• 한국식물병리학회지
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• 제14권2호
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• pp.177-183
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• 1998

A DNA fragment which is involved in tolassin production was cloned to obtain a molecular marker of Pseudomonas tolaasii, a casual agent of bacterial brown blotch disease of oyster mushroom (Pleurotus ostreatus). Tolaasin is a lipodepsipeptide toxin and known as a primary disease determinant of the P. tolaasii. It is responsible for formation of white line in agar when P. tolaasii were cultured against white line reacting organisms (WLROs). White line negative mutants (WL-) were generated by conjugation between rifampicin resistant strain of P. tolaasii and E. coli carrying suicidal plasmid pSUP2021 : : Tn5. The ability of tolaasin production of the WL- mutants was examined by hemolysis test, pathogenicity test, and high pressure liquid chromatography (HPLC) analysis of culture filtrate. All of the WL- mutants were lost the ability of tolaasin production (Tol-). Genomic library of the Tol- mutant was constructed in pLAFR3 and the cosmid clone containing Tn5 was selected. DNA fragment fro franking region of Tn5 was cloned from the plasmid and used as a probe in Southern blot. DNA-DNA hybridization with the probe to total DNA from group of bacteria ecologically similar to P. tolaasii including WLORs, fluorescent Pseudomonads isolated from oyster mushroom, P. agarici, P. gingeri, and some of other species of Psedomonas showed that some of the tested bacteria do not have any hybridized band and others have bands sowing RFLP. The cloned DNA fragment or its nucleotide sequence will be useful in detection and identification of the P. tolaasii.

• 농업과학연구
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• 제25권1호
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• pp.79-88
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• 1998

본 연구는 축협중앙회 한우개량부에서 사육중인 한우의 혈액으로부터 genomic DNA를 추출하여 한우의 면역체계에 중요한 역할을 담당하고 있는 BoLA DRB3 exon2 유전자를 PCR기법을 이용하여 증폭하고 친자확인을 위한 이들 대립유전자들의 염기서열을 분석하여 한우의 효율적인 육종에 분자유전수준에서의 접목을 위한 기초자료를 얻고자 실시하였던바, 얻어진 결과를 요약하면 다음과 같다. 1 한우의 혈액에서 추출된 genomic DNA를 1.5% agarose gel에서 전기영동한 결과, 12.2kb이상의 단일밴드로 나타나, genomic DNA는 아주 잘 분리된 것으로 판단되었으며, 한편 genomic DNA로부터 PCR기법을 이용하여 BoLA DRB3 exon2 유전자를 증폭한 결과 284kb의 단편이 증폭 되었음을 확인하였다. 2. PCR 증폭산물을 pCR 2.1 vector를 사용하여 cloning 하고, 균주에 형질전환을 시켜 재조합 plasmid를 추출한 후, EcoR 1으로 처리한 결과 300bp 단편이 확인되어 증폭되어진 BoLA DRB3 exon2 유전자가 vector 내에 잘 삽입되었음을 확인하였다. 3. 부와 모의 BoLA DRB3 exon2 대립유전자의 염기서열을 분석한 결과 염기서열의 상동성은 부의 대립유전자간에는 82.0% 이었고, 모의 대립유전자간에는 90.1%이었다. 4. 친자를 확인하기 위해 부와 모 그리고 자손간의 가계에 대한 BoLA DRB3 exon2 대립유전자의 염기서열을 분석한 결과 Mendel 의 법칙에 따라 유전된다는 사실을 확인 할 수 있었다. 5. 이상의 결과를 종합하여보면 한우의 BoLA DRB3 exon2 유전자의 부와 모, 그리고 자손의 대립유전자에 대한 염기서열 수준에서의 친자확인이 가능하였으며, 이들 연구결과는 축우의 유전적 능력개량에 중요한 분자유전학적 기초 자료가 될 것으로 판단되었다.

• 한국균학회지
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• 제23권2호통권73호
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• pp.129-138
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• 1995

비허용온도인 $37^{\circ}C$에서 삼투감수성을 보이며 베타-1,3-글루칸 합성능이 현저히 손상된 Saccharomyces cerevisiae mutant(LP353)를 YCp50으로 제조한 yeast genomic library로 형질전환시킨 후, 콜로니 자기방사법으로 형질전환체의 선별을 시도한 결과, LP353의 베타-1,3-글루칸 합성능을 부분적으로 회복시켜 주는 약 8.5-kb 크기의 DNA 절편을 클로닝하는데 성공하였다. 클로닝된 8.5-kb의 DNA 절편은 copy 수에 무관하게 LP353의 또 다른 표현형질인 온도의존적 삼투감수성은 회복시켜 주지 못하였으나, 세포벽의 베타-1,3-글루칸 함량과 베타-1,3-글루칸 분해효소인 ${\beta}-glucanase$에 대한 내성은 copy수에 무관하게 증가시켜 주었다. 한편, 8.5-kb의 DNA 절편은 $37^{\circ}C$의 삼투안정제가 첨가된 액체배지에서 잘 자라지 못하는 LP353의 돌연변이 형질을 회복시켜 야생형의 수준에 근접하는 생장양상을 보여 주었다. 이상의 결과로 클로닝된 8.5-kb 크기의 DNA 절편은 S. cerevisiae의 베타-1,3-글루칸 생합성에 관여하는 유전자의 하나인 BGS2를 포함하고 있는 것으로 보여지며, subcloning을 통한 기능부위 분석 결과, 4.8-kb 크기의 BglII-KpnI DNA 절편에 BGS2가 존재하는 것으로 추정되었다.

• 대한소아치과학회지
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• 제33권2호
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• pp.304-310
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• 2006

본 연구는 치주질환 주요 병인균주 중의 하나인 P. intermedia를 대상으로 하여, 이 균주에서의 hemin 결합 단백질 유전자를 분리하고 염기서열을 결정하기 위하여 수행되었다. 본 연구에서는 약 5,000개의 recombinant colony들을 스크리닝하여 hemin 결합 단백질 유전자를 포함하고 있는 것으로 여겨지는 1개의 클론(pHem1)을 확인하였다. Restriction enzyme mapping 결과 pHem1의 insert DNA의 크기는 약 2.5kb이었으며 P. intermedia chromosomal DNA 내에는 hemin 결합 단백질 유전자가 single copy로 존재하였고, transcript의 크기는 약 1.8kb이었다. 분리한 pHem1 유전자는 1개의 ORF를 가지고 있으며, ORF의 크기는 2,550bp로 약 850개의 아미노산 폴리펩타이드로 구성되어 있다. 또한, pHem1 유전자는 이미 밟혀진 다른 유전자들과 상동성을 보이지 않았다. 본 연구는 P. intermedia에서의 porphyrin생리 및 hemin 획득기전을 분자생물학적으로 규명하는데 있어 중요한 의의가 있으리라 사료된다. 향후 pHem1 유전자의 특성 분석 등이 수행되어야 할 것으로 여겨진다.

• 생명과학회지
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• 제8권3호
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• pp.348-351
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• 1998

Common DNA fragments of the ${\beta}$-globin gene were observed from six races of the adult common carp: Hybrid-Yamato, Japanese wild type, Mirror, Suwa-Yamato, Scale German, and Saku-Yamato. Chromosomal DNAs isolated from the above six races were digested with restriction endonucleased EcoRI and PstI. The digested fragments were transferred onto nitrocellulose filter and hybridized with a probe of carp ${\beta}$-globin cDNA. Molecular sizes of the hybridized DNA fragments digested with EcoRI were 3.6Kb(Kilo base), 4.3Kb and 15Kb in Hybrid-Yamato, Japanese wild type, Mirror, Scale German and Saku-Yamato carp DNAs. In Scale German and Saku-Yamato carp DNAs, two and one more hybridized DNA fragments were observed, respectively. Molecular sizes of the hybridized DNA fragments digested with PstI were 2.2Kb, 6.5Kb, 7.8Kb and 9.2Kb in Hybrid-Yamato, 2.2Kb, 6.5Kb and 9.2Kb in Japanese wild type, 2.2Kb, 6.5Kb, 7.8Kb, and 13Kb in Mirror, 2,2Kb, 5,5Kb, 6.5Kb, 7.8Kb, 9.2Kb and13Kb in Scale German, and 2.2Kb, 5.5Kb, 6.5Kb, 9.2Kb and Saku-Yamato carp DNA. Therefore, depending on carps, three to six DNA fragments were hybridized with ${\beta}$-globin gene probe. Thus it indicated polymorphysm in the globin gene family of carp.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제22권6호
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• pp.599-606
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• 1994

Bacillus stearothermomophilus, a strong xylan degrader, was confirmed to express multiple esterase activities in addition to the major xylanolytic enzymes. One of the genes encoding the esterases was isolated from the genomic library of B. stearothermophilus constructed with EcoRl restriction endonuclease and pBR322 plasmid. Three recombinant plasmids showing the tributyrin degrading activity were selected from approximately 7, 000 E. coli HB101 transformants, and were found to have the same insert of a 3.2 kb DNA fragment. Restriction mapping and hybridization studies revealed that the gene(estII) on the hybrid plasmid (pKMG7) had originated from the B. stearothermophilus chromosome, and was distinct from the estl, another esterase gene of B. stearothermophilus isolated in the previous work. The E. coli cells harboring pKMG7 produced an acetylxylan esterase that exibited similar substrate specificity to the esterase encoded by the estI gene.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제21권6호
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• pp.542-548
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• 1993

Bacillus stearothermophilus was shown to express multiple xylanolytic enzymes including acetyl xylan esterase. Genomic DNA of the strain partially digested with HindIII was ligated into the HindIII site of pBR322, and expressed in E. coli HB101 cells in order to clone the gene for acetyl xylan esterase. One transformant among 4000 screened formed a clear zone around its colony on the LB agar supplemented with 1.0% tributyrin. The functional clone harbored the recombinant plasmid pKMG5 with an insert of 5.1kb.

• Journal of Periodontal and Implant Science
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• 제37권sup2호
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• pp.339-351
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• 2007

Cytolethal distending toxin(CDT)은 세포 주기 중 G2에서 M 기로의 전환을 막아 세포의 증식을 억제할 수 있는 세균 단백 독소의 일종이다. 구강 미생물 중 유일하게 Actinobacillus actinomycetemcomitans (A. actinomycetemcomitans)만이 이 CDT를 생성 할 수 있는 것으로 알려져 있다. A. actinomycetemcomitans는 localized aggressive periodontitis (LAP)의 원인균으로 여겨지며 비 운동성의 그람 음성 구간균이고 $37^{\circ}C$, 5% $CO_2$ 하에 성장이 왕성하다. A. actinomycetemcomitans의 CDT는 3개의 인접한 유전자인 cdtA, cdtB, cdtC에 의해 형성 되며 각각의 유전자에 대한 단백질의 기능은 아직 완전히 밝혀지지 않았다. 현재까지 연구에 의하면 cdtA는 CDT의 세포부착과 관련이 있는 것으로 여겨지며 이 유전자의 기능 이상 시 CDT의 독성 효과가 현저히 감소한다고 알려져 있다. 따라서 본 연구는 A. actinomycetemcomitans의 cdtA 유전자를 클로닝, 단백질 발현하여 향후 치주질환의 발병 과정에서 CdtA의 역할을 규명하고 질환의 예방 및 치료법에 도움을 주고자 하였다. A. actinomycetemcomitans Y4균주를 cdtA 유전자 클로닝을 위해 사용하였다. A. actinomycetemcomitans의 genomic DNA는 genomic DNA 추출 kit를 사용하여 분리하고 cdtA에 특이적인 primer를 이용하여 PCR을 통해 cdtA 유전자를 증폭하였다. 증폭된 cdtA 유전자를 T-vector에 클로닝 하였으며, 클로닝 된 cdtA 유전자는 단백질 발현을 위해 pRSET Avector에 서브클로닝 한 후 발현 균주인 BL21(DE3)를 이용하여 발현시켰다. 발현 후 Ni-NTA AP conjugate를 이용한 Western blot을 통해 pRSET-CDTA를 확인하였다.

• 한국동물번식학회:학술대회논문집
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• 한국동물번식학회 2002년도 춘계학술발표대회 발표논문초록집
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• pp.64-64
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• 2002

Peroxiredoxins (Prxs) possess protective activity against oxygen radicals generated by thiol-catalyzed oxidative systems. We already reported the genomic structure and its expression of mouse Prx Ⅰ, Ⅱ, and 1-Cys Prx. However, the Prx Ⅲ has not been determined. That was initially defined transiently expressed gene, mouse MER5, of murine erythroleukaemia cell differentiation. In addition, this protein was recently redefined a member of the thiol-specific antioxidant gene family. (omitted)

• 미생물학회지
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• 제49권3호
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• pp.270-274
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• 2013

서양뒤영벌(Bombus terrestris)은 꿀벌의 봉군붕괴증후군(colony collapse disorder)에 대한 대체 화분매개곤충으로서 농업분야에서 중요한 역할을 하고 있다. 최근 서양뒤영벌에서 바이러스, 세균, 응애 등의 여러 병원체와 기생체가 발견되었고, 이들은 서양뒤영벌의 수명과 생식력 등에 영향을 주는 것이 알려져 있다. 서양뒤영벌 야외개체군에서 Nosema spp.를 탐지하기 위해, 서양뒤영벌 성충으로부터 genomic DNA를 추출하여 Nosema spp. 유전자들에 대해 polymerase chain reaction (PCR)을 수행하였다. 이들 유전자 중에서 small subunit ribosomal RNA (SSU rRNA) 유전자만이 증폭되었고, 염기서열분석을 통해 N. ceranae로 확인된 것은 조사된 야외개체군에서 N. ceranae가 서양뒤영벌의 주된 감염체임을 보여준다. Quantitative real-time PCR (qRT-PCR)을 이용하여 SSU rRNA 유전자를 탐지하기 위해, 먼저 PCR을 통해 SSU rRNA 유전자의 2개 영역에 대한 유전자 특이적 증폭을 확인하였다. qRT-PCR을 이용하여 각 개체에서 얻은 genomic DNA의 순차적인 농도희석를 통해 $0.85ng/{\mu}l$ 이하의 genomic DNA 농도에서도 SSU rRNA 유전자가 성공적으로 증폭되는 것이 확인되었다. 이러한 실험 결과, qRT-PCR를 이용한 N. ceranae 특이 유전자 증폭은 서양뒤영벌의 병원체 감염 진단 뿐만 아니라 생태계 위해성 평가에도 활용될 수 있을 것으로 사료된다.