• 제목/요약/키워드: Hierarchical clustering method

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공간국부성을 최적화하는 클러스터링 방법 (A Clustering Method for Optimizing Spatial Locality)

  • 김홍기
    • 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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    • 제31권2호
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    • pp.83-90
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    • 2004
  • 본 논문에서는 순환적인 검색공간과 장애물이 존재하는 검색공간에서 객체들을 클러스터링할 때 고려해야하는 CCD(Clustering with Circular Distance) 문제와 COD(Clustering with Obstructed Distance) 문제를 연구하였다. 그리고 다차원 검색공간에서 삽입이나 삭제가 빈번히 발생하는 객체들을 효율적으로 클러스터링하기 위한 새로운 클러스터링 알고리즘을 제안하였다. 제안한 클러스터링 알고리즘에는 CCD 및 COD 문제를 해결하기 위한 거리 함수가 정의된다. 그리고 최소의 연산 시간으로 높은 공간 국부성을 갖는 클러스터들을 생성하기 위한 클러스터링 방법이 포함된다.

A Study of HME Model in Time-Course Microarray Data

  • Myoung, Sung-Min;Kim, Dong-Geon;Jo, Jin-Nam
    • 응용통계연구
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    • 제25권3호
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    • pp.415-422
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    • 2012
  • For statistical microarray data analysis, clustering analysis is a useful exploratory technique and offers the promise of simultaneously studying the variation of many genes. However, most of the proposed clustering methods are not rigorously solved for a time-course microarray data cluster and for a fitting time covariate; therefore, a statistical method is needed to form a cluster and represent a linear trend of each cluster for each gene. In this research, we developed a modified hierarchical mixture of an experts model to suggest clustering data and characterize each cluster using a linear mixed effect model. The feasibility of the proposed method is illustrated by an application to the human fibroblast data suggested by Iyer et al. (1999).

시퀀스 요소 기반의 유사도를 이용한 시퀀스 데이터 클러스터링 (Mining Clusters of Sequence Data using Sequence Element-based Similarity Measure)

  • 오승준;김재련
    • 한국지능정보시스템학회:학술대회논문집
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    • 한국지능정보시스템학회 2004년도 추계학술대회
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    • pp.221-229
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    • 2004
  • Recently, there has been enormous growth in the amount of commercial and scientific data, such as protein sequences, retail transactions, and web-logs. Such datasets consist of sequence data that have an inherent sequential nature. However, only a few of the existing clustering algorithms consider sequentiality. This study presents a method for clustering such sequence datasets. The similarity between sequences must be decided before clustering the sequences. This study proposes a new similarity measure to compute the similarity between two sequences using a sequence element. Two clustering algorithms using the proposed similarity measure are proposed: a hierarchical clustering algorithm and a scalable clustering algorithm that uses sampling and a k-nearest neighbor method. Using a splice dataset and synthetic datasets, we show that the quality of clusters generated by our proposed clustering algorithms is better than that of clusters produced by traditional clustering algorithms.

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계층적 군집화를 이용한 능동적 학습 (Active Learning based on Hierarchical Clustering)

  • 우호영;박정희
    • 정보처리학회논문지:소프트웨어 및 데이터공학
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    • 제2권10호
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    • pp.705-712
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    • 2013
  • 능동적 학습(active learning)은 소수의 라벨 데이터로 구성된 훈련 집합이 주어진 경우에 분류기 학습에 가장 도움이 될 만한 언라벨드 데이터를 선택하여 전문가에 의한 라벨링을 통해 훈련 집합에 포함시키는 과정을 반복함으로써 분류기의 성능을 향상시키는 것을 목적으로 한다. 본 논문에서는 워드 연결(ward's linkage)을 이용한 계층적 군집화(hierarchical clustering)를 바탕으로 한 능동적 학습 방법을 제안한다. 제안된 방법은 각 군집에서 적어도 하나의 샘플을 포함하도록 초기 훈련 집합을 능동적으로 구성하거나 또는 기존의 훈련 집합을 확장함으로써 전체 데이터 분포를 반영할 수 있게 한다. 기존의 능동적 학습 방법들 중 대부분은 초기 훈련 집합이 주어져 있을 경우를 가정하는 반면에 제안하는 방법은 초기 클래스 정보를 가진 훈련 데이터가 주어지지 않은 경우와 주어진 경우에 모두 적용 가능하다. 실험을 통하여 제안하는 방법이 비교 방법들에 비해 분류기 성능을 크게 향상시킬 수 있는 효과적인 데이터 선택을 수행함을 보인다.

MCL 알고리즘을 사용한 유전자 발현 데이터 클러스터링 (Clustering Gene Expression Data by MCL Algorithm)

  • 손호선;류근호
    • 전자공학회논문지CI
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    • 제45권4호
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    • pp.27-33
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    • 2008
  • 유전자 발현 데이터의 분석 기법 중 무감독 학습 기반의 클러스터링 기법은 생물학적 변화와 진의 발현 정도를 이해하는데 자주 사용되는 방법이다. 생명공학 연구에 있어서 그래프 기반의 MCL 알고리즘은 그래프 내의 노드들을 클러스터링 하는 알고리즘으로 빠르고 효과적이다. 우리는 기존의 MCL 알고리즘을 개선하여 마이크로어레이 데이터에 적용시켰다. MCL 알고리즘 수행 시 inflation과 대각선 항의 두 요인을 조정하는 시뮬레이션을 실행하였으며, 마코브 행렬을 이용하여 변환하였다. 또한 개선된 MCL 알고리즘에서는 더 명확한 클래스를 구분하기 위하여 각 열의 평균을 구한 후 그 값을 임계치로 사용하였다. 따라서 수정된 알고리즘은 기존의 알고리즘들보다 정확도를 높일 수 있었다. 즉, 실제 실험 결과 기존에 알려진 클래스와 비교했을 때 평균 70%의 정확도를 보였다. 또한, 다른 클러스터링 기법, K-means 알고리즘, 계층적 클러스터링 그리고 SOM 알고리즘을 비교 분석하였으며, 그 결과 MCL 알고리즘이 다른 클러스터링 기법보다 더 좋은 결과를 보임을 알 수 있다.

Distance Aware Intelligent Clustering Protocol for Wireless Sensor Networks

  • Gautam, Navin;Pyun, Jae-Young
    • Journal of Communications and Networks
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    • 제12권2호
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    • pp.122-129
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    • 2010
  • Energy conservation is one of the most important issues for evaluating the performance of wireless sensor network (WSN) applications. Generally speaking, hierarchical clustering protocols such as LEACH, LEACH-C, EEEAC, and BCDCP are more efficient in energy conservation than flat routing protocols. However, these typical protocols still have drawbacks of unequal and high energy depletion in cluster heads (CHs) due to the different transmission distance from each CH to the base station (BS). In order to minimize the energy consumption and increase the network lifetime, we propose a new hierarchical routing protocol, distance aware intelligent clustering protocol (DAIC), with the key concept of dividing the network into tiers and selecting the high energy CHs at the nearest distance from the BS. We have observed that a considerable amount of energy can be conserved by selecting CHs at the nearest distance from the BS. Also, the number of CHs is computed dynamically to avoid the selection of unnecessarily large number of CHs in the network. Our simulation results showed that the proposed DAIC outperforms LEACH and LEACH-C by 63.28% and 36.27% in energy conservation respectively. The distance aware CH selection method adopted in the proposed DAIC protocol can also be adapted to other hierarchical clustering protocols for the higher energy efficiency.

대용량 데이터 처리를 위한 하이브리드형 클러스터링 기법 (A Hybrid Clustering Technique for Processing Large Data)

  • 김만선;이상용
    • 정보처리학회논문지B
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    • 제10B권1호
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    • pp.33-40
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    • 2003
  • 데이터 마이닝은 지식발견 과정에서 중요한 역할을 수행하며, 여러 데이터 마이닝의 알고리즘들은 특정의 목적을 위하여 선택될 수 있다. 대부분의 전통적인 계층적 클러스터링 방법은 적은 양의 데이터 집합을 처리하는데 적합하여 제한된 리소스와 부족한 효율성으로 인하여 대용량의 데이터 집합을 다루기가 곤란하다. 본 연구에서는 대용량의 데이터에 적용되어 알려지지 않은 패턴을 발견할 수 있는 하이브리드형 신경망 클러스터링 기법의 PPC(Pre-Post Clustrering) 기법을 제안한다. PPC 기법은 인공지능적 방법인 자기조직화지도(SOM)와 통계적 방법인 계층적 클러스터링을 결합하여 두 과정에서는 군집의 내부적 특징을 나타내는 응집거리와 군집간의 외부적 거리를 나타내는 인접거리에 따라 유사도를 측정한다. 최종적으로 PPC 기법은 측정된 유사도를 이용하여 대용량 데이터 집합을 군집화한다. PPC 기법은 UCI Repository 데이터를 이용하여 실험해 본 결과, 다른 클러스터링 기법들 보다 우수한 응집도를 보였다.

On the Categorical Variable Clustering

  • Kim, Dae-Hak
    • Journal of the Korean Data and Information Science Society
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    • 제7권2호
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    • pp.219-226
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    • 1996
  • Basic objective in cluster analysis is to discover natural groupings of items or variables. In general, variable clustering was conducted based on some similarity measures between variables which have binary characteristics. We propose a variable clustering method when variables have more categories ordered in some sense. We also consider some measures of association as a similarity between variables. Numerical example is included.

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비구조화 P2P 시스템에서 이동에이전트를 이용한 Peer의 속성기반 계층적 클러스터링 (Property-based Hierarchical Clustering of Peers using Mobile Agent for Unstructured P2P Systems)

  • 마이클 안젤로 살보;마테오 로미오;이재완
    • 인터넷정보학회논문지
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    • 제10권4호
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    • pp.189-198
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    • 2009
  • 비구조화 P2P 시스템은 오늘날 인터넷에서 가장 널리 사용되지만, 파일의 배치는 임의로 이루어지며, Peer와 컨텐츠간에는 어떤 상관관계도 존재하지 않는다. 또한 보낸 모든 질의가 원하는 데이터를 찾았는지에 대한 보장도 없다. 본 논문에서는 비구조화된 P2P시스템에서 군집형 계층 클러스터링을 사용하여 노드들을 클러스터화함으로써 검색을 향상시키는 방법을 제시한다. 제안한 기법과 k-means를 사용한 기법간에 노드 클러스터링을 위한 지연시간을 비교하였다. 또한 제안한 알고리즘, k-means 클러스터링, 클러스터링을 사용하지 않은 방법간에 한 네트워크 토폴로지에서 데이터를 찾기 위한 지연시간에 대해 시뮬레이션을 수행하였다. 시뮬레이션 결과 제안한 기법의 지연시간이 다른 방법들보다 짧았음을 알 수 있었다.

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인용문헌 표제를 이용한 문헌 클러스터링에 관한 연구 (Document Clustering Using Reference Titles)

  • 최상희
    • 정보관리학회지
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    • 제27권2호
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    • pp.241-252
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    • 2010
  • 본 연구에서는 원문헌의 표제가 문헌클러스터링에서 문헌의 주제를 나타내는데 효과적인 자질로 인식되고 있지만 동의어나 유사어를 포함하여 문헌의 주제를 대표하는데 한계가 있음을 인지하고 인용문헌의 표제로 클러스터링 자질을 확대하는 방안을 제시하였다. 문헌 클러스터링의 자질로 원 문헌의 표제 용어와 인용문헌의 표제 용어, 두 종류의 표제 용어를 혼합하여 적용하여 인용문헌의 표제가 클러스터링 성능을 향상시키는 정도를 측정하였다. 각 자질별로 계층적 클러스터링 기법 3개, within group average linkage, complete linkage, Ward 기법을 결합하여 클러스터를 생성하는 성능을 비교, 분석하였는데 원문헌과 인용문헌 표제어를 혼합하여 within group average linkage 기법으로 클러스터링 한 경우가 가장 좋은 결과를 나타내었다.