione than SMPT immunotoxins. But, our data showed that the SMPT mediated disulfide bonded immunotoxins were much more active than the SMCC mediated thioether bonded immunotoxins to kill the target cells in vitro.
Pulmonary surfactant is a lipoprotein complex composed primarily of phospholipid and lungspecific apoproteins that reduces surface tension in the alveolus and maintains alveolar stability at low lung volume. Three families of lung-specific apoproteins have been described: SP-A, a glycoprotein with a reduced molecular weight of 28~36 KDa. SP-B a hydrophobic protein with a nonreduced molecular weight of 18 KDa, and SP-C a hydrophobic protein with a non-reduced molecular weight of 5~8 KDa. Surfactant proteins have important roles in regulating surfactant metabolism as well as in determining its physical properties. The synthesis of the active surfactant peptides appears to be modulated by system with considerable complexity, including numerous levels of regulation such as cell-specific, hormonal and developmental controls. Endotoxin appears to alter surfactant protein mRNAs differentially. It is hoped that the elucidation of the factors controlling the synthesis and metabolism of the surfactant proteins will aid in understanding the pathogenesis of hyaline membrane disease and offer new avenues for the therapy and diagnosis of ther pulmonary disorders as well.
KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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제7권3호
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pp.459-470
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2013
The discovery of nearest neighbors, without training in advance, has many applications, such as the formation of mosaic images, image matching, image retrieval and image stitching. When the quantity of data is huge and the number of dimensions is high, the efficient identification of a nearest neighbor (NN) is very important. This study proposes a variation of the KD-tree - the arbitrary KD-tree (KDA) - which is constructed without the need to evaluate variances. Multiple KDAs can be constructed efficiently and possess independent tree structures, when the amount of data is large. Upon testing, using extended synthetic databases and real-world SIFT data, this study concludes that the KDA method increases computational efficiency and produces satisfactory accuracy, when solving NN problems.
Farnesyl Protein transferase(FPT)는 발암유전자 ras의 단백질 산물인 p$^{21}$의 post-translational modification의 첫 단계인 ras-farnesylation에 관여하는 효소로 본 연구에서는 정제된 FPT와 E. coli에서의 발현 system을 이용하여 FPT의 구조와 기능을 밝히고 이를 FPT 방해제의 설계에 이용하고자 한다. Bovine testis에 존재하는 FPT를 30%-50%의 Ammonium sulfate로 fractionation하고, DEAE-Sephacel, Sephacryl S-300 column을 통과시킨 후 peptide(KKCVIM) affinity column을 이용하여 순수 정제하였다. 정제된 효소의 분자량은 gel-filtration에 의해 100KDa으로 추정되었고 SDS-PAGE 결과 49KDa과 46KDa의 두 subunit로 구성되었음이 확인되었다. 효소활성에는 $Mg^{2+}$ 와 $Zn^{2+}$가 필수적이며 최적 pH는 7.0이었다. Yeast의 FPT의 두 subunit 유전자는 Yeast genomic DNA를 template로 사용하고 각 subunit에 specific한 합성된 primer들과 vent polymerase를 이용하여 Polymerase chain reaction을 통하여 얻었다. 두 유전자를 pBluescriptII SK+ vector를 변형시킨 두 vector, pBSK+4와 pBChl+4에 재조합 시킨 후 E.coli에 transformation시켜 발현시켰다. 현재 정제된 Bovine FPT와 E. coli에서 발현된 Yeast FPT의 chemical modification과 site-directed mutagenesis를 통하여 FPT의 active site와 substrate binding site에 관한 연구를 진행시키고 있다.
Korean dental association (KDA) intensively drives no smoking activities for a healthy life of Korean people. In this article, hazardous facts of smoking in oral system are reviewed from the point of view of dental science. Various activities against smoking including campaigns, conferences, polls, exhibitions and publications driven by KDA are introduced.
대한약학회 2003년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.2-2
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pp.161.1-161.1
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2003
Two chitosanses produced by Aspergillus fumigatus KB-1 were purified by ion exchange and size exclusion chromatographies. Molecular weights of chitosanses were 111.23 KDa (chitosanase I) and 23.38 KDa (chitosanase II). The N-terminal amino acid sequence of chitosanase II was determined: YNLPNNLKQIYDKHKGKXSXVLAK(\ulcorner)GFTN. The optimum pH of the chitosanase I and II were 6.5 and 5.5 respectively. The optimum temperatures were $60^\times$C and $70^\times$. Two chitosanases were most stable at $10^\times$C. (omitted)
Agrocybe cylindracea의 배양방법별 균사체 및 다당류 생산수율비교 실험에서는 모두 진탕배양이 효과적이었다. 다당류의 정제는 조단백다당류를 이용하여 DEAE-cellulose column에 의한 1차 정제를 행하였고, 최종으로 Sepharose 2B를 이용한 2차 정제를 실시하여 최종적으로 균사체내다당류(ACIPDG, ACIPAG)와 균사체외다당류(ACEPDG, ACEPAG)를 얻었다. ACEPDG는 총당 75.8%, ACEPAG는 총당 65.4%를 함유하였으며, ACIPDG는 총당 89.2%, ACIPAG는 총당 54.2%의 조성을 보였다. 다당류 분획물들의 분자량을 측정한 결과, 모두 10만이 넘는 거대분자로 ACEPDG 300KDa에서 ACIPAG 600KDa까지 나타났다. 다당류의 조성을 HPLC로 분석한 결과, ACEPDG분획물은 glucose, inositol이 검출되었으며 ACIPDG, ACEPAG, ACIPAG 분획물은 glucose, fructose, inositol이 검출되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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