• Journal of Genetic Medicine
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• 제5권1호
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• pp.21-25
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• 2008

목 적 : 최근 여러 국가에서 빠르게 탠덤매스 신생아 선천성 대사이상질환 선별 프로그램을 채택하고 있으며 많은 질환들이 검출되고 있다. 본 기관에서는 2001년 4월부터 탠덤 매스 선천성 대사이상 질환 신생아 선별 검사를 시작하였다. 연구자들은 한국에서의 탠덤매스 선천성 대사이상질환 검출율 및 탠덤매스 유용성에 대해 평가하고자 하였다. 방 법 : 2001년 4월부터 2007년 12월까지 본원에서는 탠덤매스를 이용하여 신생아 및 고위험군에 대해 선별검사를 시행하였다. 검체로부터 아실카르틴과 아미노산을 추출하여 부탄올로 유도체화시킨 후 탠덤매스에 장착하여 분석하였다. 탠덤매스 선별검사 재검, 소변 유기산 및 혈장 아미노산 검사 등을 포함한 확진 검사는 개별적으로 시행되었다. 결 과 : 총 의뢰건수는 284,933건으로 신생아 251,799건 및 고위험군 33,134건이었다. 소환율은 0.4%(1158건)이었으며, 이들 중 true positive는 117건(0.04%)이었다. 아미노산 대사 이상 질환은 총 78건(25/53), 유기산 대사이상 질환은 총 27건(16/11건) 및 지방산 산화대사이상 질환은 총 12건(5/7건)으로 전체 질환에 대한 검출율은 신생아 1:5,000이었으며 전체군 1:2,000이었다. 결 론 : 탠덤매스 신생아 선별검사는 조기 진단 및 치료가 필요한 많은 선천성 대사이상질환의 검출을 용이하게 해주었다. 그러므로, 반드시 모든 신생아들에 대한 국가지원 탠덤매스 선별검사 확대 적용 및 추적관리 시스템이 구축이 필요할 것으로 판단된다.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제5권2호
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• pp.111-118
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• 2008

목 적: 신생아 선별검사는 선천성 대사이상 질환을 조기에 진단하여 심각한 발달 지연이나 급성 질환, 심지어는 사망을 예방할 수 있어 점차 확산되고 있다. 본 연구에서는 우리나라에서 신생아 선별검사에 들어가는 비용과 시행하지 않을 때의 비용을 서로 비교하여 경제성 여부를 알아보고자 하였다. 대상 및 방법: 2005년 1월부터 2007년 12월까지 국내에서 단풍당뇨증, 호모시스틴뇨증, 갈락토스혈증 및 선천성 부신과형성증에 대한 신생아 선별검사를 받은 1,259,220명의 신생아를 대상으로 신생아 선별검사를 시행한 경우와 시행하지 않은 경우에 들어가는 비용을 비교하여 단풍당뇨증, 호모시스틴뇨증, 갈락토스혈증 및 선천성 부신과형성증에 대한 신생아 선별검사의 경제성 여부를 알아보고자 하였다. 결 과: 각 질환별로 신생아 선별 검사를 시행할 때와 시행하지 않을 때의 비용의 비를 분석해보면 단풍당뇨증이 1:0.5, 호모시스틴뇨증이 1:0.6로 낮은 유병률로 인해 검사를 시행하는 것이 손해였으며, 갈락토스혈증이 1:4.1, 선천성 부신과형성증이 1:2.9로 이득을 보여 전체적으로는 신생아 선별검사를 시행했을 때 총 2.0배의 이득이 있었다. 결 론: 단풍당뇨증, 호모시스틴뇨증, 갈락토스혈증, 선천성 부신과형성증에 대한 신생아 선별검사는 경제적 효용성 뿐만 아니라 개인의 삶의 질 향상을 위해서도 시행해야 하며 앞으로 윌슨병 등의 다른 유전성 대사질환에 대해서도 신생아 선별검사 시행을 고려해야 할 것이다.

• 한국환경생태학회지
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• 제17권2호
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• pp.169-176
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• 2003

RAPD를 이용하여 국내에 생육하는 4종의 자생 민들레와 2종의 귀화 민들레 종간의 유전적인 유연관계를 분석하였다 Primer Screening을 통해 선발된 30개의 Primer를 이용하여 RAPD를 행한 결과, Polymorphic band 수는 141개로 나타나 민들레 종간의 유전적인 차이 분석이 가능하였다. Primer OPC12, OPD16, OPK16, OPK17, OPK20, OPSI에서는 각 종마다. 특정 밴드가 있는 것으로 조사되었다. 특히 OPS8에서는 564bp에서 귀화종인 서양민들레 종에서만 특이 밴드가 나타났다. RAPD분석결과 자생종과 귀화종 민들레들은 명확히 2군으로 구분되었다. 1군에는 서양민들레. 붉은씨서양민들레 등의 귀화종 그룹이었으며, II군은 민들레, 산민들레, 좀민들레, 횐민들레 등의 자생종 민들레 그룹으로 나뉘어졌다. Bootstrap 방법으로 6종의 유연관계를 분석한 결과도 비유사계수를 통한 방법으로 분석한 결과와 매우 유사하였다 우리 나라에서 자생하는 민들레속 6종의 주요형질을 조사한 결과 I군에 속하는 민들레류는 II군에 속한 종들에 비해 개화일수가 길고, 외총포편의 방향이 다르며 털의 유무 또한 다른 특징이 있었다. ll군에 속하는 횐민들레는 다른 민들레종과는 화색에서 확연한 차이를 보였으며 자생종들 속에서도 잎의 방향과 발아의 생리적 특성 등 유전적으로 여러 다른 점이 복합적으로 작용함으로서 II군내에서도 유전적 거리가 가장 먼 것으로 나타났다.

• 과학기술학연구
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• 제1권2호
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• pp.343-369
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• 2001

생명공학의 사회적 함의에 대한 논의를 위해서는 일반 시민의 인식과 형성과정에 대해 파악할 필요가 있다. 이에 따라 생명공학에 대한 ELSI (Ethical, Legal and Social Implications) 연구의 일환으로 필자는 생명공학에 대한 사회적 인식의 지형을 정기적으로 조사하는 프로젝트를 시작하였다. 본 논문은 이 조사 프로젝트의 한 부분으로 생명공학에 대한 인지도 수준과 태도를 파악하고 관련 요인을 찾아보았다. 인식조사는 전국 성인남녀 500명을 대상으로 전화면접방법을 이용하여 이루어졌으며, 표본은 유층표집방법을 이용하여 추출하였다. 조사결과 의료 관련 생명공학에 대해서는 긍정적인 태도가 많았지만, 유전정보의 사회적 관리 및 유전자 변형식품에 대해서는 부정적 태도가 긍정적 태도와 비슷한 수준이거나 아니면 더 많았다. 그리고 인지도 수준이 높을수록 태도가 더 명확하였다. 또한 이러한 시민들의 태도는 아직 잠정적인 느낌 수준인 경우가 많으며, 매스미디어의 영향을 많이 받은 것으로 나타났다. 이러한 연구결과는 생명공학에 대한 사회적 함의에 대한 논의가 보다 건설적이기 위해서는 우선 생명공학에 대한 정보의 생산과 유통이 보다 활성화될 필요가 있다는 것을 보여준다.

• Interdisciplinary Bio Central
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• 제3권1호
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• pp.3.1-3.16
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• 2011

Investigation of the genetic functions in complex biological systems is a challenging step in recent year. Hence, several valuable and interesting research projects have been developed with novel ideas to find out the unknown functions of genes or proteins. To validate the applicability of their novel ideas, various approaches are built up. To date, the most promising and commonly used approach for discovering the target proteins from biological system using small molecule is well known a forward chemical genetics which is considered to be more convenient than the classical genetics. Although, the forward chemical genetics consists of the three basic components, the target identification is the most challenging step to chemical biology researchers. Hence, the diverse target identification methods have been developed and adopted to disclose the small molecule bound protein. Herein, in this review, we briefly described the first two parts chemical toolbox and screening, and then the target identifications in forward chemical genetics are thoroughly described along with the illustrative real example case study. In the tabular form, the different biological active small molecules which are the successful examples of target identifications are accounted in this research review.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권3호
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• pp.1687-1689
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• 2013

We performed a case-control study to investigate whether SNPs of CHIP might affect the development of IA in Chinese Han nationality. We believe we are the first to have screened IA patients for mutations in the CHIP gene to determine the association with these variants. The study group comprised 224 Chinese Han nationality patients with at least one intracranial aneurysm and 238 unrelated healthy Han nationality controls. Genomic DNA was isolated from blood leukocytes. The entire coding regions of CHIP were genotyped by PCR amplification and DNA sequencing. Differences in genotype and allele frequencies between patients and controls were tested by the chi-square method. Genotype and allele frequencies of the SNP rs116166850 was demonstrated to be in Hardy-Weinberg equilibrium. No significant difference in genotype or allele frequencies between case and control groups was detected at the SNP. Our data do not support the hypothesis of a major role for the CHIP gene in IA development in the Chinese Han population.

• 대한의생명과학회지
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• 제2권2호
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• pp.231-240
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• 1996

인체 혈액 응고 9인자는 간에서 생성되며 461개의 아미노산으로 구성된 당 단백질이다. 따라서 인체 혈액 응고 9인자 cDNA를 찾기 위해 태아의 간(fetal liver) cDNA library를 PCR(Polymerase Chain reaction) 방법으로 screening하였으며, 그 결과 ATG개시 코돈으로부터 TAA종료 코돈까지 포함하는 1.4 kb의 9인자 cDNA를 찾았다. 또한 클론된 9인자 cDNA를 박테리아에서 발현시키기 위해 박테리아 발현 벡터인 pGEX-2T 플라스미드에 클로닝하므로써 pGEX-F9 플라스미드를 제조하였다. pGEX-F9로 형질전환된 E. coli에서 PGEX-F9의 발현을 유도하면 73 kDa 크기의 GST-factor9 융합 단백질이 다량생성되며 , 이 단백질이 혈액 응고 9인자 단백질을 함유하는 융합 단잭질임을 혈액 응고 9인자 항체를 이용한 Western blot으로 입증하였다. E. coli에서 발현된 GST-factor 9 융합 단백질은 전체 단백질의 약 20%를 차지하며 GST agarose bead를 이용한 one step purificarion 방법을 통해 GST-factor9 융합 단백질을 쉽게 분리 할 수 있다.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제11권1호
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• pp.22-26
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• 2014

Maple syrup urine disease (MSUD) is a disorder that involves the metabolism of branched chain amino acids, arising from a defect in branched-chain ${\alpha}$-keto acid dehydrogenase complex. Mutations have been identified in the BCKDHA, BCKDHB, or DBT genes, which encode different subunits of the BCKDH complex. Although encephalopathy and progressive neurodegeneration are its major manifestations, the severity of the disease may range from the severe classic type to milder intermediate variants. We report two Korean siblings with the milder intermediate MSUD who were diagnosed with MSUD by a combination of newborn screening tests using tandem mass spectrometry and family genetic screening for MSUD. At diagnosis, the patients' plasma levels were elevated for leucine, isoleucine, valine, and alloisoleucine, and branched-chain ${\alpha}$-keto acids and branched-chain ${\alpha}$-hydroxy acids were detected in their urine. BCKDHA, BCKDHB, and DBT analysis was performed, and two novel mutations were identified in BCKDHB. Our patients were thought to have the milder intermediate variant of MSUD, rather than the classic form. Although MSUD is a typical metabolic disease with poor prognosis, better outcomes can be expected if early diagnosis and prompt management are provided, particularly for milder forms of the disease.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제17권3호
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• pp.1539-1546
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• 2016

Specific patterns of the hereditary breast and ovarian cancer (HBOC) syndrome are related to mutations in the BRCA1 gene. One hundred unrelated breast cancer patients were interviewed to obtain clinical symptoms and signs, pedigree and familial history of HBOC syndrome related cancer. Subsequently, data were calculated using the Breast and Ovarian Analysis of Disease Incidence and Carrier Estimation Algorithm (BOADICEA) risk prediction model. Patients with high score of BOADICEA were offered genetic testing. Eleven patients with high score of BOADICEA, 2 patients with low score of BOADICEA, 2 patient's family members and 15 controls underwent BRCA1 genetic testing. Mutation screening using PCR-HRM was carried out in 22 exons (41 amplicons) of BRCA1 gene. Sanger sequencing was subjected in all samples with aberrant graph. This study identified 10 variants in the BRCA1 gene, consisting of 6 missense mutations (c.1480C>A, c.2612C>T, c.2566T>C, c.3113A>G, c.3548 A>G, c.4837 A>G), 3 synonymous mutations (c.2082 C>T, c.2311 T>C and c.4308T>C) and one intronic mutation (c.134+35 G>T). All variants tend to be polymorphisms and unclassified variants. However, no known pathogenic mutations were found.

• Molecules and Cells
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• 제40권10호
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• pp.787-795
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• 2017

Avoiding ingestion of excessively salty food is essential for cation homeostasis that underlies various physiological processes in organisms. The molecular and cellular basis of the aversive salt taste, however, remains elusive. Through a behavioral reverse genetic screening, we discover that feeding suppression by $Na^+$-rich food requires Ionotropic Receptor 76b (Ir76b) in Drosophila labellar gustatory receptor neurons (GRNs). Concentrated sodium solutions with various anions caused feeding suppression dependent on Ir76b. Feeding aversion to caffeine and high concentrations of divalent cations and sorbitol was unimpaired in Ir76b-deficient animals, indicating sensory specificity of Ir76b-dependent $Na^+$ detection and the irrelevance of hyperosmolarity-driven mechanosensation to Ir76b-mediated feeding aversion. Ir76b-dependent $Na^+$-sensing GRNs in both L- and s-bristles are required for repulsion as opposed to the previous report where the L-bristle GRNs direct only low-$Na^+$ attraction. Our work extends the physiological implications of Ir76b from low-$Na^+$ attraction to high-$Na^+$ aversion, prompting further investigation of the physiological mechanisms that modulate two competing components of $Na^+$-evoked gustation coded in heterogeneous Ir76b-positive GRNs.