• 보존과학연구
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• 통권28호
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• pp.75-90
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• 2007

The ancient biomolecular remains are the potential source for paleobiology and paleoanthropology. Especially, ancient human specimens such as bone, teeth, and hair are powerful materials to identify historical origin and migration of ancestor population from the past. However, most excavated human specimens in archaeological sites have commonly problems as natural damage and exogenous contamination. We carried out histological and molecular analyses of excavated bone from the historic sites in South Korea from the recently discovered in tumulus of Seochun and Naju. Biological deterioration of bone was observed anatomically by optical and scanning electron microscope (SEM). We extracted degraded DNA, and amplified hyper variable region (HVR) of mitochondrial DNA (mtDNA) and amelogenin of nucleus DNA. This study applied and examined the relationships between histological preservation and DNA survival in excavated bone.

• 보존과학회지
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• 제34권1호
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• pp.1-9
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• 2018

본 연구는 부산 북구 화명동 조선시대 분묘군에서 출토된 사람뼈를 대상으로 분자유전학적 분석을 수행한 결과이다. 실리카 추출법을 사용하여 토광묘에서 출토된 사람뼈 8개체의 DNA를 분리하였고, 미토콘드리아 DNA 과변이부위 분석을 통해 모계 유연관계 여부를 확인하였다. 분석 결과 토광묘 11호, 21호, 26호에서 출토된 피장자 3명의 하플로타입이 동정되었으며 HaploGrep 2 프로그램에서 A5a, D4a와 M4"67+16311 하플로그룹으로 분류되었다. 하플로그룹이 동정된 3개체는 같은 변이형을 공유하지 않으므로 피장자 간 모계 친연관계는 없는 것으로 확인되었다. 이번 연구는 영남지역에서 출토된 조선시대 사람뼈의 분자유전학적 분석의 첫 사례로서 과거 한반도에 살았던 옛사람들과 현대인들의 유전학적 관계를 이해하기 위한 기초 자료로 활용할 수 있을 것으로 기대된다.

• Mycobiology
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• 제51권1호
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• pp.26-35
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• 2023

The diversity of A mating type in wild strains of Lentinula edodes was extensively analyzed to characterize and utilize them for developing new cultivars. One hundred twenty-three A mating type alleles, including 67 newly discovered alleles, were identified from 106 wild strains collected for the past four decades in Korea. Based on previous studies and current findings, a total of 130 A mating type alleles have been found, 124 of which were discovered from wild strains, indicating the hyper-variability of A mating type alleles of L. edodes. About half of the A mating type alleles in wild strains were found in more than two strains, whereas the other half of the alleles were found in only one strain. About 90% of A mating type combinations in dikaryotic wild strains showed a single occurrence. Geographically, diverse A mating type alleles were intensively located in the central region of the Korean peninsula, whereas only allele A17 was observed throughout Korea. We also found the conservation of the TCCCAC motif in addition to the previously reported motifs, including ATTGT, ACAAT, and GCGGAG, in the intergenic regions of A mating loci. Sequence comparison among some alleles indicated that accumulated mutation and recombination would contribute to the diversification of A mating type alleles in L. edodes. Our data support the rapid evolution of A mating locus in L. edodes, and would help to understand the characteristics of A mating loci of wild strains in Korea and help to utilize them for developing new cultivars.

• 보존과학연구
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• 통권20호
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• pp.5-20
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• 1999

We have analyzed the allele and genotype frequencies from 10 fractions of ancient human skeleton in 3 pieces of Jar coffin excavated from Naju Bokamni3rd tumulus by PCR amplification, high resolution polyacrylamide gelelectorphoresis and silver staining. We could isolate human genomic DNA from 3 bone fractions but the rest of them could not be used as materials due to being decayed. We could detect sex determination as male and 3 genotypes of STR system, HUMTHO1, HUMTPOX and HUMC5F1PO from the bone fraction of left side in Jar coffin 3 and see the slightly reaction suggesting the sex as male from the bone fraction of the left side in Jar coffin 2 and female from the right side in Jar coffin 3.We have also analyzed the genotype frequencies of mitochondria from the bone fractions of the left side and the right side in jar coffin 3, respectively. From the result of indetifiying at nucletide position between 16018 and 16378of the base of hyper variable region(HV1) in the control region, We can presume that the both bones have the same maternal inheritance.

• 한국응용곤충학회지
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• 제55권2호
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• pp.177-188
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• 2016

알파 프로테박테리아(${\alpha}-proteobacterium$)인 볼바키아(Wolbachia) 세균은 절지동물 세포내의 중요한 공생균 중의 하나이다. 그람 음성 세균인 이 공생균은 기주동물의 여러 생물적 과정에 관여하고 있으며, 현재 생물적 방제 수단으로 주목 받고 있다. 볼바키아는 기주 세포의 세포질에 서식하는 세균인데 암컷을 통하여 세대간 전염된다. 볼파키아의 감염 개체 밀도를 높이기 위해 기주의 생식방식을 조작하는 다양한 전략을 발달시켰다. 볼바키아 유전자형 계통은 볼바키아 표면 단백질(WSP)의 고변이영역 아미노산 서열과 복합좌위 서열 타이핑(Multilocus sequence typing, MLST)으로 결정된다. 상이한 유전계통 판별은 wsp, 16S rRNA, ftsZ, gltA, groEL 등 유전자 분자표지를 이용하게 된다.. 이 계통 볼바키아 세균과 그들의 우월한 표현형이 농업해충과 인간의 질병매개 곤충에 대한 방제 프로그램에서 이용 가능성이 고려되고 있다. 볼바키아 표현형들은 세포질불일치(cytoplasmic incompatibility, CI), 단성생식 유도(parthenogenesis induction, PI), 여성화(feminization, F), 수컷치사(male killing, MK) 등을 유발하는 것으로 알려져 있다. 기타 볼바키아 세균의 농업과 위생곤충 방제 프로그램에서 응용 방안을 고찰하였다.