• 제목/요약/키워드: Genetic correlation

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유색콩 수집종의 주요 생태적 특성 (Ecological Characteristics of Color - Soybean Collections)

  • 정찬식;백인열;고미석
    • 한국작물학회지
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    • 제41권2호
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    • pp.173-177
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    • 1996
  • 경상북도 일원에서 수집한 유색콩 146계통을 공시하여 밥밑콩 유전자원의 이용성을 확대하고 유색콩 품종육성의 기초자료로 활용코자 주요 작물학적 특성을 조사하여 얻어진 결과는 다음과 같다. 1. 수집계통은 흑색, 흑색 아주까리형, 선비잡이형, 밤색, 갈색, 갈색 아주까리형, 녹색 등 종피의 형태에 따라7종으로 분류되었으며 이 중 흑색 및 녹색의 종피를 가진 계통이 가장 많았다. 계통별 화색은 자색과 백색으로 나타났으며 이 중 자색을 가진 계,통이 전체 수집종의 90%에 해당하는 132계통이었다. 종실의 종피를 제거한 후 자엽의 색깔은 녹색이 82계통, 황색이 64계통 이었다. 2. 종피형태 별 개화일수, 결실일수 및 생육일수를 조사한 결과 개화일수 및 결실일수의 경우 51∼81일 및 75∼103일의 변이폭을 나타내어 수집계통간 공히 변이폭이 컸던 반면 생육일수의 경우에는 흑색 아주까리계통(123일)을 제외한 모든 계통에서 150∼159일로 비교적 변이폭이 작았다. 3. 100립중의 경우 109이하의 계통으로부터 36g이상의 계통까지 다양하였으나 이들중 흑색종피를 가진 계통중에서도 자엽색이 녹색인 계통들이 황색 계통에 비해 100립중이 무거운 경향을 보였고, 특히 선비잡이형 종피계통의 경우에는 100립중이 36g이상 되는 극대립종이었다. 4. 수집종의 종실형태는 대체로 편타원형이었으며, 길이 : 폭 : 두께의 비율은 평균1 : 0.87 : 0.69였고, 100립중과 종실의 형태적 특성간의 상관관계는 길이, 폭, 두께 모두가 고도로 유의한 정의 상관을 나타내었다.

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자포니카 다수성 품종 소비벼의 입중과 입형의 유전 (Inheritance of Grain Weight and Size of a High Yielding Japonica cultivar, Sobibyeo)

  • 이승엽;노태환;김보경;이중호
    • 한국작물학회지
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    • 제48권3호
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    • pp.142-146
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    • 2003
  • 자포니카 중대립 소비벼의 입중 및 입형 관련형질의 유전양상을 구명하기 위하여, 2조합의 자포니카 품종간 $\textrm{F}_1$$\textrm{F}_2$를 이용하여 현미 천립중, 현미 길이, 넓이, 두께 등의 유전 및 관련형질간 상관관계를 분석한 결과는 다음과 같다. 1. 장폭비를 제외한 현미 천립중, 현미 길이, 넓이, 두께 등은 익산 429호/소비벼, 익산 430호/소비벼 두 조합의 $\textrm{F}_1$ 에서 모두 양친의 평균치보다 높게 나타났으며, 현미 천립중은 $\textrm{F}_2$ 집단에서 18.4g-32.2g과 19.5g-33.4g 범위로 연속적인 빈도분포를 보였다. 2. 현미 천립중에 대한 광의의 유전력은 두 조합에서 각각 89.00과 89.06으로 높게 추정되었으며, 현미의 길이에 대한 유전력은 각각 97.45와 97.35로 관련형질 중 가장 높게 나타났다. 3. 입중과 입형 관련형질 상호간에는 고도로 유의한 정의 상관관계가 인정되었으며, 현미 천립중은 현미 길이, 넓이, 두께 순으로 고도의 상관관계를 보였다. 따라서 소비벼의 입중 및 입형관련 형질들은 우성으로 작용하는 다수의 유전자가 관여하는 양적형질로 나타났으며, 교배 모본으로 활용할 경우 초기세대에서 선발이 가능하여 육종효율을 높일 수 있을 것으로 기대되었다.

Value of KRAS, BRAF, and PIK3CA Mutations and Survival Benefit from Systemic Chemotherapy in Colorectal Peritoneal Carcinomatosis

  • Sasaki, Yusuke;Hamaguchi, Tetsuya;Yamada, Yasuhide;Takahashi, Naoki;Shoji, Hirokazu;Honma, Yoshitaka;Iwasa, Satoru;Okita, Natsuko;Takashima, Atsuo;Kato, Ken;Nagai, Yushi;Taniguchi, Hirokazu;Boku, Narikazu;Ushijima, Toshikazu;Shimada, Yasuhiro
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제17권2호
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    • pp.539-543
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    • 2016
  • Background: It is well known that peritoneal carcinomatosis (PC) from colorectal cancer (CRC) is associated with a poor prognosis. However, data on the prognostic significance of modern chemotherapy containing bevacizumab, cetuximab or panitumumab are not available. Materials and Methods: This retrospective review concerned 526 patients with metastatic CRC who were classified into two groups according to the presence or absence of PC, and were treated with systemic chemotherapy, with or without bevacizumab or anti-EGFR antibodies. The genetic background, in particular KRAS, BRAF, and PIK3CA gene mutations, and overall survival (OS) were compared between the two groups. Results: The median OS values were 23.3 and 29.1 months for PC and non-PC patients, respectively (hazard ratio [HR]=1.20; p=0.17). Among all patients, tumor location, number of metastatic sites and BRAF mutation status were significant prognostic factors, whereas the presence of PC was not. In the PC group, chemotherapy with bevacizumab resulted in a significantly longer OS than forchemotherapy without bevacizumab (HR=0.38, p<0.01), but this was not the case in the non-PC group (HR=0.80, p=0.10). Furthermore, the incidence of the BRAF V600E mutation was significantly higher in PC than in non-PC patients (27.7% versus 7.3%, p<0.01). BRAF mutations displayed a strong correlation with shorter OS in non-PC (HR=2.26), but not PC patients (HR=1.04). Conclusions: Systemic chemotherapy, especially when combined with bevacizumab, improved survival in patients with PC from CRC as well as non-PC patients. While BRAF mutation demonstrated a high frequency in PC patients, but it was not associated with prognosis.

X선 조사가 닭 유정란 부화과정에 미치는 영향 (Experimental study for the irradiation effect of x-ray on the hatching process of fertilized eggs)

  • 전병규;여진동
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제14권12호
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    • pp.6413-6419
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    • 2013
  • 방사선 감수성이 높은 시기의 닭 유정란에 방사선치료용 선형가속장치를 이용하여 고 에너지 X선을 조사하고, 부화과정 및 생존율, 외형적 기형, 혈액세포의 변화를 관찰하여 방사선 조사가 유정란 부화과정에 미치는 영향에 대하여 연구 하고자 하였다. 방사선 감수성이 가장 높을 것으로 예상 되는 5일째에 고 에너지 10 MV-X선을 5개의 유정란을 한 군으로 설정한 실험군에 각각 5, 7.5, 10 Gy를 조사하고 부화기에 입란 하였다. 매일 검란을 실시하여 20일간의 부화과정을 관찰하고 부화 예정 1일 전에는 방사선촬영을 실시하여 부화상태와 전체 골격 형성을 확인하였다. 부화 된 병아리는 방사선촬영과 혈액분석을 실시하였다. 부화율은 대조군과 실험군에서 각각 80, 46.7%이고, 조사선량 별 부화률은 대조군과 5, 7.5, 10 Gy 에서 각각 80, 100, 40, 0% 로 조사선량이 증가 함에 따라 부화율은 감소하였다. 기형발생률은 대조군과 실험군에서 각각 0, 60% 이다. 조사선량 별 기형 발생률은 5, 7.5, 10 Gy 에서 각각 20, 80, 80% 이다. 미부화란의 인공 파각 후 좌측날개, 안구돌출, 발, 목뼈 기형이 나타났으며, 조사선량이 증가함에 따라 기형발생률이 증가 하였다. 백혈구 평균치는 대조군, 5, 7.5 Gy에서 각각 87.64, 100.76, 81.42 ($10^3/{\mu}L$) 으로 나타났다. 고에너지 X선에 의한 직, 간접적 손상인 부리 이상, 눈 결손, 계태사, 혈액성분의 변화를 확인 하였다. 특히 조사선량이 높을수록 부화율과 백혈구의 평균수치가 감소하였으며, 기형의 발생률과 계태사가 증가 하였다. 기형 발생의 원인은 염색체 이상으로 추정된다. 향후 고 에너지 X선 조사에 따른 기형의 원인을 알아내기 위한 지속적인 유전학적 연구가 필요할 것이다.

고 에너지 X-선이 새싹식물 종자의 생장에 미치는 영향 (Experimental Study for the Irradiation Effect of High Energy X-ray on the Growth of Sprout Plants Seeds)

  • 전병규;여진동
    • 한국방사선학회논문지
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    • 제11권6호
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    • pp.539-545
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    • 2017
  • 본 연구는 고 에너지 X-선을 조사한 새싹식물 종자를 파종 및 재배하여 산도, 염도, 당도, 당산비의 변화를 분석하고 식물의 생장에 미치는 영향을 알아보고자 하였다. 새싹식물 6종의 종자에 각 종자별로 대조군 1개군과 실험군 4개군을 구성하여 6MV X-선을 0, 2, 5, 8, 10 Gy 각각 조사하였다. 조사된 종자들을 파종하고 재배하여 식물의 액을 추출 및 성분분석을 실시하였다. 무순과 적무의 산도는 모두 증가하였고, 청경채와 메밀은 산도가 평균적으로 감소하였다. 다른 종자의 실험군은 대조군과 비슷한 산도로 분석 되었다 새싹식물의 염도, 당도는 평균적으로 감소하였으나, 적무의 염도는 2배 증가하였고, 수분 함량이 높은 콩나물은 당도가 모두 증가하였다. 따라서 고 에너지 X선은 식물의 성분에서 염기성 이온을 생성하고, 수분 함량이 높은 식물은 방사선 감수성이 높아 생장에 영향을 받아 과산화물이 생성되어 식물의 성분 변화에 영향을 미친다고 판단된다. 향후 고 에너지 방사선의 조사에 따른 식물성분의 변화 원인을 알아내기 위한 지속적인 유전학적 연구가 필요할 것이다.

소의 초기 배 발생단계별 Telomeric DNA 함량 및 Telomerase Activity 분석 (Telomeric Dynamics and Telomerase Activity in Early Bovine Embryos)

  • 정예화;이수희;조상래;공일근;조재동;손시환
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제36권2호
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    • pp.101-109
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    • 2009
  • 목 적: 소 수정란의 telomeric DNA 함량 및 텔로머레이스 활성도 (telomerase activity)를 분석하여 초기 배아형성과정에서 텔로미어의 변화 양상을 규명하고자 하였다. 연구방법: 소의 초기 배 발생단계별 체외수정란을 대상으로 양적형광보인법 (Q-FISH)을 이용한 telomeric DNA의 함량 분석과 Telomeric Repeat Amplification Protocol (TRAP)로서 텔로머레이스 활성도를 분석하였다. 결 과: 소의 초기 수정란의 telomeric DNA 함유율은 발생과정이 진행됨에 따라 유의적인 양적 증가를 나타내었다. 배반포배의 질 (quality)에 따른 텔로미어의 함량 차이는 나타나지 않았다. 소 수정란의 8 세포기, 상실배기 및 배반포기의 모든 초기 배 단계에서 텔로머레이스 활성도를 보였으며, 상실배에서 증가하여 배반포배에서 가장 강한 활성도를 나타내었다. 결 론: 소의 초기 배아형성과정이 진행되면서 텔로미어의 함량 및 텔로머레이스 활성도는 점진적으로 증가하고 이들 간에는 정 (positive)의 상관관계를 가진다. Telomeric DNA 함량의 증가를 유지하기 위하여 텔로머레이스의 활성화는 필수적인 것으로 보여진다. 배반포기 배아에서 높은 텔로미어 함량과 강한 텔로머레이스 활성도는 이 시기가 배발생 및 분화과정 중 가장 세포적 활성도가 높은 시점임을 의미하는 것으로 사료된다.

Impact of HER2 and PTEN Simultaneous Deregulation in Non-small Cell Lung Carcinoma: Correlation with Biological Behavior

  • Panagiotou, Ioannis;Georgiannos, Stavros N.;Tsiambas, Evangelos;Karameris, Andreas;Konstantinou, Marios;Lazaris, Andreas C.;Kavantzas, Nikolaos;Vilaras, George;Patsouris, Efstratios
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제13권12호
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    • pp.6311-6318
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    • 2012
  • Background: HER2/neu overexpression due to gene amplification is an important factor in breast cancer, modifying the sensitivity to anti-HER2 monoclonal antibody therapy. The clinical significance of HER2 expression in non small cell lung carcinoma (NSCLC) is currently under evaluation. The tumor suppressor gene PTEN negatively regulates the HER2/PI3K/Akt signalling pathway. The purpose of this study was to evaluate the role of simultaneous alteration in HER2 and PTEN protein expression in relation to biological behaviour of NSCLCs. Materials and Methods: Protein expression was determined by immunohistochemistry in sixty-one (n=61) NSCLC cases along with CISH for HER2 gene analysis and detection of chromosome 17 aneuploidy. Patients were followed-up for a period of 34 to 41 months after surgery. Results: HER2 overexpression (2+/3+score) was detected in 17 (27.9%) patients while loss of PTEN expression was observed in 24 (39.3%) cases, low expression in 29 (47.6%) and overexpression in 8 (13.1%). Simultaneous HER2 overexpression and PTEN low/loss of expression were correlated with metastasis (71.4% vs 36.2% p=0.03). Analysis in the subgroup of 22 patients of pTNM stage III with lymph node status N1 or N2 revealed that there was a relationship between the number of positive regional lymph node groups and simultaneous deregulation of the two genes (p=0.04). Multivariate analysis determined that HER2 overexpression was associated with an increasing risk of developing metastases (OR: 4.3; 95%CI: 1.2-15.9; p: 0.03) while PTEN overexpression was associated with lower risk (OR: 0.1; 95%CI: 0.1, 1.0; p: 0.05). Conclusions: Simultaneous HER2/PTEN deregulation is a significant genetic event that leads to a more aggressive phenotype of NSCLC.

야생콩(Glycine soja Sieb. & Zucc.) 유전자원의 단백질, 지방 및 지방산조성 변이 (Variation of protein, Oil Contents and Fatty Acid Composition of Korean Wild Soybean (Glycine soja Sieb. & Zucc.) Seeds)

  • 김광철;박의호
    • 한국작물학회지
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    • 제50권spc1호
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    • pp.118-122
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    • 2005
  • 우리나라 재래 야생콩 70계통들의 종실 성분들을 분석하여 활용 가능한 야생콩 계통을 선발함으로써 나물콩 품종 육성의 재료로 활용할 수 있는 기초 자료를 얻고자 수행된 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 조단백질 함량 범위는 $35.6-47.9\%$, 평균은 $42.3\%$였으며, 13계통은 $45\%$ 이상인 고단백 계통이었다. 조지방 함량은 $2.8-18.0\%$, 평균 $10.2\%$$3\%$이하인 2계통을 찾을 수 있었다. 2. 지방산 조성에서 16:0은 $11.1-44.6\%$, 18:0은 $3.0-11.4\%$, 18:1은 $11.1-30.6\%$, 18:2는 $12.4-59.5\%$, 18:3은 $1.1-17.3\%$ 범위였는데 특히 18:3 조성이율이 극히 낮은 2계통을 발굴하였다. 3. 조단백질은 조지방 및 지방산과 상관이 인정되지 않았고, 조지방은 16:0, 18:0함량과 고도의 부의 상관이, 18:2와 고도의 정의 상관을 그리고 16:0과 18:0, 18:1 간에는 고도의 정의 상관이 인정되었고, 18:2와 18:3과는 고도의 부의 상관이 인정되었다.

The Construction of a Chinese Cabbage Marker-assisted Backcrossing System Using High-throughput Genotyping Technology

  • Kim, Jinhee;Kim, Do-Sun;Lee, Eun Su;Ahn, Yul-Kyun;Chae, Won Byoung;Lee, Soo-Seong
    • 원예과학기술지
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    • 제35권2호
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    • pp.232-242
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    • 2017
  • The goal of marker-assisted backcrossing (MAB) is to significantly reduce the number of breeding generations required by using genome-based molecular markers to select for a particular trait; however, MAB systems have only been developed for a few vegetable crops to date. Among the types of molecular markers, SNPs (single-nucleotide polymorphisms) are primarily used in the analysis of genetic diversity due to their abundance throughout most genomes. To develop a MAB system in Chinese cabbage, a high-throughput (HT) marker system was used, based on a previously developed set of 468 SNP probes (BraMAB1, Brassica Marker Assisted Backcrossing SNP 1). We selected a broad-spectrum TuMV (Turnip mosaic virus) resistance (trs) Chinese cabbage line (SB22) as a donor plant, constructing a $BC_1F_1$ population by crossing it with the TuMV-susceptible 12mo-682-1 elite line. Foreground selection was performed using the previously developed trsSCAR marker. Background selection was performed using 119 SNP markers that showed clear polymorphism between donor and recipient plants. The background genome recovery rate (% recurrent parent genome recovery; RPG) was good, with three of 75 $BC_1F_1$ plants showing a high RPG rate of over 80%. The background genotyping result and the phenotypic similarity between the recurrent parent and $BC_1F_1$ showed a correlation. The plant with the highest RPG recovery rate was backcrossed to construct the $BC_2F_1$ population. Foreground selection and background selection were performed using 169 $BC_2F_1$ plants. This study shows that, using MAB, we can recover over 90% of the background genome in only two generations, highlighting the MAB system using HT markers as a highly efficient Brassica rapa backcross breeding system. This is the first report of the application of a SNP marker set to the background selection of Chinese cabbage using HT SNP genotyping technology.

Genetic Variability in the Fodder Yield, Chemical Composition and Disappearance of Nutrients in Brown Midrib and White Midrib Sorghum Genotypes

  • Singh, Sultan;Prasad, S.V.Sai;Katiyar, D.S.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제16권9호
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    • pp.1303-1308
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    • 2003
  • Samples of eleven brown midrib (ICSU 96031, ICSU 93046, ICSU 96082, ICSU 96078, ICSU 96075, ICSU 95101, ICSU 96034, ICSU 96063, ICSU 45116, ICSA 93-3 and ICSA 3845 X 3816) and nine white midrib genotypes (ICSU 96050, ICSU 96030, ISU 95082, SSG 59-3, FSHI 93-1, FSHI 2219A X 3211, HC 171, ICSA 93-2 and ICSA 93-1) based on their phenotypic appearance were collected at 50 per cent flowering from the sorghum germplasm grown at Research farm of IGFRI, Jhansi. These genotypes were evaluated with respect to crude protein, fiber composition, in-sacco dry matter, OM, cell wall components disappearance/digestibility besides the fodder yield, total phenolic and availability index values. Brown midrib genotypes were lower (p<0.05) in NDF, ADF, cellulose and acid detergent lignin concentration than white midrib genotypes. Mean NDF, ADF, cellulose and lignin contents were 69.4, 42.1, 35.4 and 5.7% in brown mid rib vis-a vis 75.8, 47.5, 39.6 and 7.3% in white mid rib genotypes. Nonsignificant (p>0.05) differences were observed in dry matter, crude protein and organic matter contents between brown midrib and white midrib genotypes. Phenolic contents were significantly (p<0.05) lower in browm mid rib (0.2) than white mid rib (0.3%) sorghum. Brown midrib genotypes exhibited significantly (p<0.05) higher in-sacco DM, OM and CP disappearance than normal (white midrib) genotypes. The mean degradability of DM, OM and CP was 64.1, 62.6 and 79.6% in brown mid rib and 53.1, 54.0 and 76.6% in white mid rib genotypes, respectively. There were no significant (p>0.05) differences between genotypes in extent of fiber fraction degradability though in-sacco NDF and ADF degradability was more by 5 and 4 units, respectively in brown midrib genotypes vis-a-vis white midrib genotypes. Average fodder yield (green and dry g/plant) and availability index (%) values were significantly (p<0.05) higher for brown midrib (474.2, 129.8 and 80.4) genotypes than white midrib (375.0, 104.8 and 69.2) genotypes. Lignin contents had significant negative correlation with DM, OM, NDF and ADF degradability. The results of the study revealed that brown midrib genotypes are superior not only with regard to chemical entities and disappearance of DM and fiber fractions but also better in respect of fodder yield and availability index values. Thus, brown midrib sorghum strains may be useful in increasing digestibility, intake, feed efficiency and animal performance.