• 제목/요약/키워드: Isozyme analysis

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The allopolyploid origin of Euphorbia stevenii and E. boöphthona (Euphorbiaceae)

  • Ki-Ryong PARK
    • 식물분류학회지
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    • 제52권4호
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    • pp.219-225
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    • 2022
  • To elucidate the ancestry of the allopolyploids E. stevenii and E. boöphthona, I examined eleven isozyme loci and 24 morphological characters from 28 populations representing five related Euphorbia species from Australia. According to an analysis of genetic and morphological data, three diploid species differentiated recently, but two independent polyploid species are estimated to have differentiated a relatively long time ago. Fixed heterozygosity for most isozymes in E. stevenii and E. boöphthona strongly suggests that these two species are allopolyploids rather than autopolyploids. The isozyme profiles of E. stevenii indicate that it is an allopolyploid that evolved from interspecific hybridization between the diploid E. tannensis and unidentified or extinct tetraploid species. In addition, isozyme patterns strongly suggest that E. stevenii was one of the ancestors of E. boöphthona. However, E. boöphthona showed a large number of fixed alleles that were not detected in any other Australian Eremophyton species. The most likely hypothesis for the origin of E. boöphthona is that it was formed by hybridization and chromosomal doubling between an extinct diploid species and the hexaploid E. stevenii.

표고버섯 영양요구성 변이주의 전기영동법에 의한 Isozyme 비교 (Electrophoretic Patterns of Isozymes from the Mycelia of the Auxotrophs of Lentinula edodes)

  • 김채균;김병각
    • 한국균학회지
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    • 제25권2호통권81호
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    • pp.85-90
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    • 1997
  • 표고버섯(Lentinula edodes)의 동위효소 양상을 표고 연구의 기초 연구의 일환으로 실시하였다. 균사체의 Tris-HCl 완충액에 용해되는 세포내 효소를 nondenaturing polyacrylamide gel 전기영동 법으로 분리후, peroxidase, esterase, superoxide dismutase, acid phosphatase, alkaline phosphatase, alcohol dehydrogenase, ${\alpha}-amylase$ 효소 활성을 측정하였다. 표고는 peroxidase, esterase, superoxide dismutase, acid phosphatase 활성이 검출되었으며, 본 연구에서 사용한 방법으로 alkaline phosphatase, alcohol dehydrogenase, ${\alpha}-amylase$ 효소 활성은 검출되지 않았다. 표고버섯의 peroxidase, esterase band는 배양 기간에 따라 큰 차이가 없이 안정하였으며, 동위효소는 표고의 유전적 연구 및 원형질체 융합 후 융합체의 특성 연구에 중요하다.

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The genetic structure of taro: a comparison of RAPD and isozyme markers

  • Sharma, Kamal;Mishra, Ajay Kumar;Misra, Raj Shekhar
    • Plant Biotechnology Reports
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    • 제2권3호
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    • pp.191-198
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    • 2008
  • Germplasm characterization and evolutionary process in viable populations are important links between the conservation and utilization of plant genetic resources. Here, an investigation is made, based on molecular and biochemical techniques for assessing and exploiting the genetic variability in germplasm characterization of taro, which would be useful in plant breeding and ex situ conservation of taro plant genetic resources. Geographical differentiation and phylogenetic relationships of Indian taro, Colocasia esculenta (L.) Schott, were analyzed by random amplified polymorphic DNA (RAPD) and isozyme of seven enzyme systems with specific reference to the Muktakeshi accession, which has been to be proved resistant to taro leaf blight caused by P. colocasiae. The significant differentiations in Indian taro cultivars were clearly demonstrated by RAPD and isozyme analysis. RAPD markers showed higher values for genetic differentiation among taro cultivars and lower coefficient of variation than those obtained from isozymes. Genetic differentiation was evident in the taro accessions collected from different regions of India. It appears that when taro cultivation was introduced to a new area, only a small fraction of genetic variability in heterogeneous taro populations was transferred, possibly causing random differentiation among locally adapted taro populations. The selected primers will be useful for future genetic analysis and provide taro breeders with a genetic basis for selection of parents for crop improvement. Polymorphic markers identified in the DNA fingerprinting study will be useful for screening a segregating population, which is being generated in our laboratory aimed at developing a taro genetic linkage map.

Preliminary Studies on the Role of ${\alpha}-Esterase$ Isozymes in Quantitative Traits of Two Multivoltine Silkworm (Bombyx mori L.) Races and their $F_1$ Hybrid

  • Kumaresan P.;Somasundaram P.;Kumar K. Ashok;Urs S. Raje
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제13권2호
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    • pp.113-117
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    • 2006
  • Heterosis was studied involving two multivoltine silkworm breeds viz, APM1 and SLKSPM through rearing and isozyme analysis. A positive significant heterotic effect was observed in fecundity, hatching % and survivability. The heterobeltiosis was observed only in fecundity and hatching %. Isozyme analysis of ${\alpha}-esterase$ showed variation in loci and allelic expression. The allele with heterozygosity $(Est-2^{12})$ was observed at the Est-2 locus in $F_1$ progeny. Est-3 was observed in $F_1$ progeny, whereas it was completely absent in both parental lines. The present study suggests that the markers ($Est-2^{12}$ and Est-3) targeted for introgression may be useful for the improvement of fecundity and survivability as the phenomenon of heterosis was observed only in $F_1$ progeny.

급격한 환경변화에 대한 angelfish (Pterophyllum scalare) 젖산탈수소효소 동위효소의 변화 (Variation of Lactate Dehydrogenase Isozymes in Angelfish (Pterophyllum scalare) according to Acute Environmental Change)

  • 안창수;조성규;염정주
    • 생명과학회지
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    • 제20권3호
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    • pp.416-423
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    • 2010
  • 열대 저산소 환경에 적응되어 있는 angelfish (Pterophyllum scalare)를 급격한 온도변화($27{\pm}0.5{\rightarrow}18{\pm}0.5^{\circ}C$) 및 DO 변화($6{\pm}1{\rightarrow}18\;ppm$)에 2시간 동안 적응시킨 후 젖산탈수소효소(EC 1.1.1.27, lactate dehydrogenase, LDH) 동위효소의 특성 및 유전자발현을 연구하였다. LDH 동위효소의 특성은 native-polyacrylamide gel 전기영동, Western blot 분석 및 효소활성 측정으로 확인하였다. 전기영동 결과 liver- 및 eye-specific Ldh-C 유전자는 간, 눈 및 뇌 조직에서 발현되었다. Western blot 분석 결과 LDH $A_4$ 동위효소는 $B_4$ 동위효소보다 음극 쪽에 나타났다. 간 조직에서 온도 저하 시 LDH $A_4$ 동위효소가 증가하고 $B_4$ 동위효소는 감소하였으며, DO 증가 시 LDH $A_4$$C_4$ 동위효소가 증가하고 $B_4$ 동위효소는 감소하였다. 눈 조직에서는 온도 저하 시 LDH $A_4$$B_4$ 동위효소가 증가하고 $C_4$ 동위효소는 감소하였으며, DO 증가 시 LDH $A_4$$B_4$ 동위효소는 증가하지만 $C_4$ 동위효소 및 하부단위체 C를 포함하는 동위효소는 감소하였다. 심장 조직에서는 DO 증가 시 LDH 활성이 증가하였고, LDH $B_4$ 동위효소가 증가하였다. 뇌 조직에서는 온도 저하 시 LDH $A_4$$B_4$ 동위효소가 증가하였고, DO 증가 시 LDH $B_4$ 동위효소는 증가하였다. 따라서 liver- 및 eye-specific Ldh-C는 DO 변화에 의해 영향을 받으며 간 및 눈 조직에서 LDH $B_4$$C_4$ 동위효소는 서로 상대적으로 조절되므로 $C_4$ 동위효소는 lactate oxidase로서 기능을 나타내는 것으로 사료된다.

동위효소 분석에 의한 느타리속의 종간 유연관계 (Interspecific Relationships within the Fungal Genus Pleurotus by Isozyme Analysis)

  • 이희경;유영복;차동열;민경희
    • 한국균학회지
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    • 제26권2호통권85호
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    • pp.163-172
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    • 1998
  • 국내외에서 수집된 Pleurotus속 13종 32균주와 종(species)이 밝혀지지 않은 4균주 등 모두 36균주의 동위효소 분석에 의한 종간 유연관계를 파악하기 위하여 본 실험을 수행하였다. Pleurotus속 균주들의 균사체에서 수용성 단백질을 추출하여 등전점 전기영동 isozyme polymorphic banding pattern법으로 여섯 종류의 동위효소 즉 esterase, glucosephosphate isomerase, leucine aminopeptidase, malate dehdrogenase, peroxidase, phosphoglucomutase를 분석하여 총 166개 밴드를 확인하였고 36개 느타리 균주의 종간 다형성을 관찰하였다. Esterase가 종간에 가장 다양한 밴드 pattern을 나타내어 종의 구별에 아주 유용한 동위효소라 생각되며, 다른 동위효소에서도 종간 다형성을 관찰할 수 있었다. 동위효소 분석 결과 유연관계가 가장 가까운 종은 P. florida와 P. sajor-caju로 유사도가 약 89%였으며, 연구에 이용된 총 13종간의 유사도는 약 77%였다. 분류상 논란이 많이 되는 P. ostreatus는 P. pulmonarius 종과 확실히 구별되었으며 P. florida도 독립된 종으로 판명되었다. 그러나 P. sapidus와 P. spodoleucus 균주들은 확실한 종의 판명이 어려웠다. Isozyme polymorphic banding pattern 결과와 현미경적인 형태 분류에 의한 종 판명 결과가 몇 종을 제의하고는 일치하였다. 동위효소를 이용한 분류는 매우 유용하다고 판단되었다.

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소나무의 몇가지 다형적(多形的) 동위효소(同位酵素)의 유전분석(遺傳分析)(II) - Acid phosphatase, alcohol dehydrogenase와 catalase 동위효소(同位酵素)의 유전양식(遺傳樣式) - (Genetic Analysis of Some Polymorphic Isozymes in Pinus densiflora(II) - Inheritance of acid phosphatase, alcohol dehydrogenase and catalase isozymes -)

  • 김진수;홍용표
    • 한국산림과학회지
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    • 제68권1호
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    • pp.32-36
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    • 1985
  • 소나무의 acid phosphatase (ACP), alcohol dehydrogenase (ADH)와 catalase (CAT) 동위효소(同位酵素) 유전양식(遺傳樣式)을 구명(究明)하기 위하여 배유조직(胚乳組織)을 수평식 감자전분 전기영동법에 의하여 분석(分析)하였다. ACT 동위효소(同位酵素)는 최소한 3~4개의 지역(地域)으로 분리(分離)되었으나 분리가 잘된 ACP-A 지역(地域)의 동위효소(同位酵素)만이 분석(分析)되었다. ACP-A 지역(地域)에서 관찰된 5개(A1-A5)의 동위효소(同位酵素) 표현형(表現型)들은 공히 Mendel의 분리비(分離比)를 보여 이들이 각각 ACP-A 유전자좌(遺傳子座)에 존재(存在)하는 5개의 대립유전자(對立遺傳子)에 의해 지배받고 있음을 알 수 있었다. 2개의 ADH 지역(地域)이 (ADH-A와 ADH-B) 분리(分離)되었으나, 양극(陽極)으로의 이동(移動)속도가 빠른 ADH-A 지역(地域)에서는 분석(分析)에 사용된 재료(材料)에서 변이(變異)가 발견(發見)되지 않았다. ADH-B 지역(地域)에서는 3개의 동위효소(同位酵素) 표현형(表現型) (B1-B3)들이 관찰되었고 이들이 공히 1:1의 분리비를 보여 ADH-B 유전자좌(遺傳子座)에 존재하는 3개의 대립유전자(對立遺傳子)에 의해 지배됨이 추정되었다. 수개의 band로 구성된 5개의 동위효소(同位酵素) 표현형(表現型)이 CAT에서 관찰되었으며, 이형접합성(異型接合性)인 모수(母樹)에서 이들 표현형간(表現型間)의 분리(分離)가 1:1 분리비(分離比)로부터 편차(偏差)를 보이지 않았으므로, 소나무에 있어서 CAT 동위효소(同位酵素)는 5개의 대립유전자(對立遺傳子)가 존재(存在)하는 하나의 유전자좌(遺傳子座)에 의해 지배되는 것으로 추정하였다.

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동위효소 다형특성에 의한 누에 품종의 유연관계 (Genetic Relationships of Silkworm Stocks in Korea Inferred from Isozyme Analyses)

  • 성수일
    • 한국잠사곤충학회지
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    • 제39권2호
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    • pp.119-133
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    • 1997
  • Isozyme was used to characterize general protein patterns of genetic relationships among 303 silkworm stocks preserved in National Sericultural and Entomology Research Institute, RDA. Six isozymes (esterase, acid phosphatase, alkaline phosphatase, amylase, glucose-6-phosphate dehydrogenase and sucrase) from hemolymph, midgut, and digestive juice were employed to construct dendograms(UPGMA method) using a polycrylamide gel electrophoresis. A cluster analysis revealed four major group, which were divided into several subgroups within each group, contained assemglages of Japanese and Chinese races. Especially, genetic differentiation in the first and second group was greatest rather than within Japanese and Chinese races repectively and was concordant with the hypothesis of phyletic sorting of initial variability in China many years ago. Hypothesized recent introgression between groups was also plausible, but the eviednce suggested bidirectional gene flow between the Chinese and the Japnaese lineages. Interpreting the results in light of evidence from the current study, the genetic diversity and relationship showed in Korean silkworm race, Hansammyun reflected early and independent evolution from the Chinese ancestor, limited addition of new variability and phyletic sorting within Korean peninsula more than 4,000 years.

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Evaluation and Selection of Potential Parents Based on Selection Indices and Isozyme Variability in Silkworm, Bombyx mori, L.

  • Moorthy S.M.;Das S.K.;Rao, P.R.T.;Urs S. Rao,;Sarkar A.
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제14권1호
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    • pp.1-7
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    • 2007
  • In order to find out the appropriate parents for the breeding programme, twelve bivoltine and three multivoltine silkworm breeds were evaluated on the basis of multivariate selection index and isozyme analysis. Of which, four [CSR2, D6 (P), SK3, SK4] bivoltine and two multivoltine (Nistari, Cambodge) breeds were selected and breeding initiated to develop higher survival bivoltine silkworm breed suitable for tropical conditions. Among two isozyme (Esterase and acid phosphatase) analyzed, only esterase exhibited polymorphism among the bivoltine breeds. No polymorphism was observed among multivoltine in respect of esterase as well as acid phosphatase.

느타리 버섯균의 정치배양으로부터 생산되는 중요한 망간퍼옥시데이즈(MnP3)의 N-말단 아미노산 배열 분석 (N-terminal amino acid sequence analysis of major manganese peroxidase (MnP3) produced by static culture of Pleurotus ostreatus)

  • 하효철
    • 한국버섯학회지
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    • 제17권4호
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    • pp.185-190
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    • 2019
  • 리그닌 분해 담자균류로 알려져 있는 느타리버섯균 No.42는 망간퍼옥시데이즈(MnP) 및 락게이즈(Lac)를 생산하였으나 글루코오스-펩톤-이스트-밀기울(GPYW)배지를 이용한 정치배양조건하에서 리그닌퍼옥시데이즈(LiP)활성은 검출되지 않았다. 한편, 동일배지에서 망간퍼옥시데이즈 활성은 11일째 80(3.6) U/flask(ml)의 최대 생산되었다. 망간퍼옥시데이즈 분리정제는 Sepha-ros CL-6B 및 Mono-Q 컬럼순으로 수행하였으며 주요 망간퍼옥시데이즈 isozyme은 단일밴드로 분자량은 36.4KDa이였다. N-말단으로부터 19개의 아미노산 배열은 단백질 자동 분석 장치로 분석한 결과 ATCADGRTTANAACCVLFP를 나타내었다. 느타리버섯균 No.42의 정치배양조건 하에서 세포외로 생산되는 중요한 망간퍼옥시데이즈 isozyme의 N-말단 아미노산 배열은 이전에 보고된 MnP3의 아미노산 배열과 동일하였다.