Moon Jun Hwan;Choi Ho Young;Lee Deung Ho;Jun Sung Hwan
Korean Journal of Bronchoesophagology
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v.11
no.1
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pp.37-41
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2005
Deep neck infections mean infection in the potential spaces and facial planes of the neck, either abscess formation or cellulitis. Deep neck infections are caused by dental, salivary gland, pharyngeal and tonsillar infections. Sometimes, deep neck infection may be caused by tuberculosis in case of immunodefiecient patients. Acquired immunodeficiency syndrome(AIDS) is a disease associated with defective cell-mediated immunity after infected with human immunodeficiency virus(HIV). The chance of opportunistic infection in patients of AIDS increases as the level of immunodeficienty progresses. Human immunodeficiency virus infection is the most single significant risk factor for progression of pulmonary tuberculosis to extrapulmonary sites. In patients infected with HIV, the rate of extrapulomonary tuberculosis rises upto $60\%$. We report a case of a 47 year old male patient with AIDS associated with deep neck infection by tuberculosis.
For screening of the antiviral agent from soil, about 520 strains of microorganisms were evaluated for their antiviral activity, About 6.9% of strains showed more than 95% antiviral activity against Herpes Simples Virus (HSV)-1. Two strains among 30 strains active against HSV-1 virus showed a quite strong activity against human immunodeficiency virus.
Human papillomavirus is a virus that is distributed worldwide, and persistent infection with high-risk genotypes (HR-HPV) is considered the most important factor for the development of squamous cell cervical carcinoma (SCC). However, by itself, it is not sufficient, and other factors may contribute to the onset and progression of lesions. For example, infection with other sexually transmitted diseases such as human immunodeficiency virus (HIV) may be a factor. Previous studies have shown the relationship between HPV infection and SCC development among HIV-infected women in many regions of the world, with great emphasis on low- and middle-income countries (LMICs). Brazil is considered a LMIC and has great disparities across different regions. The purpose of this review was to highlight the current knowledge about HPV infection and cervical abnormalities in HIV+ women in Brazil because this country is an ideal setting to evaluate HIV impact on SCC development and serves as model of LMICs and low-resource settings.
For the detection of Human Immunodeficiency Virus (HIV), multiple and ultra-rapid real-time PCR methods were developed. The target DNA sequences were deduced from HIV-1 specific 495bp partial env gene (gi_1184090) and from HIV-2 specific 294 bp partial env gene (gi_1332355), and were synthesized by using PCR-based gene synthesis on the reason of safety. Ultra-rapid real-time PCR was performed by $Genspector^{TM}$ using microchip-based, $1\;{\mu}l$ of reaction volume with extremely short time in each 3 step in PCR. The detection including DNA-amplification and melting temperature analysis was completed inner 15 minutes. The HIV-1 specific 117 bp-long and HIV-2 specific 119 bp-long PCR products were successfully amplified from minimum of template,2.3 molecules of each env gene. This kind of real-time PCR was designated as ultra-rapid real-time PCR in this study and it could be applied not only an alternative detection method against HIV, but also other pathogens using PCR-based detection.
Korean Red Ginseng (KRG) is a heat-processed ginseng developed by the repeated steaming and air-drying of fresh ginseng. Compared with fresh ginseng, KRG has been shown to possess greater pharmacological activities and stability because of changes that occur in its chemical constituents during the steaming process. In addition to anticancer, anti-inflammatory, and immune-modulatory activities, KRG and its purified components have also been shown to possess protective effects against microbial infections. Here, we summarize the current knowledge on the properties of KRG and its components on infections with human pathogenic viruses such as respiratory syncytial virus, rhinovirus, influenza virus, human immunodeficiency virus, human herpes virus, hepatitis virus, norovirus, rotavirus, enterovirus, and coxsackievirus. Additionally, the therapeutic potential of KRG as an antiviral and vaccine adjuvant is discussed.
Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) integrase plays a critical role in the life cycle of the HIV virus. An ability to accurately map its electrostatic potential, and then use this information to predict the manner in which DNA will bind to the active site of the catalytic domain could provide a foundation for inhibitory design. Attempts to discern the crystal structure of HIV-1 integrase have proven problematic, especially in the region of enzymatic activity, that being those residues involved in the catalysis of the integration of viral DNA into the host cell. However, there is a structural correlation in to the region of interest with avian sarcoma virus (ASV), so a homology model utilizing this similarity was constructed to approximate the behavior/structure of the undetermined portions of the HIV-1 integrase crystal. After this model was constructed and its energy minimized, electrostatic calculations were carried out on the substance, so that an electrostatic potential map was constructed. Using this information, it was determined that DNA binding was oriented so as to exploit the regions of positive potential nearby the active site, as well as the positive potential of the magnesium cofactors.
Natural products, total number of 175, were screened to test for their effect on the replication of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1). Five of them, such as Eriobotrya japonica, Eugenia caryphyllata, Cuscuta chinensis, Glycyrrhiza uralensis, and Coptis chinensis were shown to be effective in inhibiting the replication of HIV-1 in tissue culture and their selectivity indexes were 42, 40, 14, 18 and 65, respectively. To further fractionate Coptis chinensis, which is shown to be highest anti-HIV-1 activity, methanol extracts of Coptis chinensis were fractionated into methylene chloride at pH3, pH10 and water residue. The selectivity Indexes of CH$_2$C1$_2$(pH 3), CH$_2$C1$_2$(pH 10) and water residue were 50, 22 and 98 respectively. Our results show that the water residue of Coptis chinensis was the most effective for anti-HIV-1 activity.
본 연구는 인간면역결핍바이러스의 입자를 비이온성 계면활성제로 처리할 때 바이러스 입자구조에서 분리되어 방출되는 바이러스 구조단백질들의 분포를 sucrose gradient로 분석하여, 바이러스 입자를 구성하는 바이러스 구조단백질과 바이러스입자의 생물리학적 특성을 연구하였다. 바이러스입자들을 0.16% NP40 (Nonidet P-40)으로 처리할 때, 바이러스 capsid 단백질과 바이러스 막 단백질 (membrance protein)들은 다른 바이러스 구성성분들과 잘 분리되었다. 계면활성제처리에서 방출되지 않은 구성 성분들은 matrix 단백질, nucleocapsid 단백질, reverse transcriptase, integrase 및 바이러스 RNA genome로써, 이들은 subviral 구조를 형성한다. 이러한 결과는 상대적으로 다른 바이러스들의 capsid 단백질과 면역 결핍 바이러스의 capsid 단백질 (p24)를 비교할 때, 면역결핍바이러스의 capsid 단백질은 바이러스핵을 형성할 때, capsid 단백질 사이의 결합력이 매우 약한 것으로 추정된다. 또한 바이러스 조절단백질의 하나인 vpr 단백질을 함유하는 바이러스입자를 NP40 처리하여 분석하였을 때, vpr 단백질은 subviral 구조에 존재하는 것으로 나타났다.
Retroviral integrase is required for integration of viral DNA into the host cell chromosome. Human immunodeficiency virus type-1 integrase was partially purified as a part of a fusion protein linked to a maltose-binding protein and characterized in terms of an endonucleolytic activity. The concentration of the fusion protein purified through an amylose column was about 12mg/ml. Indicating that the solubility of the fusion protein is highly increased by the presence of a maltose-binding protein, considering that the integrase protein alone is poorly solubilized. The endonucleolytic activity of the fusion protein was detected at 0.1 to 1.OmM $Mn^{++}$ ion, but not at any concentrations tested of $Mn^{++}$ ion.
Kim, Do-Jin;Oh, You-Take;Lee, Sang-Kwang;Shin, Cha-Gyun
BMB Reports
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v.32
no.6
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pp.599-604
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1999
A highly conserved amino acid, glutamic acid (Glu), present at position 152 in the catalytic domain of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) integrase (IN) protein has been known to be critical for enzymatic function since substitution of Glu 152 with other residues results in a complete loss of enzymatic activities. In order to better understand the role of Glu 152 as a conserved residue in enzymatic action, intragenic second site mutations have been introduced around residue 152 of a mutant IN (E152A), and their biochemical properties were analyzed in terms of enzymatic activities. Disintegration activities were found to be significantly restored in several second site mutant INs, while integration activities were only recovered weakly. However, endonucleolytic activities were not discovered in all the mutant INs. These findings indicate that the second site mutations can partially restore that catalytic structure of the active site disturbed by the E152A mutation and lead to the regaining of integration and disintegration activities. In addition, it is also suggested that endonucleolytic activity requires a more accurate structure of the catalytic site than that for the integration and disintegration activities.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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