• 제목/요약/키워드: Guanine

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Secondary Structure for RNA Aptamers Binding to Guanine-Rich Sequence in the 5'-UTR RNA of N-Ras Oncogene

  • Cho, Bongrae
    • 대한화학회지
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    • 제65권2호
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    • pp.121-124
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    • 2021
  • RNA molecules which bind to the G-rich sequence in the 5'-UTR RNA which plays an important role in expression of N-ras, were selected. The secondary structures of five selected RNA aptamers including primer sequence were found by the CLC RNA workbench ver. 4.2 program (www.clcbio.com) and investigated with RNA structural probes such as RNase T1 which has specificity for a G in single-stranded region, RNase V1 specific for double strand and nuclease S1 specific for single strand. The generalized secondary structure model was proposed and characterized. It was composed of a central long double strand region flanked by single strand region at both end sides. The double strand region had an internal single-strand region and bulges. The single strand loop in the right side was composed of four or five nucleotides.

Expression and Distribution of the Guanine Nucleotide-binding Protein Subunit Alpha-s in Mice Skin Tissues and Its Association with White and Black Coat Colors

  • Yin, Zhihong;Zhao, Xin;Wang, Zhun;Li, Zhen;Bai, Rui;Yang, Shanshan;Zhao, Min;Pang, Quanhai
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제29권10호
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    • pp.1392-1397
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    • 2016
  • Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-s ($Gn{\alpha}s$) is a small subunit of the G protein-couple signaling pathway, which is involved in the formation of coat color. The expression level and distribution of $Gn{\alpha}s$ were detected by quantitative real-time-polymerase chain reaction (qPCR), western blot, and immunohistochemistry to investigate the underlying mechanisms of coat color in white and black skin tissues of mice. qPCR and western blot results suggested that $Gn{\alpha}s$ was expressed at significantly higher levels in black mice compared with that of white mice, and transcripts and protein possessed the same expression in both colors. Immunohistochemistry demonstrated $Gn{\alpha}s$ staining in the root sheath and dermal papilla in hair follicle of mice skins. The results indicated that the $Gn{\alpha}s$ gene was expressed in both white and black skin tissues, and the expression level of $Gn{\alpha}s$ in the two types of color was different. Therefore, $Gn{\alpha}s$ may be involved in the coat color formation in mice.

Aflatoxin-DNA Adduct의 화학합성에 관한 연구 (Studies on the Chemical Synthesis of Aflatoxin-DNA Adduct)

  • 최상경;김성영;강진순;정덕화
    • 한국식품과학회지
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    • 제24권4호
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    • pp.367-370
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    • 1992
  • Aflatoxin은 세계 여러 곳에서 식품에 오염되어 발견되며 증가하는 인간의 간암발생과 빈번히 역학적으로 관련하여 보고되는 발암물질이다. 이러한 aflatoxin의 발암성 규명에 대한 연구의 일환으로 20 mg calf thynmus DNA와 8 mg 표준 aflatoxin $B_1$을 반응시켜 화학적으로 aflatoxin $B_1$을 반응시켜 화학적으로 aflatoxin $B_1-DNA$ adduct를 합성하였다. 합성된 aflatoxin $B_1-DNA$ adduct는 산가수분해와 열처리에 의해 거대한 DNA 분자를 절단하였고, immunoaffinity column을 통과시켜 aflatoxin $B_1-DNA$ adduct만 선택적으로 정제한 후 HPLC법으로 정량하였다. 그 결과 반응생성물의 대부분은 aflatoxin $B_1-guanine$ adduct였으며, 그 함량은 aflatoxin $B_1$으로 5.2 mg이었다.

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인삼 지용성성분인 유전독성억제효과와 작용기전 (Antigenotoxicity of Ginseng Petroleum Ether Extract and its Action Mechanism)

  • 허문영
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제13권3호
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    • pp.243-251
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    • 1998
  • 백삼(Pampx ginseng C.A. Meyer, 4년근)을 가루로 한 다음 petroleum ether로 24시간 추출 후 감압 농축시켜 인삼 석유에텔추출물(GPE)로 하였다. 이때 GPE의 수율은 평균 2.24%였다. 또한 GPE를 petroleum ether 소량에 녹이고 petroleum ether:ether 용매계열로 silicagel column chromatography에 의한 partition을 실시하여 P1, P2, P3 , P4, P5의 5개의 분획을 얻었다. 본 실험에서는 소핵생성 물질인 N-methyl-N-nitrosourea(MNU) 및 benzo(a) pyrene[B(a)P]를 이용하여 소핵생성억제실험을 하였따. 상기의 5가지 분획 중에서 MNU에 대해서는 GPE, P1, P2에서 억제효과가 나타났다. 한편, B(a)P에 대해서는 GPE, P1, P2, P3 , P4, P5 모두에게 억제효과를 나타내었다. 그러나 여러 가지 활성을 보인 분획 중에서 여러 가지 양성대조물질들에 대해서 가장 두드러져 보이는 것은 P2였다. P2는 MNU, B(a)P 모두에 대해서 GPE와 유사한 억제경향을 보이면서 억제활성은 크게 나타난T다. EK라서 P2가 GPE가 보이는 소핵생성억제효과에 깊은 관련이 있는 물질로 판단되었다. 이와 같은 유전독성억제효과의 작용기전을 알기 위하여 B(a)P의 대사에 미치는 영향을 연구한 결과 GPE와 P2는 S-9 mix에 의해 유도된 B(a)P 대사를 억제시켰으며, DNA-B(a)P binding도 감소시켰다. 한편, MNU에 의한 DNA binding 과 O6-methyl guanine 및 7-methyl guanine 생성에 있어서도 억제적인 경향을 나타내었다. 따라서 GPE와 P2는 B(a)P와 같은 2차 발암 물질과 MNU와 같은 알킬화제에 의한 유전독성을 활성대사억제 및 methylation 억제 , DNA binding 억제 등의 기전으로 감소시키고 있는 것으로 판단되었다. 한편, 소핵생성억제 효과에서 가장 활성이 좋았던 P2를 NMR과 GC/MS결과, aliphatic ketone류의 혼합물로서 주성분은 분질량 330과 386의 두 개 물질이 함유되어 있는 혼합물이었으며 향후 계속적으로 분리 동정이 필요한 물질이다.

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굴젓 숙성중(熟成中) 핵산(核酸) 관련물질(關聯物質)의 변화(變化) (Degradation of Nucleotides and Their Related Compounds During the Fermentation of Oyster)

  • 성낙주
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제7권2호
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    • pp.1-6
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    • 1978
  • 선도(鮮度)좋은 거제산(産) 양식(養殖)굴, Crassostrea gigas을 원료(原料)로 하여, 굴젓 숙성중(熟成中) 핵산관련물질(核酸關聯物質)의 변화(變化)를 high speed liquid chromatography로 분석(分析)한 결과(結果)를 요약(要約)하면 원료(原料)에는 5'-UMP가 $26.1{\mu}mole/g$(건물양기준(乾物量基準))로서 월등히 많았고, 다음이 uracil($5.2{\mu}mole/g$), hypoxanthine($3.8{\mu}mole/g$), 5'-IMP($2.8{\mu}mole/g$), 5'-GMP($2.7{\mu}mole/g$)의 순(順)이었다. 함량(含量)이 적은 것은 cytosine, 2',3'-CMP, 5'-AMP, 2',3'-GMP로서 이들은 모두 $1.0{\mu}mole/g$ 이하(以下)였고 guanine은 흔적량(痕跡量)에 불과(不過)하였다. 젓갈에는 원료(原料)에 많았던 5'-UMP, uracil, hypoxanthine, 5'-IMP, 5'-GMP가 숙성중(熟成中)에도 함량(含量)이 많았다. 그리고 숙성중(熟成中) 감소(減少)하는 것은 5'-UMP 및 5'-IMP, 증감(增減)이 불규칙(不規則)한 것은 5'-GMP 및 uracil, 그 외(外) 5'-AMP, 2',3',-CMP, cytosine 및 guanine은 숙성중(熟成中) 모두 증가(增加)하였다. 숙성중(熟成中) hypoxanthine은 특(特)히 많이 증가(增加)하여, 숙성(熟成) 19일(日) 후(後)에는 생시료(生試料)에 비(比)하여 약(約) 3.1배(倍), 숙성(熟成) 36일(日) 후(後)에는 약(約) 4.2배(倍), 그리고 숙성(熟成) 68일(日) 후(後)에 7.7배(倍) 증가(增加)하였다.

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Galangin의 유전독성 억제효과와 작용기전 (Antigenotoxicity of Galangin and its Action Mechanism)

  • 허문영;류재천
    • 한국환경성돌연변이발암원학회지
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    • 제18권2호
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    • pp.77-82
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    • 1998
  • In order to compare the suppressive effect of galangin on the genotoxicity by N-methyl-N-nitrosourea (MNU) or benzo[a]pyrene B(a)P, in vivo micronycleus test using mouse peripheral blood and in vitro sister chromatid exchange(SCE) test using mouse spleen lymphocytes were performed. MNU or B(a)P-induced micronucleated reticulocytes in vivo was decreased by the simultaneous treatment of galangin. MNU or B(a)P-induced SCEs in vitro was also decreased by the simultaneous treatment of galangin. On the other hand, the determinations of [$^3$H]MNU-induced total DNA binding and methylated DNA were performed to find out the mechanism of action. [$^3$H]MNU-induced total DNA binding was inhibited by the treatment of galangin in calf thymus DNA. HPLC analysis of DNA hydrolysates showed that galangin caused a decrease of 7-methyl guanine and $O^{6}$-methyl guanine in calf thymus DNA. To elucidate the action mechanism of galangin against B(a)P, alteration of B(a)P metabolism was studied. Galangin inhibited B(a)P metabolism in the presence of S-9 mix and decreased B(a)P-DNA binding in calf thymus DNA with S-9 mix.

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