An aldolase gene has been cloned from Methanococcus jannaschii. The coding region of the gene has been expressed in E. coli using a pET system to a level of 30% of total cellular proteins. The protein was purified to more than 95 % homogeneity by heat treatment and ion exchange chromatography. The protein performed an aldol condensation reaction with glyceraldehyde as substrate and dihydroxyacetone phosphate as a carboxyl donor. The protein was determined to be a type II aldolase which requires the $Zn^{2+}$ ion as a metal cofactor. This enzyme has a broad range of optimum pH (7-9) and temperature ($50-80^{\circ}C$). It shows strong stability against heat, chemical denaturants, as well as a high percentage' of organic solvents. The half-life of this enzyme at $85^{\circ}C$ is more than 24 h and it maintains more than 90% of aldolase activity in the presence of 6 M urea, 50% acetonitrile, or 15% isopropyl alcohol.
The retention mechanism and separation of various aromatic sulfonic and carboxylic acids on reversed-phase liquid chromatographic column were studied in the mobile phase containing dodecyltrimethylammonium bromide (DTAB). The retention mechanism was found to be followed the ion-interaction model where the DTAB occupies a primary layer at the stationary phase while the sample anions and other co-anions in the system compete for forming the secondary layer. The capacity factors of samples were influenced by the several factors such as pH, concentration of various organic solvents, co-anions in the mobile phase and functional groups in sample molecules. Some mixtures of organic samples were attempted to separate under optimum condition.
Determination of Aconitum alkaloids in processed Buza (Cho-0, Salted Buza, Moist-heating Buza, Limed Buza), which had been prepared from the raw tubers of Aconitum chiisanenseb(Ranunculaceae), was established using visible spectrophotometry and high-performance liquid chromatography (HPLC) method especially for Aconitine analysis. Aconitum alkloids were reacted with tetra- thiocy-anatocobalt[II] complex ion to form a stable ion pair. The reaction product was insoluble in water but freely soluble in several organic solvents. 1.2-Dichloroethane was the best extracting solvent among the examined solvents. Spectrophotometry of Aconitum alkaloids at nax. 625 was carried out. The HPLC method for aconitine was carried out using Radial PAK-CN column with gradient solvent system by solvent mixture of acetonitrile and phosphate buffer (pH 3.0) at 4$0^{\circ}C$ and 254 nm. Linear relationship was found between absorbance response and concentration of aconitine in range of 0.45 mM~0.9 mM ($r^2$=0.9949) by spectrophotometry and 0.3 mM~1.2mM($r^2$=0.9983) by HPLC method. These methods have been found to be suitable and reproducible for routine analysis of Aconitum alkaloids and its pharmaceutical preparations.
Although offline enrichment of phosphorylated peptides is widely used, enrichment for phosphopeptides using $TiO_2$ is often performed manually, which is labor-intensive and can lead to irreproducible results. To address the problems associated with offline enrichment and to improve the effectiveness of phosphopeptide detection, we developed an automated online enrichment system for phosphopeptide analysis. A standard protein mixture comprising BSA, fetuin, crystalline, ${\alpha}$-casein and ${\beta}$-casein, and ovalbumin was assessed using our new system. Our multidimensional system has four main parts: a sample pump, a 20-mm $TiO_2$-based column, a weak anion-exchange, and a strong cation-exchange (2:1 WAX:SCX) separation column with LC/MS. Phosphorylated peptides were successfully detected using the $TiO_2$-based online system with little interference from nonphosphorylated peptides. Our results confirmed that our online enrichment system is a simple and efficient method for detecting phosphorylated peptides.
This study was conducted to efficiently separate the Ig from Korean native cattle colostrum and to utilize them as an immunogen for the production of antibodies aginst rabbit. The results obtained were as follows : 1. About 84% of Ig G could be separated from Korean native cattle colostrum by·gel filtration using Superose 12 column on HPLC. The separation profile of Korean native cattle colostral immunoglobulin was similar that of Holstein colostral Ig. 2. Separation of Korean native cattle colostral Ig by anion exchange chromatography using Mono Q column on HPLC was poor resolution chromatographic pattern. 3. Hi-Trap Protein G column showed better results than the Protein A Sepharose CL-4B column in the Ig G binding capacity from Korean native cattle colostral Ig. 4. Protein G Sepharose Fast Flow system resulted in higher Ig g binding capacity as the industrial size scale-up approach. 5. Sufficient titer reaction of antibody to Korean native cattle colostral Ig G was confirmed by ELISA.
This article provides comprehensive guidance on the maintenance, cleaning, regeneration, and storage of silica-based HPLC (High-Performance Liquid Chromatography) columns. The general considerations emphasize the importance of using in-line filters and guard cartridges to protect columns from blockage and irreversible sample adsorption. While these measures help, contamination by strongly adsorbed sample components can still occur over time, leading to an increase in back pressure, loss of efficiency, and other issues. To maximize column lifetime, especially with UHPLC (Ultra-High Performance Liquid Chromatography) columns, it is advisable to use ultra-pure solvents, freshly prepared aqueous mobile phases, and to filter all samples, standards, and mobile phases. Additionally, an in-line filter system and sample clean-up on dirty samples are recommended. However, in cases of irreversible compound adsorption or column voiding, regeneration may not be possible. The document also provides specific recommendations for column cleaning procedures, including the flushing procedures for various types of columns such as reversed phase, unbonded silica, bonded normal phase, anion exchange, cation exchange, and size exclusion columns for proteins. The flushing procedures involve using specific solvents in a series to clean and regenerate the columns. It is emphasized that the flow rate during flushing should not exceed the specified limit for the particular column, and the last solvent used should be compatible with the mobile phase. Furthermore, the article outlines the storage conditions for silica based HPLC columns, highlighting the impact of storage conditions on the column's lifetime. It is recommended to flush all buffers, salts, and ion-pairing reagents from the column before storage. The storage solvent should ideally match the one used in the initial column test chromatogram provided by the manufacturer, and column end plugs should be fitted to prevent solvent evaporation and drying out of the packing bed.
In this study, I attempted to develope the expression and purification system of human mammaglobin proteins in Escherichia coli and to produce anti-human mammaglobin rabbit antibody for the detection of human mammaglobin protein in the peripheral blood of breast cancer patients. Human mammaglobin gene was cloned and sequenced from m-RNAs purified from donated breast cancer tissues using RT-PCR. The cloned gene was inserted into pET30, pET22, and pET32 plasmid. The cloned gene in pET30 yields insoluble proteins which was difficult to purify from the cells extracts. The mammaglobin gene in pET32 was strongly expressed soluble proteins which were isolated using Ni-NTA affinity chromagraphy and DEAE-ion exchange chromatography, followed by enterokinase digestion of the purified proteins. The isolated proteins had enough purity to use as a antigen for the production of anti-mammaglobin antibody in rabbits. The polyclonal antibody produced against the isolated mammaglobin showed a specificity to mammaglobin after Westernblot immuno assay. In conclusion, the isolated mammaglobin protein and the anti-mammaglobin rabbit antibody may be used for diagnosis of breast cancer as well as development of anti-breast cancer drug.
In this study, experiment was done to verify the relationship between sprayed water's pH and gas removal efficiency of the Air Washer system. The experiment was done with sprayed water's pH in between pH 4.7 to 7.7, and Ion Chromatography analysis was used to identify the system's gas removal efficiency. As a result, $NH_3$ is removal efficiency decreased under 50% above pH 7, and $SO_X$ and $NO_X$ removal efficiency decreased under pH 6. Through this research, the optimum pH operating condition of the Air Washer System was conformed to be in range between pH6 to pH6.5.
An endonuclease from Xanthomonas oryzae pathovar oryzae KACC 10331, XorII, was recombinantly produced in Escherichia coli using a T7 system. XorII was purified using a combination of ion exchange and immobilized metal affinity chromatography (IMAC). An optimized washing protocol was carried out on an IMAC in order to obtain a high purity product. The final amount of purified XorII was approximately 2.5 mg/L of LB medium. The purified recombinant XorII was functional and showed the same cleavage pattern as PvuI. The enzyme activity tested the highest at $25^{\circ}C$ in 50 mM NaCl, 10 mM Tris-HCl, 10 mM $MgCl_{2}$, and 1 mM dithiothreitol at a pH of 7.9.
To investigate host defense mechanisms for protecting the mammary gland from mastitis infection, the membrane fraction of mammary tissues from Holstein cows was purified by differential velocity centrifugation, and then the sodium dodecyl sulfate-polyacrylamid gel electrophoresis (SDS-PAGE) separated proteins were identified by ion trap mass spectrometer equipped with a Surveyor high performance liquid chromatography (HPLC) system. A total of 183 proteins were identified. Bioinformatics software was applied to analyse physicochemical characteristics of the identified proteins and to predict biochemical function. These data may provide valuable information to investigate the mechanisms of mammary gland milk secretion and infectious disease, and enable a clear identification of proteins and potential protein targets for therapies.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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