In this study we evaluated the frequency of fusion between TMPRSS2 and ETS family members (ERG, ETV1, ETV4) in prostate cancers in patients from northern China in order to explore differences in fusion rates among regions in northern and southern China, other parts of Asia, Europe, and North America. We examined 100 prostate cancer patients, diagnosed by means of prostate biopsy; fluorescence in situ hybridization (FISH) was used to detect the expression of TMPRSS2, ERG, ETV1 and ETV4 in cancer tissue. Differences in gene fusion rates among different ethnics groups were also analyzed. Of the 100 prostate cancer patients, 55 (55%) had the fusion gene. Among the patients with the fusion gene, 46 (83.6%) patients had the TMPRSS2:ERG fusion product, 8 (14.8%) patients had TMPRSS2:ETV1 fusion, 1 (1.6%) patient had TMPRSS2:ETV4.
Guinote, Ines Batista;Moreira, Ricardo Neves;Freire, Patrick;Arraiano, Cecilia Maria
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
제22권4호
/
pp.484-493
/
2012
BolA protein homologs are widely distributed in nature. In this report, we have studied for the first time YrbA, the only BolA homolog present in Escherichia coli, which we have renamed ibaG. We have constructed single and multiple ibaG mutants, and overexpressed ibaG in wild-type strains, in order to characterize this gene. The ibaG phenotypes are different from the bolA-associated round morphologies or growth profiles. Interestingly, ibaG and bolA single-and double-deletion mutants grow faster and have higher viabilities in rich media, whereas the overexpressed strains are significantly growth impaired. However, the mutant strains have lower viabilities than the wild type in the late stationary phase, indicating that both bolA and ibaG are important for survival in difficult growth conditions. bolA, as a transcription factor, binds to some promoters, but ibaG does not interact with the same DNA regions. We have determined that ibaG is transcribed in an operon with the murA gene, involved in the synthesis of peptidoglycan precursors. ibaG was also seen to change its mRNA expression pattern in response to acidic stress. ibaG may thus represent a new gene involved in cell resistance against acid stress.
G protein-coupled receptors (GPCR) constitute the largest superfamily of cell membrane receptors, mediating diverse signal-transduction pathways. The melanocortin 4 receptor (MC4R) has been of interest for its physiological role and size, one of the smallest among the GPCRs, which makes it a good model system for the structural study of GPCRs. To study the molecular structure and tissue-specific expression of MC4R in olive flounder (Paralichthys olivaceus), the full-length MC4R gene was obtained using PCR amplification of genomic DNA as well as cDNA synthesis. Sequence analysis of the gene indicates that 978 bp of the MC4R gene encodes 325 amino acids without introns. Sequence alignment with the MC4Rs from other fish shows the highest degree of identity (96%) between Paralichthys olivaceous and Verasper moseri, followed by Takifugu rubripes and Tetraodon nigroviridis (89%). RNA was isolated from various tissues to examine the tissue distribution of MC4R by using RT-PCR. The results showed major expression of MC4R in the liver, brain, and eye, which is consistent with the expression pattern in other fish belonging to the order Pleuronectiformes.
Park, Yong-Doo;Kim, Jong-Won;Suh, You-Hun;Min, Byoung-Goo
대한의용생체공학회:학술대회논문집
/
대한의용생체공학회 1997년도 추계학술대회
/
pp.475-477
/
1997
We have analyzed the fluorescence image obtaining from green fluorescence protein (GFP). In order to monitor the fluorescence of specific gene, we used the amyloid precursor protein promoter which has been known to act as a major role in the development of Alzheimer's disease. The promoter from - 3.0 kb to + 100 base pair was inserted into the gene expression monitoring GFP vector purchased from Clontech. This construct was transfected into the PC 12 and fibroblast cells and the fluorescence image was captured by two kinds of methods. One is using cheaper CCD camera and other is SIT-CCD camera. or the higher sensitivity of the fluorescence image, we developed the multiple image grabbing program. As a results, the fluorescence image by conventional CCD camera have the similar sensitivity compared with that of the SIT-camera by applying the multiple image grabbing programs. By this system. it will be possible to construct the fluorescence monitoring system with lower cost. And gene expression in real time by fluorescence image will be possible without changing the fluorescence images.
BamHI restriction pattern and genomic library of Herpes simplex virus type 2 (HSV-2) strain G were constructed, and locations of the glycoproteins gB and gD, and tk genes on the fragments were detected by Southern blot analysis. HSV-2 genomic DNAs were cleaved into twenty-seven fragments by BamHI enzyme in the range of 0.72 to 15.08 (total 150.44 kb), which were cloned into the BamHI site of pBluescript SK(+) to construct genome library of the HSV-2. The library was named by the order of the fragment size from smallest one to largest one. HSV-2 glycoprotein gD gene was located in pHLA2-21 and pHLA2-22 recombinant plasmids, gB gene in pHLA2-24 plasmid, and tk gene in pHLA2-11 clone by Southern blot analysis.
A full-length cDNA encoding dihydroflavonol 4-reductase (st-dfr) of potato was isolated by rapid amplification of cDNA ends, and their expression was investigated from purple-fleshed potato (Solanum tuberosum L. cv. Jashim). The st-dfr exists as a member of a small gene family and its transcripts was abundant in the order of tuber flesh, stem, leaf, and root. The expressions of st-dfr gene were light inducible and cultivar dependant. Transgenic potato plants harboring antisense st-dfr (AS-DFR) sequences were analyzed. The accumulation of mRNA was nearly completely inhibited as a result of introducing an AS-DFR gene under the control of the 35S CaMV promoter into the red tuber skin Solanum tuberosum L. cv. Desiree. The anthocyanin content of the tuber peels of the transgenic lines was dramatically decreased by up to 70%. The possible production of flavonols in the peels of AS-DFR transgenic potatoes was discussed.
A tetracycline resistant Vibrio parahaemolyticus, capable of growing on TCBS medium containing tetracycline, was isolated from cultivated fishes. A gene responsible for the tetracycline resistance was cloned from chromosomal DNA of the V. parahaemolyticus strain using Escherichia coli KAM3, which lacks major multi-drug efflux pumps (${\Delta}acrB$) as host cells. The nucleotide sequence and homology analysis revealed an open reading frame (ORF) for tetracycline resistance protein (TetB). In order to characterize the antibiotic resistance of TetB originated from the V. parahaemolyticus strain, the gene was sub cloned into plasmid pSTV28. The resulting plasmid was designated as pSTVTetB and transformated into E. coli KAM3. E. coli KAM3 cells harboring the recombinant plasmid pSTVTetB are able to grow on plates containing tetracycline and oxytetracycline but not doxycycline, indicating that the tetB gene confers the tetracycline- and oxytetracycline-resistance to the host cell.
SUC2 유전자를 가진 재조합 Saccharomyces cerevisiae의 invertase 생산성을 향상시키기 위하여 균체 생육과 유전자 발현에 미치는 아미노산과 용존산소 농도의 영향을 연구하였다. 균체 생육과 invertase 발현에 적합한 leucine과 histidine의 최적 첨가량은 탄소원인 포도당에 대한 비율로서 나타내어 0.03g/g glucose와 0.04g/g glucose였다. 회분배양에서는 통기량이 적을수록 invertase 비활성이 증가하였다. 희석율 0.09h에서 용존산소농도를 조절한 연속배양에서는 요존산소농도가 감소함에 따라 유전자 발현이 잘되어 5 포화 이하일때 invertase 비활성이 급격히 증가하여 통기를 하지 않은 조건에서 125.54KU/g cell의 최고 비활성을 얻었다.
Methanopyrus kandleri is a hyperthermophilic methanogen that represents one of the most heat-resistant organisms: the maximum growth temperature of M. kandleri is $110^{\circ}C$. A random sequence analysis of the genomic DNA of M. kandleri has been performed to obtain genomic information. More than 200 unique sequence tags were obtained and compared with the sequences in the GenBank and PIR databases. About 30% of the analyzed tags showed strong sequence similarity to previously identified genes involved in various cellular processes such as biosynthesis, transport, methanogenesis, or metabolism. When statistics relating to the frequency of codons were examined, the sequenced open reading frames showed highly biased codon usage and a high content of charged amino acids. Among the identified genes, a homologue of the catalytic subunit of carbon monoxide dehydrogenase (CODH) that reduces $CO_2$ to CO was cloned and sequenced in order to examine its detailed gene structure. The cloned gene includes consensus promoters. The amino acid sequence of the cloned gene shows a strong homology with the CODH genes from methanogenic Archaea, especially in the presumed binding sites for Fe-S centers.
The gene (galE) encoding UDP-galactose-4-epimerase, operative in the galactose metabolic pathway, was cloned together with the $\beta$-galactosidase gene (lacZ) from Lactococcus lactis ssp. lactis ATCC7962 (L. lactis 7962). galE was found to have a length of 981 bps and encoded a protein with a molecular mass of 36,209 Da. The deduced amino acid sequence showed a homology with GalE proteins from several other microorganisms. A Northern analysis demonstrated that galE was constitutively expressed by its own promoter. When galactose or lactose was added into medium, the galE transcription was induced by several upstream promoters. The structure of the gal/lac operon of L. lactis 7962 was partially characterized and the gene order around galE was galT-lacA-lacZ-galE-orfX.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.