• 제목/요약/키워드: Genetic parameters and carcass traits

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Estimates of Genetic Correlations between Production and Semen Traits in Boar

  • Oh, S.H.;See, M.T.;Long, T.E.;Galvin, J.M.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제19권2호
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    • pp.160-164
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    • 2006
  • Currently, boars selected for commercial use as AI sires are evaluated on grow-finish performance and carcass characteristics. If AI sires were also evaluated and selected on semen production, it may be possible to reduce the number of boars required to service sows, thereby improving the productivity and profitability of the boar stud. The objective of this study was to estimate genetic correlations between production and semen traits in the boar: average daily gain (ADG), backfat thickness (BF) and muscle depth (MD) as production traits, and total sperm cells (TSC), total concentration (TC), volume collected (SV), number of extended doses (ND), and acceptance rate of ejaculates (AR) as semen traits. Semen collection records and performance data for 843 boars and two generations of pedigree data were provided by Smithfield Premium Genetics. Backfat thickness and MD were measured by real-time ultrasound. Genetic parameters were estimated from five four-trait and one five-trait animal models using MTDFREML. Average heritability estimates were 0.39 for ADG, 0.32 for BF, 0.15 for MD, and repeatability estimates were 0.38 for SV, 0.37 for TSC, 0.09 for TC, 0.39 for ND, and 0.16 for AR. Semen traits showed a strong negative genetic correlation with MD and positive genetic correlation with BF. Genetic correlations between semen traits and ADG were low. Therefore, current AI boar selection practices may be having a detrimental effect on semen production.

한우의 도체형질 유전모수 추정을 위한 REML과 Bayesian via Gibbs Sampling 방법의 비교 연구 (Comparison between REML and Bayesian via Gibbs Sampling Algorithm with a Mixed Animal Model to Estimate Genetic Parameters for Carcass Traits in Hanwoo(Korean Native Cattle))

  • 노승희;김병우;김효선;민희식;윤호백;이득환;전진태;이정규
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권5호
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    • pp.719-728
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    • 2004
  • 본 연구는 한우의 도체형질들에 대한 유전적 변이를 분석방법에 따라 어떠한 차이가 있는지를 알아보고자 한우 후대검정자료를 이용하여 분석하였다. 분석에 이용된 도체성적 관련 자료는 가축개량사업소와 한우개량단지에서 1996 년부터 2001 년까지 태어난 후대검정우 1526두로부터 조사었다. 한우에 있어서 주요 개량형질인 육량과 육질에 영향하는 도체중, 도체율,배최장근단면적, 등지방두께, 근내지방도를 대상으로 유전력과 유전상관을 추정하였다. 유전모수 추정에 있어서 REML 분석법과 Bayesian추론방법으로써 Gibbs Sampling 분석법을 사용하였는데 각각의 모수들에 대한 Gibbs Sampler는 100,000회 실시하였고 초기 1,000회는 모수의 사후분포에 대한 부정확성으로 간주하여 모수의 사후분포특성 규명에서 제외하였다. 각각의 형질들에 대한 유전변이는 이러한 두 가지 분석방법을 상호 비교 함으로써 최적의 통계분석 방법을 모색하였다. 도체형질에 대한 유전력 추정은 REML 방법을 통한 추정에서는 근내지방도가 0.51로 고도의 유전력을 보였고, 도체율이 0.25로 중도의 유전력이 추정되었다. Gibbs Sampling 방법을통한 추정에서도 근내지방도가 0.54로 고도의 유전력을 도체율에서 0.25로 중도의 유전력을 보였다. REML 분석방법과 Gibbs Sampling 분석방법에서의 유전력은 다소 큰 차이는 보이지 않았으나, 대체로 Gibbs Sampling 방법으로 분석한 유전력 추정치가 높게 추정되었다. 그리고, 유전상관분석에서는 REML 방법을 통한 분석에서 도체중과 배최장근단면적에서 0.651 로 높은 정의 유전상관을 나타내었고, 배최장근단면적과 등지방두께에서 -0.139로 부의 유천상관을 나타내었다. Gibbs Sampling 방법에서는 도체중과 도체율, 배최장근단면적에서 각각 0.814, 0.695으로 높은 정의 상관을 나타내었고, 배최장근단면적과 등지방두께에서 -0.126으로 부의상관을 나타내었다. Gibbs Sampling방법을 통한 분석에서 특정 형질간 유전상관이 높게 나타났으며, 다소 큰 차이를 보이지 않았다. REML 분석방법과 Bayesian Inference를 바탕으로 한 Gibbs Sampling 분석에서 모수 추정은 큰 차이를 보이지 않았다. 따라서 방대한 현장정보를 활용하여 보다 정확한 모수 추정을 수행하기 위해서는 분석모형에 대한 계수행렬의 역행렬 계산을 통한 REML 방법의 한계성을 극복할 수 있는 방법으로써 Gibbs Sampling 분석 방법이 가능할 것으로 사료된다.

비거세 한우 집단에 있어 성장형질과 도체형질에 대한 유전모수의 추정 (Estimation of Genetic Parameters for Growth and Carcass Traits in Hanwoo Bull Populations)

  • 박철진;박영일
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제45권1호
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    • pp.23-32
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    • 2003
  • 본 연구는 농협중앙회 가축개량사업소와 한우개량단지에서 생산된 비거세 한우 숫소 3,415두의 자료를 이용하여 성장형질과 도체형질에 대한 유전모수를 추정하기 위하여 실시하였다. 본 연구에 이용된 한우 집단은 상반기와 하반기의 두 집단으로 구분하였는데 상반기 집단은 1986년부터 1990년까지 생산된 숫소 1,592두로서 6개월에 검정개시하여 18개월에 종료하였고, 단방식 우사에서 개체관리를 하였다. 하반기 집단은 1991년부터 1996년까지 출생한 1,823두로 10개월에 검정개시하여 22개월에 종료하였고, 군사식 우사에서 사양관리 하였다. 6-12개월과 12-18개월 일당증체량은 상반기 집단의 경우 1.01kg과 0.77kg이였고, 하반기 집단은 0.80kg과 0.95kg으로 하반기 집단에서 보상성장이 일어난 것으로 사료된다. 12개월 및 18개월 체중의 유전력은 상반기 집단의 경우 0.37 및 0.29이었고, 하반기 집단은 0.47 및 0.33이었으며, 6${\sim}$12개월 및 12${\sim}$18개월 일당증체량의 유전력은 상반기 집단에서 0.26 및 0.11이었고, 하반기 집단은 0.33 및 0.22으로 이들 형질의 유전력은 하반기에서 높았다. 상반기 집단의 12개월령 체고, 십자부고, 곤폭 및 흉위에 대한 유전력은 각각 0.30, 0.25, 0.11 및 0.13이었으며, 하반기의 경우 각각 0.53, 0.44, 0.36 및 0.56이었다. 상반기 집단의 18개월령 체고, 십자부고, 곤폭 및 흉위의 유전력은 각각 0.40, 0.22, 0.12 및 0.21이었고, 하반기의 경우 각각 0.45, 0.42, 0.42 및 0.35이었다. 상반기 집단의 냉도체중, 도체율, 배최장근단면적, 등지방두께 및 도체장에 대한 유전력은 각각 0.11, 0.24, 0.25, 0.18 및 0.21이었고, 하반기 집단의 경우 각각 0.32, 0.52, 0.33, 0.51 및 0.58이었으며, 근내지방도의 유전력은 0.31이었다. 상 하반기간 유전상관의 추정치는 12개월 흉위, 18개월 십자부고, 도체중 및 도체율의 경우 0.8 이상이었으나 다른 형질에서의 추정치는 이보다 낮았다.

한우 거세우의 도체형질에 대한 유전모수 추정 (Genetic Parameter Estimation of Carcass Traits of Hanwoo Steers)

  • 황정미;김시동;최연호;윤호백;박철진
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제50권5호
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    • pp.613-620
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    • 2008
  • 본 연구에서는 국가단위 한우 유전능력평가에 적용하고 있는 유전력이 적절한지를 검토하기 위하여 그간의 검정자료를 활용하여 유전모수를 추정하였으며, 향후 보증씨수소 선발지수의 개선 등을 위하여 다형질 개체모형을 활용하기 위한 기초자료로 다형질 모형을 적용하여 도체형질간 유전상관을 추정하였다. 연구결과 도체형질의 유전모수 추정치는 단형질과 다형질에서 매우 유사한 유전력을 나타냈으며 그간 연구자들이 보고한 유전력 범위 안에 있는 것으로 나타나, 아직까지는 국가단위 한우유전능력평가에 적용하고 있는 유전력을 변경할 필요는 없는 것으로 나타났다. 다만, 본 연구에서 추정한 형질 중 근내지방도 형질의 유전력이 그간 추정한 값보다 낮게 추정된 것은 근내지방도판정기준이 변경되어 기존의 1~7등급이 1~9등급체계로 변경한 문제와 8, 9등급을 7등급으로 조정하여 분석한 것에 의한 것일 수도 있을 것으로 보여 근내지방도를 변경 전과 변경 후를 다른 형질로 보아 다형질 분석을 실시하는 등 추가연구가 필요한 것으로 보인다. 한편, 도체중과 배장근단면적 간의 유전상관이 0.63으로 추정되어 현 보증씨수소 선발지수에 포함된 두 형질 중 어느 한 형질은 제거하여도 될 것으로 나타났으며, 현재와 같이 단형질 모형으로 추정한 육종가를 이용하여 선발지수를 구성할 경우 형질간의 유전상관이 고려되지 못하여 선발이 목표와 다르게 이루어질 수 있으므로 다형질 모형을 적용하여 육종가를 추정하고 이를 선발지수에 적용하는 것이 바람직할 것으로 사료된다. 또한 당대검정에서 1차 선발한 가축의 자손에 대하여 능력검정을 실시하는 체계에서는 선택된 자료만 활용하게 되므로 유전모수 추정에 영향을 미칠 수 있으므로 당대검정과 후대검정자료를 동시에 활용하여 유전모수를 추정하는 등에 대한 추가 연구가 필요한 것으로 사료된다.

Sire-maternal Grandsire Model and Sire Model in Estimation of Genetic Parameters for Average Daily Gain and Carcass Traits of Japanese Black Cattle

  • Kim, Jong-Bok;Lee, Chaeyoung;Tsuyuki, Tsutomu;Shimogiri, Takeshi;Okamoto, Shin;Maeda, Yoshizane
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제19권12호
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    • pp.1678-1684
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    • 2006
  • The objectives of this study were to estimate genetic parameters and sire breeding values for average daily gain (ADG) and carcass traits using sire-maternal grandsire model with REML approach, sire model with REML approach, sire model without relationships among sires and with REML and ANOVA approach, and to investigate advantages and disadvantages of these methods. Data were collected from 42,325 Japanese Black steers and heifers finished and slaughtered from 1991 to 2004. Traits analyzed in this study were average daily gain (ADG) during the fattening period, live weight at slaughter (LW), cold carcass weight (CW), estimated lean yield percentage (LYE), longissimus muscle area (LMA), subcutaneous fat thickness (SFT), rib thickness (RT), and marbling score (BMS). Bivariate analyses were also performed to obtain genetic and phenotypic correlation coefficients among traits. Estimated breeding values were obtained from each model, and simple and rank correlations among breeding values from each model were calculated. Estimates of heritability using the four models ranged from 0.25 to 0.31 in ADG, from 0.21 to 0.24 in LW, from 0.23 to 0.27 in CW, from 0.10 to 0.17 in DP, from 0.40 to 0.42 in LYE, from 0.19 to 0.31 in LMA, from 0.31 to 0.34 in SFT, from 0.26 to 0.33 in RT, and from 0.18 to 0.44 in BMS. The differences in heritability estimates using the four models seemed to be feasible in ADG, CW, DP, LMA, RT, and BMS. Genetic correlation coefficients of ADG with CW, SFT, RT and BMS were moderate to high and positive while the genetic correlation coefficients between ADG and LYE was low and negative. Correlation coefficients of BMS with SFT were negligible for both genetic and phenotypic correlations. The correlations of estimates evaluated from sire models with those from sire-maternal grandsire model were not large enough to convincing that breeding values using a sire model were corresponding to those using a sire-maternal grand sire model. If information of maternal grand sires are not available, the sire model with incomplete pedigree information included only sire of sire (Model 2) is optimal among the sire models evaluated in this study.

한우의 이유시 체중과 도체형질과의 유전적 관계 (Genetic Relationship Between Weaning Weight and Carcass Traits in Hanwoo)

  • 황정미;최재관;김형철;최연호;이채영;양부근;신종서;김종복
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제49권2호
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    • pp.177-182
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    • 2007
  • 본 연구는 한우에서 이유시 체중과 도체형질들 간의 상관관계를 구명하고자 실시하였다. 조사된 도체 형질은 배최장근 단면적, 등지방두께, 21단계로 구분하여 평가한 근내지방도(근내지방도 I)와 7단계로 구분하여 평가한 근내지방도(근내지방도 II), 그리고 7단계로 구분하여 평가한 육색 등이었다. 유전모수의 추정은 DFREML 방법을 적용하여 실시하였는데 이유시 체중에 대한 통계모형은 동기우 그룹효과(년도-계절-성) 외에 이유시 송아지 일령 및 어미소 일령의 1차식 효과와 2차식 효과를 고정효과로 포함하였고 개체효과를 임의효과로 포함하였다. 도체형질에 대한 통계 모형은 동기우 그룹효과(년도-계절-성) 외에 도축시 일령의 일차식 효과를 고정효과에 포함하였고 개체효과를 임의효과로 포함하였다. 조사된 형질별 유전력 추정치는 이유시 체중이 0.25, 배최장근 단면적이 0.20, 등지방두께가 0.20, 근내지방도Ⅰ이 0.32, 근내지방도 Ⅱ가 0.32 그리고 육색이 0.22였다. 이유시 체중과 배최장근 단면적, 등지방두께, 근내지방도 I, 근내지방도 II 및 육색 간의 유전(표현형) 상관계수는 각각 0.75(0.16), 0.18(0.05), -0.41(-0.09), -0.40(0.11) 및 -0.07(0.05)였다. 본 연구 결과는 이유시 체중이 무거운 방향으로 단형질 선발을 진행할 경우 등심단면적이 넓어지고, 등지방두께가 두꺼워지며 근내지방도가 감소하는 도체를 생산하는 후손집단이 형성될 가능성이 있음을 시사하고 있다.

한우의 초음파 측정 형질과 도체 형질의 유전모수 추정 (Estimation of Genetic Parameters for Ultrasound and Carcass Traits in Hanwoo)

  • 김형철;이승환;당창권;전기준;연성흠;조영무;이상민;양보석;김종복
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제54권5호
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    • pp.331-336
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    • 2012
  • 본 연구는 한우 번식우와 거세우의 도체형질과 초음파 측정형질의 유전모수를 추정하여 도체형질과 초음파 측정형질 간의 관계를 알아보기 위하여 실시하였다. 한우 암소에 있어서 초음파 등지방두께의 유전력은 0.43이었고, 초음파 등심단면적의 유전력은 0.23 그리고 초음파 근내지방도는 0.32이었다. 한편, 한우 암소 도체형질의 유전력은 등지방두께는 0.33, 등심단면적이 0.13 그리고 근내지방도는 0.33으로 분석되었다. 한우 암소에 있어서 초음파 측정 형질 간 유전상관은 초음파 등지방두께: 초음파 등심단면적에서 -0.19, 초음파 등지방두께: 초음파 근내지방도는 -0.61이었고, 초음파 등심단면적: 초음파 근내지방도는 -0.36으로 각 형질 간 부의 유전상관을 보였다. 표현형상관에 있어서는 초음파 등지방두께: 초음파 등심단면적에서 0.03, 초음파 등지방두께: 초음파 근내지방도는 0.13이었고, 초음파 등심단면적: 초음파 근내지방도는 0.26으로 분석되었다. 한우 암소에 있어서 초음파 측정 형질과 실제 도체형질 간 유전상관은 등지방두께 0.97, 등심단면적 0.94 그리고 근내지방도 0.92로 매우 높은 정 (+)의 상관을 나타내었고, 초음파 측정형질과 실제도체형질 간 표현형상관에 있어서도 등지방두께 0.90, 등심단면적 0.86 그리고 근내지방도 0.81로 높은 정 (+)의 상관계수가 추정되었다. 그리고 암소에서 나타나는 이러한 결과는 거세우 자료에서나 암소와 거세우를 통합한 자료에서도 일관되게 나타나고 있다. 본 연구에서 초음파 측정치와 실제 도체에서 측정한 값 들 사이에 유전적으로나 표현형적으로 높은 수준의 정 (+) 상관이 존재하는 본 연구 결과는 육질 개량을 위한 간접 선발의 도구로 초음파 측정 자료를 활용하는 것이 가능할 것이며 한우의 도축 결과를 상당히 정확한 수준으로 예측하는 것이 가능하므로 사양관리 측면에서도 큰 활용 가치가 있을 것으로 판단한다.

Development of an Integrated General Model (IGM) System for Comparison of Genetic Gains from Different Bull Selection Strategies for Korean Brown Cattle (Hanwoo)

  • Lee, Jeong-Soo;Kim, Hee-Bal;Kim, Si-Dong
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제24권11호
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    • pp.1483-1503
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    • 2011
  • To advance the effectiveness of the current Hanwoo improvement system, we developed a general simulation that compared a series of breeding schemes under realistic user circumstances. We call this system the Integrated General Model (IGM) and it allows users to control the breeding schemes and selection methods by manipulating the input parameters. The Current Hanwoo Performance and Progeny Test (CHPPT) scheme was simulated with a Modified Hanwoo Performance and Progeny Test (MHPPT) scheme using a Hanwoo Breeding Farm cow population of the Livestock Improvement Main Center (LOMC) of the National Agricultural Cooperatives Federation (NACF). To compare the two schemes, a new method, the Simple Hanwoo Performance Test (SHPT), which uses ultrasound technology for measuring the carcass traits of live animals, was developed. These three models, including the CHPPT, incorporated three types of selection criteria: phenotype (PH), true breeding value (TBV), and estimated breeding value (EBV). The simulation was scheduled to mimic an actual Hanwoo breeding program; thus, the simulation was run to include the years 1983-2020 for each breeding method and was replicated 10 times. The parameters for simulation were derived from the literature. Approximately 642,000 animals were simulated per replication for the CHPPT scheme; 129,000 animals were simulated for the MHPPT scheme and 112,000 animals for the SHPT scheme. Throughout the 38-year simulation, all estimated parameters of each simulated population, regardless of population size, showed results similar to the input parameters. The deviations between input and output values for the parameters in the large populations were statistically acceptable. In this study, we integrated three simulated models, including the CHPPT, in an attempt to achieve the greatest genetic gains within major economic traits including body weight at 12 months of age (BW12), body weight at 24 months of age (BW24), average daily gain from 6 to 12 months (ADG), carcass weight (CWT), carcass longissimus muscle area (CLMA), carcass marbling score (CMS), ultrasound scanned longissimus muscle area (ULMA), and ultrasound scanned marbling score (UMS).

거세한우의 도체형질에 대한 유전모수 추정 (Estimation of Genetic Parameters for Carcass Traits in Hanwoo Steer)

  • 윤호백;김시동;나승환;장은미;이학교;전광주;이득환
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제44권4호
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    • pp.383-390
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    • 2002
  • 1998년도부터 2001년도까지 실시한 한우 후대검정에서 공시된 후보종모우들에 대한 근친도를 조사해 본 결과, 대부분의 종모우들은 근친되지 않고 있어 한우 종모우 집단은 아직 non-inbred 집단으로 간주해도 무방할 것으로 사료되었다. 하지만 많은 개체들간에 혈연관계가 있는 것으로 조사되어 앞으로 근친도가 크게 상향될 것으로 예상되기 때문에 농가에서 보다 계획적인 정액 선택을 통한 교배가 권장된다. 또한 거세 검정우 1262두로부터 조사된 도체성적들에 대한 유전모수를 선형모형하에서 REML 방법으로 추정된 결과와 근내지방도를 범주형자료로 간주하여 Gibbs sampling 방법으로 추정한 결과, 기존의 비거세우를 대상으로 추정한 결과 보다 다소 높게 추정되었으며 GS방법에 의한 추정치가 REML 방법에 의한 추정치보다 높게 추정되었다. 특히 근내지방도에 대한 유전력 추정치는 GS방법에서 0.74으로 아주 고도의 유전력을 갖는 것으로 추정되어 근내지방도에 대한 개량의 용이함을 제시하였다. 또한 근내지방도와 등지방두께 간에는 0.46의 유전상관을 갖는 것으로 추정되었으며 근내지방도와 출하시 체중간에는 -0.44의 부의상관을 갖는 것으로 추정되었다. 반면에 도체율과 근내지방도간에는 -0.72의 강한 부의상관을 갖는 것으로 추정되었는데 도체율에 대한 변이가 상당히 낮은 변이계수를 고려할 때 추정치에 대한 신뢰도가 낮을 것으로 예상되었다. 종모우의 육종가에 대한 추정방법간의 상관은 다소 낮을 것으로 예상되기 때문에 이에 대한 연구가 필요할 것으로 사료된다.

Phenotypic and Genetic Parameters for Inosine Acid in Relation to Carcass and Meat Quality Traits in Pigs

  • Jiang, X.P.;Liu, G.Q.;Xiong, Y.Z.;Ding, J.T.;Xie, K.Z.;Zhang, J.Q.;Zuo, B.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제16권2호
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    • pp.257-260
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    • 2003
  • A total of 135 F2 finishing pigs (65 barrows and 69 gilts) from resource population (Large White${\times}$Meishan) were slaughtered at about 87.8 kg BW. Contents of inosine acid (IMP) and carnine (HR) in muscle were assayed by HLPC and genetic parameters for IMP content and HR content were estimated using full sibs model. There was significant sex effect on IMP content(p<0.05), $3.561{\pm}0.077mg/g$ for gilt and $3.287{\pm}0.085mg/g$ for barrow. Heritability estimates for IMP and HR content were 0.127 and 0.357, respectively. The phenotypic correlation between IMP content and HR was 0.335, pH (A) 0.024, water lose rate (WLR) -0.069, intramuscular fat (IMF) -0.214, average marbling score (MARB) -0.143, average backfat measurements (AVBF) -0.084 and average color value (CV) -0.156, respectively. The result indicated that inosine acid content in meat might be retained or slightly improved by reducing backfat depth in pig breeding.