• 제목/요약/키워드: ITS and lsu rDNA

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Puccinia klugkistiana, a Rust Fungus Occurring on Cleistogenes hackelii in Korea

  • Lee, Jae-Sung;Choi, Young-Joon;Choi, In-Young;Lee, Chong-Kyu;Shin, Hyeon-Dong
    • 한국균학회지
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    • 제49권2호
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    • pp.253-257
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    • 2021
  • Rust samples at both uredinial and telial stages were collected from Cleistogenes hackelii (Poaceae) in 2017 and 2019 in Korea. Based on the morphological examination and molecular phylogenetic analyses of the internal transcribed spacer (ITS) and large subunit (LSU) rDNA, it was identified as Puccinia klugkistiana. This rust at aecial stage has previously been recorded on Ligustrum japonicum (Oleaceae) in Korea. Puccinia diplachnicola has been previously recorded on C. hackelii in Korea; however, it is believed to be unrelated to the rust collected in the present study. Conclusively, this is the first study to report P. klugkistiana occurrence on C. hackelii in Korea.

Erysiphe cornicola, a Powdery Mildew Occurring on Cornus controversa in Korea

  • In-Young Choi;Lamiya Abasova;Joon-Ho Choi;Ji-Hyun Park;Hyeon-Dong Shin
    • 한국균학회지
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    • 제51권1호
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    • pp.57-62
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    • 2023
  • In Korea, Cornus controversa and C. florida are known as hosts of Erysiphe pulchra from section Microspharea of the genus Erysiphe. However, recent molecular-phylogenetic analyses on the internal transcribed spacer regions and large subunit gene of the rDNA revealed that the Erysiphe powdery mildew on C. controversa in Japan is in fact E. cornicola. To assess the taxonomic status of Erysiphe-C. controversa association in Korea, isolates collected since 1987 were investigated and consequently identified as E. cornicola based on molecular-phylogenetic analyses and new morphological traits. To our knowledge, this is the first study to confirm the presence of this powdery mildew in Korea.

Two Species of Endophytic Penicillium from Pinus rigida in Korea

  • Kim, Chang-Sun;Park, Myung-Soo;Yu, Seung-Hun
    • Mycobiology
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    • 제36권4호
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    • pp.222-227
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    • 2008
  • Upon studying the diversity of fungal endophytes associated with pine trees in Korea, many species of Penicillium were encountered. In this study, we report two species of Penicillium isolated from the needles of Pinus rigida. Based on ID region analysis, cultural and morphological characteristics, the two species were identified as Penicillium fellutanum and P. toxicarium, both of which are new to Korea.

Root Age-Dependent Changes in Arbuscular Mycorrhizal Fungal Communities Colonizing Roots of Panax ginseng

  • Kil, Yi-Jong;Eo, Ju-Kyeong;Lee, Eun-Hwa;Eom, Ahn-Heum
    • Mycobiology
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    • 제42권4호
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    • pp.416-421
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    • 2014
  • In this study, we examined arbuscular mycorrhizal fungal (AMF) community structure colonizing field-cultivated ginseng roots according of different ages, such as 1- to 5-year-old plant, collected from Geumsan-gun, Korea. A total of seven AMF species namely, Funnelliformis caledonium, F. moseae, Gigaspora margarita, Paraglomus laccatum, P. occultum, Rhizophagus irregularis, and Scutellospora heterogama were identified from the roots using cloning, PCR-restriction fragment length polymorphism and sequence analysis of the large subunit region in rDNA. AMF species diversity in the ginseng roots decreased with the increase in root age because of the decreased species evenness. In addition, the community structures of AMF in the roots became more uniform. These results suggest that the age of ginseng affects mycorrhizal colonization and its community structure.

에키나시아 흰가루병을 일으키는 Podosphaera xanthii 동정 (Identification of Podosphaera xanthii as the causal agent of powdery mildew disease affecting Echinacea purpurea in Korea)

  • 최인영;홍선희;이용호;신현동
    • 한국균학회지
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    • 제48권3호
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    • pp.337-343
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    • 2020
  • 한국에서 식물병원성 균류의 생물다양성을 파악하기 위한 균류 탐사를 통하여 에키나시아 흰가루병이 지속적으로 관찰되었다. 총 9점의 시료를 고려대학교 식물표본보관소에 보존하였다. 병든 식물에서는 주로 성엽에서 흰색의 얇은 균사층이 전면으로 또는 부분적으로 나타났다. 흰가루병균의 감염으로 줄기와 꽃잎에서는 변색 부위가 나타나는 특징을 보였다. 이 흰가루병균 무성세대의 형태적 특징과 더불어 ITS 및 LSU 염기서열을 계통분석한 결과, 이 흰가루병균은 Podosphaera xanthii로 동정되었다. 이는 한국에서 에키나시아 흰가루병에 관한 최초의 보고이다.

구상나무의 잎에서 분리한 두 종의 국내 미기록 내생균 (Two Unreported Species of Endophytic Fungi Isolated from Leaves of Abies koreana in Korea)

  • 박혁;김동여;엄안흠
    • 한국균학회지
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    • 제46권1호
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    • pp.22-27
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    • 2018
  • 제주도 한라산 구상나무의 잎에서 내생균을 분리하여 다양성을 확인하는 과정에서 두 종의 국내 미기록 균주를 확인하였다. 분리된 균주는 형태적 특징과 internal transcribed spacer (ITS) 지역, large subunit (LSU) rDNA 지역 염기서열의 계통분석을 통해 동정하였다. 확인된 두 미기록종 균주는 Coleophoma parafusiformis와 Coniochaeta ligniaria이며, 두 균주에 대한 형태적 특징과 염기서열의 분석 결과를 제시하였다.

Morphological and molecular characterization of root-lesion nematode Pratylenchus hippeastri from Korea

  • Sungchan Huh;Namsook Park;Heonil Kang;Changhwan Bae;Insoo Choi
    • 환경생물
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    • 제41권4호
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    • pp.657-665
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    • 2023
  • The root-lesion nematode Pratylenchus spp. is the most important plantparasitic nematode due to its worldwide distribution, wide host ranges, and migratory endoparasitic characteristics. One population of Pratylenchus collected from the giant pussy willow (Salix chaenomeloides Kimura) in the Andong area as part of a nematode survey in Korea was characterized morphologically and by molecular methods. The analysis of morphological measurements and morphometric characteristics, as well as DNA sequencing of the rRNA large subunit (LSU) D2/D3 expansion segments and the internal transcribed spacer (ITS) gene sequence, confirmed the identity of this population as P. hippeastri. This study is the first report of P. hippeastri associated with Salix chaenomeloides in Korea and worldwide. Further studies on distribution and pathogenicity in different P. hippeastri host crops, such as grapevines, strawberries, and apples, are necessary. The taxonomic keys to 16 Pratylenchus species in Korea are provided.

독도 왕호장근 근권 토양에서 분리된 미기록 균류 (Unrecorded Fungi Isolated from Rhizosphere Soil of Fallopia sachalinensis in Dokdo Islands)

  • 유영현;성한중;Manh Ha Nguyen;박종명;홍지원;지원재;김보미;김대호
    • 한국균학회지
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    • 제51권3호
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    • pp.251-257
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    • 2023
  • 독도에 자생하는 식물인 왕호장근(Fallopia sachalinensis)의 근권 토양에서 다양한 균류를 분리하였다. 분리균들의 형태적 특징과 rDNA-ITS와 LSU 또는 beta-tubulin 영역 분석을 통한 분자적 특징을 확인하였다. 그 결과 기존에 국내에 보고되지 않은 Penicillium striatisporum, Gongronella sichuanensis 종들이 분리되어 이를 보고하고자 한다. 미기록 종들의 형태적 특징과 분자적특징을 본문에 기술하였다.

국내 미기록 등수국 녹병균 Pucciniastrum hydrangeae-petiolaris (Pucciniastrum hydrangeae-petiolaris, a Newly Found Rust Fungus on Hydrangea petiolaris in Korea)

  • 이재성;최영준;최병기;정복남;박지현;신현동
    • 한국균학회지
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    • 제49권1호
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    • pp.119-125
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    • 2021
  • 등수국은 수국과에 속하는 덩굴성 식물로 우리나라의 울릉도, 제주도, 남해안 섬에 분포한다. 2017년 10월 제주도에서 등수국에 발생하는 녹병균을 국내 최초로 발견하였다. 등수국 녹병균을 동정하기 위해, 형태적 특성을 조사하고 internal transcribed spacer (ITS) 및 28S large subunit (LSU) rDNA의 염기서열의 분자계통학적 분석을 수행하였다. 그 결과, 한국의 등수국 녹병균은 일본과 러시아에서 보고된 Pucciniastrum hydrangeae-petiolaris의 형태적 및 분자계통학적 특징과 일치하였으며, 북미에서 보고된 P. hydrangeae와는 상당히 먼 계통학적 관계를 보였다. 본 연구는 한국의 등수국에서 녹병균 P. hydrangeae-petiolaris의 첫 보고이다.

형태 및 분자적 특징에 의한 때죽나무 녹병균(Pucciniastrum styracinum)의 재확인 (Rust Fungus Pucciniastrum styracinum on Styrax japonicus in Korea Confirmed by Morphological and Molecular Data)

  • 박지현;정복남;이재성;최영준;신현동
    • 한국균학회지
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    • 제49권4호
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    • pp.531-537
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    • 2021
  • 때죽나무는 때죽나무과에 속하는 낙엽 소교목으로 우리나라와 중국, 일본, 대만이 원산이나 캐나다, 미국, 영국 등에도 도입되어 분포하고 있다. 1990년 이후 전국에 분포하는 때죽나무에서 녹병균이 지속적으로 발견되었다. 한국의 때죽나무 녹병균의 형태적 특성은 일본의 쪽동백나무에서 보고된 Pucciniastrum styracinum의 형태적 특성과 가장 유사하였으며 internal transcribed spacer (ITS) 및 28S large subunit (LSU) rDNA의 염기서열의 분자계통학적 분석을 통해 동정을 확인하였다. 본 연구에서는 한국의 때죽나무에서 발견한 녹병균 P. styracinum의 존재를 재확인하였고, 균학적 특성과 형태적 측정치 및 분자적 특성에 대한 정보를 제공하였다.