• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제17권1호
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• pp.1-6
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• 2004

The 490 and 380 performance records of Karan Fries and Karan Swiss cows developed through crossbreeding followed by inter-se mating were evaluated for production, reproduction performance and disposal rate. Duration of study (1982-92) was grouped into five periods (1982-83; 1984-85; 1986-87; 1988-89; 1990-92) and each year was divided into four seasons (Winter: Dec.-Jan.; Spring: Feb.-March; Summer: April-June; Rainy: July-Sept.; Autumn: Oct.-Nov). Data were also classified according to sire and level of inbreeding. The least squares means of FLY (first lactation yield -305 days), FLL (first lactation length), FSP (first service period), FDP (first dry period), FCI (first calving interval ), MY/FLL (milk yield per day of first lactation length), MY/FCI (milk yield per day of first calving interval), EBV (expected breeding value) and EBE (expected breeding efficiency) were $3,173{\pm}82$ kg, $34611{\pm}$days, $143{\pm}11$ days, $75{\pm}6$ days, $423{\pm}11$ days, $10.6{\pm}0.2$ kg, $8.9{\pm}0.2$ kg, $3,380{\pm}26$ kg, and $88.2{\pm}1.3$% respectively in Karan Fries. Corresponding estimates in Karan Swiss cows were $2,616{\pm}82$ kg, $328{\pm}8$ days, $148{\pm}12$ days, $103{\pm}9$ days, $435{\pm}13$ days, $8.9{\pm}0.2$ kg, $7.2{\pm}0.3$ kg, $2,924{\pm38}$ kg and $86.0{\pm}3.8$% respectively. The effect of sire was significant on FLY, MY/FLL, MY/FCI and EBV in both the herd (p<0.01). The 10 and 15% sires showed superiority (FLY) over herd average of 11 and 7% in Karan Fries and 32 and 21% in Karan Swiss cattle respectively. Inbreeding has adversely and significantly (p<0.05) affected the FLY, MY/FLL, MY/FCI and survivability of Karan Fries females; FDP and disposal through culling of Karan Swiss heifers. The Karan Fries heifers with inbreeding above 12.5% performed 16% lower FLY to herd average. The effect of season of calving was significant on FLL, FSP and FCI (p<0.05) in Karan Fries. Summer calvers ($361{\pm}12$) were have higher lactation length and autumn calvers ($329{\pm}14$) had minimum. Period of calving significantly influenced the FSP, FCI, MY/FLL and MY/FCI in Karan Fries and FLY, MY/FLL and MY/FCI in Karan Swiss. Production efficiency traits in Karan Fries herd witnessed higher yield in the last two periods whereas, Karan Swiss heifers showed fluctuating performance. The findings suggested judicious use of available genetic variability, keeping of inbreeding under safer level and managemental interventions for the consistent improvement of both herds.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제16권8호
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• pp.3339-3344
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• 2015

Background: This case-control study aimed to determine if there were any associations between the two single nucleotide polymorphisms (SNPs) in Gc, rs7041 (Asp416Glu) and rs4588 (Thr420Lys) and 3 common cancers (breast, lung and colorectal) in Thai patients. Materials and Methods: Two hundred and eighty two colorectal, 101 breast and 113 lung cancer patients were recruited from one institute during 2011-2013. The controls were age-matched volunteers who had a negative history of index cancers. In addition, vitamin D levels were compared among different genotypes in the 2 SNPs. Results: The minor allele frequencies of rs7041 (G) and rs4588 (A) were 0.32 and 0.24, respectively. Under the dominant model, the study found significant associations between minor-allele genotypes of the SNP rs7041 (TG/GG) and lung cancer (odds ratio [OR] 1.78, 95% CI 1.05-3.03). When subgroup analysis was performed according to sex and age at diagnosis, the study found that the minor-allele genotypes of rs7041 (TG/GG) were significantly associated with colorectal cancer in patients whose age at diagnosis was more than 60 years (OR 1.67, 95%CI 1.06-2.61) and the minor-allele genotypes of rs4588 (CA/AA) were significantly associated with colorectal cancer in males aged 60 years or less (OR 2.34, 95%CI 1.25-4.37). When SNP combinations (rs7041-rs4588) were examined, the TT-CA combination had a significant protective association with lung cancer (OR 0.44, 95% CI 0.22-0.85). On evaluation of serum 25(OH)D levels in 205 individuals without cancer (males 144, females 61), the proportion of subjects with low serum vitamin D (< 20 ng/ml) in those harboring CA or AA genotypes of rs4588 (41.7%) was significantly higher than the CC genotype (15.5%, p-value < 0.01). Conclusions: Genetic polymorphisms in Gc were associated with lung and colorectal cancers in Thai patients. Lower serum 25(OH)D in minor variants of rs4588 may explain this association.

• 농약과학회지
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• 제8권4호
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• pp.288-298
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• 2004

광범위 보호 살균제인 carbendazim이 DNA, 유전자 및 염색체에 미치는 영향을 평가하기 위하여 Ames가 개발한 미생물복귀돌연변원성시험, CHL (chinese hamster lung fibroblast cell) 세포를 이용한 염색체 이상시험, DNA 손상시험 및 마우스 골수세포를 이용한 소핵시험을 수행하였다. Carbendazim $156\sim2,500{\mu}g/plate$ 농도로 직접법 및 대사활성화법으로 TA 1535, TA 1537, TA 98 및 TA 100에서 수행한 Ames test결과 음성 대조군(DMSO)과 유사한 colony수를 보여 유전자의 염기절단에 의한 결손이나 염기 치환을 일으키지 않았다. 염색체에 미치는 영향을 검색하기 위하여 CHL세포에 $2.0\sim32.0{\mu}g/mL$의 농도로 carbendazim을 처리하여 염색체이상시험을 수행한 결과 염색분체 절단과 같은 구조이상은 없었으나 염색체의 수에 변화가 관찰되어 수적 이상은 인정되었다. Carbendazim 25, 50 및 $100{\mu}g/mL$을 마우스에 처리하여 30분, 60분 및 120분에 DNA에 직접 노출시켜 DNA손상 시험을 수행한 결과 60분까지는 영향이 없었으나, 120분 노출 군에서 대조군에 비해 $22\sim27%$정도의 DNA이동거리가 증가하여 약간의 손상이 관찰되었으며, 세포에 노출시켰을 때도 중 농도와 저 농도에서 16%의 이동거리 증가와 120분 노출시켰을 때 $10%\sim26%$의 이동거리 증가가 있어 DNA에 직접 노출한 경우와 비슷하였다. Carbendazim 375, 750 및 1,500 mg/kg 농도로 투여한 소핵시험결과 음성으로 판단되었으며, 골수세포에 대한 세포독성도 관찰되지 않았다. 이상의 결과에선 benzimidazole계 살균제 carbendazim이 DNA손상 및 염색체의 수적이상을 일으킨다는 것을 알 수 있었다. 이와 같은 결과는 계속적으로 논란이 되고 있는 benzimidazole계 농약인 benomyl이나 carbendazim에 장기적으로 인체에 노출되었을 경우 유전물질에 영향을 미칠 수 있을 것으로 생각되나 만성독성성적과 노출량 등 구체적인 자료를 이용한 위해성평가를 수행하여야 보다 정확한 판단을 할 수 있을 것으로 사료되었다.

• 생명과학회지
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• 제26권12호
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• pp.1446-1457
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• 2016

이 논문은 무제치늪에서 채집한 기장대풀(Isachne globosa Kuntze), 솔방울고랭이(Scirpus karuisawensis Makino), 이삭귀개(Utricularia racemosa Wall.), 좀개수염(Eriocaulon decemflorum Maxim.)등 4종의 식물 뿌리에서 서식하는 내생곰팡이의 분포 및 다양성을 확인하기 위해 조사하였다. 총 226 균주가 분리되었고, 3문(Phyla), 7강(Class), 10목(Order), 22과(Family), 31(genera)속으로 분리되었다. 내생진균에서 가장 많이 분리된 속은 Acephala (19.9%), Tolypocladium (16.3%), Neopestalotiopsis (11.5%), Perenniporia (7.1%) 순으로 확인하였다. 다양성지수 분석에 있어서, 이삭귀개(Ur)가 다른 식물 종에 비해 종 풍부도 (Menhinick's index = 2.37), (Margalef's index = 4.46)와, 종 균등도 (Simpson's index diversity = 0.91), 그리고 종 다양성(Shannon's indx = 2.57)로 높게 나왔다. 이러한 분석 결과를 봤을 때, 이삭귀개(Ur)에서 내생진균이 가장 다양하게 서식할 수 있는 것으로 보여진다.

• 한국식품과학회지
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• 제31권3호
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• pp.672-677
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• 1999

백미와 3종류의 유색미(수원 415호, 익산 427호, 수원 432호)를 이용한 식혜를 제조하여 유색미 식혜의 당화과정 중 이화학적 특성과 관능적 특성을 조사하였다. 당화과정동안 유색미 식혜는 백미 식혜보다 당도는 $0.5{\sim}2%$정도 낮았고, 환원당량은 약 20%정도 낮았으며, pH는 $5.8{\sim}6.0$범위로 차이가 없었다. 백미, 익산 및 적미 식혜의 명도는 거의 변화가 없었으나, 수원 식혜의 명도는 당화 후기로 갈수록 감소하였다. 백미, 익산 및 적미 식혜의 적색도는 거의 0, 0.9, 0.1정도였으며, 수원 식혜의 적색도는 10정도로써 가장 높았다. 당화과정동안 백미 식혜의 황색도는 조금씩 감소하였으나, 유색미 식혜의 황색도는 당화 1시간일 때 조금 증가한 후 거의 변화가 없었다. 백미 식혜는 담황색, 수원 식혜는 적자색, 익산 식혜는 담적자색, 적미 식혜는 약간 붉은 기가 도는 담황색을 띄었다. 시료 식혜들의 관능검사 결과, 백미 식혜와 익산 50, 익산 25, 적미 50과 적미 25 식혜의 단맛은 유의적인 차이가 없다고 느꼈고, 유색미 식혜와 백미 식혜사이의 향미도 유의적인 차이가 없었다. 전체적인 기호도는 백미식혜와 25% 유색미 식혜에서 높게 나타났다.

• 한국식품영양학회지
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• 제26권3호
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• pp.383-390
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• 2013

본 연구에서는 겨우살이 열수 추출물인 미슬로 C의 안전성을 검토하고자 유전 독성 및 실험동물을 이용한 안전성 검사를 실시하였다. 미슬로 C의 미생물 돌연변이 실험을 S. typhimurium의 히스티딘 요구성 균주와 E. coli의 트립토판 요구성 균주를 이용하여 대사 활성계 적용 및 비적용 하에서 복귀돌연변이 시험을 실시한 바, $5,000{\mu}g/plate$의 처리 농도까지 복귀돌연변이 집락은 나타나지 않았다. ICR 마우스에게 500, 1,000 및 2,000 mg/kg를 경구 투여하고, 골수세포를 수집하여 소핵을 측정한 결과, 정상마우스의 경우와 비교하여 유의한 소핵은 관찰되지 않았기에 미슬로 C는 유전독성을 유발하지 않는 것으로 판단되었다. 식품의약안전청의 의약품 등의 독성시험기준에 따라 암 수 SD 계열의 랫드에 시험물질을 0, 500, 1,000 및 2,000 mg/kg/day의 용량으로 1회 경구 투여한 후, 14일간의 체중 변화 및 사망률을 조사한 결과, 대조군과 비교하여 유의한 체중 변화는 없었으며, $LD_{50}$은 2,000 mg/kg 이상인 것으로 사료된다. 또한 0, 250, 500 및 1,000 mg/kg/day의 용량으로 13주간 반복 투여하면서 실험동물의 일반증상, 체중변화, 혈액 및 혈액생화학적 변화, 부검소견, 조직학적인 변화를 관찰하였다. 시험기간 중 암 수 모든 군에서 시험물질 투여에 기인한 일반적인 증상 변화는 관찰되지 않았고, 시험물질의 반복 투여로 인한 사망 마우스 역시 관찰되지 않았다. 따라서 미슬로 C를 13주간의 랫드에 대한 13주 반복 경구 투여 결과, 무독성량은 최소한 1,000 mg/kg 이하인 결과를 나타냈으며, 이 농도에서 독성을 유발하는 표적장기는 관찰되지 않았다.

• 한국균학회지
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• 제25권3호통권82호
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• pp.202-208
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• 1997

Fusarium을 간단한 방법으로 DNA를 추출한 후, 유전적 다형성을 검출하는 방법인 RAPD(Randomly Amplified Polymorphic DNA)를 이용하여 Fusarium균의 유전적 다형성과 계통분류학적 분석을 실시하였다. 20개의 분리균을 배양하여 얻어진 균사체로부터 genomic DNA를 추출하여 PCR을 실시 15개의 primer에서 $0.2{\sim}3\;Kb$ 크기의 band를 총 180개 얻었다. 180개의 band 중 다형화 현상을 보이는 band는 126개로 이를 이용하여 bionominal matrix code(0,1)을 작성한 후 UPGMA법을 이용하여 각 균주간의 관계를 분석하였다. Fusarium oxysporum 균주중 355번(F. oxysporum)과 358번(F. oxysporum)은 0.9603의 높은 상동성을 보인 반면, F. roseum (87번)과 F. oxyspoyum (358번), 69번 (F. o. f. sp. lycopersici)과 68번(F. o. f. sp. melongena)은 0.3809의 낮은 상동성을 보였다. 361번 (F. oxysporum)과 218번 (F. o. f. sp. ruphani)은 0.8730의 유사도를 354번(F. oxysporum), 228번(Fusarium sp.)은 0.7936의 유사도, 87번(F. roseum)과 57번(F. o. f. sp. raphani)은 0.5873 유사도를 가진다.

• 대한임상검사과학회지
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• 제36권2호
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• pp.110-114
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• 2004

Apolipoprotein E is the major lipid-carrier protein in the brain, and several studies provided evidence that apolipoprotein E(ApoE) epsilon4 allele can be considered a genetic risk factor for Alzheimer's disease(AD). Inheritance of the APOE gene has three alleles: ${\varepsilon}2$, ${\varepsilon}3$ and ${\varepsilon}4$. There are six possible genotypes: ${\varepsilon}2/{\varepsilon}2$, ${\varepsilon}3/{\varepsilon}3$, ${\varepsilon}4/{\varepsilon}4$, ${\varepsilon}2/{\varepsilon}3$, ${\varepsilon}2/{\varepsilon}4$, ${\varepsilon}3/{\varepsilon}4$. AD is characterized by a progressive loss of function and death of nerve cells in several areas of the brain. The ${\varepsilon}4$ allele is associated with a risk for developing AD. People with the ${\varepsilon}4/{\varepsilon}4$ genotype have the highest risk, but people with the ${\varepsilon}2/{\varepsilon}4$ or ${\varepsilon}3/{\varepsilon}4$ genotypes are also likely to develop the disease. 64.3% of people carry the is ${\varepsilon}3/{\varepsilon}3$ genotype, 22.1% carry the second ${\varepsilon}3/{\varepsilon}4$ genotype but, ${\varepsilon}2/{\varepsilon}2$ genotype is not usually found of people carry the 3.6% is ${\varepsilon}4/{\varepsilon}4$ genotype in a total of a test group of 140 people. The ratio of ${\varepsilon}4/{\varepsilon}4$ genotype related directly with AD is less than the ${\varepsilon}3/{\varepsilon}3$ genotype, but the ${\varepsilon}2/{\varepsilon}4$ and ${\varepsilon}3/{\varepsilon}4$ genotype ratio of indirect AD risk is 25.7% in the group of people, regardless. Thus, we have referred to the benefit from the treatment of AD through apoE genotype diagnosis.

• 원예과학기술지
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• 제28권5호
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• pp.802-809
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• 2010

역병은 세계적으로 고추에 발생하는 병 중 가장 문제시 되는 병해로 국내 83개 지역에서 채집한 재래종 고추 유전자원 중 300개를 선발하여 공시하였다. 파종 후 온실에서 70일간 육묘하였고 공시한 역병균의 유주자낭 농도를 $10^5/mL$으로 하여 주당 5mL 관주접종 후, 습실 처리하였고 1주 간격으로 4주간 이병주율을 조사하였다. 접종 7일 후 이병주율을 조사하였더니, 공시한 300개 고추 자원 중 67개 자원에서 이병주율이 60.1% 이상으로 높은 감수성을 보였으며, 37개 자원은 접종 후 7일까지 전혀 발병하지 않았다. 역병균 접종 28일 후, 공시한 300점의 고추자원 중 244개 자원은 60% 이상의 이병주율을 보여 역병에 대해 감수성을 나타내었으며, 11개 자원은 20% 미만의 이병주율을 보여 중도저항성을 보였고, 5개 자원은 전혀 발병하지 않아 저항성을 나타내었다. 5개 자원의 저항성 고추유전자원은 역병저항성 고추 품종 육종에 유용한 중간모본으로 사용될 것으로 생각된다. 본 실험의 정밀도를 높이기 위해 분자마커를 활용한 추가실험이 진행된다면 고추유전자원의 역병 저항성에 대한 중요한 정보를 제공할 수 있을 것으로 본다.

• Genomics & Informatics
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• 제16권3호
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• pp.52-58
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• 2018

In this report, we present a case study of how pharmacogenomics and pharmacometabolomics can be useful to characterize safety and pharmacokinetic profiles in early phase new drug development clinical trials. During conducting a first-in-human trial for a new molecular entity, we were able to determine the mechanism of dichotomized variability in plasma drug concentrations, which appeared closely related to adverse drug reactions (ADRs) through integrated omics analysis. The pharmacogenomics screening was performed from whole blood samples using the Affymetrix DMET (Drug-Metabolizing Enzymes and Transporters) Plus microarray, and confirmation of genetic variants was performed using real-time polymerase chain reaction. Metabolomics profiling was performed from plasma samples using liquid chromatography coupled with quadrupole time-of-flight mass spectrometry. A GSTM1 null polymorphism was identified in pharmacogenomics test and the drug concentrations was higher in GSTM1 null subjects than GSTM1 functional subjects. The apparent drug clearance was 13-fold lower in GSTM1 null subjects than GSTM1 functional subjects (p < 0.001). By metabolomics analysis, we identified that the study drug was metabolized by cysteinylglycine conjugation in GSTM functional subjects but those not in GSTM1 null subjects. The incidence rate and the severity of ADRs were higher in the GSTM1 null subjects than the GSTM1 functional subjects. Through the integrated omics analysis, we could understand the mechanism of inter-individual variability in drug exposure and in adverse response. In conclusion, integrated multi-omics analysis can be useful for elucidating the various characteristics of new drug candidates in early phase clinical trials.