• 제목/요약/키워드: HBV DNA polymerase

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Detection of Lamivudine-Resistant Mutations of HBV DNA Polymerase Gene Using PCR-Direct Sequencing

  • 이경옥
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제38권3호
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    • pp.196-202
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    • 2006
  • 최근 만성 B형간염의 치료에 B형간염 바이러스 복제를 저해하여 감염력을 약화시키는 lamivudine이 많이 사용되고 있다. 그러나 이 약제를 장기간 복용할 경우 B형간염 바이러스 DNA polymerase 유전자의 YMDD motif에 아미노산 치환을 일으켜 lamivudine 저항성 B형간염 바이러스가 나타나는 점이 문제시 되고 있다. 본 연구의 목적은 lamivudine 치료를 받은 만성 B형간염 환자에서 PCR-direct sequencing 법을 이용하여 B형간염 바이러스 DNA 중합효소 유전자의 YMDD motif(codon 552)와 codon 528에서 돌연변이 출현빈도를 구하고, HBeAg과의 관련성을 보고자 하였다. 방법은 만성 B형간염 환자의 혈청에서 DNA를 추출하고 DNA 중합효소 유전자의 codon 552와 528을 포함하는 부위에서 선택한 두 쌍의 primer를 이용하여 nested PCR을 실시하였다. 증폭된 PCR 산물은 2% agarose gel에서 전기영동을 한 후, 자동염기서열분석기를 이용하여 sequencing을 실시하였다. 총 207명 중에서 돌연변이는 124명(60%)에서 발견되었으며, 남, 녀에서 차이는 발견되지 않았고, 돌연변이군에서 비돌연변이군에 비해 평균나이가 약간 높게 나타났으나 유의성은 없었다. Codon 552에서 단일돌연변이로는 M552I(50.8%)가 가장 높게 나타났고, 다음으로 M552V(43.5%), M552I/V(5.7%)의 순서로 나타났다. Codon 528에서는 67.0%의 L528M 돌연변이가 발견되었다. Codon 552와 codon 528에서 동시에 발생한 중복돌연변이로는 M552V/L528M(43.6%)이 가장 높게 나타났고, 다음으로 M552I/L528(33.1%) 그리고 M552I/L528M(17.7%)의 순으로 나타났다. Codon 552에서 serine 돌연변이(M528S)는 발견되지 않았으며, L528M은 M552V 돌연변이와 거의 동시에 검출되었다. 본 연구에서 만성 B형간염환자에서 HBeAg의 유무와 lamivudine 돌연변이율과의 상관성은 발견되지 않았으며, PCR-direct sequencing법은 고가의 자동염기서열분석 장비와 숙련된 기술자가 필요하다는 문제점은 있으나, 검체 수가 많은 큰 임상검사실에서는 활용성이 클 것으로 판단된다. 향 후 lamivudine으로 인한 HBV 돌연변이형과 환자의 임상결과의 관련성에 대한 연구가 추가적으로 실시되면, lamivudine을 복용하는 만성 HBV 환자의 치료와 예후에 유용할 것으로 사료된다.

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적혈구 농축제재에서 HBV DNA의 노출정도 (Prevalence of HBV DNA in Packed Red Blood Cells)

  • 이채훈;김정숙;송달효
    • Journal of Yeungnam Medical Science
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    • 제12권2호
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    • pp.339-346
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    • 1995
  • 수혈 후 B형 간염 바이러스의 전파를 감소시키기 위한 방법으로 현재 적십자 혈액원에서 공급되는 적혈구 농축제재를 대상으로 HBV DNA, HBsAg, anti-HBs 및 anti-HBc를 측정 하여 수혈자에서 HBV DNA의 노출정도와 HBV DNA와 B형 바이러스 간염의 혈청학적 표지자와의 관련성을 조사하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 대구 적십자 혈액원에서 공급되는 적혈구 농축제재에서는 HBsAg이 검출되지 않았으며, HBV DNA는 0.6%에서 검출되었는데, 모두 anti-HBc만 양성인 경우였다. Anti-HBc양성률은 37%였으며, 이들중 65.8%에서 anti-HBs도 양성으로 나타나 anti-HBc만 양성인 경우는 공혈혈액의 13.0% 정도로 추정되었다. 따라서, 우리나라와 같이 anti-HBc양성률이 높은 지역에서는 anti-HBs를 추가하는 경우 13%의 혈액제제만을 폐기함으로써 HBV DNA의 전파를 차단시킬수 있으리라 생각되며 현재 실시하고 있는 검사보다 예민도와 특이도가 높은 선별검사의 개발이 필요한 것으로 생각된다.

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Phylogenetic Analysis of Hepatitis B Virus Genome Isolated from Korean Patient Serum

  • Kim, Seon-Young;Kang, Hyen-Sam;Kim, Yeon-Soo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제10권6호
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    • pp.823-828
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    • 2000
  • The complete nucleotide sequence of hepatitis B virus DNA isolated from Korean patient serum was determined and characterized, and its phylogenetic relation was then investigated. The viral genome was 3,215 base pairs long and included four well known open reading frames (i.e. surface antigens, core antigens, X protein and DNA polymerase). The sequence of the surface antigen showed that the HBV genome under investigation, designated HBV 315, was characteristic of subtype adr. A phylogenetic analysis using the total genome sequence revealed that HBV315 was grouped into genomic group C together with isolates from Japan, China, Thailand, Polynesia, and New Caledonia. The mean percent similarity between HBV315 and other HBV isolates in genomic group C was 97.25%, and that with other genomic groups ranged from 86.16% to 91.25%. The predicted amino acid sequences of HBV315 were compared with two closely related subtype adr isolates, M38636 and D12980. The results showed that the X gene product was identical in the three strains, while there were significant amino acid sequence differences between HBV315 and M38636 in the Pre-S1 and Pre-S2 regions.

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만성 B형 간질환에서 간염 B virus 표식자 발현에 따른 DNA의 검출 (Detection of Serum Hepatitis B Virus DNA According to HBV Markers in Chronic Hepatitis B Liver Disease)

  • 이동준;최진수;김준환;이헌주
    • Journal of Yeungnam Medical Science
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    • 제14권1호
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    • pp.155-167
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    • 1997
  • 본 연구는, HBV의 증식 및 감염력을 파악하는데 가장 중요한 표지자로 알려진 HBV DNA를 최근 임상에서 많이 이용되고 있는 PCR법을 사용해 검출함으로써 기존의 dot blot법과 PCR법을 비교하고, 만성 간질환 환자에서 HBV의 e항원, 항체체계에 따른 HBV DNA의 검출율을 PCR법을 이용하여 알아봄으로써 HBV의 증식 및 감염력을 파악하고자 무증상 HBsAg 보유자 17명(HBeAg 양성 9명, anti-HBe 양성 8명), 만성 B형 간염 환자 91명(HBeAg 양성 50명, anti-HBe 양성 41명), 간경변증 한자 57명(HBeAg 양성 21명, anti-HBe 양성 36명), 원발성 간세포암 환자 27명(HBeAg 양성 10명, anti­HBe 양성 17명)을 대상으로 HBV DNA의 검출빈도를 조사하여 다음과 같은 결과를 얻었다. Dot blot법의 경우 HBeAg 양성인 환자군, anti-HBe 양성인 환자군에서의 HBV DNA의 검출율은 각각 58.9%, 34.3% 이었고, PCR법에 의한 검출율은 상기군에서 각각 72.2%, 53.9%였다. HBeAg 음성인군에서의 PCR법에 의한 HBV DNA 검출율은 무증상 HBsAg 보유자의 경우 25.0%, 만성 B형 간염 환자군의 경우 61.0%, 간병변증 환자군의 경우 52.8%, 원발성 간세포암 환자군의 경우 52.9%였다. 무증상 HBsAg 보유자에서 HBeAg 양성인 군과 음성인 군간의 HBV DNA 검출율은 각각 77.8%, 25.0%로 유의한 차이가 있었으나, 나머지 군에서는 HBeAg 양성인 군과 음성인 군간의 HBV DNA 검출율의 유의한 차이는 없었다. 이상의 결과로 PCR을 이용할 경우 기존의 dot blot보다 훨씬 예민하게 HBV DNA를 검출할 수 있고, HBsAg 양성인 만성 간질환 환자의 대부분에서는 HBeAg 및 anti-HBe 표식자 체계와는 무관하게 바이러스의 증식이 지속되고 있음을 알 수 있었으며, PCR법이 무증상 HBsAg 보유자의 예후를 알 수 있는 지표로서 유용성에 대한 가능성을 의미하나 확실한 의의를 알기 위하여 전향적인 연구가 필요할 것으로 사료된다.

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Anti-HBc 단독 양성자에서 B형 간염 백신 접종의 면역 반응과 B형 간염 DNA의 조사 (A Study of Immune Response to Hepatitis B Vaccine & HBV DNA in Isolated Anti-HBc Positive Subjects)

  • 김순덕;최지호;김성열;이진수;고희정
    • Journal of Preventive Medicine and Public Health
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    • 제38권2호
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    • pp.170-174
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    • 2005
  • Objectives: The aim of this study was to evaluate the response to a hepatitis B vaccination, and investigate the HBV DNA in subjects with isolated anti-HBc. Methods: 34 subjects with persistent isolated anti-HBc were included in the study. 32 subjects negative for HBsAg, anti-HBs and anti-HBc were included as a control group. They were all vaccinated with Hepaccine at 0, 1 and 2 months, and anti-HBs titers were measured 1 month after the 1st and 3rd vaccinations (1 and 3 months). The HBV-DNA was tested by polymerase chain reaction in subjects with isolated anti-HBc. Results: After the 1st & 3rd vaccinations, the anti-HBs titers$\geq$10mIU/ml were 70.6 & 70.6% in isolated anti-HBc group, and 34.4 & 81.2% in the control group, respectively. There were statistically significant differences after the 1st vaccination, but none after the 3rd, between the two groups. In the isolated anti-HBc and control groups, the primary, amnestic and no responses were 0 vs. 46.9%, 55.9 vs. 6.3% and 29.4 vs. 18.8%, respectively. The HBV DNA was not detected in all subjects with isolated anti-HBc. Conclusion: None of the subjects with isolated anti-HBc had a false positive result (primary response); therefore, they should be excluded from vaccination programs in Korea. To differentiate between immunity and occult infections, a single dose of vaccine, with a follow-up anti-HBs test, is preferable for subjects with isolated anti-HBc. An amnestic response indicates late immunity, and no response a suspect occult infection.

Interleukin-6-174 Promoter Polymorphism and Susceptibility to Hepatitis B Virus Infection as a Risk Factor for Hepatocellular Carcinoma in Iran

  • Attar, Marzieh;Azar, Saleh Shahbazi;Shahbazi, Majid
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제17권5호
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    • pp.2395-2399
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    • 2016
  • Background: Hepatitis B virus (HBV) is a major risk factor for hepatocellular carcinoma (HCC). Cytokines play an important role in the regulation of immune responses and defense against viral infections. Human interleukin 6 (IL6) is a multifunctional cytokine that participates in these processes. Objective: The aim of this study was to assess the IL6-174 gene polymorphism in patients with chronic hepatitis B virus (HBV) infection as compared with healthy controls in an Iranian population. Materials and Methods: Totals of 297 HBV patients and 368 control individuals were evaluated. Genomic DNA was extracted from peripheral blood and the SSP-PCR (sequence specific primer-polymerase chain reaction) method was applied for genotyping. Results: The frequencies of genotypes C/C, G/G and C/G in HBV cases were 4.7%, 34.3%, 60.9% and in controls were 12.8%, 39.7% and 47.6%, respectively. The frequencies of G and C allele in patients and controls were 78.1%, 21.9% and 67.4%, 32.6 % respectively. There was a significant difference in the frequencies of G/G genotype (CI=1.8-7.1, OR=3.47, P=0.00001) and G allele (CI=1.34-2.23, OR=1.72, P=0.0001) between HBV patients and the control group. Conclusions: These findings suggest that the IL6-174 C/G genotype and the G allele are strongly associated with susceptibility to HBV infection. Demographic information showed that most of the subjects were male (74.4%). According to high frequency of G/G genotype in male participants (63.1%) men probably are more susceptible to hepatitis than women.

Use of ALLGIO Probe Assays for Detection of HBV Resistance to Adefovir in Patients with Chronic Hepatitis B, Kerman, Iran

  • Afshar, Reza Malekpour;Mollaie, Hamid Reza
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제13권11호
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    • pp.5463-5467
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    • 2012
  • Hepatitis B virus (HBV) infection is contagious with transmissiobn vertically or horizontally by blood products and body secretions. Over 50% of Iranian carriers contracted the infection prenatally, making this the most likely route of transmission of HBV in Iran. To evaluate the resistance to adefovir (ADV) therapy in patients with chronic hepatitis B infection, a study was conducted on 70 patients (63 males and 7 females), who had received in first line lamivudine and second line adefovir. All were tested for the presence of hepatitis B surface antigen (HBsAg), hepatitis B envelope antigen (HBeAg), serum alanine amino transferase (ALT) level and HBV DNA load before and after treatment with ADV. In all samples, resistance to lamivudine and ADV was tested with real time PCR. Among seventy patients with chronic hepatitis B infection, 18 (25.7%) were resistant to LAM and 8 (11.4%) were resistant to ADV. Only one patient was negative for the presence of HBS-Ag (5.6%) and two were negative for HBe-Ag (11.1%). In this study we used a new method (ALLGIO probe assay) that has high sensitivity in detection of adefovir resistance mutants, which we recommend to other researchers. Mutant strains of the YMDD motif of HBV polymerase can be found in some patients under treatment with lamivudine and ADV. ADV has been demonstrated to be efficient in patients with lamivudine resistant HBV.

재조합 효모 세포내에서의 간염백신 생산 (The Production of HBsAg in the Recombinant Yeast Cells)

  • Park, Cha-Yong;Lee, Hei-Chan
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제14권6호
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    • pp.455-460
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    • 1986
  • 간염 보균자의 혈액으로부터 Dane 입자를 분리하였다. Dane 입자의 핵으로부터 분리해낸 DNA는 $\alpha$-($^{32}$P) dNTP 존재하의 DNA 폴리머레이즈 반응 후 액체 씬틸레이션 카운터와 한천 전기영동 및 가이거 뮐러 카운터에 의하여 간염의 DNA임이 확인되었다. 간염 바이러스에 의한 감염을 막기 위한 백신으로서의 B형 간염 바이러스 표면항원을 생산하기 위하여 산성포스파테이즈 프로모터를 갖는 재조합 프라스미드를 함유하는 효모균주를 사용하였다. 재조합 프라스미드는 pHBV 130 및 pAM 82로부터 제작되었으며 대장균에 변환되어진 후 효모균주에 전달되었다. 간염 표면항원은 조절된 무기 인산 농도하에서 버크홀더 최소배지에서의 저해 해제로 생산되었다. 간염 표면항원의 생산 속도도 조사하였다. 전체 간염 표면항원 활성은 인산이 없는 배지에 옮겨진 뒤 3시간 내지 6시간에서 급격히 증가하였으며 9시간째에 최대에 도달하였다. 인산이 없는 배지에 옮기는 것은 고농도 인산 배지에서의 세포 배양을 6시간동안 수행한 뒤에 하는 것이 최적의 결과를 나타내었다.

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만성 B형 간염 환자에서 엔테카비어의 단기 치료 효과 (The Short Term Efficacy of Entecavir Therapy in Chronic Hepatitis B)

  • 김현;채희복;전원중;박선미;윤세진;은종렬;이헌주
    • Journal of Yeungnam Medical Science
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    • 제25권1호
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    • pp.31-40
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    • 2008
  • 충북대학교 병원과 영남대학교 병원에서 만성 B형 간염으로 내원한 환자를 대상으로 9개월 동안 엔테카비어를 투약한 뒤 그 치료성적을 조사하여 본 결과 외국 연구의 성적과 유사하게 생화학적 반응에서 3개월째는 20명(61%), 6개월째는 24명 (73%), 9개월째는 22명(67%), 바이러스학적 반응에서 3개월째 바이러스학적 반응은 27명 (82%), 6개월째는 30명 (91%), 9개월째는 30명 (91%), 바이러스 비검출율에서 3개월째는 16명 (49%), 6개월째는 24명 (73%), 9개월째는 28명 (85%)로 우수한 치료성적을 보여주었다. 치료 9개월째 바이러스 돌파현상은 2명에서 관찰되었다. 결론적으로 엔테카비어는 만성 B형 간염 환자에서 이전의 다른 뉴클레오사이드 유도체보다 좋은 치료효과 및 낮은 내성 발현율을 보이고 있다.

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Association of Viral Infections with Risk of Human Lymphomas, Egypt

  • Kadry, Dalia Y;Khorshed, Amira M;Rashed, Reham A;Mokhtar, Nadia M
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제17권4호
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    • pp.1705-1712
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    • 2016
  • Background: The aim of this study was to determine and evaluate the association of different viral infections, with hepatitis B and C viruses, Epstein-Barr virus, cytomegalovirus and human herpes virus-8 (HBV, HCV, EBV, CMV, HHV-8) with the risk of lymphomas (Hodgkin and non-Hodgkin) among Egyptian patients, and correlate with the histopathological staging and typing as well as the prevalence of combined infections. Materials and Methods: A total of 100 newly diagnosed lymphoma patients with 100 healthy age and sex matched normal controls were assayed for viral infection using enzyme linked immunosorbant assay (ELISA) followed by real time polymerase chain reaction (RT-PCR). Results: Our results showed a high statistical significant difference between cases and controls as regards clinical and laboratory findings (P<0.001 and=0.003). A high statistical difference was seen for the association of most viruses and lymphoma cases (p<0.001) except for positive HBs Ag, positive CMV IgG and HHV-8 (p=0.37, 0.70 and 1.0 respectively). No statistical significant difference was found between Hodgkin (HL) and non-Hodgkin (NHL) as regards viral prevalence except HCV antigen, 57.1% for HL and 26.5% for NHL (p = 0.03). Only, HBV DNA showed a high significant value among infiltrated bone marrow cases (p=0.003) and finally, a high significant association of 2 combined viral infections with infiltrated bone marrow lymphoma cases (p=0.04). Conclusions: Our results showed that infection with HBV, HCV, CMV and EBV were associated with increased risk of lymphoma among the Egyptian population. Detection of new associations between infectious agents and risk of cancer development will facilitate progress in elaboration of prophylactic measures, early diagnostic methods and, hopefully, novel therapy of malignant tumours.