• 제목/요약/키워드: Human calicivirus

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Application of Buoyant Density Centrifugation Method for the Rapid Detection of Feline Calicivirus in Oyster and Lettuce as Norovirus Surrogate

  • Cho, Yun-Sik;Lee, Kang-Whie;Jang, Keum-Il;Ahn, Jun-Bae;Kim, Kwang-Yup
    • Food Science and Biotechnology
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    • 제17권5호
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    • pp.925-930
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    • 2008
  • Norovirus has become the most common cause of human gastroenteritis in developed countries. Detection procedures of foodborne viruses from foods require several steps. The concentration step using polyethylene glycol (PEG) is time-consuming and the detection efficiency of reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) is affected by inhibitors from food components. In this study, a rapid detection method based on buoyant density centrifugation was developed to replace the time-consuming chloroform-polyethylene glycol-Tris Tween method. Feline calicivirus that belongs to the family Caliciviridae was used as a surrogate model for norovirus. After artificial inoculation of feline calcivirus (FCV) to oyster and lettuce, 830 ${\mu}L$ of homogenized sample suspension was layered on the top of 670 ${\mu}L$ 20% percoll and centrifuged. Then RNA extraction step was proceeded with the supernatant. By varying several physical conditions, the detection limits were lowered to $2.4{\times}10^2$ PFU per 1 g in oyster and $2.4{\times}10^0$ PFU per 1 g in lettuce. The protocol obtained in this study could be used to develop new detection method for norovirus in foods.

Antiviral Effect of Korean Red Ginseng Extract and Ginsenosides on Murine Norovirus and Feline Calicivirus as Surrogates for Human Norovirus

  • Lee, Min-Hwa;Lee, Bog-Hieu;Jung, Ji-Youn;Cheon, Doo-Sung;Kim, Kyung-Tack;Choi, Chang-Sun
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제35권4호
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    • pp.429-435
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    • 2011
  • Korean red ginseng has been studied various biological activities such as immune, anti-oxidative, anti-microbial, and anticancer activities but antiviral mechanism needs further studies. In this study, we aimed to examine the antiviral effects of Korea red ginseng extract and ginsenosides on norovirus surrogate, including murine norovirus (MNV) and feline calicivirus (FCV). We evaluated the pre-, co-, and post-treatment effects of Korean red ginseng (KRG), ginsenosides $Rb_1$ and $Rg_1$. To measure the antiviral effect and cytotoxicity of KRG extract, and ginsenosides $Rb_1$ and $Rg_1$, we treated Crandell-Reese Feline Kidney for FCV or RAW264.7 cells for MNV with concentrations of 0, 5, 6.7, 10, 20 ug/mL total saponin. There was cytotoxic effect in the highest concentration 20 ug/mL of KRG extract so this concentration was excluded in this study. The FCV titer was significantly reduced to 0.23-0.83 $log_{10}$ 50% tissue culture infectious dose ($TCID_{50}$)/mL in groups pre-treated with red ginseng extract or ginsenosides. The titer of MNV was significantly reduced to 0.37-1.48 $log_{10}$ $TCID_{50}$/mL in groups pre-treated with red ginseng extract or ginsenosides. However, there was no observed antiviral effect in groups co-treated or post-treated with KRG and its constituents. Our data suggest that KRG extract has an antiviral effect against norovirus surrogates. The antiviral mechanisms of KRG and ginsenosides should be addressed in future studies.

한국형 사람 Calicivirus Replicase 단백의 발현 및 항원성 평가 (Expression and Antigenicity of Replicase Protein from Snow Mountain-Like Caliciviruses, Korean Isolates)

  • 장미윤;양재명;김경희
    • 대한바이러스학회지
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    • 제27권2호
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    • pp.151-160
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    • 1997
  • In view of the potential of replicase protein as a diagnostic reagent for human caliciviruses (HuCVs), we have cloned and over-expressed this gene from the Snow Mountain-like Korean strains in Escherichia coli as a fusion protein with glutathione S-transferase (GST), and described the preliminary antigenic characterization of the recombinant products. Each 470bp fragment corresponding to highly conserved region of RNA-dependent RNA polymerase was generated by RT-PCR from stools of two diarrheal children, cloned in pMOSBlue T-vector, and subcloned between the EcoRI and SalI restriction sites of pGEX-4T-3, a GST gene fusion vector, yielding $pGCV_{pol}$. This construct expressed a Snow Mountain-like HuCV replicase under the control of the IPTG-inducible tac promoter. An extract prepared by sonication of the E. coli cell inclusion bodies bearing $pGCV_{pol}$ products was purified and analyzed by SDS-PAGE. After Coomassie blue staining, it was shown that the recombinant replicase migrated on the gels with an approximate molecular mass of 46.5 kDa, that was subsequently cleaved into a 26 kDa GST fragment and a 20.5 kDa replicase protein upon digestion with thrombin protease. The replicase was recognized on immunoblotting with the sera from symptomatic children with the HuCV-associated diarrhea but not by asymptomatic sera from adults. The results presented the first biological activity of individually expressed HuCV replicase subunit and provided important reagents for diagnosis of HuCV infection.

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Baculovirus에서 발현된 Norwalk Virus 캡시드 항원에 대한 국내인의 혈청학적 반응도 (Seroprevalence of Norwalk-Like Viruses (NLVs) in Seoul: Detection Using Baculovirus-Expressed Norwalk Virus Capsid Antigen)

  • 강신재;남기범;조양자;김경희
    • 대한바이러스학회지
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    • 제27권2호
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    • pp.161-168
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    • 1997
  • The present study was designed to estimate the seroprevalence of NLVs among diarrheagenic children and in healthy adults in Seoul and its vicinity with the use of an EIA and an Western blot (WB) based on recombinant Norwalk virus capsid protein (rNV) and crude virus preparations as antigen. Seroconversion was observed in 34 (83%) of 41 tested using the EIA and in 21 (54%) of 39 using the WB, suggesting that the NLVs with epitopes common to rNV are prevalent in Seoul area. Diarrheal children who were known to have been infected with several other strains of the NLVs showed no significant antibody response to the rNV. Infection with rNV occurred earlier in life: primary infections with rNV were common before the age of 6 months and over 91 % of children had evidence of infection by that age by the EIA. Since the amount of the NLV antigens available for seroepidemiologic surveys is limited, we tried to detect NLV antibody by using crude virus preparations as antigen. One crude virus preparation of a child whose stool yielded genetically distinct NLV revealed the presence of the plural number of bands upon SDS-PAGE, but precipitated only one band (62 kDa) after the WB with a serum (collected 10 days after the onset of symptoms) of another diarrheal child. The WB assay we present in this report revealed that the NLVs are prevalent among Korean population and that the sera contained antibody to a single major structural protein, with molecular sizes of 58 to 62 kDa, compatible with the sizes reported for the Norwalk virus and Snow Mountain agent proteins, respectively. When the results of the WB were compared with those obtained by the EIA, the EIA antibody assay was sensitive enough to detect an antibody rise of as much as 4096-fold but not as specific as the WB. The WB assay presented in this paper will provide a powerful tool to elucidate not only antigenic structures of the NL Vs but also seroepidemiology of the NLV infection. The availability of an unlimited source of antigen will enable a large scale serologic studies that will greatly increase our understanding of the role of NLVs in human enteric illness.

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바이러스에 의한 최근(2010-2019) 국내 식중독 사고와 검출법 및 제어법에 대한 동향 조사 (Recent (2010-2019) foodborne outbreaks caused by viruses in the Republic of Korea along with their detection and inactivation methods)

  • 권승욱;김상순
    • 한국식품과학회지
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    • 제53권1호
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    • pp.1-11
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    • 2021
  • 본 논문에서는 최근 10년간(2010-2019년) 바이러스에 의한 식중독 통계 및 바이러스 검출법과 제어법에 대한 자료를 정리하여 나타냈다. 국내에서 지난 10년 동안 바이러스에 의해 발생한 식중독 사고 488건 중 94.9%가 노로바이러스에 의한 것으로 확인되어 노로바이러스가 국내에서 가장 주요한 식중독 바이러스로 생각된다. 노로바이러스를 검출하는 방법으로는 PCR을 이용한 방법이 주로 보고되고 있으며 현재(2020년 12월) 식품 공전에 등록된 방법(고시 제 2010-45호)에 따라 전기 영동을 기반으로 한 one-step RT PCR 및 semi-nested PCR 방법이 널리 이용되고 있다. 또한 최근 DNA sequencing 기술이 발달됨에 따라서 검출된 바이러스의 서열을 분석하여 이미 보고된 바이러스의 서열과 비교한 논문들이 많이 보고되었다. 이 외에도 real-time PCR을 적용한 논문들도 보고되고 있으며 앞으로는 전기 영동을 실시하는 conventional PCR을 대신하여 신속하게 정량 검출이 가능한 realtime PCR의 활용이 늘어날 것으로 생각한다. 기타 바이러스의 검출에 있어서도 역시 PCR을 활용한 방법이 주로 보고되고 있으며 multiplex PCR을 활용하여 여러 종류의 바이러스를 동시에 검출하고자 하는 노력이 이루어지고 있다. 더 나아가서, 자기 면역력 분리와 퀀텀닷 분석 방법 등을 이용한 신속 검출법이 제시되고 있어 앞으로 여러 식품에 오염된 바이러스를 현장에서 신속분리 및 검출하는데 이용할 수 있을 것으로 전망된다. 한편, 노로바이러스는 실험실에서 배양하기가 어렵기 때문에 노로바이러스 제어 연구는 대체재를 이용한 방법들이 주를 이루었다. 옴 가열을 포함한 여러 종류의 열처리와 초고압, 오존, 감마선, 광펄스 등의 비가열 처리를 이용하여 노로바이러스의 저감 정도를 살펴본 연구들이 최근 보고되었다. 일반적으로 물이나 완충용액보다는 식품 샘플에서 바이러스의 저감 정도가 낮게 관찰되었는데 식품 matrix가 이러한 물리적 처리에 간섭 효과를 나타내기 때문으로 생각되며 이를 극복하기 위해서는 여러 물리적, 화학적 처리를 조합하여 처리할 필요가 있다. 기타 바이러스 제어 연구에 있어서는 열, 광펄스, 고압력 등의 물리적 처리와 더불어 살균제(sanitizer)를 적용한 논문들이 보고되고 있으며 식중독 바이러스의 저감 메커니즘에 대한 체계적인 연구가 수행되고 있는 것을 확인하였다. 여러 물리적, 화학적 처리에 대해서 식중독 바이러스가 저항성을 갖는 이유와 사멸되는 메커니즘을 정확하게 이해한다면 추후 여러 식품에서의 바이러스에 대한 안전성을 확보하는데 도움이 될 것으로 사료된다.

한국 소아 암환자에서 노로바이러스 감염증의 임상 양상 (Clinical Manifestations of Norovirus Infection in Korean Pediatric Cancer Patients)

  • 최현신;최영배;황지영;천두성;정혜숙;최연호;유건희;성기웅;구홍회;김예진
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제18권1호
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    • pp.40-47
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    • 2011
  • 목 적 : 노로바이러스는 바이러스성 설사의 흔한 원인이며, 면역 저하 환자에서도 심각한 감염증을 유발하는 것으로 알려져 있어, 소아 암환자에서 노로바이러스 감염의 임상 양상을 알아보고자 하였다. 방 법: 2008년 11월부터 2009년 9월까지 삼성 서울병원에 입원한 환아 중 대변에서 노로바이러스 PCR 양성을 보였던 소아 암환자를 대상으로 하였고, 이들의 의무기록을 후향적으로 분석하였다. 결 과:연구에 포함된 환자는 총 10명이었으며, 이들 연령의 중앙값은 0.83세, 남녀의 비율은 1.5대 1이었다. 기저질환은 혈액암 4명, 신경모세포종 4명, 뇌종양 2명이었고, 감염 진단 당시 조혈모세포이식 수여자는 4명이었다. 모든 환자에서 설사 증상을 보였으며, 설사 횟수의 중앙값은 8.5회/일, 바이러스 배출 기간의 중앙값은 72.5일이었다. 장기종 소견을 보인 4명의 환자는 금식 및 총정맥 영양을 투여 받았으며, 노로바이러스 관련 사망은 관찰되지 않았다. 결 론 : 노로바이러스 감염은 소아 암환자에서 다양한 임상 증상을 유발 할 수 있으며, 이들 면역저하 환자에서 바이러스 배출 기간이 매우 길어, 설사가 있는 암환자에서 고려해야 할 바이러스 감염이다.