• 제목/요약/키워드: Genetic fragmentation

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Evaluation of Beef Carcass and Palatability Traits and Prediction of Tenderness in A Cross of Bos Indicus × Bos Taurus Cattle

  • Kim, Jong Joo;Taylor, Jerry
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제14권11호
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    • pp.1621-1627
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    • 2001
  • Steers and heifers (N=490) were produced between 1991 and 1996 by reciprocal fiillsib backcross and $F_1$ crosses from Angus and Brahman to compare characteristics of carcass and palatability traits between Bos indicus and Bos taurus inheritance. Carcasses of 3/4Angus were heavier, fatter (p<0.05), more tender and higher in other palatability attributes (p<0.01) than those of 3/4Brahman. Reciprocal effects of parental cross breeds were found on some traits. Within 3/4Brahman inheritance group, Brahman sired progeny produced heavier and fatter carcasses with better palatability (p<0.05) than progeny with Brahman as a dam breed. Estimates of heritability were intermediate to high in most carcass and palatability traits. Genetic correlations of tenderness with marbling score (MARB), sarcomere length (SARC), fragmentation index (FRAG) and calpastatin activity (CALP) were moderate to high, suggesting potential use of the tenderness-influencing factors as indirect selection criteria to improve palatability attributes. MARB and SARC that were best predictors of tenderness explained 3.07 to 5.85% and 4.32 to 8.24% of variation in tenderness, respectively. However, there was no tenderness-influencing factor to dominantly explain large portion of variation in tenderness.

SIFamide and SIFamide Receptor Define a Novel Neuropeptide Signaling to Promote Sleep in Drosophila

  • Park, Sangjin;Sonn, Jun Young;Oh, Yangkyun;Lim, Chunghun;Choe, Joonho
    • Molecules and Cells
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    • 제37권4호
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    • pp.295-301
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    • 2014
  • SIFamide receptor (SIFR) is a Drosophila G protein-coupled receptor for the neuropeptide SIFamide (SIFa). Although the sequence and spatial expression of SIFa are evolutionarily conserved among insect species, the physiological function of SIFa/SIFR signaling remains elusive. Here, we provide genetic evidence that SIFa and SIFR promote sleep in Drosophila. Either genetic ablation of SIFa-expressing neurons in the pars intercerebralis (PI) or pan-neuronal depletion of SIFa expression shortened baseline sleep and reduced sleep-bout length, suggesting that it caused sleep fragmentation. Consistently, RNA interference-mediated knockdown of SIFR expression caused short sleep phenotypes as observed in SIFa-ablated or depleted flies. Using a panel of neuron-specific Gal4 drivers, we further mapped SIFR effects to subsets of PI neurons. Taken together, these results reveal a novel physiological role of the neuropeptide SIFa/SIFR pathway to regulate sleep through sleep-promoting neural circuits in the PI of adult fly brains.

Study on the In-vitro Culture Method for Normal Embryonic Cell Development of Porcine Parthenogenetic Embryos

  • Jung, Na-Hyeon;Kim, Sang-Hwan;Kim, Dae-Seung;Yoon, Jong-Taek
    • 한국동물생명공학회지
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    • 제35권1호
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    • pp.94-101
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    • 2020
  • In the early development of parthenogenetic embryo, cytoplasm and nucleic acid fragmentation may be a cause of lower embryo development. The purpose of this study was to evaluate whether embryonic development and apoptosis factors can be reduced by controlling the in-vitro culture environment by the addition of hormones, pregnancy serum and uterine milk. Our study showed that the activity of Casp-3 increased within the cytoplasm when artificially used hormones to induce the incubation environment, and PCNA's manifestation was low. However, the addition of pregnant serum appeared to lower the Casp-3 activity compared to the other groups. In addition, MMP-9 activity was increased and early embryo development and cytoplasmic fidelity were also increased. Therefore, the results of the present study showed that the use of gestational serum in the development of parthenogenetic embryo inhibit apoptosis and increases cytoplasmic reorganization by natural environmental control in in vitro culture.

알로자임을 이용한 청각의 유전적 다양성과 집단구조 (Genetic Diversity and Population Structure of Codium fragile (SURINGAR) HARlOT in Korea Using Allozymes)

  • 이복규;박소혜;허윤성;주무열;최주수;허만규
    • 생명과학회지
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    • 제16권2호
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    • pp.213-218
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    • 2006
  • 알로자임 분석을 이용하여 청각의 유전적 다양성과 집단구조를 분석하였다. 이 종은 한국내 생태적, 경제적 중요한 자원이지만 유전적 분석이 수행되지 않았다. 전분 젤 전기영동으로 이 종의 한국내 네 집단에 대해 알로자임 변이와 유전 구조를 조사하였다. 15개 대립유전자좌위에 대해 9개 좌위(60.0%)가 적어도 한 집단에 대해 다형현상을 나타내었다. 종수준에서 유전적 다양성은 매우 높았다($H_{ES}$=0.144). 집단수준에서 유전적 다양성은 비교적 낮았다($H_{EP}$=0.128). 청각에서 전체 유전적 다양도의 87%는 집단내에 내포되어 있었다. 청각의 번식방법은 유성생식보다는 무성생식이 우세하고, 집단의 단절, 낮은 자손의 생성, 지리적 격리, 그리고 정착과정이 낮은 유전적 다양성을 설명하는 요인으로 사료된다. 조사한 청각 집단에서 세대당 이주하는 개체수는 1.69로 평가되었다. 이 값은 보통 수준의 유전자 흐름으로 해류를 통한 이동이 주된 요인으로 보인다.

한국 특산식물 변산바람꽃(Eranthis byunsanensis)의 유전적 변이 (Genetic variation in populations of the Korean endemic Eranthis byunsanensis (Ranunculaceae))

  • 소순구;이병순;박기룡
    • 식물분류학회지
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    • 제42권4호
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    • pp.253-259
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    • 2012
  • 한국특산식물이며 희귀식물인 변산바람꽃(Eranthis byunsanensis)의 보전을 위해 5개 자생지 집단을 대상으로 9개의 allozyme marker를 이용하여 유전적 다양성과 구조를 분석하였다. 변산바람꽃 집단의 대립 유전자의 수(A)는 2.4개, 다형적 유전좌위의 비율(P)은 90.0%, 이형접합자의 평균 기대치($H_E$)는 0.311을 나타내어 분포 역이 넓은 특산식물과 유사하거나 다소 높은 수준의 유전적 다양도를 유지하는 것으로 나타났다. 유전적 구조분석 결과 집단간 $F_{IS}$는 양의 값을 나타내었고 집단간 유전적 분화도는 낮은 결과(0.131)를 보였다. 집단간 높은 유전적 변이, 낮은 유전적 분화, 이형접합자의 결여양상은 이 종이 최근 고립되어 서식지의 단편화를 경험했을 가능성을 제시하며 유전적 확산을 막아 집단의 근친교배율이 증가한 것으로 판단된다. 현재 마이산과 나로도 자생지는 집단의 작은 크기와 종의 생존을 위협하는 인간활동에 의해 매우 취약한 상태이다. 따라서 유전적 변이가 다소 높고 분화가 적은 변산바람꽃 집단의 합리적 보전을 위해서는 특정한 집단에 대한 보전의 우선권을 설정하는 것 보다 전체 집단을 지속적으로 유지하고 근친교배율을 낮추기 위한 노력이 요구된다.

한반도 아고산대 특산·희귀식물 설앵초의 유전적 다양성과 지리적 분화 (Genetic diversity and geographic differentiation in the endangered Primula farinosa subsp. modesta, a subalpine endemic to Korea)

  • 정재민;손성원;김상용;박광우;김성식
    • 식물분류학회지
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    • 제43권3호
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    • pp.236-243
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    • 2013
  • 북방계 식물들의 잔존적 피난처인 아고산대에 분포하는 식물들은 기후변화에 따른 자생지 환경변화로 인해 멸종 및 멸절 위험에 크게 직면해 있는 실정이다. 본 연구는 한반도의 남부지역 아고산대에 제한적으로 분포하고 있는 특산식물이며 희귀식물인 설앵초(Primula farinosa subsp. modesta (Bisset & Moore) Pax)에 대한 유전적 다양성과 지리적 분화 양상을 구명을 통한 보존전략을 수립하기 위해 3지역 6집단 165개체를 대상으로 ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) 분석을 수행하였다. 그 결과 집단 수준의 유전 다양성의 평균은(P = 60.62, SI = 0.299, h = 0.190) 유사한 생활사를 갖는 다년생 초본류의 평균보다 낮은 수준이었으며, 이형화주의 특징을 갖는Primula속의 근연 분류군들에 비해서도 다소 낮은 결과를 보였다. 유전적 분화도 구명을 위해 AMOVA(Analysis of molecular variance) 분석 결과 전체 유전변이 중 약 50%가 지역 간에 분포하는 결과를 보여 종내 지역간 분화도가 매우 높은 수준으로 판단되며, Bayesian cluster 분석 결과에서도 조사된 세 지역이 각각 독특한 유전적 cluster를 형성함으로써 개체군간 유전자 이동이 매우 제한적임을 암시하였다. 따라서 설앵초 집단의 급속한 분획화와 낮은 수준의 유전적 다양성, 지역간 높은 분화도 등의 특성들을 고려하여 설앵초 집단의 개체군 감소 및 멸절 방지를 위한 현지 내 외 보전 전략 수립이 시급한 것으로 판단된다.

Salsolinol, a Tetrahydroisoquinoline Catechol Neurotoxin, Induces Human Cu,Zn-superoxidie Dismutase Modificaiton

  • Kang, Jung-Hoon
    • BMB Reports
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    • 제40권5호
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    • pp.684-689
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    • 2007
  • The endogenous neurotoxin, 1-methyl-6,7-dihydroxy-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline (salsolinol), has been considered a potential causative factor for the pathogenesis of Parkinson's disease (PD). In the present study, we examined the pattern of human Cu,Zn-superoxide dismutase (SOD) modification elicited by salsolinol. When Cu,Zn-SOD was incubated with salsolinol, some protein fragmentation and some higher molecular weight aggregates were occurred. Salsolinol led to inactivation of Cu,Zn-SOD in a concentration-dependent manner. Free radical scavengers and catalase inhibited the salsolinol-mediated Cu,Zn-SOD modificaiton. Exposure of Cu,Zn-SOD to salsolinol led also to the generation of protein carbonyl compounds. The deoxyribose assay showed that hydroxyl radicals were generated during the oxidation of salsolinol in the presence of Cu,Zn-SOD. Therefore, the results indicate that free radical may play a role in the modification and inactivation of Cu,Zn-SOD by salsolinol.

TPA-and $H_2O_2$- induced Apoptosis by Epigenetic Mechanism and Preventive Effect of L-Carnosine on TPA- and $H_2O_2$- induced Apoptosis of v-myc Transformed Rat Liver Epithelial Cells

  • Kang, Kyung-Sun;Yun, Jun-Won;Cho, Sung-Dae;Lee, Yong-Soon
    • 한국독성학회:학술대회논문집
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    • 한국독성학회 2001년도 International Symposium on Signal transduction in Toxicology
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    • pp.22-40
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    • 2001
  • Apoptosis is characterized by DNA fragmentation, chromatin condensation and plasma membrane blebbing. These apoptotic processes have been mainly associated with genetic mechanisms. Recently, these processes have been also associated with mitochondrial events that include the release of cytochrome c and Diablo/SMAC by modulation of mitochondrial membrane permeability.(omitted)

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Nursing Effects of Thiols Including Cysteine in Lymph Node Stromal Cells and P388 Cells

  • Lee, Sang-Han;Ma, Jin-Yeul;Park, Kap-Joo;Kang, Hyunmin;Park, Taekyu;Park, Doo-Sang
    • Journal of Life Science
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    • 제11권2호
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    • pp.99-102
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    • 2001
  • Mouse malignant T-lymphoma CS21 cells can grow when cocultured with CAl2 lymph node stromal cells, but they undergo apoptotic cell death with DNA fragmentation when separated from CA12 stromal cells. In the course of examining the effects of the soluble factor (s) secreted by CAl2 stromal cells on CS2l cell growth, we found that thiols including cysteine promoted CS2l cell growth. P388 cell growth was also promoted by various thiols. These results suggest that thiols including cysteine participate in CA12 and P388 cell growth.

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Differential involovement of JNK in apicidin-induced apoptosis.

  • Kim, Ji-Ae;Cho, Eun-jung;Lee, Hoi-Young;Hong , Sung-Youl;Lee, Hyang-Woo;Han, Jeung-Whan
    • 대한약학회:학술대회논문집
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    • 대한약학회 2002년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.2
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    • pp.323.2-323.2
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    • 2002
  • We previously reported that apicidin induces apoptosis through selective induction of Fas/Fas ligand. resulting in the release of cytochrome C from mitochondria to the cytosol and subsequent activation of caspase-9 and \ulcorner However. we observed that apicidin did not induce the apoptosis in a specific cell line. such as HeLa. which was characterized by nuclear DNA fragmentation. On the basis of these facts, we tested whether JNK activation is involved in cell death induced by apicidin. (omitted)

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