• 미생물학회지
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• 제38권3호
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• pp.198-204
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• 2002

폴리오 바이러스는 전형적인 장관계 바이러스로 마비, 무균성 수막염, 뇌염 등을 유발한다. 폴리오 바이러스는 분변-구강 경로를 통해 전파되며, 오염된 물을 음용수로 사용할 시 공중 보건에 문제가 될 수 있으므로 먹는 물에서 폴리오 바이러스를 검출하는 것은 중요하다. 감염성이 있는 바이 러스와 불활성화(열처리와 자외선 처리)시킨 바이러스를 세포배양법, 역전사 중합효소 연쇄반응법(reverse transcription-polymerase chain reaction: RT-PCR)그리고 세포배양-중합효소 연쇄반응 통합법(integrated cell culture-PCR: ICC-PCR)으로 검출 실험을 했다. 감염성이 있는 폴리오 바이러스는 세 가지 방법으로 모두 검출이 되었으며, 이 중에서 바이러스를 검출하는데 ICC-PCR 방법이 가장 민감했다. 세포배양법은 적은 수의 바이러스를 검출하는데 약 2주의 긴 시간이 걸렸다. 열처리나 자외선 처리로 불활성화된 바이 러스는 세포배양과 ICC-PCR방법으로는 검출이 되지 않았다. 자외선 처리한 바이러스는 RT-PCR 방법으로 검출되지 않았으나 열처리한 바이러스는 검출되었다. RT-PCR 방법은 감염성 바이러스뿐 아니라 불활성화된 바이러스도 검출할 수 있으므로 감염성이 있는지 없는지를 구분할 수 없는 단점이 있다. 이와 같은 결과는 감염성 있는 바이러스를 가장 민감하고 효과적으로 검출하는 방법이 ICC-PCR 방법이라는 것을 제시하여 준다.

• Journal of Microbiology
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• 제44권2호
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• pp.162-170
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• 2006

Oysters are known to be carriers of food-born diseases, but research on viruses in Korean oysters is scarce despite its importance for public health. We therefore tested oysters cultivated in Goheung, Seosan, Chungmu, and Tongyeong, for viral contamination using cell culture and integrated cell culture PCR (ICC-PCR) with Buffalo green monkey kidney (BGMK) and human lung epithelial (A549) cells. Additional screens via PCR, amplifying viral nucleic acids extracted from oysters supplemented our analysis. Our methods found 23.6 %, 50.9 %, and 89.1 % of all oysters to be positive for adenoviruses when cell culture, ICC-PCR, and direct PCR, respectively, was used to conduct the screen. The same methodology identified enteroviruses in 5.45%, 30.9%, and 10.9% of all cases. Most of the detected enteroviruses (81.3%) were similar to poliovirus type 1; the remainder resembled coxsackievirus type A1. A homology search with the adenoviral sequences revealed similarities to adenovirus subgenera C (type 2, 5, and 6), D (type 44), and F (enteric type 40 and 41). Adenovirus-positive samples were more abundant in A549 cells (47.3%) than in BGMK cells (18.2 %), while the reverse was true for enteroviruses (21.8 % vs. 14.5 %). Our data demonstrate that Korean oysters are heavily contaminated with enteric viruses, which is readily detectable via ICC-PCR using a combination of A549 and BGMK cells.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제14권2호
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• pp.83-89
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• 2010

In this study, we studied whether hydrogen sulfide ($H_2S$) has an effect on the pacemaker activity of interstitial cells of Cajal (ICC), in the small intestine of mice. The actions of $H_2S$ on pacemaker activity were investigated using whole-cell patch-clamp technique, intracellular $Ca^{2+}$ analysis at $30^{\circ}C$ and RT-PCR in cultured mouse intestinal ICC. Exogenously applied sodium hydrogen sulfide (NaHS), a donor of hydrogen sulfide, caused a slight tonic inward current on pacemaker activity in ICC at low concentrations (50 and $100{\mu}m$), but at high concentration ($500{\mu}m$ and 1 mM) it seemed to cause light tonic inward currents and then inhibited pacemaker amplitude and pacemaker frequency, and also an increase in the resting currents in the outward direction. Glibenclamide or other potassium channel blockers (TEA, $BaCl_2$, apamin or 4-aminopydirine) did not have an effect on NaHS-induced action in ICC. The exogenous application of carbonilcyanide p-triflouromethoxyphenylhydrazone (FCCP) and thapsigargin also inhibited the pacemaker activity of ICC as NaHS. Also, we found NaHS inhibited the spontaneous intracellular $Ca^{2+}$ ($[Ca^{2+}]_i$) oscillations in cultured ICC. In doing an RT-PCR experiment, we found that ICC enriched population lacked mRNA for both CSE and CBS, but was prominently detected in unsorted muscle. In conclusion, $H_2S$ inhibited the pacemaker activity of ICC by modulating intracellular $Ca^{2+}$. These results can serve as evidence of the physiological action of $H_2S$ as acting on the ICC in gastrointestinal (GI) motility.

• 공업화학
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• 제33권3호
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• pp.235-241
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• 2022

유엔이 발표한 세계 물개발 보고서는 2030년까지 식수가 현재보다 40% 감소할 것으로 전망하고 있다. 이는 물의 양이 감소하는 것이 아니라, 환경오염으로 인해 상수원이 오염되는 것을 말한다. 미생물이 수질에 깊은 연관이 있기 때문에 미생물의 분석은 수질관리에 매우 중요하다. 현재 미생물 분석에 사용되는 방법은 배양 후 현미경을 통한 모양과 형태를 분석하는 것이 가장 일반적이나, 유전자분석 기술이 발달함에 따라 현미경을 통한 미생물 분석 방식에 qPCR(quantitative polymerase chain reaction) 적용이 가능해졌고 활용방법 등이 연구되었다. 그 중에는 역전사 단계를 추가하여 RNA 분석에 용이성을 부여한 RT-qPCR법과 미생물 배양분석에 접목시켜 검사시간을 단축시키는 ICC-qPCR, 자연에서 채취한 샘플의 위양성율을 감소시키는 데 용이한 viability qPCR, 다중분석에 용이한 multiplex qPCR, 소량의 샘플만으로 분석이 가능한 microfluidic qPCR법 등이 있다. 본 논문에서는 이처럼 qPCR 방법이 미생물 분석에 적용되는 사례와 방식의 원리, 그리고 발전 방향에 대해 소개하고자 한다.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제15권3호
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• pp.129-135
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• 2011

In this study we determined whether or not 5-hydroxytryptamine (5-HT) has an effect on the pacemaker activities of interstitial cells of Cajal (ICC) from the mouse small intestine. The actions of 5-HT on pacemaker activities were investigated using a whole-cell patch-clamp technique, intracellular $Ca^{2+}$ ($[Ca^{2+}]_i$) analysis, and RT-PCR in ICC. Exogenously-treated 5-HT showed tonic inward currents on pacemaker currents in ICC under the voltage-clamp mode in a dose-dependent manner. Based on RT-PCR results, we found the existence of 5-$HT_{2B,\;3,\;4,\;and\;7}$ receptors in ICC. However, SDZ 205557 (a 5-$HT_4$ receptor antagonist), SB 269970 (a 5-$HT_7$ receptor antagonist), 3-tropanylindole - 3 - carboxylate methiodide (3-TCM; a 5-$HT_3$ antagonist) blocked the 5-HT-induced action on pacemaker activity, but not SB 204741 (a 5-$HT_{2B}$ receptor antagonist). Based on $[Ca^{2+}]_i$ analysis, we found that 5-HT increased the intensity of $[Ca^{2+}]_i$. The treatment of PD 98059 or JNK II inhibitor blocked the 5-HT-induced action on pacemaker activity of ICC, but not SB 203580. In summary, these results suggest that 5-HT can modulate pacemaker activity through 5-$HT_{3,\;4,\;and\;7}$ receptors via $[Ca^{2+}]_i$ mobilization and regulation of mitogen-activated protein kinases.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권1호
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• pp.557-563
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• 2013

Intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC) is ranked as one of the top five causes of cancer-related deaths. ICC in Thai patients is associated with infection with the liver fluke, Opisthorchis viverrini, but the molecular basis for development remains unclear. The present study employed a microarray approach to compare gene expression profiles of ICCs and normal liver tissues from the same patients residing in Northeast Thailand, a region with a high prevalence of liver fluke infection. In ICC samples, 2,821 and 1,361 genes were found to be significantly up- and down-regulated respectively (unpaired t-test, p<0.05; fold-change ${\gep}2.0$). For validation of the microarray results, 7 up-regulated genes (FXYD3, GPRC5A, CEACAM5, MUC13, EPCAM, TMC5, and EHF) and 3 down-regulated genes (CPS1, TAT, and ITIH1) were selected for confirmation using quantitative RT-PCR, resulting in 100% agreement. The metallothionine heavy metal pathway contains the highest percentage of genes with statistically significant changes in expression. This study provides exon-level expression profiles in ICC that should be fruitful in identifying novel genetic markers for classifying and possibly early diagnosis of this highly fatal type of cholangiocarcinoma.

• 미생물학회지
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• 제47권2호
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• pp.117-123
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• 2011

본 연구는 human rotavirus (HRV)의 검출법을 최적화하기 위해 real-time RT-PCR과 세포 배양법을 이용하여 여러 가지 탈리 농축법을 비교 및 평가하는 것을 목적으로 하였다. 채소류 중 배추, 상추, 깻잎을 선정하여 바이러스 희석액을 접종하고 탈리액 비교를 위하여 buffer A (100 mM Tris-HCl, 50 mM glycine, 3% beef extract, pH 9.5)와 buffer B (250 mM Threonine, 300 mM NaCl, pH 9.5)를 이용하여 탈리하였고, 농축방법을 비교하기 위하여 PEG (polyethylene glycol) 침전법 또는 filtration [Nanoceram filter$^{(R)}$ (Argonide corporation)]을 이용하여 농축하였다. 또한 바이러스의 감염성 평가를 위하여 MA-104 cell을 배양하여 탈리, 농축 방법을 거쳐 회수된 HRV를 접종하고 1, 48, 72, 96, 120, 144, 168시간 후 세포를 수거하여 real-time RT-PCR을 시행하고 세포병변을 관찰하였다. 탈리 용액은 buffer A가 회수율 29.54%로 buffer B의 18.32%보다 더 뛰어난 탈리효과를 보였으며 농축방법을 비교했을 때 filtration 방법이 회수율 51.89%를 나타내며 PEG 침전법에 비해서 바이러스의 농축에 효과적이었으며 검출 소요시간이나 간단한 과정 면에서 효율적이었다. ICC/real-time RT-PCR을 시행하였을 때 세포병변 72시간 후부터 나타나기 시작했지만 Ct value는 48시간부터 감소하기 시작하여 더 빠른 시간 내에 감염성을 평가할 수 있었다. 따라서, filtration과 integrated/cell culture real-time RT-PCR을 이용하면 기존의 검출방법보다 빠른 시간 내에 바이러스 검출이 가능할 것으로 여겨진다.

• 치위생과학회지
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• 제15권3호
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• pp.377-382
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• 2015

본 연구는 노인 64명을 대상으로 Qraycam을 이용한 이미지로 치면세균막 지수를 측정하여 착색 검사와의 신뢰도를 평가하고자 하였으며, 수집된 자료를 분석하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 측정 방법, 측정 부위, 지수유형별에 따른 치면세균막 지수의 각 측정값 사이에 높은 일치도가 나타났다. 측정 방법에 따른 전치부 순면의 Quigley-Hein index와 PCR의 평균은 유의한 차이가 없었으며, 측정 부위에 따른 Quigley-Hein index와 PCR의 평균은 통계적으로 유의한 차이가 있었다(p<0.001). Qraycam 검사와 착색 검사의 지수유형별 kappa계수를 확인한 결과 kappa값의 평균은 Quigley-Hein index 0.90, PCR 0.84로 전체적으로 높은 일치도를 보였다. Qraycam과 착색 검사의 전치부 순면 및 전체 치아를 Quigley-Hein index와 PCR로 측정하였을 때, 변수 간 ICC는 1에 가까운 결과를 보였다. 본 연구 결과 측정방법, 측정 부위, 지수유형별에 따른 치면세균막 지수의 일치도 평가에서 모든 측정값의 일치도가 높게 나타났다. 따라서 Qraycam은 치면세균막 검사 시 screening 도구로서 충분한 신뢰도가 있음을 확인하였다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제60권2호
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• pp.143-147
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• 2022

Acanthamoeba keratitis (AK) is a rare ocular disease, but it is a painful and sight-threatening infectious disease. Early diagnosis and adequate treatment are necessary to prevent serious complications. While AK is frequently diagnosis via several PCR assays or Acanthamoeba-specific antibodies, a more specific and effective diagnostic method is required. This study described the production of a polyclonal peptide antibody against the periplasmic binding protein (PBP) of A. castellanii and investigated its diagnostic potential. Western blot analysis showed that the PBP antibody specifically reacted with the cell lysates of A. castellanii. However, the PBP antibody did not interact with human corneal epithelial (HCE) cells and the other 3 major causative agents of keratitis. Immunocytochemistry (ICC) results revealed the specific detection of A. castellanii trophozoites and cysts by PBP antibodies when A. castellanii were co-cultured with HCE cells. PBP antibody specificity was further confirmed by co-culture of A. castellanii trophozoites with F. solani, S. aureus, and P. aeruginosa via ICC. The PBP antibody specifically reacted with the trophozoites and cysts of A. polyphaga, A. hatchetti, A. culbertsoni, A. royreba, and A. healyi, thus demonstrated its genus-specific nature. These results showed that the PBP polyclonal peptide antibody of A. castellanii could specifically detect several species of Acanthamoeba, contributing to the development of an effective antibody-based AK diagnostics.

• 생명과학회지
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• 제15권5호
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• pp.696-702
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• 2005

오존처리는 음용수중의 유해한 미생물을 소독하는 처리기술로 주로 이용되고 있으며, 생물활성탄 처리기술 역시 오염물질 제거를 포함한 음용수 제조과정에 여러 가지 이점을 제공한다. 이글의 병행처리는 원수중의 여러 물질을 제거하는데 효과적인 공정으로 간주되고 있다. 본 연구에서는 낙동강 하류의 매리취수장 원수를 사용하여 생물활성탄 정수처리공정 및 오존에 의한 수질 변화와 함께 폴리오바이러스 제거 효율을 조사하였다. 수질인자들은 BAC 여과를 거치면서 $NH^{+}_{4}-N$등을 포함한 모든 항목들은 거의 제거되는 것으로 나타났다. Pilot-plant를 이용한 정수처리공정별 폴리오바이러스 제거실험에서는 전오존 접촉에 의해 $96.8\%$, 침전단계에서$99.3\%$, 여과단계에서 $99.6\%$의 바이러스가 제거되었으며, 후오존을 거친 BAC 여과수 시료에서는 세포배양법과 ICC-PCR 방법에서 바이러스가 $100\%$ 제거되어짐을 확인할 수 있었다. 오존농도에 의한 폴리오바이러스 제거실험 결과 0.4mg/1에서 5분간 접촉되었을 때는 약 $61.1\%$ 이상이, 0.8mg/1에서 10분 이상 접촉시킨 후에는 바이러스의 $100\% $가 불활성화 되어졌음을 알 수 있었다.