• 제목/요약/키워드: HindIII

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해양미생물 Pseudomonas sp. W7이 생산하는 Extracellular Agarase의 정제 및 Gene Cloning (Purification of Extracellular Agarase from Marine Bacterium (Pseudosmonas sp. W7) and Molecular Cloning of the Agarase Gene)

  • 공재열;배승권
    • KSBB Journal
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    • 제11권1호
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    • pp.37-45
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    • 1996
  • 한국의 남해안에서 한천 분해능이 뛰어난 해양 미 생물을 분리하여 통정한 결과 Pseudomonas 속으로 판명되었으며, 본 연구에서는 이 균을 Halophilic P Pseudomonas sp. W7이라 명영하였다. 이 균주는 호염성 세균으로, 한천의 존재 하에서 높은 효소활성 을 가지는 extracellular agarase를 생산해 내었다. 이 extracellular agarase를 DEAE-Cellulose ani- on exchange chromatography와 gel filtration을 통해 정제하였으며, 정제된 agarase는 SDS-PAGE 를 통해 약 89KDa의 분자량을 지니는 single protein band염을 확인하였다. 한편 agarase의 대량생 산을 위하여 host cell Eo coli JM83과 vector pUC19를 이용하여 gene cloning을 행하였다. Pseudomonas sp. W7의 chromosomal DNA가 삽 입 된 균주 중에 서 agarase activity를 나타내는 E. coli JM83/pSWl과 Eo coli JM83/pSW3를 선멸하 였으며, 전기영통 실험결과 이들은 각각 307Kb, 3.0 K Kb의 chromosomal 단편을 지니고 있음을 확인하였 다. 또한 agarase 유전자가 압입된 변이 균주(B)는 inclusion body 형태의 interacellular agarase를 세포 내에 축적하고 있음이 확인되었다.

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과꽃에서 분리한 Cucumber mosaic virus의 성질 (Characterization of an Isolate of Cucumber mosaic virus Isolated from Chinese aster (Callistephus chinensis))

  • 오선미;김성률;홍진성;류기현;이긍표;최장경
    • 식물병연구
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    • 제14권3호
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    • pp.229-232
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    • 2008
  • 모자이크 증상의 과꽃(Callistephus chinensis L.)으로부터 Cucumber mosaic virus (CMV)의 한 계통(Cas-CMV)를 분리하고, Fny-CMV와 As-CMV를 대조로 기주반응, dsRNA, RT-PCR 및 RFLP분석을 통하여 바이러스를 동정하였다. Cas-CMV의 특징적인 기주반응의 차이는 박과 식물에서 발현되는 강한 병정이었으며, 특히 쥬키니호박에 접종하였을 때에는 접종 15-20일 후에 심한 모자이크 증상과 함께 어린 식물이 고사되는 괴저현상을 나타냈다. DsRNA분석과 RT-PCR실험의 결과는 Cas-CMV가 서브그룹 I의 CMV에 속하는 것으로 나타났으며, 더욱이 HindIII를 이용한 RFLP 분석은 Cas-CMV가 서브그룹 IA 구분되었다.

트레오닌 생합성에 관여하는 효모유전자 THR1의 클로님, 염색체통합 및 발현 (Molecular Cloning, Chromosomal Integration and Expression of the Homoserine Kinase gene THR1 of Saccharomyces cerevisiae)

  • 최명숙;이호주
    • 미생물학회지
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    • 제29권1호
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    • pp.16-24
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    • 1991
  • The yeast gene THR1 encodes the homoserine kinase (EC 2.7.1.39: HKase) which catalyses the first step of the threonine specific arm at the end of the common pathway for methionine and threonine biosynthesis. A recombinant plasmid pMC3 (12.6 kilobase pairs, vector YCp50) has been cloned into E. coli HB101 from a yeast genomic library through its complementing activity of a thr1 mutation in a yeast recipient strain M39-1D. When subcloned into pMC32 (8.6kbp, vector YRp7) and pMC35 (8.3 kbp, vector YIp5), the HindIII fragment (2.7 kbp) of pMC3 insery was positive in the thrI complementing activity in both yeast and E. coli auxotrophic strains. The linearized pMC35 was introduced into the original recipient yeast strain and the mitotically stable chromosomal integrant was identified among the transformants. Through the tetrad analysis, the integration site of the pMC35 was localized to the region of THR1 structural gene at an expected genetic distance of approximately 11.1 cM from the ARG4 locus on the right arm of the yeast chromosome VIII. When episomically introduced into the auxotrophic cells and cultured in Thr omission liquid medium, the cloned gene overexpressed the HKase in the order of thirteen to fifteenfold, as compared with a wildtype. HKase levels are repressed by addition of threonine at the amount of 300 mg/l and 1, 190 mg/l for pMC32 and pMC3, respectively. Data from genetic analysis and HKase response thus support that the cloned HindIII yeast DNA fragment contains the yeast thr1 structural gene, along with necessary regulatory components for control of its proper expression.

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Lactobacillus casei의 동종간 세포융합에 의한 유전자 재조합에 관한 연구 (Studies on the Genetic Recombination by Intraspecific Fusion of Lactobacillus casei Protoplast)

  • Young Jin Baek;Hyeong Suk Bae;Young Kee Kim;Min Yoo;Hyun Uk Kim
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.319-324
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    • 1986
  • Lactobacillus casei 모세포와 동종간 융합세포간의 유산생성, 단백질 분해력, Bacteriophage 저항성 등의 생리적 특성과 표현형을 비교분석하였다. 두 모세포 사이에서 형성된 융합세포는 모세포를 침입하는 bacteriophage에 대하여 저항성을 시험한 결과 L. casei C-M 표현형은 융합세포 중 46%를 차지하였고, L. casei 3-M 표현형은 42%였고, 12%의 융합세포는 두 모세포 bacteriophage에 저항성을 소유하였다. 융합세포의 유산생성력과 단백질 분해력도 유사한 출현율을 나타내었다. Plasmid DNA의 Hind III 분해물은 모세포와 융합세포간에 차이가 없었으나, 융합세포들은 L. casei C-M 또는 L. casei 3-M 중 어느 한 모세포의 Plasmid만을 소유하고 있었다.

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4-Chlorobenzoic Acid 분해유전자의 클로닝과 유전학적 특성 (Cloning and Characterization of the Genes Responsible for Degradation of 4-Chlorobenzoic Acid)

  • 이익근;김종우;김치경
    • 미생물학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.41-46
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    • 1990
  • 자연환경으로부터 분리한 DJ-12 균주는 4CBA 및 4CB를 비롯하여 그 대사산물인 4OHBA와 PCA를 분해하여 단일 탄소원으로 이용하였다. DJ-12 균주에서 4CBA 및 4CB분해유전자는 약 65kb 크기의 plasmid인 pDJ121에 존재하였으며, 이 pDJ121은 ExoRI, HindIII, SalI 그리고 PslI의 절단부위를 각각 9, 11, 10 그리고 19개씩 가지고 있었다. EcoRI으로 처리한 pDJ121 절편을 pKT230에 ligation 시켜 재조합 vector인 pDK450을 만들었으며, 이를 Pseudomonas putida KT2440에 transformation 시켜 얻은 cloned cell 에서는 4CBA 분해유전자가 잘 발현되었다.

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Cloning of a Potentially Strain-Specific DNA Probe of prevotella intermedia ATCC 25611 by Inverted Dot Blot Hybridization Screening Method

  • Kook, Joong-Ki;Han, Jin-Ju;Kim, Hwa-Sook;Seong, Jin-Hyo;Kim, Dong-Kie;Baek, Dong-Heon;Choe, Son-Jin
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제13권2호
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    • pp.282-286
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    • 2003
  • The purpose of this study was to isolate a specific DNA probe for the strain ATTC 25611 of the species Prevotella intermedia by using a new rapid screening mothod. The whole-genomic DNA of P. intermedia ATCC 25611 was isolated and purified. The HindIII-digested genomic DNAs from the strain were cloned by the random cloning method. To screen the strain-specific DNA probe, inverted dot blot hybridization tests were performed. In this assay, 20 ng of recombinant plasmids containing the HindIII-digested genomic DNA fragment were boiled and blotted onto a nylon membrane, and hybridized with digoxigenin-dUTP labeled genomic DNAs in a concentration of 100 ng/ml. Southern blot analysis was performed in order to confirm the results of the inverted dot blot hybridization tests. The data showed that a Pi34 probe (2.1 kbp; 1 out of 32 probes) was specific for P. intermedia strain ATCC 25611 and could be useful for the detection and identification of the strain, particularly in epidemiological studies of periodontal disease.

감염 근관에서 분리된 연쇄구균의 16S Ribosomal DNA 중합효소 연쇄반응과 제한효소 절단길이 다형성에 관한 연구 (POLYMERASE CHAIN REACTION AND RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM OF 16S RIBOSOMAL DNA OF STREPTOCOCCI ISOLATED FROM INFECTED ROOT CANALS)

  • 정희일;임미경
    • Restorative Dentistry and Endodontics
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    • 제20권2호
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    • pp.577-609
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    • 1995
  • Bacteria have been regarded as one of the most important factors in pulpal and periapical diseases. Streptococci are frequently isolated facultative anaerobes in infected root canals. Recently molecular biological techniques have been rapidly progressed. This study was designed to apply the molecular biological tools to the identification and classification of streptococci in the endodontic microbiology. Streptococci isolated from infected root canals were identified with both Vitek Systems and API 20 STREP. Identification results were somewhat different in several strains of streptococci. Eighteen streptococci and enterococcal was difficult so to digest plasmid DNA using Hind III and EcoRI to differentiate strains by restriction enzyme analysis of plasmid DNA. 16S rDNA of chromosome was amplified by polymerase chain reaction(PCR) and then restricition fragment length polymorphism(RFLP) using several restriction enzymes was observed. The molecular mass of 16S rDNA of chromosomal DNA was approximately 1.4kb. There were three to five RFLP patterns using eight restriction enzymes. RFLP patterns digested with CfoI which recognizes four base sequences were identical in all stains. Hind III which recognizes six base sequences could not digest the 16S rDNA. Restriction enzymes which recognize five base sequences were suitable for RFLP pattern analysis. At least three different restriction enzymes were needed to compare each strains. 16S rDNA PCR-RFLP was simple and rapid to differentiate and classify strains and could be used in the epidemiological study of root canal infections.

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Bacillus stearothermophilus의 열안정성 $\alpha$-amylase 유전자의 E. coli내에서의 cloning과 발현 (Molecular Cloning of a Thermostable $\alpha$-Amylase Gene from Bacillus stearothermophilus and Its Expressions in E. coli)

  • Huh, Tae-Lin;Koh, Suk-Hoon;Lee, Se-Yong
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제13권4호
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    • pp.349-354
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    • 1985
  • Plasmid pBR322와 runaway Plasmid pSY343을 vector로 사용하여 E. stearothermophilus IAM 11062내의 $\alpha$-amylase 유전자를 E. coli내에 클로닝 하였다. 이때 얻어진 $\alpha$-amylase유전자는 제한효소 Hind III의 말단을 갖고 있는 4.7kb의 크기였으며 E. coli내에서 이들 유전자는 비교적 안정적 있게 유지되고 발현되었다. 재조합 $\alpha$-amylase유전자가 클로닝된 E. coli는 B. stearothermophilus IAM 11062보다 3배의 $\alpha$-amylase를 더 많이 생성하였다. EDTA를 사용한 osmotic shock 방법에 의하여 E. coli내에서 생성된 $\alpha$-amylase는 그 효소 생성량의 75%정도가 periplasm에 존재함이 밝혀졌다. 재조합된 $\alpha$-amylase 유전자에 의해서 E. coli에서 생성된 $\alpha$-amylase는 최적 작용온도가 55$^{\circ}C$로서 이들의 열안정성과 분자량(61,000)도 B. stearothermophilus IAM 11062의 $\alpha$-amylase와 거의 동일하게 나타나 E. coli와 B. stearothermophilus IAM 11062에서 생성된 $\alpha$-amylase는 효소학적 성질이 같음을 보여주었다.

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개에서 경골 조면 내측에 피질골 나사못을 장착하는 방법에 의한 내측 슬개골 탈구 치료 증례 (Treatment of Medial Patellar Luxation by Placement of a Cortical Screw on the Medial Side of the Tibial Crest in a Dog)

  • 강병재;윤대영;류다은;김용선;이승훈;김완희;권오경
    • 한국임상수의학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.133-136
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    • 2014
  • 8 kg, 9개월령 중성화 수컷 시바 이누견이 양측 후지의 간헐적인 파행 증상으로 내원하였다. 검사를 통해 3단계의 양측 슬개골 탈구가 진단되었다. 대퇴 사두근의 정상 배열을 회복하기 위해서 상대적으로 비침습적인 조면의 위치를 재배열하는 독특한 수술 방법을 적용하였다. 이 과정은 경골 능선을 따라 경골 조면의 내측 피질골을 절개하고, 경골 조면을 외측으로 변위시키기 위해 경골 능선의 내측에 피질골 나사못을 장착하는 방식으로 이루어졌다. 수술 후 3개월 검사에서 양측 후지의 파행과 슬개골 탈구가 개선된 것이 확인되었다. 이 수술 기법은 골격이 미성숙한 환자에서 내측 슬개골 탈구를 치료하기 위한 효과적인 방법으로 고려될 수 있다.

고전압맥동전류에 의한 일차 및 이차통각과민대의 RIII 반사의 변화 (Change of RIII Reflex of Primary and Secondary Hyperalgesia Site by High Voltage Pulsed Current)

  • 김수현;최석주;이정우;정진규;김태열;김계엽
    • 대한임상전기생리학회지
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    • 제4권1호
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    • pp.1-12
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    • 2006
  • This study conducted RIII reflex measurement to examine degree of pain depending on polarity of high voltage pulsed current of primary and secondary hyperalgesia site in hyperalgesia rat by local thermal injury. Hind paw which was injury site was taken as primary hyperalgeisa site, sole which was injury adjacent site was taken as secondary hyperalgesia site, and mechanical pain threshold, thermal pain threshold and root mean square of RIII reflex were measured. This study was conducted with control group I of hyperalgesia rat at hind paw by thermal injury and experimental groups divided into cathodal high voltage treatment group II, anodal high voltage treatment group III and alternate high voltage treatment group IV, applied active electrode of high voltage pulsed current to hind paw directly, placed reference electrode on the sole of injury adjacent site and applied pulse frequency. It measured RIII reflex and obtained the following results: Root mean square of RIII reflex at primary hyperalgeisa site was significantly reduced in group II after 2 days of hyperalgesia. Group II showed significant decrease after 5 and 6 days of hyperalgesia. Root mean square of RIII reflex at secondary hyperalgesia site showed significant reduction in group II after 6 days of hyperalgesia. Consequently it was found that application of high voltage pulsed current of hyperalgesia site reduced RIII reflex at primary hyperalgeisa site and secondary hyperalgesia site by electrical stimuli. Effects by polarity of high voltage pulsed current showed the greatest reduction of pain threshold when cathodal active electrode was used.

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